賈彥輝, 徐慶剛
(江蘇大學(xué)生命科學(xué)研究院,鎮(zhèn)江 212013)
在20世紀(jì)80年代,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一種嚴(yán)重威脅人類健康的傳染病——獲得性免疫缺陷綜合征(acquired immunodeficiency syndrome AIDS),一般稱為艾滋??;根據(jù)血清學(xué)和基因序列的差異,HIV分為兩個(gè)型,即HIV-1 和 HIV-2。目前全球流行的艾滋病主要是由HIV-1 引起的。HIV-1主要感染人的CD4+T淋巴細(xì)胞,導(dǎo)致人的免疫機(jī)能下調(diào)。單核細(xì)胞在宿主免疫系統(tǒng)中發(fā)揮著重要的作用。樹突狀細(xì)胞(DCs)是免疫系統(tǒng)中最重要的抗原呈遞細(xì)胞(antigen presenting cell,APCs),其最大的特點(diǎn)是能夠顯著刺激初始性T細(xì)胞進(jìn)行增殖因而被認(rèn)為是機(jī)體免疫應(yīng)答的始動(dòng)者。當(dāng)有外界病原體入侵時(shí),單核細(xì)胞可以被刺激分化為樹突狀細(xì)胞(DCs)和巨噬細(xì)胞,發(fā)揮免疫作用。單核細(xì)胞是HIV-1感染的潛伏庫(kù),提示單核細(xì)胞在病毒致病過程中的作用[1, 2]。雖然單核細(xì)胞表達(dá)HIV-1的受體和輔助受體,但是它們并不支持HIV-1的復(fù)制性感染,當(dāng)它們分化為樹突狀細(xì)胞(DCs)或者巨噬細(xì)胞后,對(duì)HIV-1感染的限制作用可以得到緩解[3, 4]。
HIV-1的基因組主要編碼3個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白(gag,pol,env)和6個(gè)輔助蛋白,tat和rev兩個(gè)調(diào)節(jié)蛋白,vif(viral infectivity factor),vpr(viral protein R),vpu(viral protein U),nef四個(gè)功能蛋白。這些輔助蛋白在HIV-1的生活周期中起著關(guān)鍵的作用。HIV-1的生活周期主要包括:1)病毒進(jìn)入靶細(xì)胞。2)逆轉(zhuǎn)錄,合成病毒雙鏈 DNA 分子。3)進(jìn)核,病毒雙鏈DNA 分子與相連的病毒蛋白形成前病毒復(fù)合體,并在核定位蛋白的導(dǎo)向下進(jìn)入細(xì)胞核。4)整合,病毒 DNA 在整合酶作用下整合到宿主細(xì)胞染色體上,形成前病毒。5)轉(zhuǎn)錄,前病毒利用宿主細(xì)胞的 RNA 聚合酶合成病毒的 RNA。6)翻譯。7)出芽釋放。
病毒作為細(xì)胞的寄主,可以迅速適應(yīng)宿主內(nèi)的環(huán)境。在病毒生活周期的每個(gè)環(huán)節(jié),都需要宿主編碼的蛋白的參與;病毒利用宿主編碼的蛋白和胞內(nèi)的一些機(jī)制完成其自身的復(fù)制。單核細(xì)胞內(nèi)一些關(guān)鍵因子的缺失毫無疑問的會(huì)使HIV-1的復(fù)制受到限制。Brasse等人用siRNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞,從HeLa或HEK293細(xì)胞中獲得幾百個(gè)HIV-1復(fù)制依賴性因子(HIV-1-dependent factors,HDFs)[5]。HIV-1的生活周期高度依賴于宿主基因的表達(dá)。
了解宿主細(xì)胞抵制逆轉(zhuǎn)錄病毒感染的機(jī)制有助于我們理解病毒的致病機(jī)制。最近研究顯示宿主細(xì)胞內(nèi)表達(dá)的一些蛋白也稱為限制性因子可以抑制HIV-1的復(fù)制,比如SAMHD1,APOBEC3G/F,Tetherin,TRIM5α等。細(xì)胞內(nèi)還存在大量的microRNA可以調(diào)控HIV-1的復(fù)制。
SAMHD1是最近發(fā)現(xiàn)的一個(gè)新的抗病毒限制性因子,它是小鼠Mg11基因的同源基因,這個(gè)蛋白由636個(gè)氨基酸編碼而成,含有SAM(sterile α motif)和HD兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,SAM結(jié)構(gòu)域是蛋白與蛋白或蛋白與RNA相互作用的區(qū)域,HD結(jié)構(gòu)域富含組氨酸(His)和天冬氨酸(Asp),具有磷酸水解酶的活性,這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域在進(jìn)化上都是高度保守的,在核苷酸代謝中起著重要的作用。SAMHD1蛋白在人的骨髓細(xì)胞系中高表達(dá),在病毒的生活周期早期階段發(fā)揮功能,但是對(duì)于其具體的作用方式還有待進(jìn)一步的研究。干擾素(IFN)刺激巨噬細(xì)胞和樹突狀狀細(xì)胞可以誘導(dǎo)SAMHD1蛋白的表達(dá)[6]。
盡管宿主細(xì)胞內(nèi)有多種機(jī)制阻止病毒的感染,但是HIV-1依然可以有效的復(fù)制。HIV-1不僅可以躲避細(xì)胞內(nèi)模式識(shí)別受體(PRRs),成功地逃逸人體免疫系統(tǒng)監(jiān)管,它還可以通過自身編碼的一些輔助蛋白抵抗宿主內(nèi)的限制性因子。但是SAMHD1是一個(gè)例外。雖然跟其它限制性因子一樣,SAMHD1在所有組織中都存在,但是只特異性的抑制HIV-1在髓樣來源的細(xì)胞系中的復(fù)制[7]。SAMHD1是一種可以降解dNTPs的脫氧鳥苷三磷酸酶,SAMHD1介導(dǎo)的HIV-1限制被推測(cè)與其降解dNTPs從而導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)dNTPs濃度降低有關(guān)[8]。HIV-1及其相關(guān)的SIV都不能編碼拮抗SAMHD1的輔助蛋白,但是HIV-2及其相關(guān)的SIV編碼的Vpx可以通過蛋白酶體途徑降解這一蛋白,從而消除病毒在骨髓細(xì)胞中復(fù)制的抑制。通過外源性轉(zhuǎn)導(dǎo)方法使Vpx蛋白在樹突狀細(xì)胞(DCs)或者單核細(xì)胞中穩(wěn)定表達(dá)或瞬時(shí)表達(dá),那么HIV-1在這兩類細(xì)胞中就可以有效地復(fù)制??梢娝拗鲀?nèi)的非分裂細(xì)胞可能是HIV-1逃逸機(jī)體免疫的一個(gè)策略。那么HIV-1是否有其它的優(yōu)勢(shì)來拮抗SAMHD1,有效地感染樹突狀細(xì)胞和單核細(xì)胞,則有待進(jìn)一步的研究。
最近一些研究顯示限制性因子與宿主的天然免疫系統(tǒng)有著復(fù)雜的關(guān)系。TRIM5α既可以發(fā)揮限制性因子的作用,也可以作為模式識(shí)別受體(PRRs)。做為限制性因子,TRIM5α與病毒衣殼蛋白(CA)相互作用可以激活下游的NF-kB和激活蛋白-1(AP-1);作為PRR,可以調(diào)控促炎癥因子的分泌。相似的,SAMHD1也可以作為免疫調(diào)節(jié)器參與炎癥反應(yīng),誘導(dǎo)I-型干擾素的生產(chǎn)[9]。最近研究發(fā)現(xiàn),Vpx本身是不能誘導(dǎo)干擾素的分泌的,但Vpx處理樹突狀細(xì)胞(DCs),用HIV-1病毒顆粒感染細(xì)胞,細(xì)胞內(nèi)的干擾素分泌會(huì)增加[10],SAMHD1可能是干擾素信號(hào)通路中的負(fù)調(diào)控因子,那么Vpx降解SAMHD1可能會(huì)導(dǎo)致干擾素分泌增加,這可能會(huì)擴(kuò)大宿主的免疫反應(yīng)。SAMHD1在這個(gè)信號(hào)通路中的作用還需要進(jìn)一步研究的。
Tetherin(骨髓質(zhì)細(xì)胞抗原2)又稱為CD317,HM1.24,BST-2。在1995年,從類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎骨髓液細(xì)胞系中克隆而得。
Tetherin蛋白是Ⅱ型跨膜蛋白,N-端位于胞質(zhì)區(qū),胞外區(qū)的C-端含有糖基化磷脂酰肌醇膜錨定區(qū)域。Tetherin蛋白會(huì)富集在病毒顆粒出芽的位置,并嵌入到病毒包膜內(nèi),把成熟出芽的病毒顆粒完全固定在細(xì)胞膜上,使其無法釋放到胞外[11]。但Tetherin蛋白把病毒顆粒固定在細(xì)胞膜上的機(jī)制有待進(jìn)一步研究。HIV-1編碼的Vpu蛋白可以拮抗BST-2蛋白的抑制作用。β-TrCP是SCF(Skp1/Cullin/F-box蛋白)-E3泛素連接酶的識(shí)別亞單位,能夠識(shí)別并特異性降解磷酸化底物。Vpu蛋白的胞質(zhì)區(qū)域的DpSGxxpS基序的S52和S56發(fā)生磷酸化,標(biāo)記BST-2,從而通過蛋白酶體降解途徑降解BST-2[12];另外,Vpu蛋白可以調(diào)控Tetherin蛋白在細(xì)胞內(nèi)的分布[13, 14],使其無法在病毒出芽的位置富集。
APOBEC3是最近剛發(fā)現(xiàn)不久的APOBEC家族成員,由七個(gè)(A-H)胞嘧啶脫氨酶相關(guān)成員組成,哺乳動(dòng)物編碼的APOBEC3都具有抗病毒活性。其中APOBEC3G/F蛋白可以顯著的抑制人細(xì)胞中HIV-1的復(fù)制。APOBEC3G/F主要分布于人外周單核細(xì)胞(PBMC),脾細(xì)胞,卵巢和睪丸細(xì)胞等。
APOBEC3G/F蛋白要發(fā)揮抗病毒活性,首先需要與HIV-1的Gag蛋白或RNA相互作用[15],被包裝到新合成的病毒顆粒中,在該病毒顆粒感染新的靶細(xì)胞后,APOBEC3G/F蛋白被釋放出來,作用于新合成的負(fù)鏈DNA[16],胞嘧啶(C)脫氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?U)(C→U)。這一高突變的基因組是十分不穩(wěn)定的,無法整合到宿主的基因組中,即便是整合到了宿主的基因組中,它也無法翻譯合成功能性的病毒蛋白,從而也就無法產(chǎn)生感染性的病毒顆粒。
HIV-1病毒編碼的vif蛋白可以中和APOBEC3G/F的抗病毒活性[17]。Vif蛋白可以募集細(xì)胞內(nèi)的cul5-Rbx1-EloB/C蛋白復(fù)合物,激活蛋白泛素化途徑,從而降解APOBEC3G/F蛋白, Vif蛋白可以與APOBEC3G/F mRNA結(jié)合[18],抑制A3G mRNA的翻譯,與APOBEC3G/F蛋白競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合HIV-1 Gag蛋白和基因組,從而阻止A3G蛋白被包裝到新產(chǎn)生的病毒顆粒中。
TRIM5α也是備受關(guān)注的抗HIV-1病毒的限制性因子之一。HIV-1感染的宿主只限于人類和黑猩猩。TRIM5α屬于三重基序蛋白(tripartite motif protein,TRIM)大家族的成員。TRIM家族蛋白都有三個(gè)共同的基序結(jié)構(gòu):1個(gè)富含半胱氨酸(Cys)RING基序;1~2個(gè)B-Box結(jié)構(gòu)域;一個(gè)與蛋白復(fù)合體形成相關(guān)的螺旋狀-螺旋區(qū)域。因此TRIM家族蛋白也被稱作RBCC(RING-B-Box-Coiled-Coil)蛋白。除了上述3個(gè)基序結(jié)構(gòu)外,在C端還有一個(gè)可變的結(jié)構(gòu)域,不同的TRIM家族成員,氨基酸組成也存在著較大的差異。B-box和螺旋狀-螺旋域可以促進(jìn)TRIM5分子的多聚化,是TRIM5分子發(fā)揮抗病毒活性所必須的;TRIM5α在C端具有一個(gè)其特有的B30.2(SPRY)結(jié)構(gòu)域[19],決定了其發(fā)揮限制作用的特異性。
HIV-1能夠有效地進(jìn)入到舊大陸猴的細(xì)胞中,但是病毒在發(fā)生逆轉(zhuǎn)錄前會(huì)受到限制。TRIM5α可以與HIV-1病毒顆粒的衣殼蛋白相互作用,阻止病毒脫衣殼[20]。TRIM5α分子是一個(gè)廣譜的逆轉(zhuǎn)錄病毒限制因子,它的限制效應(yīng)表現(xiàn)出典型的物種特異性。但是對(duì)于TRIM5α限制逆轉(zhuǎn)錄病毒感染的具體過程還存在許多未知。
傳統(tǒng)認(rèn)為,限制性因子都是蛋白質(zhì),但是最近發(fā)現(xiàn)的一些microRNA在抑制病毒復(fù)制中也起著關(guān)鍵的作用。一些microRNA通過調(diào)控HIV-1復(fù)制周期中的關(guān)鍵蛋白從而調(diào)控HIV-1的復(fù)制。Cyclin T1是tat蛋白驅(qū)動(dòng)的HIV-1轉(zhuǎn)錄過程中的一個(gè)關(guān)鍵因子,它在未分化的單核細(xì)胞中的表達(dá)受到miRNA-198的抑制;在未激活的CD4+的T淋巴細(xì)胞中,CyclinT1的表達(dá)同樣會(huì)受到miR-27b,miR-29b,miR-150和miR-22的直接或間接調(diào)控[21]。除此之外,還有許多其它的microRNAs可以調(diào)控單核細(xì)胞分化依賴性的HIV-1的易感性,例如miRNA-28,miRNA-150,miRNA-223,miRNA-382,用這些microRNA的抑制劑或類似物轉(zhuǎn)染細(xì)胞,都可以調(diào)控HIV-1感染單核細(xì)胞和刺激分化的樹突狀細(xì)胞的敏感度。一些microRNA也可以直接作用于病毒的基因序列,調(diào)控HIV-1的復(fù)制[22]。在靜息的CD4+的T淋巴細(xì)胞中,miR-28,miR-125b,miR-150,miR-223,miR-382可以直接作用于HIV-1nef3′-UTR,使HIV-1進(jìn)入到潛伏感染,抑制HIV-1的復(fù)制[23]。
除了本文中介紹的一些限制性因子以及microRNA在HIV-1復(fù)制中的關(guān)鍵作用外,還有許多其他因子在病毒復(fù)制周期的不同環(huán)節(jié)發(fā)揮作用。CD4,DC-SIGN等調(diào)控病毒進(jìn)入細(xì)胞,CypA等調(diào)控細(xì)胞的脫衣殼和逆轉(zhuǎn)錄,importins,Nucleoporins等在病毒入核階段發(fā)揮功能。
HIV-1復(fù)制高度依賴的宿主蛋白的研究還處于初級(jí)階段,研發(fā)抗HIV-1感染的藥物或HIV-1的基因治療還有很長(zhǎng)的路要走。體外已經(jīng)發(fā)現(xiàn)很多宿主因子能夠調(diào)節(jié)HIV-1的復(fù)制,盡管這些因子與HIV-1感染之間的關(guān)系有待進(jìn)一步的體內(nèi)驗(yàn)證。但是這些宿主因子的研究或許能為抗HIV-1策略發(fā)展提供新的靶點(diǎn)。
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