徐靈佳,郭欣桐
(寧夏職業(yè)技術(shù)學(xué)院,寧夏銀川 750021)
隨著質(zhì)譜分析技術(shù)迅速發(fā)展,液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用系統(tǒng)分析已經(jīng)成為最廣泛應(yīng)用的蛋白質(zhì)復(fù)合物分離鑒定研究方法[1-3]。而前端采用納流液相色譜的液質(zhì)聯(lián)用方法,更是大大突顯了液質(zhì)聯(lián)用高效率、高分辨、高靈敏度以及低進樣量的優(yōu)勢[4]。因此,如何進一步提高前端色譜分離的效率和效果是目前蛋白質(zhì)組學(xué)分析亟需解決的問題。
球包球填料[5]是一種新型的殼-核色譜填料,它優(yōu)化了色譜動力學(xué)過程,在之前的研究中色譜分離效果良好[6]。通過改變表面納米小球的殼厚度,可以將色譜填料調(diào)整到適宜尺寸的孔隙,從而適用于分離生物大分子。
本實驗采用這種新型球包球殼-核式反相色譜填料填充納流液相色譜柱,探究色譜柱的柱性能,并構(gòu)建了液質(zhì)聯(lián)用平臺,探究此平臺在牛血清白蛋白酶解產(chǎn)物分析中的應(yīng)用,從而預(yù)測其未來在蛋白質(zhì)組學(xué)分析中的應(yīng)用潛能。
材料:內(nèi)徑100 μm,外徑375 μm 的透明涂層毛細管(永年銳灃色譜器件有限公司)。
試劑:乙腈(色譜純,賽默飛世爾科技(中國)有限公司)、超純水、尿素、NH4HCO3、二硫蘇糖醇(DTT)、碘乙酰胺(IAA)、三氟乙酸(TFA)、胰蛋白酶。
樣品:牛血清白蛋白(BSA)。
實驗儀器:Vario EL III 元素分析儀(Elementar,Germany);日立S-4800 掃描電鏡(Hitachi,Japan);納流液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用平臺由Waters ACQUITY 超高壓液相色譜系統(tǒng)(Waters,Milford,MA,USA)和QExactive 高性能臺式四級桿-軌道阱質(zhì)譜儀(Thermo Scientific,USA)組成,分析柱由球包球填料填充而成。
數(shù)據(jù)處理:將Q-Exactive 質(zhì)譜分析得到的raw 文件用Proteome Discoverer(Version 1.40,Thermo Fisher)進行檢索,數(shù)據(jù)庫為Uniprot-Bovine。
1.3.1 柱截面填充情況檢測 采用勻漿法填充3 根15 cm 長的球包球填料毛細管柱,每根色譜柱以每2 cm 為1 節(jié)點按照垂直于色譜柱方向截斷,用掃描電鏡觀察其柱床填充情況。
1.3.2 球包球填料元素含量分析 將球包球填料(SOS-ODS)、A scentis Express C18、HALO C18(AMT,Inc.)、Kinetex C18(Phenomenex)、Poroshell 120(Agilent)5 種填料各取適量,分2 份包裹在錫箔中,稱重之后放入自動樣品進樣器的旋轉(zhuǎn)式進樣盤中進行元素分析。
1.4.1 牛血清白蛋白的酶解 蛋白質(zhì)酶解樣品是通過胰蛋白酶在溶液里酶解標準蛋白而獲得的。首先,蛋白質(zhì)被溶解在8 mol/L 尿素、0.05 mol/L NH4HCO3的溶液中。然后,蛋白質(zhì)被DTT 分解,被IAA 烷基化。最后,胰蛋白酶以50∶1 的比例加進去,酶解過夜。
1.4.2 納流液相色譜體系流動相的配制 分別配制流動相,A 相(水相):H2O+0.1%TFA;B 相(有機相):ACN+0.1%TFA;C 相:50%ACN。
1.4.3 梯度洗脫 液相的流量為300 nL/min。流動相梯度為0~5 min,2%~10%B;5~85 min,10%~35%B;85~105 min,35%~65%B;105~110 min,65%~95%B;110~120 min,95%B。
為了解球包球填料填充的納流液相色譜柱的柱床微觀結(jié)構(gòu),探求其對色譜分離效能的影響,使用掃描電鏡對色譜柱截面進行了觀察,見圖1。由圖1 可以看出,球包球填料高度均一,但由于填料表面布滿了納米小球,表面比較粗糙,納米小球彼此之間擠壓,造成填充柱床中的空腔較多,孔隙較大。柱床中的大孔隙雖然可以降低色譜分離時的背壓,提高分離速度,但是對于復(fù)雜多肽混合物的分離效果可能不利。
圖1 球包球填料毛細管柱的掃描電鏡圖
對于反相色譜填料來說,C18 的修飾決定了蛋白多肽等生物分子的保留情況,因此,探究色譜填料的碳載量尤為重要。本實驗對球包球填料和4 種商業(yè)化的反相色譜填料進行元素分析,見表1。
表1 5 種色譜填料的元素分析表
由表1 可以看出,球包球填料的平均碳載量相對較低,這可能會影響到色譜分離時生物分子的保留情況,可能需要更長的洗脫時間和洗脫梯度才能達到較好的分離效果。
利用球包球填料填充的毛細管柱構(gòu)建納流液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用分析平臺,對標準蛋白牛血清白蛋白(BSA)酶解進行分離,得到BSA 酶解產(chǎn)物的質(zhì)譜總離子流圖見圖2。由圖2 可知,球包球填料對小分子多肽的混合物分離效果良好。由圖3 可知,在此平臺下對BSA 酶解產(chǎn)物進行分析鑒定,肽段匹配很高。通過搜庫結(jié)果可知,肽段的覆蓋率可達63.90%,由此證明了球包球填料高效的色譜分離能力和液質(zhì)聯(lián)用在蛋白質(zhì)組學(xué)分析的應(yīng)用潛能。
圖2 BSA 酶解產(chǎn)物的質(zhì)譜總離子流圖
圖3 BSA 酶解產(chǎn)物中肽段匹配情況
本實驗利用球包球填料填充納流液相色譜分析柱,對其柱床性能進行了簡單考察,成功構(gòu)建了納流液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用分析平臺,并采用液質(zhì)聯(lián)用法對牛血清白蛋白酶解產(chǎn)物進行了分析鑒定。球包球填料的納流液相色譜柱床孔隙較大,可能與其表面過于粗糙有關(guān)。球包球填料平均碳載量相對較低,影響生物分子保留,后續(xù)還需要進一步優(yōu)化。盡管如此,球包球填料依舊顯示出它在色譜上的高效分離,由其建立的液質(zhì)聯(lián)用在蛋白質(zhì)組學(xué)分析上具有巨大應(yīng)用潛能。