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    丹參-莪術(shù)藥對(duì)治療癌性厭食的作用機(jī)制*

    2024-04-16 12:41:22張?zhí)?/span>宋萌萌賈文文喬元?jiǎng)?/span>
    中醫(yī)藥臨床雜志 2024年3期
    關(guān)鍵詞:莪術(shù)丹參靶點(diǎn)

    張?zhí)穑蚊让龋Z文文,喬元?jiǎng)?/p>

    1 山東中醫(yī)藥大學(xué) 山東濟(jì)南 250014

    2 山東省泰安市中醫(yī)醫(yī)院 山東泰安 271000

    癌性厭食(cancer-related anorexia,CA)是指與癌癥或抗癌治療相關(guān)的食欲減少甚至喪失,伴或不伴體重下降[1]。CA按照病因分為原發(fā)性和繼發(fā)性?xún)深?lèi)。原發(fā)性厭食的具體臨床機(jī)制尚不清晰。繼發(fā)性厭食多由于抑郁、便秘、疼痛和接受抗腫瘤治療等導(dǎo)致[2]。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)治療,尚存在一定的不良反應(yīng)[3-4],而CA是癌癥患者不容忽視的一大癥狀。

    丹參性苦,微寒,歸心、肝二經(jīng),具有活血祛瘀、通經(jīng)止痛、清心除煩、涼血消癰的作用。莪術(shù)辛苦溫,入肝、脾經(jīng),具有破血行氣、消積止痛之功。大量臨床研究表明丹參[5-7]、莪術(shù)[8-9]具有抗腫瘤的作用。同時(shí)丹參[10]、莪術(shù)[11-13]作為復(fù)方藥物的組成之一,具有改善進(jìn)食情況的作用,但機(jī)制尚不明確。本研究旨在通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接預(yù)測(cè)丹參與莪術(shù)治療CA的靶點(diǎn),明確其作用機(jī)制,了解其作用原理,為進(jìn)一步研究丹參—莪術(shù)治療CA提供具體的理論依據(jù)。

    資料與方法

    1 藥物成分獲取

    以“丹參、莪術(shù)”為關(guān)鍵詞,檢索中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php),按照ADME參數(shù)設(shè)置化合物分子的口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、類(lèi)藥性(drug likeness,DL)≥0.18進(jìn)行篩選,獲得丹參、莪術(shù)的化合物分子,結(jié)合文獻(xiàn)[14-17]對(duì)莪術(shù)的化學(xué)成分進(jìn)行補(bǔ)充。

    2 藥物基因靶點(diǎn)獲取

    通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)獲得的丹參、莪術(shù)的化合物進(jìn)行靶點(diǎn)蛋白獲取,結(jié)合Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.uniprot.org/)獲取對(duì)應(yīng)的基因。文獻(xiàn)中獲取得到的莪術(shù)成分使用PharmMapper數(shù)據(jù)庫(kù)(http://lilab-ecust.cn/pharmmapper/index.html),設(shè)定條件為物種Human Protein、Norm Fit>0.9,篩選得出對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)基因。

    3 藥物基因可視化分析

    去重后利用cytoscape3.8.2軟件實(shí)施網(wǎng)絡(luò)可視化分析。

    4 疾病基因靶點(diǎn)的獲取

    以“cancer-related anorexia”為關(guān)鍵詞,分別在GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https: //www.genecards.org/)和OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)(https: //omim.org/)中篩選,合并去重后得到CA相關(guān)的基因靶點(diǎn)。

    5 疾病和藥物交集基因獲取

    將疾病基因與藥物交集基因輸入“微生信”(http://www.bioinformatics.com.cn/),獲取韋恩圖。

    6 疾病—藥物蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建(PPI)及可視化分析

    將疾病和藥物交集基因?qū)С龅絊tring數(shù)據(jù)庫(kù)(https://cn.string-db.org/),并設(shè)定物種為“Homo spanies”,將最低相互作用評(píng)分(minimum required interaction score)設(shè)置為medium confidence(0.400),并勾選隱藏游離的蛋白質(zhì)。將結(jié)果導(dǎo)出到cytoscape3.8.2軟件進(jìn)行調(diào)整。

    7 GO富集分析與KEGG富集通路分析

    將潛在的基因靶點(diǎn)上傳至Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)(https://metascape.org/)中,選擇物種為“H.sapiens”,進(jìn)行custom analysis。分別得到GO富集分析及KEGG富集通路分析結(jié)果。KEGG富集通路分析按照P值進(jìn)行升序排列;GO分析按logP值進(jìn)行升序排列,結(jié)果利用“微生信”(http://www.bioinformatics.com.cn/)進(jìn)行可視化展示。

    8 核心活性成分-靶點(diǎn)分子對(duì)接分析

    利用PDB數(shù)據(jù)庫(kù)下載關(guān)鍵靶蛋白,從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中下載核心活性成分的mol2結(jié)構(gòu),利用Autodock Tools進(jìn)行去水、加氫、設(shè)置旋轉(zhuǎn)鍵、盲對(duì)接等操作,再進(jìn)行分子對(duì)接,最終結(jié)果通過(guò)pymol進(jìn)行可視化處理。

    結(jié)果

    1 丹參、莪術(shù)化學(xué)成分的篩選結(jié)果

    通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù),經(jīng)ADME篩選(OB≥30%,DL≥0.18)、文獻(xiàn)補(bǔ)充、篩選后共得到丹參58個(gè)有效成分,莪術(shù)8個(gè)有效成分。見(jiàn)表1。

    2 丹參、莪術(shù)化學(xué)物預(yù)測(cè)靶點(diǎn)

    通過(guò)Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)、PharmMaper數(shù)據(jù)庫(kù)檢索對(duì)應(yīng)的基因,丹參58個(gè)化合物共有833個(gè)基因,莪術(shù)8個(gè)化合物共有90個(gè)基因,利用cytoscape3.8.2軟件建立基因靶點(diǎn)與化合物的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖,見(jiàn)圖1。

    圖1 丹參—莪術(shù)基因靶點(diǎn)—化合物

    3 疾病-藥物交集基因

    將丹參、莪術(shù)的基因靶點(diǎn)去重后得到丹參126個(gè)基因,莪術(shù)54個(gè)基因,并將疾病基因輸入微生信網(wǎng)站得到交集基因,丹參-莪術(shù)交集基因?yàn)?5個(gè),CA與丹參-莪術(shù)的交集基因?yàn)?4個(gè)。見(jiàn)圖2。

    圖2 藥物-疾病交集基因

    4 蛋白互作圖

    基于String數(shù)據(jù)庫(kù)分析“丹參-莪術(shù)”與CA靶點(diǎn)之間的交互作用,使用cytoscape3.8.2軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化分析,一個(gè)節(jié)點(diǎn)代表一個(gè)蛋白質(zhì),邊則代表蛋白相互之間的作用關(guān)系,其中1個(gè)游離的蛋白質(zhì)被舍棄,共13個(gè)點(diǎn),22條邊。利用Analyse network進(jìn)行度的分析,度值越大則節(jié)點(diǎn)越大,顏色越紅,表示“丹參-莪術(shù)”通過(guò)此靶點(diǎn)治療CA的可能性越大。邊按照combined score進(jìn)行顏色、粗細(xì)調(diào)節(jié),顏色越紅,線(xiàn)條越粗,表示得分越高,蛋白互作關(guān)系越強(qiáng)。見(jiàn)圖3、圖4。

    圖3 string原圖

    圖4 可視化后的PPI網(wǎng)絡(luò)圖

    5 GO富集分析

    GO分析中按logP值進(jìn)行升序排列,結(jié)果顯示生物過(guò)程(BP)有83個(gè)條目,細(xì)胞組分(CC)有4個(gè)條目,分子功能(MF)有18個(gè)條目。其中BP、MF展示前10個(gè)條目,CC展示全部條目。BP主要涉及細(xì)胞對(duì)有機(jī)環(huán)狀化合物的反應(yīng)、類(lèi)固醇激素介導(dǎo)的信號(hào)通路、類(lèi)固醇激素反應(yīng)等;CC主要涉及膜小凹、膜微區(qū)、膜筏、質(zhì)膜筏;MF主要涉及核受體活性、配體激活的轉(zhuǎn)錄因子活性、核類(lèi)固醇受體活性、類(lèi)固醇結(jié)合等。見(jiàn)圖5。

    圖5 GO富集分析結(jié)果

    6 KEGG富集通路分析

    KEGG富集通路分析結(jié)果共得到20條信號(hào)通路,包括化學(xué)致癌-受體激活通路、癌癥信號(hào)通路、雌激素信號(hào)通路、乳腺癌信號(hào)通路、催乳素信號(hào)通路、內(nèi)分泌耐藥的信號(hào)通路、腫瘤壞死因子信號(hào)通路等,按照P值進(jìn)行升序排列,并將該結(jié)果通過(guò)微生信網(wǎng)站進(jìn)行可視化分析。見(jiàn)圖6。

    圖6 KEGG富集通路分析結(jié)果

    7 分子對(duì)接

    通過(guò)cytoscape3.8.2軟件進(jìn)行degree篩選,將PPI得出的前2個(gè)核心靶點(diǎn)(MAPK1、ESR1)通過(guò)PDB數(shù)據(jù)庫(kù)轉(zhuǎn)換為受體(3SA0、1XPC),分別與前3個(gè)核心成分丹參新醌(dan-shexinkum d,MOL007093)、二氫丹參內(nèi)酯(dihydrotanshinlactone,MOL007100)、2-異丙基-8-甲基菲-3,4-二酮(2-isopropyl-8-methylphenanthrene-3,4-dione,MOL007041)進(jìn)行分子對(duì)接,對(duì)接次數(shù)設(shè)置為50次。通常認(rèn)為當(dāng)結(jié)合能<-5kcal/mol時(shí),靶點(diǎn)與藥物成分結(jié)合較好,具體結(jié)合能見(jiàn)表2,其中MOL007100與3SA0、 MOL007093與1XPC、MOL007093與3SA0可見(jiàn)氫鍵連接。見(jiàn)圖7-圖9。

    圖7 MOL007100-3SA0

    圖8 MOL007093-1XPC

    圖9 MOL007093-3SA0

    表2 分子對(duì)接結(jié)合能(kcal/mol)

    討論

    CA具有發(fā)病率高的特點(diǎn),是癌癥患者常見(jiàn)的伴發(fā)癥狀。但其出現(xiàn)的機(jī)制尚不明了,影響因素較多。針對(duì)CA,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)可采用糖皮質(zhì)激素、大麻素、醋酸甲地孕酮等藥物[18]。而目前中醫(yī)治療上主要應(yīng)用經(jīng)方、驗(yàn)方、中成藥注射劑及中醫(yī)外治法[19],但缺少指南統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)。

    本研究通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)及相關(guān)文獻(xiàn)補(bǔ)充,篩選得出丹參—莪術(shù)的活性成分,再由GeneCards、OMIM數(shù)據(jù)庫(kù)中得到CA的疾病靶點(diǎn),后利用String數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白互作分析,并通過(guò)cytoscape3.8.2軟件進(jìn)行可視化分析,篩選得到核心靶點(diǎn),最終進(jìn)行富集分析及分子對(duì)接。結(jié)果表明丹參新醌、二氫丹參內(nèi)酯、2-異丙基-8-甲基菲-3,4-二酮與MAPK1、ESR1有較強(qiáng)的結(jié)合能力,在丹參、莪術(shù)治療CA過(guò)程中具有重要作用。

    MAPK是絲裂原活化蛋白激酶,也是CXC趨化因子的靶標(biāo)之一[20],趨化因子可結(jié)合相應(yīng)受體,參與腫瘤形成、免疫反應(yīng)等過(guò)程[21],CXCL14作為趨化因子家族成員,參與了體重控制過(guò)程,并且可能在中樞神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)控?cái)z食行為活動(dòng)中起到重要作用[22]。胰高血糖素樣肽-1(glucagon-like peptide-1,GLP-1)是由腸道L細(xì)胞所產(chǎn)生的激素,具有刺激胰島素分泌、利尿、減少胃排空、減少炎癥和細(xì)胞凋亡等作用[23],研究表明GLP-1受體激活能夠增加MAPK磷酸化達(dá)到抑制食物攝入的目的[24]。同時(shí)MAPK1是GATA3轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄靶標(biāo),去泛素化酶USP21可以通過(guò)與GATA3結(jié)合來(lái)調(diào)節(jié)MAPK1的表達(dá)[25]。當(dāng)血管緊張素Ⅱ1型受體與血管緊張素Ⅱ結(jié)合后可激活細(xì)胞內(nèi)MAPK途徑以觸發(fā)鈉攝入[26]。另外,通過(guò)果蠅實(shí)驗(yàn)證明Dop1R2/Raf/MAPK通路是多巴胺信號(hào)在食欲嗅覺(jué)記憶穩(wěn)定過(guò)程中的關(guān)鍵下游效應(yīng)子[27],能夠以此來(lái)穩(wěn)定食欲和嗅覺(jué)的記憶。

    ESR1作為編碼雌激素受體α(estrogen receptor,ERα)的基因,對(duì)于乳腺癌[28]、子宮內(nèi)膜癌[29]、肝內(nèi)膽管癌[30]等具有臨床意義。ERα作為重要的雌激素受體之一,是調(diào)節(jié)正常攝食行為、維持正常的能量消耗和脂肪分布必不可少的[31]。ESR1能夠調(diào)節(jié)SLC2A4基因的表達(dá),改變組織胰島素敏感型葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白4(GLUT4)含量,最終調(diào)節(jié)血糖[32]。也有研究表明ESR1與限制性神經(jīng)性厭食有關(guān),但相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性還沒(méi)有已知的功能,仍需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)[33]。

    KEGG通路富集分析表明丹參、莪術(shù)治療CA可能與雌激素信號(hào)通路(Estrogen signaling pathway)、腫瘤壞死因子信號(hào)通路(TNF signaling pathway)等有關(guān)。雌激素信號(hào)通路有助于對(duì)抗腫瘤免疫的異常調(diào)節(jié),還可能逆轉(zhuǎn)出現(xiàn)免疫抑制的腫瘤微環(huán)境[34]。雌激素可以與GLP-1結(jié)合形成GLP-1-雌激素偶聯(lián)物,其存在可以將雌激素特異性遞送到表達(dá)胰高血糖素樣肽-1受體(GLP-1R)的區(qū)域[35],而SIM1神經(jīng)元中的ERα可以部分介導(dǎo)GLP-1-雌激素偶聯(lián)物,從而發(fā)揮減重作用[36]。此外,在已被切除卵巢的大鼠中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),證實(shí)雌二醇(E2)具有抑制食物攝入的效力[37]。癌癥患者的免疫系統(tǒng)會(huì)釋放細(xì)胞因子,TNF-α作為其中之一,可通過(guò)血腦屏障,與大腦內(nèi)皮細(xì)胞管腔表面相互作用,進(jìn)而導(dǎo)致影響食欲下降的物質(zhì)的釋放[13]。在腫瘤惡病質(zhì)患者中,血液TNF-α水平也出現(xiàn)顯著增高,且與體重穩(wěn)定組的腫瘤患者相比,腫瘤惡病質(zhì)患者的皮下脂肪組織中TNF-αmRNA呈現(xiàn)高表達(dá)狀態(tài)[38]。

    綜上所述,本研究針對(duì)丹參、莪術(shù)治療CA的機(jī)制、作用靶點(diǎn)、通路進(jìn)行預(yù)測(cè),并運(yùn)用分子對(duì)接進(jìn)行驗(yàn)證,可知丹參、莪術(shù)的前3個(gè)核心成分為丹參新醌、二氫丹參內(nèi)酯、2-異丙基-8-甲基菲-3,4-二酮并通過(guò)MAPK1、ESR1核心靶點(diǎn)入手,調(diào)節(jié)Estrogen signaling pathway、TNF signaling pathway等信號(hào)通路,達(dá)到改善患者食欲的目的。后續(xù)可繼續(xù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,為進(jìn)一步研究丹參、莪術(shù)治療CA的臨床效果,提供一定的指導(dǎo)意義。

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