趙 耀,邢國(guó)鋒,蘇帆帆,高 攀,彭 健,吳自豪,吳 靜
[1.塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院/新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木動(dòng)物疫病診斷與防控工程實(shí)驗(yàn)室,新疆 阿拉爾 843300;2.新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)第九師農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所(畜牧科學(xué)研究所),新疆 額敏 834601;3.塔里木大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆 阿拉爾 843300]
大腸桿菌是人和動(dòng)物正常腸道菌群的成員之一。 通常,寄居于腸道的大腸桿菌不具有致病性,但當(dāng)致病性大腸桿菌侵入或大腸桿菌寄生部位發(fā)生改變時(shí),可引起宿主腹瀉、胃腸道感染、尿路感染和乳腺炎等多種疾病[1]。 在奶牛生產(chǎn)上,致病性大腸桿菌可隨母牛乳汁進(jìn)入犢牛胃腸道, 引起犢牛腹瀉,造成經(jīng)濟(jì)損失。
目前, 抗菌藥物療法仍是臨床上治療細(xì)菌感染性疾病的主要方法,但細(xì)菌耐藥性產(chǎn)生與擴(kuò)散、病原菌在人畜間的水平傳播以及新型抗菌藥物研發(fā)難度大等問題, 使得抗菌藥物的應(yīng)用受到巨大限制。 大腸桿菌產(chǎn)生的超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended-spectrum beta-lactamases,ESBLs)可水解含β-內(nèi)酰胺環(huán)的抗菌藥物,是介導(dǎo)大腸桿菌對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物特別是頭孢菌素類抗菌藥物、單酰胺酶類抗菌藥物以及青霉素耐藥的主要機(jī)制,具有廣泛的水解酶活性[2]。 產(chǎn)ESBLs 的臨床菌株不僅對(duì)β-內(nèi)酰胺類藥物耐藥,而且還對(duì)氨基糖苷類藥物、氟喹諾酮類藥物、多西環(huán)素、氟苯尼考等耐藥,表現(xiàn)出多重耐藥特性[3]。 ESBLs 編碼基因包括TEM、SHV、CTX-M、OXA 和KPC 基因,均可編碼產(chǎn)生絲氨酸β-內(nèi)酰胺酶[4]。在過去的十幾年中,CTX-M 取代TEM 和SHV 成為流行最為廣泛的ESBLs 編碼基因之一, 成為介導(dǎo)革蘭陰性菌多重耐藥的主要因素[5]。 研究表明,大腸桿菌中攜帶的CTX-M 基因分為5 個(gè)亞型(CTX-M-1G、CTX-M-2G、CTX-M-8G、CTX-M-9G 和CTX-M-25G)[6],較為常見的是CTX-M-1G 和CTX-M-9G。 前人研究發(fā)現(xiàn),CTX-M 型ESBLs 耐藥基因可以通過質(zhì)粒、整合子、轉(zhuǎn)座子等可移動(dòng)遺傳元件,在質(zhì)粒與染色體間,或從一個(gè)質(zhì)粒到另一個(gè)質(zhì)粒,或從一種細(xì)菌到另一種細(xì)菌進(jìn)行轉(zhuǎn)移, 具有復(fù)雜的遺傳傳播背景[7-9],可在人畜間進(jìn)行水平傳播,給世界各地的公共衛(wèi)生安全和動(dòng)物食品生產(chǎn)安全造成嚴(yán)重威脅和重大經(jīng)濟(jì)損失。
目前已在新疆維吾爾自治區(qū)的牛、羊、駱駝、馬、豬、禽和寵物源大腸桿菌中檢測(cè)到CTX-M 型ESBLs 耐藥基因,包括CTX-M-1G 和CTX-M-9G等亞型。 但關(guān)于塔額墾區(qū)牛腹瀉樣本中大腸桿菌攜帶CTX-M 型耐藥基因的流行情況報(bào)道較少。塔額墾區(qū)作為新疆維吾爾自治區(qū)重要的牛養(yǎng)殖地區(qū)之一,攜帶CTX-M 型耐藥基因的大腸桿菌在牛養(yǎng)殖中的潛在危害不容忽視。因此,本研究從新疆維吾爾自治區(qū)塔額墾區(qū)的牛腹瀉糞便中分離大腸桿菌,對(duì)其進(jìn)行分子分型、藥敏試驗(yàn)、CTX-M 型ESBLs 鑒定、耐藥基因檢測(cè)、毒力基因檢測(cè)和生物被膜形成能力檢測(cè),以期為CTX-M 型大腸桿菌引起的牛感染性疾病的臨床防治提供基礎(chǔ)試驗(yàn)數(shù)據(jù)。
1.1.1 樣品采集與菌株
從新疆維吾爾自治區(qū)塔額墾區(qū)某牛場(chǎng)采集16 份(約50 g/份)新鮮牛腹瀉糞樣,置無菌管中于4 ℃保存,低溫運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行處理。
大腸桿菌ATCC 25922 和表皮葡萄球菌ATCC 35984 均由新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木動(dòng)物疫病診斷與防控工程實(shí)驗(yàn)室保存。
1.1.2 主要試劑和儀器
PCR 引物、Taq PCR Master Mix(2×)試劑盒,購自生工生物工程(上海)股份有限公司;藥敏紙片,購自溫州市泰康生物科技有限公司;胰蛋白胨大豆瓊脂/液體培養(yǎng)基(tryptic soy agar,TSA;tryptic soy broth,TSB)、 水解酪蛋白胨瓊脂/液體培養(yǎng)基(Mueller-Hinton agar,MHA;Mueller-Hinton broth,MHB)、麥康凱瓊脂培養(yǎng)基(MacConkey agar)、伊紅美蘭瓊脂培養(yǎng)基(eosin-methylene blue agar),購自青島海博生物科技有限公司;EasyPureRBacteria Genomic DNA Kit, 購自北京全式金生物科技有限公司。 PCR 試驗(yàn)所用引物合成及測(cè)序工作由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
PCR 儀、 凝膠成像系統(tǒng)、 電泳儀, 購自Bio-Rad 公司;超凈工作臺(tái),購自上海博訊醫(yī)療生物儀器股份有限公司;移液器,購自Eppendorf 公司;高速冷凍離心機(jī),購自Thermo Scientific 公司;電子天平,購自奧豪斯儀器(上海)有限公司;恒溫培養(yǎng)振蕩器,購自上海智城分析儀器制造有限公司;光學(xué)顯微鏡,購自Zeiss 公司;全波長(zhǎng)酶標(biāo)儀,購自Gene Company Limited 公司。
1.2.1 大腸桿菌的分離鑒定
用接種環(huán)挑取樣品至TSB 中過夜培養(yǎng), 劃線接種于麥康凱瓊脂培養(yǎng)基上,然后挑取圓形、光滑的玫紅色菌落劃線接種于伊紅美蘭瓊脂培養(yǎng)基上, 將呈黑色金屬光澤的菌落劃線接種在TSA 上進(jìn)行純化。純化后的菌株進(jìn)行革蘭染色鏡檢,將鏡下觀察呈短直桿狀的粉紅色菌株作為疑似大腸桿菌菌株。 利用PCR 方法對(duì)疑似菌株進(jìn)行大腸桿菌特 異 性 基 因phoA 擴(kuò) 增 檢 測(cè) (phoA F:GTGACAAAAGCCCGGACACCATAAATGCC;phoA R:TACACTGTCATTACGTTGCGGATTTGGCGT)[10]。將phoA 基因擴(kuò)增陽性的菌株進(jìn)行16S rDNA 擴(kuò)增(27 F:CCAGGCAAAGAGTTTATGTTGA;1 492 R:GCTATTTCCCTGCCGATA AGAGA)[11],對(duì)PCR 陽性產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。 16S rDNA 的PCR 擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸5 min。將分離菌株的16S rDNA 序列在NCBI 網(wǎng)站上(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) 與 已 知 序 列 進(jìn) 行BLAST 比對(duì),確定菌株種屬。
1.2.2 分子分型(系統(tǒng)發(fā)育群和脂多糖核心型)
參照Clermont 等[12]報(bào)道的方法和判斷標(biāo)準(zhǔn),對(duì)chuA、yiaA 和TspE4.C2 基因進(jìn)行三重PCR 檢測(cè),根據(jù)PCR 檢測(cè)結(jié)果判定大腸桿菌的系統(tǒng)發(fā)育群。 PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性30 s,59 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸10 min。
根據(jù)Amor 等[13]發(fā)表的文獻(xiàn)中大腸桿菌脂多糖 (LPS) 核心型PCR 檢測(cè)方法, 檢測(cè)大腸桿菌LPS 核心型。PCR 反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性40 s,55 ℃退火40 s,72 ℃延伸130 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸10 min。
1.2.3 藥物敏感性試驗(yàn)以及耐藥基因檢測(cè)
參考美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)指南(CLSI,2021) 操作要求和判斷標(biāo)準(zhǔn), 以大腸桿菌ATCC 25922 作為質(zhì)量控制菌株, 使用K-B 紙片法對(duì)牛源大腸桿菌進(jìn)行藥物敏感性檢測(cè)。 使用以下藥物進(jìn)行藥敏試驗(yàn),包括β-內(nèi)酰胺類:青霉素G (P,10 μg/片)、 頭孢噻吩 (FUR,30 μg/片)、 美羅培南(MRP,10 μg/片);氟喹諾酮類:諾氟沙星(NOR,10 μg/片)、恩諾沙星(ENR,5 μg/片);利福霉素類:利福平(RD,5 μg/片);四環(huán)素類:替加環(huán)素(TGC,15 μg/片);氨基糖苷類:鏈霉素(S,10 μg/片)、阿米卡星(AK,30 μg/片);氯霉素類:氟苯尼考(FFC,30 μg/片);多肽類:多黏菌素(PB,100 IU/片);磺胺類:復(fù)方新諾明(SXT,25 μg/片)共8 類12 種藥物。參考文獻(xiàn)[14]中多重耐藥菌的判斷標(biāo)準(zhǔn),將對(duì)3 類及以上抗菌藥物同時(shí)耐藥的菌株作為多重耐藥(multiple drug resistance,MDR)菌株。
參考文獻(xiàn)[10]中報(bào)道的大腸桿菌耐藥基因引物序列和擴(kuò)增程序,使用PCR 技術(shù)對(duì)β-內(nèi)酰胺類(TEM、CTX-M、SHV、OXA-1)、 氨基糖 苷類[ant(6′)、aac (6′)-Ib、aph (3′)、rmtA)]、 四 環(huán)素 類(tetB、tetM、tetA)、氯霉素類(cmlA、dfrIA、floR)、磺胺類(sul1、sul2)、氟喹諾酮類(parC、gyrA、gyrB、qnrA)、多重耐藥泵相關(guān)類(marA、oqxA、oqxB)、多肽類(mcr-1)共8 大類24 種耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)。
1.2.4 產(chǎn)ESBLs 大腸桿菌鑒定
根據(jù)美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)指南(CLSI,2021) 標(biāo)準(zhǔn)操作要求和判斷標(biāo)準(zhǔn), 使用頭孢噻肟(CTX)與頭孢噻肟/克拉維酸(TCL)雙紙片法對(duì)牛源大腸桿菌進(jìn)行產(chǎn)ESBLs 表型試驗(yàn)。判斷標(biāo)準(zhǔn)為:若待檢菌株頭孢噻肟抑菌圈≤27 mm, 并在加入克拉維酸后抑菌圈減小5 mm 及以上時(shí),則判定其產(chǎn)ESBLs。
參考文獻(xiàn)[15]中報(bào)道的方法對(duì)產(chǎn)ESBLs 的大腸桿菌進(jìn)行CTX-M 基因擴(kuò)增檢測(cè),PCR 反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸10 min。 參考文獻(xiàn)[16]對(duì)檢測(cè)出CTX-M 基因的牛源大腸桿菌進(jìn)行CTX-M 基因亞型鑒定(CTX-M-1G、CTX-M-2G 和CTX-M-9G 亞型, 引物序列見表1)。 PCR 反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,52 ℃/55 ℃/60 ℃退 火30 s,72 ℃延 伸1 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸10 min。
表1 CTX-M 基因亞型引物信息
1.2.5 毒力基因檢測(cè)
參考文獻(xiàn)[17-20]中報(bào)道的大腸桿菌毒力基因引物序列和PCR 反應(yīng)條件,對(duì)大腸桿菌進(jìn)行耶爾菌素(irp2)、沙門菌素(iroN)、有氧肌動(dòng)蛋白(iucD)、curli 菌毛(csgA)、Ⅰ型菌毛(fimH)、P 菌毛(papG)、輔助性黏附素(aatA)、Ⅳ型菌毛(facG)、熱修飾蛋白(ompA)、血清抗性蛋白(issⅠ)、超氧化物酶歧化酶(sodA)、血清抗性基因(bor)、莢膜多糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(kspM)、表面膜蛋白(yijP)、腦血管內(nèi)皮細(xì)胞侵襲素 (ibeB)、 腦膜炎相關(guān)溫度敏感菌毛(mat)、沉默溶血素(sheA)、溶血素(hlyA)、熱敏性腸毒素(toxA)、耐熱性腸毒素(estA)、志賀菌毒素(sxt1 和sxt2)、空泡化自轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(vat)、大腸桿菌素(cavC)共24 種毒力基因進(jìn)行檢測(cè)。
1.2.6 生物被膜形成能力檢測(cè)
采用結(jié)晶紫染色法半定量檢測(cè)生物被膜,將活化后的待檢菌株接于TSB 液體培養(yǎng)基中過夜培養(yǎng),然后轉(zhuǎn)接至新鮮TSB 中培養(yǎng)至菌液呈云霧狀,用無菌TSB 液體培養(yǎng)基將菌液進(jìn)行1∶200 稀釋,取200 μL 稀釋后的菌液加入96 孔板。 以表皮葡萄球菌ATCC 35984 為陽性對(duì)照, 無菌TSB 液體培養(yǎng)基為空白對(duì)照。 放至恒溫培養(yǎng)箱中37 ℃培養(yǎng)36 h 后用無菌水洗去未黏附細(xì)菌。56 ℃烘干后,每孔加入200 μL 1%結(jié)晶紫染色5 min。 染色完成后用PBS 溶液沖洗掉多余染液, 再次烘干后使用丙醇和乙醇(體積比為2∶8)混合溶液進(jìn)行溶解,并測(cè)定OD570nm值。根據(jù)OD570nm值的不同將生物被膜表型分為4 組:OD570nm≤1ODC, 無成膜能力 (-);1ODC
經(jīng)選擇性分離培養(yǎng)、 革蘭染色鏡檢及分子生物學(xué)鑒定 (PCR 產(chǎn)物目的條帶大小為1 500 bp),本研究從新疆維吾爾自治區(qū)塔額墾區(qū)的16 份牛腹瀉糞便樣品中分離出16 株大腸桿菌,分離率為100%。
系統(tǒng)發(fā)育群分群結(jié)果顯示,16 株大腸桿菌中有14 株(87.50%)屬于B1 群,1 株(6.25%)屬于A群,1 株(6.25%)屬于D 群。 LPS 核心型分析表明,15 株菌(93.75%)屬于R1 型,1 株(6.25%)菌屬于R3 型。
2.3.1 藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果
根據(jù)美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)指南(CLSI,2021)的判斷標(biāo)準(zhǔn),對(duì)16 株牛源大腸桿菌藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行判斷,12 種抗菌藥物的藥敏試驗(yàn)結(jié)果見圖1。 16 株大腸桿菌對(duì)不同抗菌藥物的耐藥率如下:青霉素(P)為100%、氟苯尼考(FFC)為50.00%、多黏菌素(PB)為0、阿米卡星(AK)為37.50%、替加環(huán)素(TGC)為0、恩諾沙星(NOR)為31.25%、復(fù)方新諾明(SXT)為68.75%、鏈霉素(S)為43.75%、諾氟沙星(ENR)為18.75%、頭孢噻吩(FUR)為50.00%、利福平(RD)為68.75%、美羅培南 (MRP) 為0。 16 株牛源大腸桿菌中有12 株(75.00%)為多重耐藥菌株。
圖1 牛源大腸桿菌藥物敏感性試驗(yàn)結(jié)果
2.3.2 耐藥基因檢測(cè)結(jié)果
對(duì)選取的β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類、四環(huán)素類、氯霉素類、磺胺類、氟喹諾酮類、多重耐藥泵相關(guān)類、 多肽類共8 大類24 種耐藥基因進(jìn)行檢測(cè),共檢出17 種耐藥基因,檢出結(jié)果見圖2。 16 株牛源大腸桿菌中,TEM、CTX-M、ant (6′)、sul1、sul2、parC、gyrA 和marA 8 種基因檢出率為100%,aac(6′)-Ib、floR 和gyrB 3 種基因檢出率為93.75%,tetB 基因檢出率為68.75%,cmlA、oqxA 和oqxB 3種基因檢出率為25.00%,tetM 基因檢出率為18.75%,dfrIA 基因檢出率為12.50%。
圖2 牛源大腸桿菌耐藥基因檢出情況
根據(jù)美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)指南(CLSI,2021) 判斷標(biāo)準(zhǔn),CTX 與TCL 雙紙片法篩選結(jié)果顯示,16 株牛源大腸桿菌中有11 株產(chǎn)ESBLs,占比68.75%。 16 株大腸桿菌中14 株 (87.50%)為CTX-M-1G 基因亞型 (見圖3),1 株 (6.25%)為CTX-M-2G 基因亞型,1 株(6.25%)未檢出所屬基因亞型。
圖3 CTX-M-1G 基因亞型電泳圖
從24 種毒力基因中檢測(cè)出12 種毒力基因(見圖4),其中,iroN、ompA、yijP、mat 和sheA 5 種基因檢出率為100%。 其他毒力基因檢出率較低,irp2、iucD、csgA、fimH、issⅠ、sodA、ibeB 基因檢出率 分 別 為 18.75% 、31.25% 、25.00% 、56.25% 、18.75%、87.50%、37.50%。
圖4 牛源大腸桿菌毒力基因檢出情況
16 株牛源大腸桿菌中,有15 株(93.75%)可形成生物被膜,其中,1 株(6.25%)具有強(qiáng)生物被膜形成能力,5 株(31.25%)具有中等生物被膜形成能力,9 株(56.25%)具有弱生物被膜形成能力;1 株(6.25%)沒有生物被膜形成能力。
大腸桿菌宿主范圍廣泛,在人、畜禽和野生動(dòng)物中均可寄生,并可造成宿主疾病。 攜帶CTX-M基因的大腸桿菌在全球各地均有報(bào)道, 對(duì)公共衛(wèi)生安全和畜禽養(yǎng)殖與食品安全存在嚴(yán)重威脅。2003—2012 年,Rao 等[22]在中國(guó)廣東、廣西和四川等多個(gè)省份的患病動(dòng)物(雞、豬和水禽)中檢測(cè)到攜帶CTX-M 基因的大腸桿菌(24.10%,677/2 815),并且其對(duì)環(huán)丙沙星、 慶大霉素和氟苯尼考等具有較高的耐藥率(>70.00%)。 田國(guó)寶等[23]于2006—2008 年從全國(guó)19 個(gè)省市97 個(gè)規(guī)模化豬場(chǎng)分離鑒定602 株大腸桿菌,其中,有57 株(9.50%)產(chǎn)ESBLs,35 株為CTX-M 型ESBLs,檢出率61.40%(35/57)。 鄭紅青等[24]從分離自養(yǎng)殖場(chǎng)的1 273 株大腸桿菌中篩選出產(chǎn)ESBLs 陽性菌181 株(14.20%),其中151 株(83.40%)為CTX-M 型。 本研究中分離自塔額墾區(qū)的16 株牛腹瀉糞便大腸桿菌均攜帶CTX-M 基因, 通過雙紙片法驗(yàn)證,其中11 株(68.75%)具有產(chǎn)ESBLs 表型,高于之前的研究。 16 株大腸桿菌對(duì)青霉素(100%)、 利福平(68.75%)和復(fù)方新諾明(68.75%)等耐藥率較高,并且75.00%(12/16) 的大腸桿菌具有多重耐藥表型,耐藥情況較為嚴(yán)重。但所有菌株均對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物敏感, 這一現(xiàn)象與文獻(xiàn)報(bào)道類似,產(chǎn)ESBLs 大腸桿菌對(duì)碳青霉烯類抗生素的耐受性較低, 其可能原因是ESBLs 通常不能水解頭孢素類(頭孢西丁、頭孢美唑等)和碳青霉烯類(亞胺培南、美羅培南等)抗菌藥物。 不僅如此,15 株大腸桿菌具有生物被膜形成能力, 生物被膜的形成可以提高大腸桿菌對(duì)抗生素的耐受能力, 并且可以協(xié)助病原菌實(shí)現(xiàn)免疫逃避[25]。 本研究表明新疆塔額墾區(qū)攜帶CTX-M 基因的大腸桿菌在牛身上可能廣泛流行存在, 而且對(duì)臨床常用抗生素具有較強(qiáng)的耐受性。
耐藥基因的產(chǎn)生和傳播是導(dǎo)致細(xì)菌耐藥的重要原因之一, 并且由于其產(chǎn)生和傳播速率遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于抗生素的研發(fā)速度, 因此對(duì)耐藥基因的流行情況進(jìn)行檢測(cè), 可為細(xì)菌耐藥性的控制和臨床用藥提供試驗(yàn)數(shù)據(jù)。 本研究檢測(cè)的耐藥基因中,TEM、CTX-M、ant (6′)、sul1、sul2、parC、gyrA、marA、aac(6′)-Ib、floR、gyrB 的檢出率較高,與田國(guó)寶等[23]、楊鑫等[26]、杜向黨等[27]的報(bào)道相似。周萬蓉等[28]從四川省10 個(gè)規(guī)?;i場(chǎng)和16 種野生動(dòng)物糞樣中分離鑒定出的124 株菌中sul1 基因的檢出率為47.60%,sul2 基因的檢出率為17.70%, 本研究中sul1(100.00%,16/16)、sul2(100.00%,16/16)基因檢出率高于其報(bào)道, 但本研究中對(duì)磺胺類藥物的耐藥率(68.75%,11/16)與其報(bào)道的豬源分離菌類似(72.00%,72/100)。 這可能與新疆塔額墾區(qū)在飼養(yǎng)管理和臨床藥物有關(guān), 需要在飼養(yǎng)管理和臨床用藥上對(duì)磺胺類藥物的使用加以規(guī)范。 本研究表明新疆塔額墾區(qū)牛源大腸桿菌可攜帶多種耐藥基因,可能會(huì)造成大腸桿菌耐藥基因的水平傳播,給公共衛(wèi)生安全造成威脅。
致病性大腸桿菌發(fā)揮致病作用需要多種毒力因子的共同協(xié)作,如毒素、菌毛以及毒力島等,其中irp2、tsh、iucD 和issⅠ等基因與大腸桿菌的致病性關(guān)系密切[29]。 呂殿紅等[30]從105 株大腸桿菌中檢出iucD(49.52%)和iss(23.81%)。 與之類似,在本研究中共檢測(cè)到12 種毒力基因, 其中iroN、ompA、yijp、mat、sheA 的檢出率均為100%,其他毒力基因的檢出率較低,并且檢測(cè)到iucD(31.25%)和issⅠ(18.75%)。 這表明新疆塔額墾區(qū)牛源大腸桿菌攜帶多種毒力基因, 這些毒素可在大腸桿菌侵襲宿主與致病時(shí)發(fā)揮重要作用, 存在潛在的致病風(fēng)險(xiǎn)。
分子分型與大腸桿菌的致病性、 免疫原性以及毒力基因分布等特性具有相關(guān)性。研究表明,根據(jù)LPS 核心多糖的不同,LPS 核心型可將大腸桿菌分為R1、R2、R3、R4 和K12,共5 種。 在張宇曦等[31]的研究中R1 為主要核心型,并且R1 核心型大腸桿菌與neuC、cva/cvi、irp2 等毒力基因具有顯著正相關(guān)性, 攜帶毒力基因的數(shù)目高于其他核心型。 與該研究類似,在本研究中的15 株(93.75%)牛源大腸桿菌屬于R1 核心型,只有1 株(6.25%)菌屬于R3 核心型, 并且攜帶irp2 等多種毒力基因。 根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育群分析可將大腸桿菌分為A、B1、B2 和D 群, 其中共生性大腸桿菌主要集中在A 和B1 群, 致病性大腸桿菌主要集中在B2 和D群[32]。 在本研究中,14 株(87.50%)大腸桿菌為B1群,1 株為(6.25%)D 群菌株,1 株為(6.25%)A 群菌株, 表明在新疆塔額墾區(qū)牛腹瀉樣本中存在致病性較強(qiáng)的大腸桿菌, 可能是導(dǎo)致牛腹瀉的主要病原。分子分型可為大腸桿菌的溯源、致病性和耐藥性研究等方面提供支持, 但在本研究中樣本數(shù)量較少,未能進(jìn)行相關(guān)性分析。
本研究調(diào)查了新疆維吾爾自治區(qū)塔額墾區(qū)牛腹瀉源大腸桿菌CTX-M 基因的攜帶情況,并確定其基因亞型主要為CTX-M-1G 基因亞型 (占87.50%)以及CTX-M-2G 基因亞型(占6.25%)。同時(shí),還發(fā)現(xiàn)16 株牛腹瀉源大腸桿菌對(duì)多種臨床常用抗菌藥物的耐藥情況嚴(yán)重,多數(shù)(12/16,75.00%)具有多重耐藥特征。 分子分型、生物被膜、耐藥基因和毒力基因檢測(cè)結(jié)果也表明塔額墾區(qū)牛源大腸桿菌存在潛在致病風(fēng)險(xiǎn), 應(yīng)加強(qiáng)對(duì)其流行情況的監(jiān)測(cè)。