楊若楠,郭 敏,于雪雪,羅世杰,李丹丹,王 彬,相 潔,牛 焱
(太原理工大學信息與計算機學院,山西 太原 030600)
雙相障礙(bipolar disorder, BD)影響1%~3%世界人口,臨床表現(xiàn)為躁狂發(fā)作時的情緒升高與抑郁發(fā)作時的焦慮反復循環(huán)出現(xiàn),甚至可致認知障礙,包括注意力缺陷、執(zhí)行功能、短期記憶障礙及反應抑制[1]。已知BD與腦網(wǎng)絡異常有關[2],但對其具體發(fā)病機制尚不明確,且相關研究[3-4]多針對單一參數(shù)進行分析。利用多參數(shù)網(wǎng)絡能更深入探索大腦結構及其生理病理機制[5-6]。node2vec算法是基于隨機游走的圖嵌入方法,將深度和廣度優(yōu)先搜索相結合,可最大限度保留節(jié)點的網(wǎng)絡鄰域信息[7-9]。本研究基于node2vec算法和連續(xù)詞袋(continous bag of words, CBOW)模型建立多參數(shù)融合網(wǎng)絡模型,觀察其診斷BD價值。
1.1 數(shù)據(jù)來源 于openfMRI公共數(shù)據(jù)庫(https://www.openfmri.org/)選取48例BD患者(BD組)和58名年齡、性別相匹配的健康對照(normal control, NC)(NC組)的MRI資料,均由Siemens SyngoMRB17 3.0T MR儀采集,掃描參數(shù):T1W,TR 1.9 s,TE 2.26 ms,F(xiàn)OV 224 mm×256 mm,矩陣256×256,層厚1 mm,層間距0,共掃描176層;彌散張量成像(diffusion tensor imaging, DTI)采用回波平面成像序列,TR 9 000 ms,TE 93 ms,矩陣96×96,F(xiàn)A 90°,層厚2 mm,于63個方向施加彌散敏感梯度場強,b=1 000 s/mm2,1個方向未施加彌散敏感梯度場強。BD組男27例、女21例,年齡21~50歲、平均(35.0±8.9)歲,平均受教育年限(15.2±1.5)年;NC組男、女各29名,年齡21~50歲、平均(32.5±9.0)歲,平均受教育年限(14.6±2.0)年。
1.2 預處理 以基于FSL5.0和DiffusionToolkit的PANDA工具(http://www.Nitrc.org/pro jects /panda)對DTI數(shù)據(jù)進行預處理,包括提取腦、校正頭動及渦流等;之后行重采樣,將圖像配準至蒙特利爾神經(jīng)研究所(Montreal Neurological Institute, MNI)標準空間,行高斯平滑,高斯核半寬全高為4 mm×4 mm×4 mm,獲得基于體素的各向異性分數(shù)(fractional anisotropy, FA)、平均擴散系數(shù)(mean diffusivity, MD)、軸向擴散系數(shù)(axial diffusivity, AD)及徑向擴散系數(shù)(radial diffusivity, RD)圖像(圖1)。
1.3 構建網(wǎng)絡
1.3.1 單一參數(shù)網(wǎng)絡 利用自動化解剖標記模板將經(jīng)預處理后的圖像劃分為90個腦區(qū)[10],分別構建FA、MD、AD和RD 4種結構網(wǎng)絡。對MD、AD和RD網(wǎng)絡進行取反、再取對數(shù)轉換[11],分別記作lgiMD、lgiAD及l(fā)giRD;將4種網(wǎng)絡標準化至同一取值范圍內,并劃分為左、右半球網(wǎng)絡,即每個參數(shù)網(wǎng)絡含2個45×45的網(wǎng)絡矩陣。為減少偽連接對結果的影響,僅保留2個腦區(qū)之間纖維數(shù)>3的連接[12]。見圖1。
1.3.2 融合網(wǎng)絡 以node2vec算法回溯并通過非均等概率偏置隨機游走方式對網(wǎng)絡上的節(jié)點進行采樣,根據(jù)公式(1)計算2個參數(shù)(p、q)指導的二階隨機游走概率:
(1)
式中,αpq(t,x)表示游走概率,dtx表示節(jié)點到節(jié)點的邊數(shù);p表示廣度優(yōu)先搜索游走時從當前節(jié)點跳至原來節(jié)點的概率;q表示深度優(yōu)先搜索游走時離開當前節(jié)點跳至其他節(jié)點的概率。
以node2vec算法提取的序列作為CBOW訓練模型的輸入項。CBOW模型結構包括輸入層(Input layer)、投影層(Projection layer)和輸出層(Output layer)。輸入層以獨熱編碼方式表示輸入目標節(jié)點的C個上下文節(jié)點的初始化向量,乘以共享輸入權重矩陣,得到所有節(jié)點對應的低維節(jié)點向量;在投影層中將上述相乘所得節(jié)點向量累加后求其平均值,即對C個上下文節(jié)點的低維向量求平均值,再乘以共享輸出矩陣(所有節(jié)點對應的上下文向量)而得到輸出層,即一個softmax回歸分類器,可輸出降維的節(jié)點向量(圖2)。
node2vec+CBOW模型設置:對模型訓練迭代500次,游走次數(shù)800次,每次隨機游走長度為200;設p為0.1,q為1.6;設嵌入向量維數(shù)N為10,滑動窗口設為3,則上下文節(jié)點數(shù)量為2C。將多參數(shù)節(jié)點嵌入向量拼接,計算2個節(jié)點之間的余弦相似性,進而重構網(wǎng)絡;所獲數(shù)值越大,則2個向量的相似度越高,如公式(2):
(2)
式中,S(i,j)表示第i個節(jié)點與第j個節(jié)點之間的相似度,Ai、Aj表示節(jié)點的嵌入向量,·表示向量的點積,|Ai|、|Aj|表示向量的范數(shù)。
為進一步評估大腦左、右半球的各自特性,消除大腦半球間的連接,將融合網(wǎng)絡分為左、右2個半球。
1.4 統(tǒng)計學分析 采用SPSS 19.0統(tǒng)計分析軟件。以頻數(shù)表示計數(shù)資料,以χ2檢驗比較2組性別差異;以±s表示計量資料,采用t檢驗比較2組年齡及受教育年限差異。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
采用GRETNA工具箱計算網(wǎng)絡屬性,全局特征包括局部效率(local efficiency, Eloc)和標準化聚類系數(shù)(γ)、標準化路徑長度(λ)、小世界(small world, SW)屬性、分類系數(shù)(assortativity coefficient, AC)、模塊性(modularity, M)及度(degree, D),節(jié)點特征指節(jié)點度。以雙樣本T檢驗比較2組網(wǎng)絡屬性,選取P值<0.001的拓撲屬性作為分類特征(經(jīng)Bonferroni校正),并以T值作為判斷特征貢獻度的依據(jù)。采用支持向量機(support vector machine, SVM)算法進行分類,行10折交叉驗證,重復100次實驗;繪制受試者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲線,以分類準確率均值作為最終評估結果(圖3)。
2組受試者性別(χ2=0.399,P=0.527)、年齡(t=1.377,P=0.171)差異均無統(tǒng)計學意義;BD組受教育年限長于NC組(t=2.075,P=0.039)。
2.1 網(wǎng)絡特征選擇 相比NC組,除大腦左半球γ及AC外,BD組大腦網(wǎng)絡特征Eloc、γ、λ、SW和M均顯著增加,而AC顯著降低,見圖4A;以組間差異顯著的全局特征屬性作為分類特征,見圖4B。
融合網(wǎng)絡節(jié)點度分析中,BD組大腦左、右半球均較NC組存在顯著差異,且右半球異常腦區(qū)多于左半球,主要集中于額葉[右側中央前回(precentral gyrus, PreCG)、雙側額中回(middle frontal gyrus, MFG)、雙側額中回眶部(orbital part of middle frontal gyrus, ORBmid)、右側額下回眶部(orbital part of inferior frontal gyrus, ORBinf)、雙側眶內額上回(medial orbital of superior frontal gyrus, ORBsupmed)、右側補充運動區(qū)(supplementary motor area, SMA)]、頂葉[右側頂下緣角回(inferior parietal lobule, but supramarginal and angular gyri, IPL)、雙側緣上回(supramarginal gyrus, SMG)、右側角回(angular gyrus, ANG)、雙側中央旁小葉(paracentral lobule, PCL)],以及邊緣系統(tǒng)[左側中央溝蓋(Rolandic operculum, ROL)、左側島葉(insular lobe, INS)、雙側內側和旁扣帶回(median cingulate and paracingulate gyrus, DCG)、雙側海馬(hippocampus, HIP)、雙側海馬旁回(parahippocampal gyrus, PHG)、雙側杏仁核(amygdala, AMYG)、右側尾狀核(caudate nucleus, CAU)、雙側殼核(putamen, PUT)、雙側蒼白球(pallidum, PAL)、雙側丘腦(thalamus, THA)、左側顳極(middle temporal pole, TPOmid)]及枕葉[左側舌回(lingual gyrus, LING)],見圖5A;特征選擇貢獻度排序見圖5B。
2.2 分類性能 FA、lgiMD、lgiAD及l(fā)giRD單一參數(shù)網(wǎng)絡選取左、右半球合并特征診斷BD的準確率分別為93.55%、94.45%、93.54%及94.36%,均高于基于左半球特征的89.91%、90.02%、88.09%及88.18%和基于右半球特征的92.36%、93.64%、92.98%及93.45%。融合網(wǎng)絡中,選取左、右半球合并特征診斷BD的準確率最高,達99.10%,高于基于左半球特征的96.27%和基于右半球特征的98.18%。見圖6。
DTI可通過量化水分子擴散特性而從多種角度檢測大腦白質結構異常。FA對多種潛在神經(jīng)病理學過程的敏感性較高,但非特異性不高;MD可反映水分子平均擴散水平;AD和RD變化與軸突和髓鞘損傷相關?;诖耍疚奶岢鲆环N多參數(shù)融合網(wǎng)絡模型,即融合FA、MD、AD和RD 4個參數(shù)特性的網(wǎng)絡模型,對BD大腦進行綜合性分析,進而輔助診斷BD;通過提取多參數(shù)網(wǎng)絡節(jié)點的嵌入特征并進行拼接,重構余弦相似度半球網(wǎng)絡并進行統(tǒng)計分析,以組間差異顯著的圖論屬性作為分類特征,用于分類和預測BD。
既往研究[13]表明,BD患者腦網(wǎng)絡存在整體退化,可能與髓鞘和軸突損傷有關;BD患者髓鞘相關基因表達異??赡茉斐善淝榫w的產(chǎn)生和調節(jié)異常[14]。本研究網(wǎng)絡全局特征結果表明,BD患者大腦整合功能下降(λ增加),分離功能增加(Eloc,γ增加)且SW屬性喪失,提示其半球網(wǎng)絡拓撲結構被破壞;且腦半球網(wǎng)絡出現(xiàn)異常的模塊分離(M增加)和網(wǎng)絡復原力(AC降低),可能因其腦網(wǎng)絡處理模式更易受到干擾,致大腦信息交流傳遞出現(xiàn)異常[15]。
本研究網(wǎng)絡節(jié)點特征結果顯示,BD所致異常主要集中在額葉-皮層-紋狀體-丘腦回路這一關鍵區(qū)域,該區(qū)域回路中斷可能導致情緒信息處理異常和情緒調節(jié)不足[16]。一項fMRI研究[16]結果表明,BD患者大腦右半球功能紊亂,而右半球可能在情緒調節(jié)中占據(jù)主導地位。本研究同樣發(fā)現(xiàn)BD患者右半球異常腦區(qū)較多,可能與其大腦不對稱性喪失或反轉有關;這些異常腦區(qū)除與情緒功能障礙有關外,還與記憶、視覺、注意力、執(zhí)行等認知功能存在緊密聯(lián)系。
既往研究中,基于DTI數(shù)據(jù)以SVM模型區(qū)別NC和BD的準確率達78.12%[17];以Keras建立序列深度學習模型預測BD的準確率可達92%[18]。本研究選取左、右半球合并特征,基于node2vec及CBOW的融合網(wǎng)絡模型的分類準確率高達99.10%,提示融合網(wǎng)絡模型可更好地提取節(jié)點間的隱含特征信息,極大地提升分類效果。
綜上,本研究建立的多參數(shù)融合網(wǎng)絡模型對于BD與NC的分類準確率高達99.10%,為臨床輔助診斷BD提供了新的視角。但本研究僅針對大腦結構網(wǎng)絡,未涉及功能網(wǎng)絡,有待進一步探索。