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      紅外相機(jī)監(jiān)測(cè)目標(biāo)物種的一種自動(dòng)化檢測(cè)方法:以綠尾虹雉為例

      2022-07-28 08:26:26王翰霖文帥白俊李東睿羅概林玉成
      四川動(dòng)物 2022年4期
      關(guān)鍵詞:候選框紅外物種

      王翰霖 ,文帥 ,白俊 ,李東睿 ,羅概 ,林玉成 *

      (1.四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,成都 610065;2.四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,四川省瀕危野生動(dòng)物保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,成都 610065;3.西南科技大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,四川 綿陽(yáng) 621010)

      紅外相機(jī)在野外動(dòng)物資源和棲息地調(diào)查、日活動(dòng)節(jié)律和動(dòng)物行為監(jiān)測(cè)中具有重要的地位(李晟等,2014),具有定量定性、非侵入性等優(yōu)點(diǎn)(汪國(guó)海等,2016),有利于我國(guó)物種的監(jiān)測(cè)以及區(qū)域性編目工作的開(kāi)展(朱淑怡等,2017)。唐卓等(2017)利用布設(shè)紅外相機(jī)捕捉的圖像數(shù)據(jù)來(lái)分析綠尾虹雉的年活動(dòng)、日活動(dòng)以及活動(dòng)溫度范圍。但是,紅外相機(jī)監(jiān)測(cè)中普遍存在數(shù)據(jù)量大、數(shù)據(jù)處理工作量大的挑戰(zhàn),須投入大量的人力和物力(田成等,2018)。如何挖掘紅外相機(jī)圖像中的有用信息并規(guī)范管理是目前普遍存在的問(wèn)題(劉雪華等,2018)。

      在復(fù)雜的氣候條件下,對(duì)紅外相機(jī)監(jiān)測(cè)到的部分中、小型物種進(jìn)行鑒定的難度更大,意味著誤檢、漏檢的概率更高(朱淑怡等,2017)。近年來(lái),為提高對(duì)紅外相機(jī)圖像的處理效率,結(jié)合紅外相機(jī)深度學(xué)習(xí)成為當(dāng)下研究熱門(mén)。Norouzzadeh等(2017)利 用 VGGNet(Simonyan&Zisserman,2014)、ResNet(He,2016)等神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法對(duì)野生動(dòng)物進(jìn)行物種識(shí)別;成都大熊貓繁育研究基地實(shí)現(xiàn)了對(duì)大熊貓繁殖的自動(dòng)化監(jiān)測(cè)(Yan,2020),其他研究包括日常行為(Ren,2015;Swarup,2021)、面部(何育欣等,2020)和個(gè)體識(shí)別(Hou,2020)。當(dāng)下,生態(tài)分析自動(dòng)化是紅外相機(jī)監(jiān)測(cè)體系未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì)(楊彪等,2021)。降低人力、物力成本,提高紅外相機(jī)圖像處理效率,并保證圖像識(shí)別結(jié)果的準(zhǔn)確性至關(guān)重要。目前,有關(guān)紅外相機(jī)圖像物種識(shí)別的自動(dòng)化檢測(cè)方法仍有一些技術(shù)問(wèn)題亟待解決。

      卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)識(shí)別方法提取單幅圖像所有特征,在背景比重過(guò)大的情況下會(huì)導(dǎo)致模型準(zhǔn)確度差、檢出率低(Krizhevsky,2012;Gomez,2016)。為解決背景干擾問(wèn)題,Norouzzadeh等(2017)選擇直接性剔除背景圖,劉文定等(2018)運(yùn)用興趣區(qū)作為目標(biāo)物種的識(shí)別區(qū)域,但仍存在效率低下、操作繁瑣等弊端。宮一男等(2019)使用基于 DarkNet53 的 YOLOv3(Redmon&Farhadi,2018)進(jìn)行模型訓(xùn)練,取得了較好的效果,但識(shí)別的準(zhǔn)確度與檢出率相較于人工識(shí)別,仍有一定的提升空間。

      檢出率是衡量模型可靠性的重要指標(biāo),與訓(xùn)練數(shù)據(jù)集容量正相關(guān)(Tabak,2019)。對(duì)于非珍稀瀕危動(dòng)物而言,數(shù)據(jù)量較充足,能夠容易地訓(xùn)練檢出率較高的模型,但對(duì)于某些地區(qū)特有且數(shù)量稀少的珍稀瀕危動(dòng)物而言,數(shù)據(jù)量稀少導(dǎo)致模型的檢出率受限。本研究擬通過(guò)改進(jìn)目標(biāo)檢測(cè)方法來(lái)提高模型的檢出率。

      以我國(guó)特有種、國(guó)家一級(jí)重點(diǎn)保護(hù)鳥(niǎo)類(lèi)——綠尾虹雉為對(duì)象,提出一種基于紅外相機(jī)監(jiān)測(cè)的目標(biāo)物種的自動(dòng)化檢測(cè)方法,該方法可在目標(biāo)物種紅外相機(jī)數(shù)據(jù)較少的情況下,訓(xùn)練出高準(zhǔn)確率與檢出率的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,從而進(jìn)一步提高紅外相機(jī)自動(dòng)化處理的效率,推進(jìn)紅外相機(jī)在野生動(dòng)物資源監(jiān)測(cè)中的運(yùn)用以及對(duì)目標(biāo)物種的保護(hù)。除此之外,本方法具有一定的普適性,可訓(xùn)練出針對(duì)其他目標(biāo)物種的自動(dòng)化目標(biāo)檢測(cè)模型。

      1 方法的構(gòu)建思路

      1.1 架構(gòu)思路

      以 YOLOv5(https://githubcom/ultralytics/yolov5)為依托,分析目標(biāo)檢測(cè)(Bochkovskiy,2020)網(wǎng)絡(luò)模型的處理流程,設(shè)計(jì)先驗(yàn)框策略,改進(jìn)特征提取骨干網(wǎng)絡(luò),植入?yún)f(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)(Hou,2021),改進(jìn)目標(biāo)檢測(cè)網(wǎng)絡(luò),提出一種改進(jìn)的目標(biāo)檢測(cè)模型。

      1.2 訓(xùn)練流程設(shè)計(jì)

      使用相同的數(shù)據(jù)與訓(xùn)練參數(shù)對(duì)改進(jìn)網(wǎng)絡(luò)與原生YOLOv5進(jìn)行模型訓(xùn)練,測(cè)試訓(xùn)練的模型,以驗(yàn)證改進(jìn)網(wǎng)絡(luò)模型的優(yōu)勢(shì)。為簡(jiǎn)化訓(xùn)練流程,對(duì)模型訓(xùn)練采用遷移學(xué)習(xí)技術(shù)。遷移學(xué)習(xí)可有效提高訓(xùn)練效率以及模型準(zhǔn)確度。分析野外環(huán)境紅外相機(jī)所捕捉到綠尾虹雉個(gè)體存在大目標(biāo)與小目標(biāo)的情況,自定義分類(lèi)個(gè)數(shù)以適應(yīng)訓(xùn)練過(guò)程。

      1.3 性能優(yōu)化策略

      為有效提高模型的精確度(Precision)與檢出率(Recall),采取具有空間和通道的協(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)對(duì)網(wǎng)絡(luò)模型進(jìn)行優(yōu)化,以CSPDarkNet53提取骨干網(wǎng)絡(luò)為切入點(diǎn),在其末端植入?yún)f(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)。

      1.4 數(shù)據(jù)集準(zhǔn)備

      模型訓(xùn)練需要海量的標(biāo)記照片數(shù)據(jù)作為學(xué)習(xí)的先驗(yàn)知識(shí),因此進(jìn)行了數(shù)據(jù)的實(shí)地采集。于2019年8—10月和2020年4—10月在四川唐家河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)采集11萬(wàn)條紅外相機(jī)數(shù)據(jù),提取綠尾虹雉紅外相機(jī)圖像數(shù)據(jù)715張,涵蓋不同距離、不同拍攝角度以及其他若干指標(biāo),如綠尾虹雉側(cè)面、正面、斜面、背面以及不同曝光度,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)代表性較好。對(duì)715張圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)增強(qiáng)操作,例如翻轉(zhuǎn)、旋轉(zhuǎn)、對(duì)比度、飽和度、亮度的隨機(jī)化調(diào)整,生成2 855條數(shù)據(jù)。

      對(duì)2 284張照片中的綠尾虹雉個(gè)體進(jìn)行人工打框和添加標(biāo)記操作,框選部分盡可能保證與動(dòng)物的輪廓相貼合,標(biāo)記的名稱(chēng)為。采用5折交叉驗(yàn)證,訓(xùn)練集與測(cè)試集的比例為4∶1,確保最終的訓(xùn)練效果。

      2 自動(dòng)化檢測(cè)方法的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

      2.1 網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練流程概述

      網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練流程分為3個(gè)板塊:前向傳播、損失計(jì)算和反向傳播。前向傳播是網(wǎng)絡(luò)模型的主要部分。由于前向傳播的復(fù)雜性,決定了梯度更新的反向傳播操作復(fù)雜,故選擇YOLOv5簡(jiǎn)化反向傳播操作。以綠尾虹雉這單一物種為例,通過(guò)自定義聚類(lèi)先驗(yàn)框、植入?yún)f(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)有效提高模型的訓(xùn)練精度。

      2.2 基礎(chǔ)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

      網(wǎng)絡(luò)引入的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)由輸入層、骨干網(wǎng)絡(luò)層、特征融合層和推理預(yù)測(cè)層組成(表1)。為簡(jiǎn)化網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建流程,沿用YOLOv5中的輸入層、特征融合層與預(yù)測(cè)層。由于方法涉及單目標(biāo)檢測(cè),考慮到綠尾虹雉個(gè)體大小及其他特征,對(duì)跨階段局部網(wǎng)絡(luò)的殘差數(shù)量進(jìn)行改進(jìn),并在骨干網(wǎng)絡(luò)層的最后階段植入?yún)f(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)。

      表1 網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)Table 1 Infrastructure of proposed network

      改進(jìn)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1所示。

      圖1 改進(jìn)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.1 Structure of proposed network

      骨干網(wǎng)絡(luò)層提取的特征圖分為大、中、小3個(gè)尺度,大特征圖對(duì)應(yīng)提取的較小目標(biāo)特征,中等特征圖對(duì)應(yīng)提取的中等大小目標(biāo)特征,小特征圖對(duì)應(yīng)提取的大目標(biāo)特征。特征融合層借鑒特征金字塔結(jié)構(gòu)與路徑融合結(jié)構(gòu),提高對(duì)不同尺度像素特征的融合能力。

      2.2.1 損失計(jì)算方法 因單類(lèi)別檢測(cè)的緣故,將推理預(yù)測(cè)層分類(lèi)數(shù)量設(shè)置為1。采用泛化交并比作為候選框的損失函數(shù);置信度預(yù)測(cè)使用邏輯回歸策略;采用二元交叉熵?fù)p失函數(shù)計(jì)算分類(lèi)損失。計(jì)算的所有損失以如下形式展現(xiàn):

      特征圖被分為數(shù)量的網(wǎng)格,為候選框的數(shù)量,代表網(wǎng)格的索引,代表候選框的索引,I代表第個(gè)單元格的第個(gè)候選框中對(duì)象預(yù)測(cè)為“存在”,代表負(fù)責(zé)檢測(cè)當(dāng)前物體的檢測(cè)框,為位置誤差,為含有物體與不含有物體的置信度誤差,為最終的分類(lèi)誤差。

      2.2.2 檢測(cè)框生成方法 為高效、精確地生成檢測(cè)框,提高模型檢出率,采用聚類(lèi)的方法生成6個(gè)用于預(yù)測(cè)的先驗(yàn)框,計(jì)算公式如下:(boxcentroid)1-IOU(box,centroid),式中,box為標(biāo)注框,centroid為聚類(lèi)框,IOU為標(biāo)注框與聚類(lèi)框的交并比,為標(biāo)注框與聚類(lèi)框的差異度,通過(guò)該法不斷進(jìn)行更新迭代,最終生成的先驗(yàn)框(寬×高)分 別 為(26×57)、(67×71)、(82×140)、(146×137)、(226×199)、(262×279)(表2)。

      表2 輸出特征圖尺度與對(duì)應(yīng)先驗(yàn)框大小Table 2 Size of feature map and corresponding anchor box size

      根據(jù)特征圖的尺度選擇不同的先驗(yàn)框進(jìn)行預(yù)測(cè),生成的預(yù)測(cè)框?yàn)楹蜻x框(圖2)。

      圖2 目標(biāo)物種候選框的預(yù)測(cè)方法Fig.2 Bounding boxes with dimension priors and location prediction

      式中,p、p為先驗(yàn)框在特征圖中的寬、高;函數(shù)用于約束t、t的偏移量,使其值落在0~1之間;σ(t)、σ(t)t、t為候選框中心點(diǎn)坐標(biāo)相對(duì)于特征圖的偏移量以及寬、高的預(yù)測(cè)值;c、c為候選框相對(duì)于整個(gè)特征圖網(wǎng)格位置的補(bǔ)償點(diǎn)坐標(biāo);b、b為候選框在特征圖上的中心點(diǎn)坐標(biāo);b、b為候選框在特征圖上的寬、高。對(duì)候選框的篩選使用非極大值抑制策略,篩選后的框?yàn)樽罱K的檢測(cè)框。完成上述計(jì)算后,依據(jù)特征提取骨干網(wǎng)絡(luò)對(duì)輸入圖片到特征圖的降采樣系數(shù),進(jìn)行特征圖到實(shí)際圖像的還原操作,得到檢測(cè)框在實(shí)際照片中的位置。

      2.3 協(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)植入

      協(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)突出感興趣的目標(biāo)區(qū)域,通過(guò)對(duì)通道和空間位置權(quán)重的重新分配以達(dá)到前景、背景分離以及獲取大范圍上下文依賴(lài)關(guān)系的目的。將協(xié)同注意力模型植入所提出的特征提取骨干網(wǎng)絡(luò)部分,通過(guò)對(duì)已提取特征圖進(jìn)行重新加權(quán)賦值,從而有效獲取目標(biāo)區(qū)域位置并減少背景干擾。

      圖3 協(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig.3 Network structure of coordinate attention

      2.4 網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練

      在表3所示的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)環(huán)境下,選擇Adam為優(yōu)化器,學(xué)習(xí)率設(shè)置為0.001,動(dòng)量因子設(shè)置為0.1,批處理參數(shù)設(shè)置為32,最大迭代次數(shù)為1 000。每進(jìn)行一輪迭代,輸入的圖像數(shù)量為256,照片縮放大小設(shè)置為608*608。采用泛化交并比作為檢測(cè)框的損失函數(shù);置信度預(yù)測(cè)使用邏輯回歸策略。

      表3 基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)環(huán)境Table 3 Basic experimental environment

      訓(xùn)練圖像進(jìn)行前向傳播、計(jì)算損失、反向傳播計(jì)算更新模型的權(quán)重參數(shù),以此不斷迭代處理,使模型損失收斂,最終保存最佳的權(quán)重參數(shù)作為綠尾虹雉目標(biāo)檢測(cè)模型權(quán)重。依次對(duì)改進(jìn)網(wǎng)絡(luò)模型以及原生YOLOv5進(jìn)行訓(xùn)練,訓(xùn)練歷時(shí)72 h。

      3 自動(dòng)化檢測(cè)方法的實(shí)現(xiàn)

      3.1 評(píng)價(jià)指標(biāo)

      運(yùn)用精確度、檢出率、均值化平均精確度(mAP)對(duì)模型進(jìn)行評(píng)價(jià)。

      式中,TP為預(yù)測(cè)正確的數(shù)目,F(xiàn)P為預(yù)測(cè)錯(cuò)誤的數(shù)目,F(xiàn)N為漏檢的數(shù)目。IOU>0.5的候選框?yàn)門(mén)P,IOU<0.5的為FP。在候選框生成后進(jìn)行非極大值抑制生成最終的檢測(cè)框。mAP是評(píng)估目標(biāo)檢測(cè)模型效果的重要指標(biāo),用于衡量檢測(cè)框與標(biāo)記框的匹配精度以及預(yù)測(cè)物種名與標(biāo)記物種名的一致性,該指標(biāo)可通過(guò)精確度和檢出率來(lái)計(jì)算。本研究涉及的是單目標(biāo)檢測(cè),因此不存在真負(fù)例指標(biāo)(TN),且mAP值與AP值相同。mAP@0.5為在IOU>0.5下曲線(xiàn)下方的面積(圖4)。

      圖4 綠尾虹雉目標(biāo)檢測(cè)P-R曲線(xiàn)Fig.4 P-R curve of Lophophorus lhuysii

      3.2 驗(yàn)證結(jié)果

      模型訓(xùn)練結(jié)果如圖5所示。

      圖5 目標(biāo)物種的自動(dòng)化檢測(cè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.5 Automated test results of target species

      從訓(xùn)練模型對(duì)測(cè)試集處理的結(jié)果上看,訓(xùn)練模型已達(dá)到最優(yōu)的條件。改進(jìn)方法訓(xùn)練模型的mAP@0.5指標(biāo)優(yōu)于原生YOLOv5訓(xùn)練模型,模型的擬合度適中。隨后進(jìn)行一組照片測(cè)試,模型預(yù)測(cè)的檢測(cè)框貼合綠尾虹雉個(gè)體較好,在光線(xiàn)暗淡、巖石遮擋的情況下也達(dá)到了比較理想的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度。

      在10余萬(wàn)張紅外相機(jī)照片中,對(duì)拍攝到綠尾虹雉個(gè)體的相機(jī)的所有照片進(jìn)行檢測(cè)(表4),從總的檢測(cè)指標(biāo)看,改進(jìn)的模型相較于原生YOLOv5,在檢出率、精確度指標(biāo)上均占優(yōu)。

      表4 照片分揀結(jié)果Table 4 Photo sorting results

      經(jīng)植入?yún)f(xié)同注意力網(wǎng)絡(luò)后,測(cè)試結(jié)果顯示改進(jìn)的訓(xùn)練模型對(duì)綠尾虹雉的識(shí)別準(zhǔn)確度達(dá)到了99.62%,檢出率高達(dá)100%。在測(cè)試環(huán)境下,模型對(duì)所有數(shù)據(jù)集的檢測(cè)速度平均為每張0.07 s,若為視頻數(shù)據(jù)流,則能夠應(yīng)對(duì)實(shí)時(shí)的目標(biāo)檢測(cè)任務(wù)。

      4 結(jié)論與討論

      本文聚焦紅外相機(jī)圖像的自動(dòng)化檢測(cè),運(yùn)用深度學(xué)習(xí)技術(shù),以綠尾虹雉為例,植入?yún)f(xié)同注意力機(jī)制,提出并驗(yàn)證改進(jìn)的自動(dòng)化目標(biāo)檢測(cè)方法,實(shí)現(xiàn)了高精度自動(dòng)化識(shí)別與目標(biāo)檢測(cè)任務(wù),可提高對(duì)紅外相機(jī)圖像及視頻的處理效率,降低人力、物力成本,推進(jìn)對(duì)目標(biāo)物種的保護(hù)。

      4.1 方法的實(shí)際應(yīng)用

      在實(shí)際應(yīng)用場(chǎng)景中,科研人員在野外部署若干紅外相機(jī),經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的數(shù)據(jù)收集,由人工或自動(dòng)的方式上傳到紅外相機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù),隨后將大批量的紅外相機(jī)數(shù)據(jù)送入本方法訓(xùn)練完成的模型中進(jìn)行自動(dòng)化處理,最后給予科研人員反饋(圖6)。

      圖6 紅外相機(jī)圖像的處理流程Fig.6 Image processing of infrared camera

      從提高實(shí)際應(yīng)用效率的角度看,本文改進(jìn)的目標(biāo)檢測(cè)方法會(huì)自動(dòng)創(chuàng)建含有目標(biāo)物種的紅外相機(jī)目錄,方便科研人員檢索。對(duì)于獨(dú)立有效照片數(shù)量及相對(duì)拍攝率的獲取,可通過(guò)本方法的附加模塊“Intelli-Camera”自動(dòng)化處理。也可自動(dòng)批量提取目標(biāo)物種照片中的時(shí)間戳、溫度等重要基礎(chǔ)指標(biāo),根據(jù)這些指標(biāo)還可自動(dòng)生成表格,從而更加方便快捷地指導(dǎo)科研實(shí)踐(圖7)。

      圖7 自動(dòng)化流程Fig.7 Automatic process

      4.2 方法的優(yōu)勢(shì)

      本文優(yōu)化了方法所涵蓋的訓(xùn)練過(guò)程,創(chuàng)新性地提出一種針對(duì)綠尾虹雉的自動(dòng)化目標(biāo)檢測(cè)方法,通過(guò)此方法訓(xùn)練生成的模型與YOLOv5相比,其準(zhǔn)確度與檢出率都達(dá)到了較高的水平。

      該方法可推廣到其他中、小型珍稀瀕危野生動(dòng)物物種。且該方法對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)量的要求較低,也可加強(qiáng)對(duì)偶見(jiàn)種的監(jiān)測(cè)(劉雪華等,2018),因此,該模型具有一定的推廣和應(yīng)用價(jià)值。

      4.3 方法的局限性

      本文提出的目標(biāo)物種自動(dòng)化檢測(cè)方法存在一定的局限性。在紅外相機(jī)僅捕捉到其頭部部分或不完整身體的情況下,通常無(wú)法準(zhǔn)確地進(jìn)行自動(dòng)化識(shí)別和目標(biāo)檢測(cè),因此,需要完善綠尾虹雉的頭部或其他不完整軀干數(shù)據(jù)集,并對(duì)其進(jìn)行訓(xùn)練,生成能夠識(shí)別綠尾虹雉頭部以及不完整軀干的模型,綜合本研究的模型,進(jìn)行更可靠、高效的自動(dòng)化識(shí)別與目標(biāo)檢測(cè)。

      4.4 后續(xù)研究展望

      基于紅外相機(jī)的對(duì)野外動(dòng)物物種行為特征自動(dòng)化識(shí)別、個(gè)體自動(dòng)化計(jì)數(shù)技術(shù)是后續(xù)展望研究的部分。行為特征自動(dòng)化識(shí)別、個(gè)體自動(dòng)化計(jì)數(shù)技術(shù)能夠更加精確地計(jì)算出相對(duì)多度指數(shù)(Rowcliffe,2014)、時(shí)間段活動(dòng)強(qiáng)度以及相對(duì)拍攝率(Mohd-Azlan&Engkamat,2013),這能夠更加精確、高效并自動(dòng)化評(píng)估目標(biāo)物種的種群以及季節(jié)活動(dòng)指標(biāo),更好地解決野生動(dòng)物資源監(jiān)測(cè)的三大問(wèn)題(肖治術(shù)等,2014,2017),從而更高效、準(zhǔn)確地推進(jìn)對(duì)目標(biāo)物種的保護(hù),進(jìn)一步提高對(duì)紅外相機(jī)捕捉圖像的利用效率。

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