何青青,劉傳強(qiáng),李建建,王晶晶,姚 祥,周圣浩,陳 英*,王浩然*
(1. 南京林業(yè)大學(xué)楊樹種質(zhì)創(chuàng)新與品種改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心,江蘇 南京 210037;2. 江蘇省中國科學(xué)院植物研究所,江蘇 南京 210014;3. 江蘇省泰興市農(nóng)村能源技術(shù)開發(fā)服務(wù)站,江蘇 泰興 225400)
假儉草(Eremochloaophiuroides)植株低矮、抗逆性強(qiáng),是蜈蚣草屬中唯一可用作草坪草的一個(gè)種[1],也是世界公認(rèn)起源于中國的最好的暖季型草坪草,有“中國草坪草”的美譽(yù)[2]。假儉草可粗放管理,是建植各類綠地草坪及高速公路邊坡草坪、堤壩護(hù)埂、固土護(hù)坡、綠化建設(shè)、治理水土流失的理想材料[3]。其廣泛分布于我國長江流域及其以南地區(qū)[4],是我國南方酸土區(qū)的一些極度缺磷貧瘠的強(qiáng)酸性土壤上重要的優(yōu)勢種及建群種。磷元素作為植物必需的大量營養(yǎng)元素,是植物細(xì)胞內(nèi)核酸和細(xì)胞膜脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)組成部分,參與植物體內(nèi)各種代謝過程,在植物的生長發(fā)育中發(fā)揮著重要作用[5]。雖然在包括磷匱乏的酸性土壤在內(nèi)的大多數(shù)類型土壤中,磷元素的實(shí)際總含量水平不低;但是由于土壤中的磷素流動(dòng)性低且易被鋁固定為非有效態(tài)磷,往往造成實(shí)際能夠被植物吸收利用的有效磷含量偏低,因而磷素是最難以被植物吸收利用的營養(yǎng)元素之一,成為限制植物生長發(fā)育的重要因素[6-8]。因此,探索假儉草這類天然適應(yīng)低磷土壤條件植物的磷素調(diào)控相關(guān)分子機(jī)制,對磷高效定向育種具有重要的指導(dǎo)意義。
植物對磷的吸收和利用均依賴于磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(phosphate transporters,PTs)[9-10]。以往的研究表明,一系列具有磷轉(zhuǎn)運(yùn)活性的蛋白參與了植物根系對磷素的吸收以及磷素在細(xì)胞器、細(xì)胞或組織器官間的運(yùn)輸分配。有多種機(jī)制調(diào)控這些磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,其中泛素化是在蛋白水平上調(diào)控磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的重要過程[9]。泛素化是一種主要由泛素介導(dǎo)的蛋白降解機(jī)制,參與許多細(xì)胞事件的調(diào)控,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)等[11-12]。其中,可以特異性識(shí)別靶蛋白的泛素連接酶(E3)則是泛素化途徑中最關(guān)鍵的一類酶。NLA(nitrogen limitation adaptation)蛋白作為一種RING型E3泛素連接酶參與關(guān)鍵蛋白的泛素化,在調(diào)節(jié)植物磷素平衡方面起著至關(guān)重要的作用[9,13]。NLA分別位于質(zhì)膜和細(xì)胞核兩個(gè)不同的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中,包含4個(gè)不同的域:①RING域,介導(dǎo)質(zhì)膜上磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的降解;②SPX域,促進(jìn)NLA與磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的相互作用;③位于RING和SPX域之間的鏈接器域;④C末端結(jié)構(gòu)域,與接頭區(qū)域一樣,其功能未知[12]。有研究表明,NLA編碼蛋白質(zhì)的N末端SPX結(jié)構(gòu)域,可調(diào)節(jié)酵母中磷的感應(yīng)和攝取[14-16]。根據(jù)對模式植物擬南芥的研究,NLA蛋白是RING-HCa-Type E3泛素連接酶家族的成員[17],其SPX域在磷酸鹽依賴性途徑中介導(dǎo)蛋白質(zhì)間相互作用[18-20],控制PHT1家族的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白泛素化降解過程[21]。 因此,NLA被認(rèn)為是植物磷素穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。此外,最近的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),NLA還介導(dǎo)了質(zhì)膜定位硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白NRT1.7的轉(zhuǎn)換[22],表明NLA在調(diào)節(jié)植物中氮和磷酸鹽含量方面具有更加廣泛的作用。
本研究以假儉草為研究材料,通過RACE方法克隆獲得了一個(gè)假儉草NLA泛素連接酶的基因,命名為EoNLA。通過生物信息學(xué)分析確定該基因的全長序列及編碼氨基酸序列,利用原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系確定其膜定位,采用qRT-PCR方法分析該基因在低磷誘導(dǎo)下的表達(dá)模式,并轉(zhuǎn)化擬南芥進(jìn)行基因功能鑒定。通過研究假儉草EoNLA的磷高效轉(zhuǎn)運(yùn)分子機(jī)制,為草坪草適應(yīng)酸性土壤生境的磷高效轉(zhuǎn)運(yùn)分子育種和栽培調(diào)控提供理論依據(jù)。
基因克隆和表達(dá)分析所用材料為假儉草(E.ophiuroides)的酸土抗性品系E041,采集自江蘇省中國科學(xué)院植物研究所草坪草種質(zhì)資源苗圃。轉(zhuǎn)基因和原生質(zhì)體分離轉(zhuǎn)化所用材料為擬南芥(Arabidopsisthaliana)Col-0盆栽苗,生長條件為:溫度23 ℃,16 h光照、8 h黑暗環(huán)境。
大腸桿菌(Escheriachiacoli)菌株Top10、農(nóng)桿菌(Agrobacterium)菌株EHA105購自天根(北京)公司 (Tiangen Biotech, Beijing, China);pMD19-T載體購自寶生物工程(大連)有限公司(TaKaRa, Dalian, China);植物過量表達(dá)載體pBI121-3HA以及原生質(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)載體p2GWF7.0由南京林業(yè)大學(xué)楊樹種質(zhì)創(chuàng)新與品種改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2.1 假儉草EoNLA基因克隆
采用RNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(Tiangen)提取假儉草總RNA。根據(jù)假儉草轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)(未公開)篩選獲得EoNLA基因參照序列。選用大連寶生物公司的SMART RACE試劑盒進(jìn)行基因全長克隆,所涉及的3′RACE和5′RACE引物見表1。擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳分析,將大小正確的條帶切下,利用天根公司的DNA凝膠回收試劑盒回收純化,連接pMD19-T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Top10,挑取陽性克隆委托測序公司(安徽通用生物)進(jìn)行測序。
將所獲得的3′和5′片段進(jìn)行比對與拼接,獲得EoNLA基因的全長cDNA序列。通過NCBI ORF Finder 在線程序查找序列的開放閱讀框(ORF),設(shè)計(jì)EoNLA基因ORF片段的特異性引物(表1),進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序驗(yàn)證。
表1 假儉草EoNLA基因克隆及qRT-PCR引物
1.2.2EoNLA基因序列分析
利用NCBI數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)的 Blast P 進(jìn)行比對檢索,下載其他植物中EoNLA同源基因的氨基酸序列,使用 Clustal X 多序列比對軟件,進(jìn)行氨基酸序列的多重比對,預(yù)測其保守結(jié)構(gòu)域。利用 MEGA軟件對EoNLA及其同源蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。利用 SMART 工具(http: //smart.embl-heidelberg.de/)預(yù)測假儉草EoNLA蛋白的功能結(jié)構(gòu)域。ProtParam 在線工具(https://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測分子量、等電點(diǎn)、不穩(wěn)定系數(shù)。在線網(wǎng)站ProtScale(https://web.expasy.org/protsca/)預(yù)測蛋白質(zhì)親疏水性,蛋白的信號(hào)肽預(yù)測用SignalP 4.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.1/)分析,磷酸化位點(diǎn)預(yù)測采用NetPhos (http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/)分析,蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測用TMHMM 2.0分析。SOPMA (https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)進(jìn)行蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測。在線工具SWISS MODEL(https://www.swissmodel.expasy.org/)預(yù)測EoPHR2蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)。
1.2.3 EoNLA蛋白的亞細(xì)胞定位
采用Gateway技術(shù)(Invitrogen)將EoNLA基因的ORF序列構(gòu)建至植物瞬時(shí)表達(dá)載體p2GWF 7.0上,重組為EoNLA::GFP融合基因。采用植物原生質(zhì)體制備及轉(zhuǎn)化試劑盒(中科瑞泰),進(jìn)行擬南芥原生質(zhì)體的分離和瞬時(shí)轉(zhuǎn)化。以Pro35S::GFP為正對照,在450~490 nm藍(lán)光波長熒光顯微鏡下觀測各樣品中GFP綠色熒光表達(dá)部位。
1.2.4EoNLA基因的表達(dá)分析
基于假儉草水培體系[23]培養(yǎng)假儉草水培材料3周至最佳生長狀態(tài)后,對假儉草材料的根、莖、葉組織分別采樣(3個(gè)生物學(xué)重復(fù)),鮮樣采集清洗后立即用液氮速凍并提取RNA,用于基因的表達(dá)分析。使用FastStart Universal SYBR Green Master Mix (Roche) 熒光定量試劑及ABI ViiA7熒光定量PCR儀(ABI)進(jìn)行qRT-PCR實(shí)驗(yàn),采用相對定量法[24]進(jìn)行分析,管家基因Actin作為內(nèi)參基因,該實(shí)驗(yàn)技術(shù)重復(fù)3次。相關(guān)引物見表1。
1.2.5EoNLA轉(zhuǎn)基因擬南芥表型鑒定
采用Gateway技術(shù)(Invitrogens)將EoNLA基因的ORF序列構(gòu)建至植物過量表達(dá)載體pBI121-3HA,質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌EHA105。通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的擬南芥花序浸潤法轉(zhuǎn)化擬南芥,篩選獲得轉(zhuǎn)基因T3代純合體,并對轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行功能檢測。
栽培基質(zhì)為泥炭、蛭石與珍珠巖體積比為1∶1∶1的混合基質(zhì),預(yù)拌入1/10的大比例稀釋MS營養(yǎng)液作為基肥。種子萌發(fā)后生長至4片葉狀態(tài)的擬南芥野生型/ 轉(zhuǎn)基因幼苗移栽入內(nèi),采用無營養(yǎng)的清水灌溉,繼續(xù)培養(yǎng)3周后,觀察盆栽苗的生長表型。
無菌種子苗培養(yǎng)及處理方式:采用MS固體培養(yǎng)基(pH 5.8,添加蔗糖20 g/L、瓊脂9 g/L)作為基礎(chǔ),通過調(diào)整KH2PO4(P)母液的添加量控制磷元素濃度(同時(shí),相應(yīng)添加KCl母液補(bǔ)足鉀元素至標(biāo)準(zhǔn)水平)模擬脅迫處理?xiàng)l件,分別為0 mmol/L P(無磷)、0.062 5 mmol/L P(低磷)、0.625 0 mmol/L P(半磷)和1.250 0 mmol/L P(全磷)。野生型及轉(zhuǎn)基因純合體,兩個(gè)株系的擬南芥種子,消毒播種于培養(yǎng)基平板培養(yǎng)3周后,對表型進(jìn)行觀測。采用儀器掃描植株生長表型(WinRHIZO Pro 2017系統(tǒng))。各處理?xiàng)l件下的野生型及轉(zhuǎn)基因株系,分別取25株苗稱量全株鮮質(zhì)量。
根據(jù)假儉草轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)(未公開)篩選獲得的EoNLA基因參照序列設(shè)計(jì)引物,并采用RACE技術(shù)(rapid amplification of cDNA ends)克隆獲得假儉草EoNLA基因的全長cDNA序列。測序分析結(jié)果表明EoNLA基因全長為1 353 bp,含有217 bp的5′UTR和143 bp的3′UTR以及993 bp的開放閱讀框(ORF),共編碼331個(gè)氨基酸(圖1)。
圖1 EoNLA基因cDNA全長及相應(yīng)氨基酸序列
利用ProtParam軟件對EoNLA基因編碼蛋白的理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示:EoNLA編碼蛋白的分子質(zhì)量為37 416.54 u,理論等電點(diǎn)為8.88,該蛋白的氨基酸組分為Leu (34 個(gè),占比10.3%)、Ser (32個(gè),9.7%)、Lys (30個(gè),9.1%),以及組分占比低于9% 的其他氨基酸,不含 Pyl、Sec;該蛋白中帶負(fù)電荷的堿基數(shù)為36 (Asp + Glu),帶正電荷的堿基數(shù)為48 (Arg + Lys);不穩(wěn)定系數(shù)58.89,推測該片段屬于不穩(wěn)定型蛋白;脂溶系數(shù)76.61,總平均親水性為-0.265。利用ExPASY ProtScale進(jìn)一步預(yù)測EoNLA蛋白氨基酸序列的親疏水性,結(jié)果顯示親水性氨基酸數(shù)量大于疏水性氨基酸數(shù)量,這表明EoNLA蛋白可能為親水性蛋白。
SMART預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)域顯示,EoNLA 蛋白具有典型的RING結(jié)構(gòu)域和SPX結(jié)構(gòu)域(圖2A)。SOPMA預(yù)測蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果顯示,EoNLA編碼的蛋白含有α-螺旋(alpha helix)、延伸鏈(extended strand)、隨機(jī)卷曲(random coil)和β-轉(zhuǎn)角(beta turn)等結(jié)構(gòu),其中α-螺旋所占比例最高為54.55%,隨機(jī)卷曲所占比例為33.03%,延伸鏈所占比例是9.09%,β轉(zhuǎn)角占比為3.33%(圖2B)。利用SWISS MODEL進(jìn)一步構(gòu)建EoNLA蛋白的三維模型,預(yù)測的三維結(jié)構(gòu)與其二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相符為探尋EoNLA在不同植物種間的同源性及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,將假儉草EoNLA基因編碼氨基酸序列提交到NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行同源比對,結(jié)果(圖3)顯示,其與高粱(Sorghumbicolor)、哈氏黍(Panicumhallii)、狗尾草(Setariaitalica)、日本水稻(OryzasativaJaponica group)、野生水稻(Oryzabrachyantha)、疣粒野稻(Oryzameyerianavar.)、二穗短柄草(Brachypodiumdistachyon)、大麥(Hordeumvulgare)、山羊草(Aegilopstauschiisubsp.)、硬粒小麥(Triticumturgidumsubsp.)等植物種具有較高的同源性,多重序列比對結(jié)果顯示EoNLA基因編碼蛋白序列的保守性較強(qiáng),各植物種的NLA同源蛋白在氨基酸序列C端的226~274區(qū)域均具有保守的RING結(jié)構(gòu)域(圖3)。根據(jù)EoNLA基因的氨基酸序列,利用MEGA 6.0軟件構(gòu)建其與其他植物種同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(N-J鄰接法),結(jié)果顯示其在不同植物種間具有一定的保守性,其中,假儉草與高粱、哈氏黍、狗尾草構(gòu)成一個(gè)高支持分支(99%);假儉草與高粱擁有最近的遺傳距離,其親緣關(guān)系最近;同為稻屬的日本水稻、野生水稻、疣粒野稻在同一進(jìn)化分支,而禾本科的二穗短柄草、大麥、山羊草和硬粒小麥則在另一分支(圖4)。
圖2 EoNLA氨基酸序列分析
紅框標(biāo)識(shí)為RING結(jié)構(gòu)域。The red box represents the RING domain.
圖4 EoNLA的系統(tǒng)進(jìn)化樹
(圖2C)。此外,NetPhos的預(yù)測結(jié)果表明,EoNLA編碼蛋白含有27個(gè)磷酸化位點(diǎn)[結(jié)果分值(score)>0.5],包含4 個(gè)酪氨酸位點(diǎn)、18 個(gè)絲氨酸位點(diǎn)、5 個(gè)蘇氨酸位點(diǎn)(圖2D)。
研究基因表達(dá)蛋白的亞細(xì)胞定位,可以幫助了解該基因在細(xì)胞中發(fā)揮作用的位置,從而為鑒定其生物學(xué)功能提供參考。通過SignalP 4.1預(yù)測分析EoNLA蛋白的氨基酸序列,結(jié)果顯示EoNLA蛋白的分值(S-score)平均值為0.001 4,S-score平均值低于0.5表明該蛋白為非分泌型蛋白,因而應(yīng)當(dāng)進(jìn)一步通過實(shí)驗(yàn)檢測分析EoNLA蛋白的亞細(xì)胞定位。分離擬南芥原生質(zhì)體,通過PEG介導(dǎo)將構(gòu)建的EoPHR2-GFP融合載體導(dǎo)入原生質(zhì)體中,使該基因下游的綠色熒光蛋白GFP得到表達(dá),觀察熒光表達(dá)部位即可確定該基因在細(xì)胞中發(fā)揮生物學(xué)功能的位置。顯微鏡下觀測顯示:原生質(zhì)體細(xì)胞具有完整、規(guī)則的細(xì)胞形態(tài),細(xì)胞內(nèi)葉綠體自發(fā)熒光清晰,表明細(xì)胞狀態(tài)正常;在488 nm激發(fā)光下,EoNLA-GFP融合蛋白的綠色熒光主要聚集在細(xì)胞膜;同時(shí),在僅含GFP的對照中綠色熒光信號(hào)則沒有明確的細(xì)胞定位,綠色熒光在全細(xì)胞范圍彌散(圖5)。由此判斷EoNLA蛋白定位于細(xì)胞膜,這與其結(jié)合細(xì)胞膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行泛素化的功能定位相符合。
圖5 EoNLA蛋白在原生質(zhì)體中的定位
通過分析基因表達(dá)的組織特異性,可以了解該基因在植物體中發(fā)揮作用的器官組織定位,是預(yù)測鑒定基因生物學(xué)功能的重要參考。利用實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)(qRT-PCR)對EoNLA基因在假儉草不同器官組織間的表達(dá)模式進(jìn)行比較分析,結(jié)果顯示EoNLA基因在根組織的表達(dá)量顯著高于莖和葉,該基因具有根組織表達(dá)特異性(圖6)。
**.P<0.01.
由此可以推斷,EoNLA主要在根系組織發(fā)揮功能,該結(jié)果與以往在模式物種的相關(guān)研究報(bào)道相符。
為進(jìn)一步分析基因功能,構(gòu)建EoNLA基因的植物過量表達(dá)載體、轉(zhuǎn)化擬南芥、迭代篩選并鑒定,獲得T3代純合體轉(zhuǎn)基因株系,命名為EoNLA-OV(圖7A)。在無營養(yǎng)的清水灌溉基質(zhì)盆栽條件下,轉(zhuǎn)基因擬南芥生長表型均劣于野生型(圖7B),推測是EoNLA基因的過量表達(dá)負(fù)調(diào)控磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,從而抑制了植株對磷營養(yǎng)的吸收利用。
A.轉(zhuǎn)基因植株鑒定identification of transgenic plants;B.園土基質(zhì)盆栽植株表型phenotype of potted plants in garden soil matrix;C.不同磷濃度梯度處理下的植株表型plant phenotype under different phosphorus concentration gradient;D.低磷條件下的植株根表型plant roots phenotype under low phosphorus condition;E.不同磷濃度梯度處理下的植株鮮質(zhì)量(25株)fresh weight of plants under different phosphorus concentration gradients (25 plants). *.P<0.05;***. P<0.001;****.P<0.000 1.
將野生型(WT)和轉(zhuǎn)基因(EoNLA-OV)擬南芥分別播種于0 mmol/L P(無磷)、0.062 5 mmol/L P(低磷)、0.625 0 mmol/L P(半磷)和1.250 0 mmol/L P(全磷)4個(gè)磷濃度梯度條件下萌發(fā)培養(yǎng)3周后,觀察其生長表型,并稱量植株鮮質(zhì)量,結(jié)果顯示:在0 mmol/L P的無磷條件下,野生型及轉(zhuǎn)基因擬南芥均表現(xiàn)出明顯的生長抑制表型(圖7C);在0.062 5 mmol/L P的磷匱乏條件下,轉(zhuǎn)基因株系相對于野生型呈現(xiàn)出更加明顯的生長抑制表型,其根系發(fā)育表型明顯弱于野生型對照(圖7C、7D);在0.625 0 mmol/L P的半磷濃度條件下,野生型擬南芥相較于轉(zhuǎn)基因植株呈現(xiàn)出較明顯的總體生長優(yōu)勢,野生型植株鮮質(zhì)量明顯高于轉(zhuǎn)基因植株(圖7C、7E);在1.250 0 mmol/L P的全磷濃度條件下,轉(zhuǎn)基因擬南芥相較于野生型植株,生長表型及植株鮮質(zhì)量則表現(xiàn)出明顯的差異(圖7C、7E)。此外,對野生型及轉(zhuǎn)基因植株在不同磷濃度梯度下的植株鮮質(zhì)量增量分別進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn):野生型擬南芥的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)在半磷濃度條件(0.625 0 mmol/L P)已經(jīng)達(dá)到峰值,與全磷濃度(1.250 0 mmol/L P)條件的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)基本一致;而過量表達(dá)EoNLA的轉(zhuǎn)基因擬南芥鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)則隨著半磷及全磷濃度條件的變化而呈現(xiàn)出遞增趨勢,直至全磷濃度條件下的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)接近于野生型(圖7E)。
磷是植物生長發(fā)育必不可少的營養(yǎng)元素,但土壤酸化使其有效性低,成為最難被植物吸收利用的營養(yǎng)元素之一。早在2000年前后,我國的酸性土壤地區(qū)面積已經(jīng)占全國陸地總面積的22.7%,遍及南方14個(gè)省份[25],而隨著土壤酸化進(jìn)程逐漸加速,酸性土壤區(qū)面積也呈現(xiàn)逐年遞增趨勢。土壤酸化后衍生的有效磷匱乏問題,則是酸土地區(qū)限制植物生長發(fā)育的主要營養(yǎng)因素[5,26]。假儉草作為我國南方地區(qū)的鄉(xiāng)土植物,廣泛分布于我國南方酸土區(qū)等低磷土壤條件地區(qū),在極度缺磷貧瘠的強(qiáng)酸性土壤上更是重要的建群種。探索假儉草這類天然適應(yīng)低磷土壤條件植物的低磷脅迫響應(yīng)分子機(jī)制,進(jìn)而指導(dǎo)培育適應(yīng)低磷土壤條件的磷高轉(zhuǎn)運(yùn)植物品種,對緩解磷肥需求壓力、提高貧瘠土地利用率以及改善貧瘠地區(qū)生態(tài)都具有重要意義。本研究首次從假儉草中克隆獲得了一個(gè)磷調(diào)控相關(guān)基因,鑒定為AtNLA/OsNLA基因的直系同源基因,命名為EoNLA。
氮限制適應(yīng)蛋白(NLA)是一種E3泛素連接酶,在氮及磷穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)中起重要作用。NLA會(huì)以不同的方式調(diào)節(jié)植物體的磷素動(dòng)態(tài)平衡,其中包括轉(zhuǎn)錄后和翻譯后水平的調(diào)控,以及通過蛋白質(zhì)中相關(guān)的功能結(jié)構(gòu)域[27-28]?;谀J街参飻M南芥的研究發(fā)現(xiàn),在磷營養(yǎng)供應(yīng)充足的情況下,NLA通過其N端SPX結(jié)構(gòu)域和C端RING結(jié)構(gòu)域促進(jìn)質(zhì)膜上磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的降解[27];當(dāng)磷營養(yǎng)受到限制時(shí),NLA則受到microRNAs的調(diào)控抑制,從而減輕對質(zhì)膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的負(fù)調(diào)節(jié)[22, 27-28]。然而,對單子葉植物模式植物水稻的研究則發(fā)現(xiàn),OsNLA1基因并非 miR827(磷饑餓誘導(dǎo)microRNA)的靶基因,而是通過其他通路誘導(dǎo)水稻OsPHT1 磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族若干成員(OsPT1/2/4/7/8/12)的降解來調(diào)控水稻對磷的吸收轉(zhuǎn)運(yùn)[29]?;谝酝煌J街参镏袑LA基因的研究報(bào)道顯示,該基因在植物的磷響應(yīng)調(diào)控通路上發(fā)揮重要作用。假儉草作為缺磷貧瘠的酸性土壤上的優(yōu)勢植物,研究其磷營養(yǎng)相關(guān)的調(diào)控通路及機(jī)制,對于了解這類酸土植物的逆境適應(yīng)機(jī)制具有重要意義。目前,有關(guān)假儉草NLA基因的研究還未見報(bào)道。本研究通過RACE方法從假儉草中克隆獲得了EoNLA基因的完整全長序列,并對其功能進(jìn)行了初步的鑒定。分析EoNLA的亞細(xì)胞定位及組織表達(dá)特異性,可以了解該基因在細(xì)胞以及器官組織中的功能位置,是鑒定基因生物學(xué)功能的重要參考?;谠|(zhì)體瞬時(shí)表達(dá)體系的亞細(xì)胞定位觀測顯示,EoNLA蛋白定位于細(xì)胞膜,這與相關(guān)研究報(bào)道中NLA結(jié)合細(xì)胞膜上的磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行泛素化的功能定位相符合;進(jìn)一步利用實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)(qRT-PCR)的基因表達(dá)組織特異性分析顯示EoNLA基因具有根組織表達(dá)特異性,EoNLA的功能主要定位于根系組織,該結(jié)果與以往在模式植物的相關(guān)研究報(bào)道相符[27]。
本研究利用EoNLA基因過量表達(dá)的轉(zhuǎn)基因擬南芥株系鑒定基因功能。根據(jù)前人的研究結(jié)果[27],NLA在磷營養(yǎng)充分的條件下介導(dǎo)磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的泛素化降解、限制磷素的吸收轉(zhuǎn)運(yùn),在低磷條件下NLA則受到microRNAs的負(fù)調(diào)控抑制、釋放磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的功能,進(jìn)而調(diào)節(jié)植物體的磷素平衡。由此可以推測,過量表達(dá)NLA會(huì)提高植株對低磷脅迫的敏感性,進(jìn)而抑制轉(zhuǎn)基因植株在低磷條件下的生長表型。本研究的結(jié)果與該理論推測相符合,即在0.062 5 mmol/L P的磷匱乏條件以及0.625 0 mmol/L P的半磷濃度條件下,野生型擬南芥相較于EoNLA過表達(dá)的轉(zhuǎn)基因植株呈現(xiàn)出生長優(yōu)勢;而在1.250 0 mmol/L P的全磷濃度條件下,不存在低磷脅迫壓力,轉(zhuǎn)基因擬南芥與野生型植株的生長表型沒有表現(xiàn)出明顯的差異。但值得注意的是,轉(zhuǎn)基因植株對不同程度的低磷脅迫所呈現(xiàn)的表型不完全相同,在脅迫程度較嚴(yán)重的磷匱乏(0.062 5 mmol/L P)條件下,轉(zhuǎn)基因株系在種子苗生長初期的根系生長發(fā)育表型明顯弱于野生型對照;而在脅迫程度較輕的半磷(0.625 0 mmol/L P)條件下,野生型擬南芥相較于轉(zhuǎn)基因植株則主要是在鮮質(zhì)量方面體現(xiàn)了總體生長優(yōu)勢,而根系形態(tài)則未表現(xiàn)出較明顯的差異。此外,對野生型及轉(zhuǎn)基因植株在不同磷濃度梯度下的植株鮮質(zhì)量增量分別進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),野生型擬南芥的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)在半磷濃度條件(0.625 0 mmol/L P)已經(jīng)達(dá)到峰值,與全磷濃度條件(1.250 0 mmol/L P)的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)基本一致;而過量表達(dá)EoNLA的轉(zhuǎn)基因擬南芥鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)則隨著半磷及全磷濃度條件的變化而呈現(xiàn)出遞增趨勢,直至全磷濃度條件下的鮮質(zhì)量數(shù)據(jù)接近于野生型,由此也可表明,過量表達(dá)EoNLA提高了轉(zhuǎn)基因植株對低磷脅迫的敏感度。鑒于自然的土壤條件中有效磷水平往往較低[6],因而在本研究中觀察到,相對于野生型,盆栽條件下,轉(zhuǎn)基因植株的生長受到了明顯的抑制。以上研究結(jié)果表明,EoNLA基因應(yīng)當(dāng)在植物體的磷素平衡調(diào)控中發(fā)揮著重要作用,但其相關(guān)的分子調(diào)控機(jī)制仍有待進(jìn)一步的研究。