利用AlphaMissense準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)組的錯(cuò)義突變

在人類基因組中觀察到的絕大多數(shù)錯(cuò)義突變具有未知的臨床意義。研究人員開發(fā)了AlphaMissense，這是一種基于AlphaFold的新AI模型，它在人類和靈長(zhǎng)類物種變異群體頻率數(shù)據(jù)庫(kù)上進(jìn)行了微調(diào)，用于預(yù)測(cè)錯(cuò)義突變的致病性。通過(guò)結(jié)合結(jié)構(gòu)背景和進(jìn)化保守性，AlphaMissense在廣泛的遺傳和實(shí)驗(yàn)性基準(zhǔn)測(cè)試中實(shí)現(xiàn)了最先進(jìn)的預(yù)測(cè)，而且完全沒有明確地在此類數(shù)據(jù)上進(jìn)行過(guò)訓(xùn)練?；虻钠骄虏⌒苑?jǐn)?shù)也可以預(yù)測(cè)其細(xì)胞的重要性，能夠識(shí)別現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)方法不足以檢測(cè)的短的必需基因。作為一種研究社區(qū)的資源，科研人員提供了一個(gè)囊括所有可能的人類單個(gè)氨基酸替換預(yù)測(cè)的數(shù)據(jù)庫(kù)，并將89%的錯(cuò)義變異分為可能良性或可能致病兩類。