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    河南豬株旋毛蟲分子鑒定

    2011-03-24 08:50:45王麗娜路國兵楊曉東陳曉寧
    承德醫(yī)學院學報 2011年2期
    關(guān)鍵詞:旋毛蟲克隆質(zhì)粒

    王麗娜,路國兵,楊曉東,高 云,陳曉寧

    (承德醫(yī)學院,河北承德 067000)

    河南豬株旋毛蟲分子鑒定

    王麗娜,路國兵,楊曉東,高 云,陳曉寧△

    (承德醫(yī)學院,河北承德 067000)

    目的:通過分析河南豬株旋毛蟲18S rRNA基因同源性序列,對旋毛蟲進行分子鑒定及分類。方法:收集旋毛蟲成蟲,提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,經(jīng)特異引物擴增獲得18S rRNA基因片段,將此目的基因與 pMD18-T載體進行連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細胞。陽性克隆經(jīng)酶切鑒定后進行序列測定及分析。結(jié)果:河南豬株旋毛蟲與親緣關(guān)系較近蟲株Trichinella nativa(AY487254.1)的同源性達99%。結(jié)論:河南豬株旋毛蟲歸屬于T.nativa。

    旋毛蟲;鑒定;18S rRNA;系統(tǒng)發(fā)育樹

    旋毛蟲病(trichinellosis)是一種嚴重的人獸共患寄生蟲病,可感染人及150多種哺乳動物,呈全球性分布,并被列為三大人獸共患寄生蟲病之首(旋毛蟲、囊蟲及棘球蚴)[1]。近年來,旋毛蟲病的流行范圍進一步擴大,發(fā)病率有逐年升高的趨勢[2]。自發(fā)現(xiàn)旋毛蟲以來,毛形屬的分類問題一直被人們所關(guān)注,目前國際上已將毛形屬分為8個隔離種和3個分類地位尚未確定的基因型(T6、T8、T9)[3]。由于旋毛蟲屬種分類復(fù)雜,本研究從分子遺傳的角度分析了河南豬分離株18S rRNA的序列,并進一步探討其歸屬問題。

    1 材料與方法

    1.1 旋毛蟲來源 旋毛蟲株(河南株)由本教研室小鼠傳代保種。

    1.2 實驗動物 健康成年雄性昆明小鼠,20-25g,購自承德醫(yī)學院實驗動物中心。健康成年雄性SD大鼠,180-220g,購自河北醫(yī)科大學實驗動物中心。

    1.3 主要試劑 胃蛋白酶(1:3000)、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,上海生物工程技術(shù)有限公司;載體pMD-18T、Tag DNA聚合酶、內(nèi)切酶EcoRⅠ和HindⅢ,大連寶生物工程有限公司;胰蛋白胨、酵母粉、瓊脂粉,英國Oxoid公司;氨芐青霉素,美國Amresco公司;DNA marker,北京泰格美科技有限公司;DNA片段凝膠回收試劑盒和質(zhì)粒小量提取試劑盒,北京三博遠志生物技術(shù)有限公司。

    1.4 收集旋毛蟲成蟲 處死保種小鼠,分離全身肌肉,搗碎后采用改良貝氏法收集囊包幼蟲。收集到的囊包幼蟲經(jīng)口感染大鼠,8000條/只,第5d處死,取全部小腸,縱向剪開,無菌生理鹽水洗凈,37℃溫箱孵育2h,孵育液

    200目紗網(wǎng)過濾,沖洗紗網(wǎng)洗下成蟲,沉淀收集干凈成蟲,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.5 RT-PCR擴增18S rRNA基因 取旋毛蟲成蟲100mg,Trizol法提取旋毛蟲成蟲總RNA。引物序列為:P1:5′-AAGCTTGCTTGTCTCAAAGATT-3′,P2:5′-GA TCCTTCCGCAGTTCACCTAC-3′,由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。RNA定量后逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)制備cDNA, 20μl反應(yīng)體系,反應(yīng)條件:42℃、15min,95℃、5min,4℃、5min。以該cDNA為模板,按PCR擴增試劑盒說明操作,PCR反應(yīng)體系為50μl。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min;94℃、1min,55℃、1min,72℃、2 min,35個循環(huán),72℃延伸10min。取5μl PCR產(chǎn)物2%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

    1.6 目的基因分子克隆和鑒定 按試劑盒說明回收電泳后的PCR產(chǎn)物。取適量PCR回收產(chǎn)物與克隆載體pMD18-T Vector 16℃連接10h,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌JM109感受態(tài)細胞,在氨芐抗性平板上進行藍白斑篩選,挑取陽性克隆接種到LB液體培養(yǎng)基(氨芐青霉素50μg/ml),37℃搖床振搖(180r/min)培養(yǎng)6h至對數(shù)生長期,菌落PCR鑒定陽性克隆子。按質(zhì)粒小量提取試劑盒說明提取質(zhì)粒,質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切,1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

    1.7 測定、分析18S rRNA基因序列 將陽性克隆送三博遠志有限公司測序,所得18S rRNA基因序列進行BLAST分析(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)。

    2 結(jié)果

    2.1 RT-PCR擴增結(jié)果 瓊脂糖凝膠電泳顯示,擴增得到一條約1800bp的條帶,與預(yù)期相符,表明成功擴增目的基因18S rRNA(圖1)。

    圖1 18S rRNA基因克隆電泳圖

    圖2 菌液PCR鑒定

    2.2 PCR法篩選菌落陽性克隆 以篩選得到的陽性克隆菌液為模板,經(jīng)PCR擴增出18S rRNA基因片段,與理論值一致,約1800bp,表明陽性克隆含有18S rRNA基因(圖2)。

    2.3 目的基因克隆后酶切鑒定 重組質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切,預(yù)期產(chǎn)生大小分別約為2700bp和1800bp的兩條帶,電泳結(jié)果與預(yù)期相符,表明目的基因克隆成功(圖3)。

    圖3 酶切鑒定重組質(zhì)粒pMD18-T-18S rRNA

    2.4 18S rRNA基因序列測定及分析 將所測18S rRNA堿基序列對NCBI數(shù)據(jù)庫進行BLAST,河南省豬旋毛蟲與毛線蟲屬的同源性最高,與已知蟲株Trichinella nativa(AY487254.1)的同源性可達99%。

    3 討論

    在旋毛蟲的不同發(fā)育階段,蟲體各階段之間及各地旋毛蟲隔離種之間缺乏一定的規(guī)律性變化,因此旋毛蟲形態(tài)學指標在分類研究中缺乏一定的說服力[4]。近年來同工酶分析、隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)及擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)等多種方法應(yīng)用于旋毛蟲的鑒定與分類,但因需要大量蟲體或重復(fù)性較差等因素使它們的應(yīng)用受到了限制。

    18S rRNA基因在生物體內(nèi)含量較大,在進化過程中非常保守,核苷酸的替換率較低,在分類學中可作為一個科學可靠的指標。近年來,利用18S rRNA序列變化來探討生物種間和種內(nèi)的親緣關(guān)系,系統(tǒng)進化以及鑒定未知的種屬等問題,已經(jīng)成為一種趨勢[5]。李冬梅等[6]用 18S rRNA序列設(shè)計引物,應(yīng)用PCR方法確定黑龍江株豬旋毛蟲為旋毛形線蟲,犬旋毛蟲為本地毛形線蟲。

    本研究18S rRNA基因測序結(jié)果及同源性序列分析發(fā)現(xiàn),河南豬旋毛蟲與北方旋毛蟲的同源性可達99%,表明河南省豬旋毛蟲歸屬于T2(T.nativa)。但當前的研究發(fā)現(xiàn),我國的豬源旋毛蟲大多歸屬于T1,犬旋毛蟲則多為T2。La Rosa等[7]對我國5個豬源旋毛蟲地理株進行等位基因酶分析,發(fā)現(xiàn)均為T1;崔晶等[8]應(yīng)用多重PCR技術(shù)鑒定,表明我國6個豬源旋毛蟲地理株均為T1。本研究的鑒定工作豐富了人們對我國豬源旋毛蟲生物多樣性的認識。

    隨著分子生物學的興起和發(fā)展,研究者們選用眾多的分子標記物應(yīng)用于物種的系統(tǒng)演化和分類研究,在選用不同的遺傳標記對物種進行分類的過程中,經(jīng)常得出一些與傳統(tǒng)分類學不相符的結(jié)果,甚至截然不同的結(jié)果[9]。我國地域遼闊,不同或者相同的地理區(qū)域旋毛蟲種在遺傳物質(zhì)上既有保守性又有一定的分化。雖然旋毛蟲的分類日益清晰,但物種在不斷進化及變異,還須對一些種屬的分類進行重新評定,做進一步的探索。我國是否還存在旋毛蟲的其它種或基因型,還有待于對更多的旋毛蟲地理株進行鑒定和分類。

    [1]王中全,崔晶.旋毛蟲病的診斷與治療[J].中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志,2008,26(1):55-57.

    [2]溫艷,張月清.聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)檢測旋毛蟲DNA的實驗研究[J].中國人獸共患病雜志,2001,17(1):61-62.

    [3]姚春雨,汪明,劉明遠,等.旋毛形線蟲分類的研究進展[J].中國獸醫(yī)科學,2008,38(01):82-85.

    [4]徐克成,劉明遠,姚春雨.中國八地區(qū)旋毛蟲繁殖力指數(shù)測定的比較[J].中國人獸共患病雜志,1998,14(3):62-63.

    [5]王寶慶,葛菁萍,平文祥.18S rRNA在系統(tǒng)進化研究中的應(yīng)用[J].黑龍江醫(yī)藥,2005,18(4):251-252.

    [6]冬梅,王秀榮,路義鑫,等.4個旋毛蟲隔離種18S rRNA基因分子克隆及序列比較分析[J].中國農(nóng)業(yè)科學,2005,39(4):860-864.

    [7]La Rosa G, Pozio E, Rossi P, et a1.Allozyme analysis of Trichinella isolates from various host species and geographical regions[J]. J Parasitol, 1992, 78(4): 641-646.

    [8]崔晶,趙桂花,王中全,等.應(yīng)用多重PCR技術(shù)鑒定我國6個旋毛蟲地理株的研究[J].中國寄生蟲學與寄生蟲病雜志,2008,26(2):86-89.

    [9]任竹梅,馬恩波,郭亞平.山稻蝗及相關(guān)物種Cyt b基因序列及其遺傳關(guān)系[J].遺傳學報,2002,29(6):507-513.

    (基礎(chǔ)醫(yī)學欄目編輯:陳志宏)

    MOLECULAR IDENTIFICATION OF SWINE-ORIGINATED TRICHINELLA IN HENAN PROVINCE

    WANG Li-na, LU Guo-bing, YANG Xiao-dong, et al
    (Chengde Medical College, Hebei Chengde 067000, China)

    Objective:To identify and classify swine-originated Trichinella in Henan province at molecular level by sequence homology analysis of 18S rRNA gene.Methods:Total RNA was extracted from adult Trichinella and obtained cDNA by reverse transcription. 18S rRNA gene was amplified by specific primer, connected to pMD18-T and transformed colibacillus competent cells. The positive clone was determined sequence and analyzed after restrictive endonuclease digestion.Results:In the phylogenetic tree, swine-originated Trichinella in Henan province had close relationship with Trichinella nativa (AY487254.1) of 99% sequences similarity.Conclusions:Swine-originated Trichinella in Henan province belongs to T.nativa.

    Trichinella; Identification; 18S rRNA; Phylogenetic tree

    圖分類號】R383.1

    A

    1004-6879(2011)02-0128-03

    2010-12-12)

    △ 通訊作者

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