1 Sites of Differential DNA Methylation between Placenta and Peripheral Blood.
Papageorgiou EA,F(xiàn)iegler H,Rakyan V,Beck S,Hulten M,Lamnissou K,Carter N P,Patsalis PC
∥the Cytogenetics and Genomics Department,The CyprusInstitute of Neurology and Genetics,Nicosia,CyprusThe American Journal of Pathology.2009,5:1609-1618
該文章于2009年發(fā)表于《The American Journal of Pathology》雜志上。母體的全血與胎兒(胎盤)間的表觀遺傳學差異是非侵入性產(chǎn)前診斷的重點所在,但對染色體范圍內(nèi)的不同甲基化位點的深入辨識限制了這種方法的應用。本研究對21、18、13號及X、Y染色體采用甲基化DNA免疫沉淀與高分辨率疊瓦式陣列寡核苷酸芯片分析相結(jié)合的方式進行研究,標本為女性全血與胎盤組織DNA。研究在每1條被檢測的染色體上都發(fā)現(xiàn)了超過2000個在全血與胎盤DNA中有不同甲基化程度的區(qū)域。而后,用實時PCR對一部分檢測到的有區(qū)別的甲基化的區(qū)域進行了確認,并研究了這些區(qū)域與Cp G島,基因和啟動子區(qū)域的關(guān)系。這些區(qū)域中的56%~83%都位于無效區(qū)域,只有1%~11%與CpG島有重合,而這其中的近65%在啟動子區(qū)。因此本研究找到了很大數(shù)目的以前未報道過的胎兒的表觀遺傳學分子標記,未來有可能發(fā)展成為對于染色體數(shù)目異常等疾病的非侵入性產(chǎn)前診斷的標記物。研究也同時證明了在富集高甲基化胎兒DNA時采用甲基化DNA免疫沉淀方法的有效性。
2 A microarray-based approach for the identification of epigenetic biomarkers for the noninvasive diagnosis of fetal disease.Chu T,Burke B,Bunce K,Surti U,Hogge W A,Peters DG
∥Centre for Fetal Medicine,Magee-Womens Research Institute,Pittsburgh,PA,USA
Prenat Diagn.2009,29:1020-1030.
該文章于2009年發(fā)表于《Prenat Diagn》雜志上。本研究結(jié)合1種215 060探針的定制寡核苷酸芯片與綜合性文庫預備方法,以及新式的統(tǒng)計工具,研究比較了絨膜絨毛樣本(CVS)與對應妊娠期的相配年齡的孕婦血細胞(MBC)樣本的DNA甲基化模式,借助定制寡核苷酸芯片可以給出人類13、18、21號染色體的高分辨率重合。
在研究的所有3對染色體中,有組織特異的不同Cp G甲基化模式的 Msp I/HpaII位點(即CCGG序列)共有6 311個。為了將得到有臨床意義的位點的可能性最大化,研究從得到的數(shù)據(jù)中又篩選出含有150bp的高單核苷酸多態(tài)性的 MspI/HpaII位點,這樣其等位基因頻率可以用于找出胎兒染色體數(shù)目異常。實驗的芯片陣列設計以及使用軟件都可以完整地下載到。
此妊娠早期胎盤中DNA甲基化模式的高分辨率分析在13、18、21號染色體上指出了用于診斷胎兒染色體數(shù)目異常的眾多標記物。
3 Array Comparative Genomic Hybridization in Prenatal Diagnosis:Another Experience.Vialard F,Molina Gomes D,Leroy B.Quarello E.Escalona A,Le Sciellour C,Serazin V, Roume J, Ville Y, de Mazancourt P,Selva J
∥Federation of Genetics,CHI Poissy Saint Germain,Poissy,fvialard@hotmail.com,F(xiàn)rance.
Fetal Diagn Ther2009;25:277-284.
該文章于2009年發(fā)表于《Fetal Diagn T her》雜志上。目前對多發(fā)先天性異常(MCA)的病原性診斷還非常缺乏。大片段染色體異常通過常規(guī)的細胞遺傳學方法就可以檢測出來,但是對于更加微小的染色體異常則需要通過mutil-FISH才能檢測出來。本文利用陣列比較基因組雜交(a-CGH)的方法在39名MCAs的患兒監(jiān)測典型的亞顯微缺失和端粒重組。最后在2名患兒體內(nèi)檢測到從頭開始的不平衡核型,這種異常利用常規(guī)細胞遺傳學方法是檢測不到的。目前對亞顯微結(jié)構(gòu)的拷貝數(shù)變異(CNV)的檢測非常熱門,而a-CGH為其檢測提供了1種有力的工具。
4 Hsa-miR-222 is involved in differentiation of endometrial stromal cells in vitro.
Qian K.
∥Reproductive Medicine Center,Tongji Hospital, Tongji Medical College,Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430030,People's Republic of China.
Endocrinology.2009,10:4734-4743.
該文章于2009年10月發(fā)表于《Endocrinology》雜志上。子宮內(nèi)膜蛻膜化是胚胎植入的1個重要過程,它的特點是子宮內(nèi)膜基質(zhì)細胞(ESCs)向蛻膜細胞分化。本研究是采用芯片尋找在體外ESCs蛻膜化和非蛻膜化過程中micro RNA表達的差別。研究共發(fā)現(xiàn)了49種microRNA,并對其中的miR-222、221、143、101、30d、30c、181b、27b、29b、507和23a用定量PCR的方法進行了驗證。研究還發(fā)現(xiàn),下調(diào)mir-222可以減少ESCs分化過程中S期細胞的數(shù)量。Antimir-222可以增加報告基因CDKN1C/p57kip2 mRNA和蛋白水平的表達。說明micro RNA在ESCs蛻膜化過程中發(fā)揮了重要作用,并且mir-222參與調(diào)節(jié)ESCs終末期的分化。
5 STOX2 but not STOX1 is differentially expressed in decidua from preeclamptic women.
Fenstad MH,Johnson MP,Loset M,Mundal SB,Roten LT,Eide IP,Bjorge L,Sande RK,Johansson AK,Dyer TD,F(xiàn)orsmo S, Blangero J, Moses EK,Austgulen R.
∥Department of Cancer Research and Molecular Medicine,F(xiàn)aculty of Medicine,Norwegian University of Science and Technology(NTNU),Trondheim,7006,Norway.
MolHum.Reprod.2010,7.July 19,2010
該文章于2010年發(fā)表于《Hum.Reprod》雜志上。已有研究表明STOX1基因的突變與子癇前期的發(fā)生存在一定的關(guān)聯(lián)。在本研究中,作者以包含子癇患者和非子癇患者的獨立人群隊列作為調(diào)查對象,分析了STOX1的候選SNPs,同時比較了在子癇孕婦和(或)胎兒生長受限(FGR)孕婦以及正常孕婦蛻膜組織中的STOX1及其同源基因STOX2的表達水平。研究表明候選SNPs與子癇前期的發(fā)生并不存在確切的關(guān)聯(lián)(p>0.05);與正常組相比,病例組中STOX1的表達水平也沒有明顯的改變,相反,與對照組相比STOX2在子癇前期并發(fā)FGR孕婦的蛻膜組織中表達顯著降低(p=0.01)。已有報道指出絨毛膜癌細胞中存在轉(zhuǎn)錄改變引起的STOX1A過表達。文章最后,作者進一步提出這種轉(zhuǎn)錄改變與子癇前期并發(fā)FGR孕婦的蛻膜組織中該基因的表達改變存在密切聯(lián)系。