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    基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法、分子對接技術(shù)及動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證探討通塞顆粒治療慢性阻塞性肺疾病急性加重期的作用機(jī)制

    2024-04-08 02:46:02付子堅(jiān)李建生田燕歌趙鵬燕苗苗蘆曉帆
    新中醫(yī) 2024年6期
    關(guān)鍵詞:靶點(diǎn)西藥通路

    付子堅(jiān),李建生,田燕歌,趙鵬,燕苗苗,蘆曉帆

    1. 河南中醫(yī)藥大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院,河南 鄭州 450011

    2. 河南中醫(yī)藥大學(xué)呼吸系統(tǒng)疾病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 鄭州 450046

    3. 河南中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,河南 鄭州 450046

    慢性阻塞性肺疾?。–OPD)是一種以呼吸道持續(xù)氣流受限為特征的進(jìn)行性發(fā)展的肺部疾病,其肺部癥狀急性惡化階段又被稱為COPD 急性加重期(AECOPD)。感染是AECOPD 最主要的誘因,是造成COPD 患者肺功能惡化和氣道重塑的關(guān)鍵因素,也是導(dǎo)致患者死亡的重要原因。AECOPD 歸屬于中醫(yī)學(xué)肺脹范疇。有學(xué)者對AECOPD 中醫(yī)證候分布規(guī)律進(jìn)行文獻(xiàn)研究與臨床調(diào)查研究,得出痰熱壅肺型為AECOPD 的最常見證型[1-2]。通塞顆粒是河南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院的院內(nèi)制劑,由葶藶子、地龍、浙貝母等組成,具有清熱滌痰活血、宣肺降氣平喘等作用。經(jīng)臨床研究證實(shí),該藥物治療痰熱壅肺型AECOPD 具有良好療效,可以有效改善患者的通氣功能和血?dú)夥治鼋Y(jié)果,減少肺部炎癥,促進(jìn)炎性分泌物的吸收[3-4]。團(tuán)隊(duì)前期研究表明,通塞顆粒-補(bǔ)肺益腎方序貫治療AECOPD 可有效減輕急性炎癥滲出、改善AECOPD 大鼠肺組織病理損傷,且其作用機(jī)制與調(diào)控Toll 樣受體4(TLR4)/核因子-κB(NF-κB)信號通路有關(guān)[5-6]。本研究在此基礎(chǔ)上運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù),通過構(gòu)建中藥復(fù)方調(diào)控網(wǎng)絡(luò),篩選出通塞顆粒治療AECOPD 的潛在靶標(biāo),并對富集分析出的通路及關(guān)鍵蛋白加以實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,為后續(xù)研究提供新思路。具體研究流程如圖1 所示。

    圖1 研究流程示意圖

    1 實(shí)驗(yàn)材料

    1.1 實(shí)驗(yàn)動物SPF 級SD 大鼠50 只,雄性,6~8 周齡,體質(zhì)量(200±20)g,動物質(zhì)量合格證號:110011211105823815,購于北京維通利華實(shí)驗(yàn)動物技術(shù)有限公司,許可證號:SCXK(京)2016-0011。動物飼養(yǎng)于河南中醫(yī)藥大學(xué)動物實(shí)驗(yàn)室[SYXK(豫)2020-0004]。本研究通過河南中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動物福利倫理審查委員會審查批準(zhǔn)(倫理審查批號為YFYDW2021028)。

    1.2 藥物、試劑及儀器

    1.2.1 藥物通塞顆粒(河南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院院內(nèi)制劑),鹽酸莫西沙星片(拜耳醫(yī)藥保健有限公司,國藥準(zhǔn)字J20150015,規(guī)格:0.4 g×3 片),硫酸沙丁胺醇片(江蘇亞邦愛普森藥業(yè)有限公司,國藥準(zhǔn)字H32024535,規(guī)格:2mg×100 片)。

    1.2.2 試劑肺炎克雷伯桿菌(46117-5a1),購于中國醫(yī)學(xué)細(xì)菌保藏管理中心(CMCC);紅旗渠過濾嘴烤煙型香煙(河南中煙工業(yè)有限責(zé)任公司);蘇木素-伊紅(HE)染液套裝(Servicebio 武漢賽維爾生物科技有限公司);大鼠腫瘤壞死因子-α(TNF-α)酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)試劑盒(ELISA Kit)、大鼠白細(xì)胞介素-17A(IL-17A)ELISA Kit 均購自武漢伊萊瑞特生物科技股份有限公司;NF-κB P65 抗體(以下簡寫為P65)(貨號:GTX102090)、NF-κB P65(phospho Ser536)抗體(以下簡寫為 P -P65)(貨號:GTX133899),絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶B(AKT)抗體[N3C2], Internal(以下簡寫為 AKT)(貨號:GTX121937),AKT(phospho Ser473)抗體(以下簡寫為P-AKT)(貨號:GTX128414)、兔抗絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)/絲裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)多克隆抗體[細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(ERK1/2),以下簡寫為MAPK1/3](貨號:GTX134462)、ERK1(phospho Thr202/Tyr204)+ERK2(phospho Thr185/Tyr187)抗體[HL173](以下簡寫為P-MAPK1/3)(貨號:GTX635617)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)抗體(貨號:GTX28245)均購自美國GENETEX,INC.;腫瘤抑制蛋白53(TP53)抗體(貨號:YT3528)購自美國ImmunoWay Biotechnology Company;辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記山羊抗鼠二抗(貨號:SA00001-1)、HRP 標(biāo)記山羊抗兔二抗(貨號:SA00001-2)均購于武漢三鷹技術(shù)有限公司。RIPA 裂解液(貨號:20-188)購自美國EMD MILLIPORE CORPORATION;BCA 試劑盒(貨號:PC0020)購自北京索萊寶科技有限公司;10%SDS-PAGE 電泳凝膠試劑盒(貨號:PG112)購自上海雅酶生物醫(yī)藥科技有限公司。

    1.2.3 儀器DSI Buxco 非束縛小動物肺功能測量儀及FinePointe 動物肺功能檢測系統(tǒng)(DATA SCIENCES INTERNATIONAL,INC.,美國);Multiskan GO 全波長酶標(biāo)儀及D-37520 臺式高速冷凍離心機(jī)(賽默飛科技中國有限公司);TissueLyser Ⅱ樣品破碎系統(tǒng)(QIAGEN,德國);DM6000 B 光學(xué)顯微鏡及LAS V4.7 照相系統(tǒng)(Leica,德國);Image-pro plus(IPP)6.0 專業(yè)圖像分析系統(tǒng)(Media Cybernetics,美國)。

    2 研究方法

    2.1 數(shù)據(jù)庫與軟件①數(shù)據(jù)庫:中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(TCMSP)(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)、中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫(http://www.organchem.csdb.cn/scdb/default.htm)、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(UniProt)(https://www.uniprot.org/)、人類基因(GeneCards)數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)、在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)系統(tǒng)(OMIM)數(shù)據(jù)庫(https://www.omim.org/)、人類疾病相關(guān)基因(DisGeNET)數(shù)據(jù)庫(https://www.disgenet.org/)、人類疾?。∕alaCards)數(shù)據(jù)庫(https://www.malacards. org/)、 DrugBank 數(shù)據(jù)庫(https://go.drugbank.com/)、微生信在線生物信息學(xué)分析、可視化云平臺(http://www. bioinformatics. com. cn/)、STRING 數(shù)據(jù)庫(https://cn.string-db.org/)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(RSCB PDB)(https://www.rcsb.org/)、有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)(Pub-chem)數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)。②軟件:Cytoscape 3.8.1軟件,R 4.1.3 軟件,ChemoBio 3D Ultra 17.0 軟件;Pymol 軟件,AutoDockTool 1.5.6 軟件,Vina 軟件。

    2.2 通塞顆?;钚猿煞趾推鋵?yīng)靶點(diǎn)篩選將通塞顆粒中的10 味中藥(矮地茶、赤芍、大黃、地龍、麻黃、麥冬、人參、石菖蒲、葶藶子、浙貝母)分別錄入TCMSP 數(shù)據(jù)庫,根據(jù)TCMSP 參數(shù)信息,將口服利用度(OB)≥20% 且類藥性質(zhì)(DL)≥0.1 作為篩選標(biāo)準(zhǔn),獲取各中藥活性成分及其對應(yīng)靶點(diǎn),并從Uniprot 數(shù)據(jù)庫對靶點(diǎn)名稱進(jìn)行注釋,轉(zhuǎn)換為基因編號ID(Gene Symbol ID)。其中地龍、麥冬2 味中藥并未被TCMSP 數(shù)據(jù)庫收錄,將其錄入中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫,獲得2 味中藥的化學(xué)成分物質(zhì)數(shù)字識別號碼(CAS 號),再從TCMSP 數(shù)據(jù)庫根據(jù)參數(shù)信息,將OB≥20%且DL≥0.1%作為篩選標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)一步篩選。

    2.3 疾病基因篩選以“acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease”為關(guān)鍵詞,通過GeneCards、 OMIM、 DisGeNET、 MalaCards、 Drug-Bank 5 個數(shù)據(jù)庫,檢索獲取與AECOPD 相關(guān)的基因。

    2.4 共同靶點(diǎn)獲取和網(wǎng)絡(luò)圖的繪制通過微生信在線生物信息學(xué)分析、可視化云平臺繪制韋恩圖(Venn圖),獲得通塞顆粒治療AECOPD 的交集靶點(diǎn)。將相關(guān)數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.8.1 軟件構(gòu)建中藥-有效成分-靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)圖,并根據(jù)網(wǎng)絡(luò)圖平均度值(degree值)篩選出核心活性成分。

    2.5 蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及核心靶點(diǎn)篩選將2.4 項(xiàng)中篩選得到的交集靶點(diǎn)信息導(dǎo)入STRING 數(shù)據(jù)庫,從多種蛋白質(zhì)(multiple proteins)中導(dǎo)入選中靶點(diǎn),有機(jī)體(organism)選為“智人(homo sapiens)”,以最高置信度(highest confidence)>0.900作為篩選條件,下載交集靶點(diǎn)的PPI 網(wǎng)絡(luò)TSV 文件。將下載文件導(dǎo)入Cytoscape 3.8.1 軟件構(gòu)建PPI 網(wǎng)絡(luò)圖,根據(jù)平均度值(degree 值)和平均中介中心度值(betweenness 值)篩選核心靶點(diǎn)。

    2.6 相關(guān)通路富集分析運(yùn)用R 語言軟件中的“org.Hs.eg.db”數(shù)據(jù)包將核心靶點(diǎn)轉(zhuǎn)化為基因ID,導(dǎo)入R 4.1.3 軟件,設(shè)定P-value<0.05、Q-value<0.05,利用“BiocManager”等軟件包對關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)進(jìn)行基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,取前30 項(xiàng)構(gòu)建柱狀圖。并將KEGG 通路富集分析得到的數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.8.1軟件進(jìn)一步構(gòu)建靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖。

    2.7 關(guān)鍵活性成分與核心靶點(diǎn)分子對接將2.4、2.5 項(xiàng)中degree 值排在前5 的活性成分和degree 值排在前6 的核心靶點(diǎn)分別進(jìn)行對接。將活性成分的英文名稱導(dǎo)入Pub-chem 數(shù)據(jù)庫,下載其相應(yīng)的小分子配體(2D 結(jié)構(gòu),sdf 格式),使用ChemoBio 3D Ultra 17.0 軟件轉(zhuǎn)格式(3D 結(jié)構(gòu),mol2 格式);將核心靶點(diǎn)導(dǎo)入U(xiǎn)niport 數(shù)據(jù)庫,限定物質(zhì)來源設(shè)定為homo sapiens,將得到的條目導(dǎo)入RSCB PDB 數(shù)據(jù)庫,下載其相應(yīng)的基因蛋白(3D 結(jié)構(gòu),pdb 格式),利用AutoDockTool 1.5.6 軟件去水加氫轉(zhuǎn)格式(3D 結(jié)構(gòu),pdbqt 格式),并設(shè)置保存活性口袋的數(shù)據(jù)參數(shù)(grid.gpf 格式)。運(yùn)用Vina 軟件對活性成分和核心靶點(diǎn)進(jìn)行分子對接,結(jié)果通過Pymol 軟件進(jìn)行可視化展示。

    2.8 通塞顆粒治療AECOPD 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證

    2.8.1 模型制備與分組干預(yù)采用隨機(jī)數(shù)字表法將50 只大鼠隨機(jī)分為對照組、模型組、中藥組、西藥組、聯(lián)合組。每組10 只。除對照組外,其余各組通過香煙和肺炎克雷伯桿菌刺激誘導(dǎo)制備AECOPD大鼠模型[7-8]。并于急性加重前2 d(Day-1、0)及其后4 d(Day 2~5)給予灌胃治療,每天2 次。藥物灌胃劑量采用等效劑量系數(shù)換算公式計(jì)算,具體公式為:D大鼠=D人×(HI大鼠/HI人)×(W大鼠/W人)2/3(其中D:劑量;HI:體型系數(shù);W:體質(zhì)量),具體給藥方案見表1。對照組、模型組均予同體積0.9%氯化鈉溶液。

    表1 各組大鼠給藥方案

    2.8.2 肺功能檢測治療結(jié)束后,用DSI Buxco 非束縛小動物肺功能測量儀以及FinePointe 動物肺功能檢測系統(tǒng)檢測大鼠的肺功能指標(biāo),包括0.3 s 用力呼氣容積(FEV0.3)、用力肺活量(FVC)、0.3 s 用力呼氣容積與用力肺活量的比值(FEV0.3/FVC)、呼氣流量峰值(PEF)。

    2.8.3 血清TNF-α、IL-17 含量麻醉大鼠,腹主動脈取血。取上清,采用ELISA 法檢測血清中TNF-α、IL-17 的含量。

    2.8.4 肺組織病理形態(tài)學(xué)觀察處死大鼠后,結(jié)扎未灌洗的左肺,取肺組織,經(jīng)脫水、透明、浸蠟、包埋、切片后進(jìn)行HE 染色并封片,在光學(xué)顯微鏡100 倍及200 倍光鏡下觀察切片。

    2.8.5 肺組織中P-P65、P65、P-AKT、AKT、PMAPK1/3、MAPK1/3 以及TP53 的蛋白表達(dá)在肺組織中加入RIPA 裂解液,剪碎打成勻漿,用離心機(jī)離心后提取蛋白質(zhì),通過BCA 試劑盒經(jīng)全波長酶標(biāo)儀進(jìn)行蛋白質(zhì)定量,經(jīng)10% SDS-PAGE 電泳凝膠分離,轉(zhuǎn)膜、封閉、抗體孵育后,用IPP 6.0 專業(yè)圖像分析系統(tǒng)進(jìn)行條帶掃描,測定各目的條帶及內(nèi)參GAPDH 的灰度值,計(jì)算比值,求得目的蛋白的相對表達(dá)含量。

    3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

    應(yīng)用SPSS 22.0 軟件統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。計(jì)量資料數(shù)據(jù)服從正態(tài)分布,以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,多組間比較采用單因素方差分析。方差齊時,多重比較采用LSD 法;方差不齊時,多重比較采用Dunnett T3 法。計(jì)量資料數(shù)據(jù)不服從正態(tài)分布,則采用非參數(shù)檢驗(yàn)進(jìn)行比較。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    4 研究結(jié)果

    4.1 通塞顆?;钚猿煞旨捌漕A(yù)測靶點(diǎn)篩選通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫收集、基于藥物代謝動力學(xué)(ADME)參數(shù)(OB≥20%、DL≥0.1)篩選出通塞顆粒的活性成分共219 個,對應(yīng)預(yù)測靶點(diǎn)1 351 個,刪去在UniProt 數(shù)據(jù)庫中不能匹配基因名的靶點(diǎn),去重后,獲得通塞顆粒有效成分172 個,對應(yīng)預(yù)測靶點(diǎn)306 個。各中藥的活性成分個數(shù)和其對應(yīng)的靶點(diǎn)個數(shù)見表2。部分中藥活性成分名稱見表3。

    表2 通塞顆?;钚猿煞謧€數(shù)和靶點(diǎn)個數(shù)(去重)

    表3 通塞顆粒治療AECOPD 的活性成分名稱

    4.2 AECOPD 疾病靶點(diǎn)收集將從各數(shù)據(jù)庫檢索AECOPD 英文全稱獲取的疾病相關(guān)靶點(diǎn)與通塞顆粒的預(yù)測靶點(diǎn)結(jié)合,基于微生信在線生物學(xué)分析、可視化平臺制圖分析。數(shù)據(jù)庫疾病靶點(diǎn)個數(shù):GeneCard 數(shù)據(jù)庫1 993 個,OMIM 數(shù)據(jù)庫173 個,DrugBank 數(shù)據(jù)庫42 個,DisGeNET 數(shù)據(jù)庫63 個,MalaCards 數(shù)據(jù)庫97 個,見圖2。通塞顆粒與AECOPD 的交集靶點(diǎn)共200 個,見圖3。

    圖2 AECOPD 疾病相關(guān)靶點(diǎn)Venn 圖

    圖3 通塞顆粒-AECOPD 靶點(diǎn)交集Venn 圖

    4.3 通塞顆?;钚猿煞峙cAECOPD 交集靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建使用Cytoscape 3.8.1 軟件構(gòu)建通塞顆粒的活性成分與AECOPD 交集靶點(diǎn)的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖(見圖4)。在網(wǎng)絡(luò)中通過degree 值和betweenness 值篩選得到前5 名關(guān)鍵活性成分,分別為槲皮素、芹菜素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇,見表4。

    表4 關(guān)鍵活性成分篩選

    圖4 通塞顆?;钚猿煞?AECOPD 交集靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖

    4.4 核心靶點(diǎn)篩選將從STRING 數(shù)據(jù)庫篩選得到的162 個交集靶點(diǎn)信息導(dǎo)入Cytoscape 3.8.1 軟件進(jìn)行處理,其PPI 關(guān)系見圖5。將靶點(diǎn)根據(jù)degree 值和betweenness 值的大小進(jìn)行排列,最終篩選得到前6 名核心靶點(diǎn),分別為TP53、MAPK3、MAPK1、RELA 原癌基因(RELA)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶1(AKT1)、腫瘤壞死因子(TNF),見表5。

    表5 核心靶點(diǎn)篩選

    圖5 中藥-疾病共同靶點(diǎn)PPI 網(wǎng)絡(luò)圖

    4.5 GO 富集分析及KEGG 通路富集分析將交集靶點(diǎn)進(jìn)行GO 富集分析和KEGG 通路富集分析。GO富集分析:將“P-value<0.05、Q-value<0.05”作為篩選條件,得到總條目2 883 個,其中生物過程(BP)2 566 條,細(xì)胞組成(CC)108 條,分子功能(MF)209條,每組選取前10 條生成可視化三合一柱狀圖,見圖6。

    圖6 GO 富集分析柱狀圖

    KEGG 通路富集分析:關(guān)鍵靶點(diǎn)富集在178 條通路上,根據(jù)P值和Q值排序,選取前30 條繪制柱狀圖,見圖7。查閱文獻(xiàn)并結(jié)合P值和Q值,篩選出與AECOPD 密切相關(guān)的TNF、IL-17、MAPK、NF-κB、磷脂酰肌醇3-激酶(P13K)-AKT、缺氧誘導(dǎo)因子1(HIF-1)通路,見圖8。

    圖8 交集靶點(diǎn)-信號通路圖

    4.6 分子對接將關(guān)鍵活性成分槲皮素、芹菜素、木犀草素、山奈酚、β-谷甾醇與核心靶點(diǎn)TP53、MAPK3、MAPK1、RELA、AKT1、TNF 進(jìn)行分子對接。結(jié)合能(Binding energy)體現(xiàn)配體與受體之間結(jié)合的可能性,能值越低表示配體與受體之間親和力越高,構(gòu)象越穩(wěn)定,在自然狀態(tài)下更易結(jié)合。結(jié)合能<-5.0 kcal/mol 表明有較好的結(jié)合活性;結(jié)合能<-7.0 kcal/mol 表明具有強(qiáng)烈的結(jié)合活性[9]。結(jié)果顯示,對接均具有較好的結(jié)合活性,見圖9。具體分子對接見圖10。

    圖9 分子對接自由結(jié)合能熱圖

    圖10 中藥關(guān)鍵活性成分與核心靶點(diǎn)對接圖

    4.7 動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果

    4.7.1 各組大鼠肺組織病理表現(xiàn)對照組大鼠:支氣管結(jié)構(gòu)基本完整,肺血管壁未見明顯增厚,肺泡結(jié)構(gòu)基本完整,少量散在的炎性細(xì)胞浸潤。模型組大鼠:支氣管上皮細(xì)胞脫落,杯狀細(xì)胞增生,大量炎性細(xì)胞浸潤,肺血管壁增厚,肺泡間隔變窄并斷裂,融合成較大的囊腔。中藥組大鼠:支氣管結(jié)構(gòu)的破壞、炎性細(xì)胞的浸潤、肺泡間的融合均較用藥前改善,但肺血管壁仍可見明顯增厚。西藥組大鼠:支氣管病理學(xué)變化與中藥組相當(dāng)。聯(lián)合組大鼠:支氣管上皮細(xì)胞的破壞程度較模型組明顯減輕,肺血管壁輕微增厚,炎性細(xì)胞的浸潤及肺泡融合擴(kuò)張明顯改善,治療效果最好。見圖11。

    4.7.2 各組大鼠肺功能指標(biāo)比較見表6。模型組FVC、FEV0.3、FEV0.3/FVC、PEF 值均較對照組降低(P<0.05)。中藥組、西藥組以及聯(lián)合組的FVC、FEV0.3、PEF 值均較模型組升高(P<0.05);聯(lián)合組FEV0.3/FVC 值較模型組升高(P<0.05)。中藥組FVC、FEV0.3、FEV0.3/FVC、PEF 值與西藥組比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。聯(lián)合組FVC、PEF 值均較中藥組及西藥組升高(P<0.05);聯(lián)合組FEV0.3較西藥組升高(P<0.05)。

    表6 各組大鼠肺功能指標(biāo)比較(±s)

    注:①與對照組比較,P<0.05;②與模型組比較,P<0.05;③與中藥組比較,P<0.05;④與西藥組比較,P<0.05

    樣本量組 別對照組模型組中藥組西藥組聯(lián)合組6 6 6 6 6 FVC(mL)18.03±2.24 10.23±1.40①13.07±1.86①②13.10±1.38①②16.28±0.97②③④FEV0.3(mL)17.13±1.96 9.16±1.40①12.83±1.98①②12.47±1.46①②14.71±1.80①②④FEV0.3/FVC(%)95.55±1.01 85.08±1.61①90.77±4.03 90.44±5.94 93.50±2.82②PEF(mL/s)92.10±2.77 71.59±1.19①81.19±0.89①②80.96±1.05①②86.94±0.80①②③④

    4.7.3 各組大鼠血清TNF-α、IL-17 含量比較見表7。模型組、中藥組、西藥組、聯(lián)合組的血清TNF-α、IL-17 含量均高于對照組(P<0.05);中藥組、西藥組及聯(lián)合組的TNF-α、IL-17 含量均低于模型組(P<0.05);聯(lián)合組血清TNF-α、IL-17 含量均低于中藥組、西藥組(P<0.05)。中藥組TNF-α 含量高于西藥組(P<0.05),IL-17 含量低于西藥組(P<0.05)。

    表7 各組大鼠血清TNF-α、IL-17 含量比較(±s) pg/mL

    表7 各組大鼠血清TNF-α、IL-17 含量比較(±s) pg/mL

    注:①與對照組比較,P<0.05;②與模型組比較,P<0.05;③與中藥組比較,P<0.05;④與西藥組比較,P<0.05

    樣本量組 別對照組模型組中藥組西藥組聯(lián)合組6 6 6 6 6 TNF-α 11.84± 1.37 35.63± 0.76①31.26± 0.45①②27.92± 1.42①②③24.50± 1.23①②③④IL-17 17.67± 1.09 44.10± 2.17①23.84± 0.75①②26.29± 0.71①②③21.08± 0.62①②③④

    4.7.4 各組大鼠肺組織蛋白表達(dá)含量比較見表8、圖12。模型組肺組織P-P65/P65、P-AKT/AKT、P-MAPK1/3/MAPK1/3 和TP53/GAPDH 蛋白表達(dá)含量均高于對照組(P<0.05);中藥組、西藥組以及聯(lián)合組上述蛋白的表達(dá)含量均低于模型組(P<0.05);聯(lián)合組上述蛋白的表達(dá)含量均低于中藥組、西藥組(P<0.05)。注:“P”代表磷酸化,“非P”代表非磷酸化。前者代表該蛋白的磷酸化水平,后者代表該蛋白的含量。因很多信號通路的蛋白在受到刺激后,均是通過其磷酸化水平的改變而引起一系列細(xì)胞反應(yīng),所以用磷酸化與非磷酸化的比值來體現(xiàn)各組檢測蛋白的實(shí)際表達(dá)含量。P65、MAPK1/3 及AKT 均是通過磷酸化表達(dá)來證明通路的激活,但TP53 不是此類型,所以用TP53 與內(nèi)參GAPDH 的比值來體現(xiàn)蛋白的表達(dá)含量。

    表8 各組大鼠肺組織蛋白表達(dá)比較(±s)

    表8 各組大鼠肺組織蛋白表達(dá)比較(±s)

    注:①與對照組比較,P<0.05;②與模型組比較,P<0.05;③與中藥組比較,P<0.05;④與西藥組比較,P<0.05

    樣本量組 別對照組模型組中藥組西藥組聯(lián)合組6 6 6 6 6 P-AKT/AKT 0.05±0.02 1.01±0.14①0.50±0.15①②0.43±0.12①②0.11±0.04②③④P-MAPK1/3/MAPK1/3 0.18±0.10 0.98±0.20①0.57±0.30①②0.54±0.16①②0.36±0.11②P-P65/P65 0.08±0.36 1.59±0.34①0.88±0.23①②1.02±0.24①②0.37±0.24①②③④TP53/GAPDH 0.09±0.01 1.41±0.03①0.92±0.12①②0.42±0.03①②③0.29±0.02①②③④

    圖12 各組大鼠肺組織中相關(guān)蛋白條帶圖

    5 討論

    本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對通塞顆粒治療AECOPD 的作用機(jī)制進(jìn)行了分析,并進(jìn)行了動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。動物實(shí)驗(yàn)病理學(xué)及肺功能檢測結(jié)果顯示通塞顆粒可有效改善AECOPD 肺泡融合、血管壁增厚,減輕肺損傷并有助于恢復(fù)呼吸功能。

    網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究結(jié)果顯示,通塞顆粒的關(guān)鍵活性成分是槲皮素、山柰酚、芹菜素、木犀草素和β-谷甾醇,除β-谷甾醇外,其余成分均為天然黃酮。黃酮類化合物具有抗氧化、抗炎、抗菌、調(diào)節(jié)免疫等藥理作用,而抗炎、抗氧化特性使其成為治療肺部炎癥疾病的潛在藥物[10]。有研究表明,槲皮素能通過抑制磷酸二酯酶4(PED-4)、激活cAMP/PKA 信號通路,抑制NF-κB 活化,并可有效減輕氣道炎癥[11-12];在COPD 鼠體模型中,槲皮素可顯著降低TNF-α 表達(dá)水平,抑制肺泡細(xì)胞凋亡,減少肺部損傷,預(yù)防COPD 的急性加重[13]。Chung MJ 等[14]通過實(shí)驗(yàn)證明,山奈酚可以顯著減少哮喘模型小鼠肺泡灌洗液中的炎癥細(xì)胞數(shù)量,改善肺泡充血及氣道壁增厚等急性肺損傷的病理特征;另外,山奈酚還可通過調(diào)節(jié)Nrf2 和NF-κB 信號通路來減少氧化應(yīng)激、炎癥和細(xì)胞凋亡[15]。木犀草素可以通過抑制內(nèi)毒素刺激導(dǎo)致的巨噬細(xì)胞磷酸化,降低IL-6 等炎癥因子的表達(dá)水平,提高肺血管通透性,減輕COPD 患者的肺水腫癥狀,改善肺功能[16-17]。芹菜素碳苷可通過抑制TLR4/瞬時受體電位通道蛋白6(TRPC6)信號通路的激活,減輕脂多糖(LPS)誘導(dǎo)的BALB/c 小鼠急性肺損傷模型的肺部炎癥和免疫毒性[18]。β-谷甾醇是一種天然甾醇,臨床上應(yīng)用以它為主要成分的中藥球蘭治療呼吸道疾病有很好的消炎作用[19];有實(shí)驗(yàn)證明,β-谷甾醇可通過下調(diào)硫氧還蛋白(Trx)/硫氧還蛋白-1(Trx1)激活TP53 表達(dá),誘導(dǎo)A549 肺癌細(xì)胞的凋亡,起到抗癌作用[20]。

    通過中藥-疾疾共同靶點(diǎn)PPI 網(wǎng)絡(luò)圖發(fā)現(xiàn),通塞顆粒治療AECOPD 的核心靶點(diǎn)涉及TP53、MAPK1、MAPK3、TNF、AKT1、RELA。TP53 是人體重要的抑癌因子,其功能為調(diào)控細(xì)胞增殖和凋亡[21];目前有研究已證實(shí)TP53 可通過外源性和內(nèi)源性凋亡途徑,調(diào)控細(xì)胞凋亡[22];TP53 能通過下調(diào)B 淋巴細(xì)胞瘤-2(Bcl-2)及上調(diào)細(xì)胞凋亡促進(jìn)基因Bax 的表達(dá)水平來促進(jìn)細(xì)胞凋亡過程[23];TP53 抑制劑可有效減少COPD大鼠肺泡上皮細(xì)胞的凋亡,減輕肺組織損傷[24-25]。MAPK 作為一種絲裂原活化蛋白激酶,負(fù)責(zé)在細(xì)胞內(nèi)傳遞信號,參與多種炎癥細(xì)胞因子和應(yīng)激信號的傳導(dǎo)[26];MAPK1、MAPK3 均屬于MAPK 家族,可以通過介導(dǎo)炎癥、免疫應(yīng)答、氣道結(jié)構(gòu)、細(xì)胞反應(yīng)等途徑參與哮喘和COPD 的發(fā)生與發(fā)展[27-29]。文獻(xiàn)[30]報(bào)道MAPK1、MAPK3 的激活可以抑制細(xì)胞凋亡。有研究結(jié)果顯示,香煙煙霧提取物(cCSE)誘導(dǎo)的A549 肺癌細(xì)胞MAPK1、MAPK3 磷酸化水平顯著升高,并且增加了肺泡上皮細(xì)胞的凋亡[31]。RELA 是NF-κB 家族的重要成員,RELA/p65 具有激活NF-κB 轉(zhuǎn)錄的功能,當(dāng)NF-κB 被激活,將出現(xiàn)核轉(zhuǎn)位過程,結(jié)合于相關(guān)基因上游的轉(zhuǎn)錄活性調(diào)控元件,促進(jìn)相關(guān)基因mRNA 的轉(zhuǎn)錄,誘導(dǎo)對應(yīng)分子的表達(dá)[32-33]。近年越來越多的研究表明,通過對RELA/P65 翻譯后修飾可以對NF-κB 通路進(jìn)行精準(zhǔn)和復(fù)雜的調(diào)控[34]。臨床研究表明,抑制RELA/P65 的過度活化可以減輕COPD 患者的氣道炎癥反應(yīng),改善肺功能和血?dú)庵笜?biāo)[35]。本研究的GO 富集分析結(jié)果顯示,通塞顆??赡芡ㄟ^調(diào)控LPS 反應(yīng)、氧化應(yīng)激反應(yīng)、絲/蘇氨酸蛋白激酶復(fù)合物、轉(zhuǎn)錄因子活性、DNA-轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合等BP 而發(fā)揮治療AECOPD 的功效。KEGG 通路富集分析結(jié)果表明,通塞顆粒治療AECOPD 主要涉及TNF、IL-17、MAPK、NF-κB、P13K、HIF-1 等多條信號通路。TNF 信號通路是COPD 疾病病理過程中的關(guān)鍵通路,參與多種信號轉(zhuǎn)導(dǎo),主要通過上調(diào)MAPK、ERK、NF-κB 等信號通路來誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡及促進(jìn)炎癥反應(yīng)[36]。TNF 信號通路通過釋放TNF-α 等促炎因子,產(chǎn)生大量炎性介質(zhì),促進(jìn)氣道炎性浸潤,增加血管通透性,形成肺水腫,加重肺損傷[37-38]。有研究證實(shí),TNF-α 廣泛存在于COPD 患者的肺組織中,其升高會引起炎性介質(zhì)的瀑布樣連鎖反應(yīng),從而加重COPD 的病情發(fā)展[39-40]。輔助性T 細(xì)胞17(Th17)是人類輔助性T 細(xì)胞分化出的一類細(xì)胞亞群,主要通過分泌IL-17A 導(dǎo)致炎性因子釋放,促使氣道黏液腺分泌大量黏液,與肺氣腫的形成、氣流阻塞密切相關(guān)[41]。有研究發(fā)現(xiàn),IL-17 可誘導(dǎo)中性粒細(xì)胞的募集,增加COPD 患者支氣管上皮細(xì)胞細(xì)胞間黏附分子-1(ICAM-1)的表達(dá),增強(qiáng)ICAM-1 的黏附作用,并加劇氣道炎癥反應(yīng)[42-43]。HIF-1 信號通路在細(xì)胞代謝、氧化應(yīng)激、損傷修復(fù)等環(huán)節(jié)中發(fā)揮重要作用[44];其由HIF-1α 和HIF-1β 兩種亞基組成異源二聚體,HIF-1α 是內(nèi)源性保護(hù)機(jī)制的始動因子,也是P13KAKT 信號通路的下游因子[45]。COPD 患者普遍存在缺氧的臨床表現(xiàn),在缺氧條件下,P13K-AKT 通路被激活,AKT 活化,下游蛋白mTOR 磷酸化,促使HIF-1α蛋白合成,以應(yīng)對低氧環(huán)境,改善氣道缺血、缺氧狀態(tài)[46]。在PI3K-AKT 經(jīng)典信號通路中,AKT 是處于PI3K 下游的關(guān)鍵蛋白,在激活后,可以通過各種下游因子的磷酸化來進(jìn)行細(xì)胞調(diào)控[47];該通路上調(diào)會激活NF-κB 上游抑制蛋白κB 抑制因子激酶(IKK)及NF-κB 抑制蛋白(IKB),使后者被泛素化降解,繼而激活NF-κB 信號通路,引起TNF-α 和IL-17 等多種炎癥因子的釋放[48-49]。另外,NF-κB 信號通路通過調(diào)節(jié)呼吸道細(xì)胞因子活性,增強(qiáng)促炎分子分泌,從而加重COPD[50]。因此許多藥物通過抑制NF-κB 信號通路的轉(zhuǎn)導(dǎo),從而起到抗炎作用,延緩COPD 的發(fā)展[51-52]。本研究動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果顯示,通塞顆??捎行抡{(diào)TP53、P-P65、P-AKT、P-MAPK1/3 蛋白表達(dá),減輕炎癥反應(yīng)和氧化應(yīng)激反應(yīng),減少細(xì)胞凋亡,起到保護(hù)肺黏膜的作用。

    綜上所述,通塞顆粒治療AECOPD 是一個涉及多成分、多靶點(diǎn)、多通路的過程。動物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果顯示相較于模型組,通塞顆??娠@著下調(diào)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)中篩選出的核心靶點(diǎn)蛋白表達(dá),減輕炎癥反應(yīng),緩解肺損傷,起到治療AECOPD 的功效。本研究系統(tǒng)地闡釋了通塞顆粒治療AECOPD 的潛在活性成分、核心靶點(diǎn)以及相關(guān)通路,為后續(xù)深入驗(yàn)證和探討通塞顆粒治療AECOPD 的分子機(jī)制提供了基礎(chǔ)和思路。

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