饒 英 林 穎 王 健 劉國(guó)鋒 張文娥 彭 婷,*
(1貴州大學(xué)農(nóng)學(xué)院/山地植物資源保護(hù)與種質(zhì)創(chuàng)新教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州 貴陽(yáng) 550025;2海南省熱帶特色花木資源生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/海南大學(xué)林學(xué)院,海南 ???570228;3廣州市林業(yè)和園林科學(xué)研究院,廣東 廣州 510405)
三色堇(Viola×wittrockiana)為堇菜科(Violaceae)堇菜屬(Viola)植物,是世界范圍內(nèi)重要的冬春季花壇花卉,具有典型的花瓣色斑性狀,是觀賞植物花色、花斑研究的理想材料。目前國(guó)內(nèi)外對(duì)三色堇花色、花斑的研究主要集中在花色素成分鑒定[1-2]及花青素合成相關(guān)基因的分離與表達(dá)分析等方面[3-4]。
酪氨酸脫羧酶(tyrosine decarboxylase, TyDC)是連接植物初生代謝與次生代謝的初始酶[5],可將底物酪氨酸脫羧形成酪胺[6-8]。在天然藥源植物紅景天(Rhodiola rosea)和地黃(Rehmannia glutinosa)中,TyDC對(duì)紅景天苷和麥角甾苷的合成分別起促進(jìn)作用[9-11]。近期的一些研究認(rèn)為T(mén)yDC 可能與花色形成有關(guān)。如Zhou 等[12]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥TyDC 的作用底物酪氨酸可以誘導(dǎo)花青素的合成,對(duì)酪氨酸降解缺陷突變體fah進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),在突變體中,酪氨酸對(duì)花青素的誘導(dǎo)效果顯著低于野生型,且突變體中花青素合成的結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因表達(dá)量的提升幅度顯著低于野生型,說(shuō)明酪氨酸的降解產(chǎn)物誘導(dǎo)了花青素的積累。本課題組前期在三色堇品種黃色帶花斑中的研究發(fā)現(xiàn),VwTyDC基因在花瓣中的表達(dá)量顯著高于根、莖和葉,并且在色斑區(qū)的表達(dá)量高于非色斑區(qū)[13]。Cui等[2]用酪氨酸對(duì)三色堇非色斑區(qū)進(jìn)行處理,發(fā)現(xiàn)非色斑區(qū)出現(xiàn)了條紋狀的色斑,通過(guò)病毒介導(dǎo)的基因沉默(virusinduced gene silencing, VIGS)技術(shù)沉默VwTyDC基因后,三色堇色斑區(qū)的顏色明顯變淺,說(shuō)明VwTyDC基因可能與花青素的合成有關(guān)。
本課題組在轉(zhuǎn)錄組中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新基因并命名VwTyDC-like,該基因在三色堇花瓣不同區(qū)域存在差異表達(dá)。為進(jìn)一步探究VwTyDC-like基因在三色堇中的精細(xì)表達(dá)模式,本研究克隆獲得VwTyDC-like基因的cDNA 及gDNA 序列,并與VwTyDC進(jìn)行對(duì)比分析。同時(shí),通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技術(shù)分析VwTyDC和VwTyDC-like基因在三色堇不同組織器官、花瓣發(fā)育不同時(shí)期、不同花色品種及其唇瓣不同區(qū)域的表達(dá)模式,以期為探究VwTyDC與VwTyDC-like基因在三色堇中的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ),為三色堇新品種培育及植物花色形成機(jī)理研究提供新的思路和途徑。
以三色堇超級(jí)賓哥(Matrix)系列的不同花色品種,包括黃色(Yellow)、黃色帶花斑(Yellow Blotch)、純藍(lán)色(True Blue)、藍(lán)色帶花斑(Blue Blotch)、白色(White)和白色帶花斑(White Blotch),帝國(guó)巨人Ⅱ(Majestica GiantsⅡ)系列的淡紫色漸變(Lavender Shades)和得大(Delta)系列的紫羅蘭白雙色(Violet & White)(圖1)為供試材料,所有種子均購(gòu)于美國(guó)泛美種子公司。于2021年8月上旬將不同品種的三色堇種子播種在廣州市觀賞植物種質(zhì)資源圃,采用常規(guī)栽培管理措施,待2021 年10 月上旬三色堇進(jìn)入始花期,分區(qū)域和發(fā)育時(shí)期采集不同品種的花瓣進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。
圖1 不同花色的三色堇品種Fig.1 Pansy cultivars with different flower colors
1.2.1 樣品采集 樣品采集分為四組,第一組:采集黃色帶花斑品種的根、莖、葉、花芽、花、幼果和種子用于不同組織器官的表達(dá)分析;第二組:參照Li等[1]的方法將三色堇的花發(fā)育過(guò)程劃分為7個(gè)時(shí)期(S1~S7),采集黃色帶花斑品種7 個(gè)時(shí)期花瓣中心色斑區(qū)(a)與非色斑區(qū)(b)的樣品,用于不同花發(fā)育時(shí)期的表達(dá)分析;第三組:將白色帶花斑和白色2個(gè)品種的唇瓣由內(nèi)向外劃分為5個(gè)區(qū)域(區(qū)域1~5)進(jìn)行采樣(圖1),用于唇瓣不同區(qū)域的表達(dá)分析;第四組:收集5 個(gè)不同花色品種(黃色、純藍(lán)色、藍(lán)色帶花斑、粉紫色漸變和紫羅蘭白雙色)花發(fā)育S7 期中心色斑區(qū)(無(wú)斑品種為中心色斑對(duì)應(yīng)區(qū),a)、非色斑區(qū)(無(wú)斑品種為非色斑對(duì)應(yīng)區(qū),b)及邊緣色斑區(qū)(僅紫羅蘭白雙色品種有此區(qū)域,c)的樣品,用于不同花色三色堇品種在S7期的表達(dá)分析(圖1)。每個(gè)樣品設(shè)置3 個(gè)生物學(xué)重復(fù),于液氮中速凍后,-80 ℃條件下保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 植物核酸提取和cDNA合成 以三色堇的嫩葉或花瓣為材料,采用改良溴化十六烷基三甲胺(cetyl trimethylammonium bromide, CTAB)法提取總DNA,利用EASYspin植物RNA快速提取試劑盒(艾德萊,北京)提取不同品種、時(shí)期及組織品種樣本總RNA,將檢測(cè)合格的RNA 樣品按照Prime ScriptTMRTreagent kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)試劑盒(TaKaRa,大連)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反轉(zhuǎn)錄后的cDNA 樣品置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3VwTyDC-like基因克隆和結(jié)構(gòu)分析 基于黃色帶花斑品種轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)篩選到1 個(gè)VwTyDC-like(Unigene0055670),結(jié)合分離VwTyDC-like基因啟動(dòng)子時(shí)得到的序列,利用Prime 5.0 軟件設(shè)計(jì)特異引物(表1),分別擴(kuò)增cDNA 及gDNA 序列。將PCR 產(chǎn)物用膠回收試劑盒(艾德萊,北京)進(jìn)行回收后,連接到pMD19-T 載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,挑選單菌落經(jīng)PCR 檢測(cè)后,送至上海生工生物公司測(cè)序。利用在線網(wǎng)站GSDS(http://gsds.gao-lab.org/)分析該基因的外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu),并利用Exon-Intron Graphic Maker 在線網(wǎng)站(http://www.wormweb.org/exonintron)繪制基因構(gòu)圖。
表1 本研究所用引物Table 1 Primer sequences used in this study
1.2.4 生物信息學(xué)分析 利用ProtParam 在線分析軟件(https://web. expasy. org/protparam/)分析VwTyDClike蛋白的理化性質(zhì),VwTyDC-like 蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分別使用在線工具SOPMA(https://npsa-prabi. ibcp. fr/cgi-bin/secpred_sopma. pl)和SWISSMODEL(https://swissmodel. xpasy. org/)完成。將獲得的VwTyDC-like 序列在NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中(https://blast.ncbi. nlm. nih. gov/Blast. cgi)進(jìn)行比對(duì),下載其他物種的同源序列并利用DNAMAN6.0 軟件進(jìn)行氨基酸序列多重比對(duì)。利用MEGA 11 軟件采用最大似然法(maximum likelihood,ML)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),bootstrap值設(shè)為1 000。
1.2.5 基因表達(dá)分析 以反轉(zhuǎn)錄cDNA 為模板,按照TB Green?Premix Ex Taq? II(Tli RNaseH Plus)試劑盒(TaKaRa,大連)操作說(shuō)明,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-tive PCR, qRT-PCR)技術(shù)分析VwTyDC-like和VwTyDC在三色堇不同組織器官、花發(fā)育的不同時(shí)期、不同品種中的表達(dá)模式。利用Primer 5.0 設(shè)計(jì)引物(表1),以三色堇β-actin作為內(nèi)參基因[15],以2-ΔΔCT法計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量。每個(gè)樣本均設(shè)置3 個(gè)生物學(xué)重復(fù),3 次技術(shù)重復(fù)。使用Excel2016 和SPSS19.0 軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,利用Duncan 新復(fù)極差法做顯著性分析(P<0.05),并采用Origin 2019b軟件作圖。
從前期獲得的黃色帶花斑三色堇轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選到1 個(gè)在花瓣不同區(qū)域存在差異表達(dá)的Unigene。以黃色帶花斑品種花瓣的cDNA 為模板,通過(guò)設(shè)計(jì)特異引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,得到1 條特異條帶(圖2-A)。測(cè)序后獲得的編碼序列(coding sequence, CDS)序列長(zhǎng)1 497 bp,編碼498個(gè)氨基酸。該基因序列與VwTyDC高度相似,命名為VwTyDC-like基因,GenBank 登錄號(hào)為ON866521。同時(shí),以黃色、純藍(lán)色、白色3個(gè)無(wú)斑品種花瓣的cDNA 為模板通過(guò)PCR 擴(kuò)增VwTyDC-like和VwTyDC的核苷酸序列。結(jié)果顯示,3 個(gè)品種VwTyDClike基因的核苷酸序列與黃色帶花斑品種完全一致;純藍(lán)色、白色品種VwTyDC基因的核苷酸序列與黃色帶花斑也完全一致,黃色品種的核苷酸序列與黃色帶花斑品種相比,僅有1 個(gè)堿基的差異,但編碼氨基酸序列一致。以黃色帶花斑葉片總DNA為模板,擴(kuò)增得到單一條帶(圖2-B),長(zhǎng)度為2 340 bp(包含部分啟動(dòng)子序列),GenBank 登錄號(hào)為ON866520?;蚪Y(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),VwTyDC-like基因包含2個(gè)外顯子和1個(gè)內(nèi)含子(圖2-C)。
圖2 VwTyDC-like基因克隆與結(jié)構(gòu)分析Fig.2 Cloning of VwTyDC-like and exon-intron structure analysis
利用ExPASy中的ProtParam tool分析VwTyDC-like蛋白的理化性質(zhì),結(jié)果表明該蛋白的相對(duì)分子量為54.94 kDa,理論等電點(diǎn)為5.84,脂肪系數(shù)86.97,總平均親水性為-0.052。利用ProtScale 程序分析VwTyDC-like 蛋白親水/疏水性,結(jié)果顯示其屬于親水性蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)與三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示2 個(gè)蛋白主要由α 螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲組成。用DNAMAN 對(duì)來(lái)自不同物種的TyDC 蛋白進(jìn)行序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)VwTyDC-like與VwTyDC(ASW27173.1)氨基酸序列有37 個(gè)位點(diǎn)存在差異,與狗尾草(Setaria viridis)、橡膠樹(shù)(Hevea brasiliensis)和毛果楊(Populus trichocarpa)等物種的同源性為66.18%(圖3)。使用MEGA 11軟件對(duì)三色堇及其他物種的TyDC蛋白構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果顯示,VwTyDC-like 蛋白與三色堇VwTyDC 蛋白進(jìn)化關(guān)系最近,與橡膠樹(shù)TyDC 蛋白親緣關(guān)系相對(duì)較近,與葡萄(Vitis riparia)TyDC 蛋白親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),與單子葉植物狗尾草和玉米(Zea mays)TyDC 蛋白親緣關(guān)系最遠(yuǎn)(圖4)。
圖3 VwTyDC-like與其他物種TyDCs蛋白序列比對(duì)Fig.3 Protein sequence alignment of VwTyDC-like and other TyDCs from different plants
圖4 三色堇與其他物種TyDC的進(jìn)化樹(shù)分析Fig.4 Phylogenetic tree of VwTyDC-like and VwTyDC with other TyDCs from different plants
qRT-PCR 結(jié)果顯示,VwTyDC-like基因在超級(jí)賓哥系列黃色帶花斑品種中的表達(dá)具有組織特異性,在花中的表達(dá)量顯著高于其他組織(圖5-A)。在花發(fā)育的S7 期,VwTyDC-like在花瓣基部的中心色斑區(qū)(a)的表達(dá)量顯著高于非色斑區(qū)(b),并達(dá)到峰值,此前S1~S6期該基因在中心色斑區(qū)(a)與非色斑區(qū)(b)的表達(dá)量無(wú)顯著差異(圖5-C)。進(jìn)一步分析顯示,VwTyDC與VwTyDC-like基因呈現(xiàn)出相似的表達(dá)模式(圖5)。
圖5 VwTyDC-like與VwTyDC在黃色帶花斑品種不同組織(A、B)和花發(fā)育的不同時(shí)期的表達(dá)分析(C、D)Fig.5 Expression analysis of VwTyDC-like and VwTyDC in different tissues (A, B) and at different flower developmental stages in Yellow Blotch cultivar (C, D)
本研究利用得大系列的紫羅蘭白雙色品種分析了2 個(gè)基因的表達(dá)模式,該品種的色斑分布比較特殊,除花瓣基部有較大塊的色斑以外,下方三枚花瓣的邊緣也有小面積的色斑(圖1-H)。qRT-PCR 分析結(jié)果表明,在花發(fā)育的S7期,2個(gè)基因在中心色斑區(qū)(a)的表達(dá)量顯著高于邊緣色斑區(qū)(c)和非色斑區(qū)(b);此外,非色斑區(qū)(b)的表達(dá)量高于邊緣色斑區(qū)(c)(圖6-A、B),推測(cè)VwTyDC-like與VwTyDC基因在花瓣中的表達(dá)可能具有位置效應(yīng)。
為進(jìn)一步明確VwTyDC-like與VwTyDC在花瓣中的表達(dá)分布是否與位置有關(guān),本研究將白色帶花斑和白色品種在S7 期的唇瓣劃分成5 個(gè)區(qū)域,即從花瓣基部到花瓣邊緣分為區(qū)域1~5(圖7-A),采用qRT-PCR分析VwTyDC-like與VwTyDC在唇瓣不同區(qū)域的表達(dá)模式。結(jié)果顯示,2 個(gè)基因明顯呈現(xiàn)出從基部到邊緣表達(dá)量逐漸下降的趨勢(shì),在唇瓣基部(區(qū)域1,無(wú)色斑)的表達(dá)量均顯著高于其他位置(區(qū)域2~5),且在唇瓣邊緣(區(qū)域5)幾乎檢測(cè)不到2 個(gè)基因的表達(dá)(圖7),說(shuō)明VwTyDC-like與VwTyDC在花瓣中的表達(dá)分布的確與位置有關(guān)。同時(shí),VwTyDC-like基因的表達(dá)量遠(yuǎn)高于VwTyDC,達(dá)到了后者的7~13倍(圖6、7)。
圖6 VwTyDC-like與VwTyDC基因在紫羅蘭白雙色品種中心色斑區(qū)(a)、非色斑區(qū)(b)和邊緣色斑區(qū)(c)的表達(dá)分析Fig.6 Expression analysis of VwTyDC-like (A) and VwTyDC (B) in the central blotch areas (a)、 non-blotch areas (b) and marginal blotch areas (c) of pansy petals in Violet & White cultivar
圖7 白色帶花斑和白色品種唇瓣不同區(qū)域(A)中VwTyDC-like (B)與VwTyDC (C)的表達(dá)分析Fig.7 Expression analysis of VwTyDC-like (B) and VwTyDC (C) in different areas of labella (A) in White Blotch and White cultivars
為了解VwTyDC-like與VwTyDC基因表達(dá)的位置效應(yīng)在其他三色堇品種中是否廣泛存在,本研究還檢測(cè)了二者在不同系列不同花色三色堇品種中的表達(dá)情況,包括超級(jí)賓哥系列黃色、純藍(lán)色、藍(lán)色帶花斑和帝國(guó)巨人II 系列的淡紫色漸變品種。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在有斑品種淡紫色漸變和藍(lán)色帶花斑中,VwTyDC-like與VwTyDC基因在花發(fā)育的S7 期,中心色斑區(qū)(a)的表達(dá)量顯著高于非色斑區(qū)(b)。而且,在無(wú)斑品種黃色和純藍(lán)色中,VwTyDC-like與VwTyDC基因的表達(dá)量在中心色斑對(duì)應(yīng)區(qū)(a)同樣顯著高于非色斑對(duì)應(yīng)區(qū)(b),無(wú)斑品種表現(xiàn)出與有斑品種相似的表達(dá)特點(diǎn)(圖8)。說(shuō)明VwTyDC-like與VwTyDC基因表達(dá)的位置效應(yīng)在其他三色堇品種中同樣存在。同時(shí),VwTyDC-like在不同品種中的表達(dá)量明顯高于VwTyDC,在淡紫色漸變品種中,VwTyDC-like的表達(dá)量比VwTyDC高252倍(圖8)。
圖8 VwTyDC-like(A)與VwTyDC(B)基因在不同花色品種不同區(qū)域的表達(dá)分析Fig.8 Expression analysis of VwTyDC-like (A) and VwTyDC (B) in the different areas of pansy petals with or without blotches in the pansy cultivars with different flower colors
目前有關(guān)植物TyDC基因的研究較少,主要集中在逆境脅迫應(yīng)答[14-22]和酪氨酸衍生物合成路徑中活性分子的生物合成等方面[5-11,23-24]。本研究從三色堇中分離了一個(gè)新的酪氨酸脫羧酶基因(VwTyDC-like),并將該基因與之前報(bào)道的VwTyDC進(jìn)行了精細(xì)表達(dá)模式的比較分析。
VwTyDC-like與VwTyDC基因具有相似的核苷酸序列,氨基酸序列一致性為92.37%。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)與三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示2 個(gè)蛋白主要由α 螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲組成。同時(shí),qRT-PCR 分析結(jié)果顯示,2個(gè)基因在三色堇不同組織器官、花發(fā)育不同時(shí)期、唇瓣不同區(qū)域、不同花色品種中呈現(xiàn)出高度一致的表達(dá)模式,在花中表達(dá)量最高;在花發(fā)育不同時(shí)期,表達(dá)差異僅在花發(fā)育的后期(S7)出現(xiàn);無(wú)論品種有無(wú)色斑存在,在不同花色品種及其唇瓣的不同區(qū)域,表達(dá)量均由花瓣基部向外遞減。VwTyDC-like與VwTyDC基因有著高度相似的氨基酸序列及表達(dá)模式,說(shuō)明二者為同源基因,可能具有相似的生物學(xué)功能。值得注意的是,VwTyDC-like的表達(dá)量明顯高于VwTyDC(圖5~8),暗示VwTyDClike可能在同源基因發(fā)揮功能的過(guò)程中具有更大作用。
本研究對(duì)超級(jí)賓哥系列黃色帶花斑品種VwTyDC-like與VwTyDC基因的表達(dá)模式進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,在有斑品種黃色帶花斑中,VwTyDC-like與VwTyDC在花發(fā)育S7 期的中心色斑區(qū)(a)的表達(dá)量顯著高于非色斑區(qū)(b)(圖5),這與前人的研究結(jié)果一致[13]。為探究VwTyDC-like與VwTyDC基因在有斑品種中心色斑區(qū)與非色斑區(qū)的表達(dá)差異是否源于位置效應(yīng),本研究還檢測(cè)了在花瓣基部與邊緣都有色斑分布的品種紫羅蘭白雙色VwTyDC-like與VwTyDC基因的表達(dá)水平。結(jié)果發(fā)現(xiàn),2 個(gè)基因在非色斑區(qū)的表達(dá)量雖然低于基部的中心色斑區(qū),但高于邊緣色斑區(qū)(圖6)。
進(jìn)一步將白色與白色帶花斑品種的唇瓣劃分為5個(gè)區(qū)域進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,在有斑品種和無(wú)斑品種中,VwTyDC-like與VwTyDC基因在唇瓣中的表達(dá)水平均由內(nèi)向外依次降低(圖7),說(shuō)明它們的表達(dá)存在明顯的位置效應(yīng)。為驗(yàn)證VwTyDC-like與VwTyDC基因表達(dá)的位置效應(yīng)在其他三色堇品種中是否同樣存在,分析了2個(gè)基因在三色堇不同系列不同色系品種中的表達(dá)模式,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在不同花色品種中,不論三色堇花瓣是否帶有花斑,二者在中心色斑區(qū)或其對(duì)應(yīng)區(qū)的表達(dá)量均顯著高于非色斑區(qū)或其對(duì)應(yīng)區(qū)(圖8),進(jìn)一步說(shuō)明VwTyDC-like與VwTyDC基因表達(dá)的位置效應(yīng)在三色堇品種中廣泛存在。至于VwTyDC-like與VwTyDC基因在花瓣上表達(dá)具有位置效應(yīng)的原因,仍有待進(jìn)一步研究。
已有研究表明,植物花斑形成的本質(zhì)是花色素合成及調(diào)控基因在花器官(特別是花瓣或花萼)的特定區(qū)域差異表達(dá)的結(jié)果[25-27]。前人對(duì)擬南芥進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),TyDC的底物酪氨酸以一種劑量依賴(lài)型的方式有效誘導(dǎo)花青素的生物合成,主要通過(guò)上調(diào)花青素合成途徑中的下游基因如DFR、LODX和UF3GT的表達(dá)量以及MYB-bHLH-WD40轉(zhuǎn)錄復(fù)合體中PAP1/MYB75、PAP2、GL3、EGL3、TTG1基因的表達(dá)促進(jìn)花青素的積累[12]。Ma等[28]對(duì)茶葉品種Huabai 1的研究發(fā)現(xiàn),酪氨酸與類(lèi)黃酮化合物的積累有關(guān)。Cui等[2]用酪氨酸處理三色堇花瓣非色斑區(qū),發(fā)現(xiàn)非色斑區(qū)出現(xiàn)了條紋狀色斑,通過(guò)VIGS技術(shù)沉默VwTyDC基因后,三色堇花瓣的色斑顏色明顯變淺,這些結(jié)果說(shuō)明酪氨酸和VwTyDC基因確實(shí)與三色堇花青素的合成有關(guān)聯(lián)。本研究通過(guò)基因表達(dá)模式分析,發(fā)現(xiàn)VwTyDC-like與VwTyDC的表達(dá)模式與三色堇花瓣中花斑的分布可能沒(méi)有直接對(duì)應(yīng)關(guān)系。由此推測(cè)在三色堇花斑形成過(guò)程中,酪氨酸脫羧酶基因還需要和其他因子聯(lián)合發(fā)揮作用,而無(wú)斑品種缺乏這些相關(guān)因子。有研究發(fā)現(xiàn),三色堇花斑由S和K兩個(gè)基因控制[29],酪氨酸脫羧酶基因可能是其中一個(gè)基因,需要和另一個(gè)基因共同發(fā)揮作用。但是,另一個(gè)基因尚未被克隆,二者如何聯(lián)合發(fā)揮作用還有待進(jìn)一步研究。
本研究從三色堇花瓣中克隆到一個(gè)VwTyDC-like基因,與VwTyDC同源性最高。VwTyDC-like與VwTyDC基因在三色堇不同組織器官、花發(fā)育不同時(shí)期、不同花色品種及其唇瓣不同區(qū)域表現(xiàn)出高度一致的表達(dá)模式,但VwTyDC-like基因的表達(dá)水平普遍高于VwTyDC。VwTyDC-like與VwTyDC基因的表達(dá)均具有組織特異性,在花瓣中的表達(dá)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他組織器官,且在花發(fā)育后期(S7)表達(dá)量最高。無(wú)論三色堇花瓣是否帶有花斑,VwTyDC-like與VwTyDC基因的表達(dá)量均由花瓣基部向外逐漸降低。本研究結(jié)果表明VwTyDC-like與VwTyDC基因在花瓣中的表達(dá)具有明顯的位置效應(yīng)。