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      基于不同預(yù)處理的油茶葉片SPAD值高光譜遙感估算研究

      2022-06-25 01:15:04胡岑龍陶光林
      江蘇林業(yè)科技 2022年2期
      關(guān)鍵詞:油茶波段葉綠素

      李 明,胡岑龍,陶光林

      (黔東南州林業(yè)科學(xué)研究所,貴州 凱里 556000)

      葉綠素作為植物進(jìn)行光合作用的重要生化參數(shù),其含量變化與植物光合速率、氮素水平以及植株健康狀況等密切相關(guān),在植物生長、營養(yǎng)狀況及光合作用等方面具有指示作用[1-2]。傳統(tǒng)的葉綠素測量方法主要是通過野外采樣和室內(nèi)分析獲得,該方法不但費(fèi)時、費(fèi)力,且對采集對象具有一定的破壞性和不可恢復(fù)性,難以實(shí)現(xiàn)大面積葉綠素含量的實(shí)時獲取[3]。當(dāng)前已廣泛使用SPAD值反映葉綠素含量,SPAD值表示葉片單位面積葉綠素的相對含量,是一個無量綱的比值。與傳統(tǒng)方法相比,SPAD測定具有快速、無損和簡便的特點(diǎn),但僅能進(jìn)行某個點(diǎn)或小范圍的測量,不利于大范圍葉綠素含量的監(jiān)測[4]。而隨著遙感技術(shù)的不斷發(fā)展,高光譜憑借其高空間分辨率、多波段和光譜信息豐富的特點(diǎn)和優(yōu)勢,使實(shí)時、快速監(jiān)測植被葉綠素含量成為可能,為采用遙感無損大尺度監(jiān)測植被葉綠素含量提供了有效手段[5]。20世紀(jì)90年代,Blackburn[6]通過光譜指數(shù)估計葉片色素濃度得出葉綠素與高光譜波段之間存在一定的關(guān)系。隨后,許多學(xué)者利用高光譜原始數(shù)據(jù)或由原始數(shù)據(jù)構(gòu)建的植被指數(shù)、基于經(jīng)驗(yàn)統(tǒng)計模型估算葉綠素含量開展了大量的研究,但大多集中在農(nóng)作物小麥、玉米、棉花等方面,而在森林植被方面,杜華強(qiáng)等[7]基于偏最小二乘回歸模型建立了馬尾松葉綠素含量與光譜反射率及9個特征參數(shù)之間的預(yù)測模型,其精度遠(yuǎn)大于傳統(tǒng)線性回歸模型。林輝等[8]以杉木成熟林為研究對象,通過分析葉綠素總量與原始光譜、原始光譜一階微分之間的相關(guān)性,構(gòu)建了杉木葉綠素含量的高光譜模型。隨著研究的不斷深入,模型構(gòu)建方面開始使用機(jī)器學(xué)習(xí)模型,馮海寬等[9]基于特征光譜參數(shù)利用隨機(jī)森林模型較好估算了蘋果葉片葉綠素含量。尼格拉·吐爾遜等[10]基于光譜一階導(dǎo)數(shù)的地理加權(quán)最小二乘支持向量回歸模型較好實(shí)現(xiàn)了對紅棗樹葉片SPAD值的預(yù)測。

      油茶(CamelliaoleiferaAbel.)為我國4大木本油料樹種之一。本文分別對原始光譜進(jìn)行一階導(dǎo)數(shù)、S-G平滑、多元散射校正(MSC)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量(SNV)及向量歸一化(VN)處理,結(jié)合偏最小二乘回歸模型進(jìn)行油茶葉片SPAD值估算,探索簡便、快捷的油茶葉片光譜預(yù)處理方法和油茶葉片SPAD值反演模型,為提高油茶葉綠素含量遙感估算精度,以便精準(zhǔn)監(jiān)測其生長及健康狀況提供一定的理論依據(jù)和技術(shù)支持。

      1 材料與方法

      研究區(qū)位于貴州省黎平縣東風(fēng)林場(東經(jīng)109°11′15″,北緯26°20′23″),研究對象為2021年7月采集的油茶葉片,為保證試驗(yàn)結(jié)果的代表性,在油茶試驗(yàn)林內(nèi)隨機(jī)選取林齡為11 a生長健康的油茶樹50株作為樣本,每個樣本按照上、中、下3層隨機(jī)各采集健康、完整、無損的葉片3片,共采集9片作為1個樣本的樣葉,將采集的葉片裝入密封袋并編號,帶回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行光譜數(shù)據(jù)的測定。

      1.1 數(shù)據(jù)采集

      使用FX2000光譜儀(光譜儀波長范圍為350—1 100 nm,狹縫寬度25 μm,光譜分辨率0.73 nm,以鎢石英鹵素?zé)魹楣庠?在暗室內(nèi)進(jìn)行油茶葉片光譜數(shù)據(jù)采集,為降低環(huán)境對測量結(jié)果的干擾,每次光譜測量前用白板進(jìn)行定標(biāo),并用干燥紙巾將葉片表面擦試干凈,然后鋪平放置于操作平臺,探頭在距葉片2 cm處垂直向下測量,每個樣本的樣葉重復(fù)測量5次,取其平均值作為該樣本的光譜反射率。根據(jù)Chan等[11]人的研究,葉綠素敏感波段主要分布在可見光-近紅外波段。因此,本研究選擇400—1 000 nm波段進(jìn)行油茶葉片特征波段的選擇和葉綠素含量的估算研究。

      為保證數(shù)據(jù)的一致性和精度,每個樣本光譜測量完后隨即采用HM-YD葉綠素儀進(jìn)行SPAD值的測量,測量時避開主脈,每個樣本的樣葉隨機(jī)選擇5個不同部位進(jìn)行測量,最終取平均值作為該樣本的SPAD值。

      1.2 光譜數(shù)據(jù)預(yù)處理

      本文使用Unscrambler 10.4軟件對原始光譜進(jìn)行一階導(dǎo)數(shù)(主要是消除不同程度的背景干擾、實(shí)現(xiàn)光譜基線校正、提高不同吸收特征的對比度和光譜特征值)、S-G平滑(消除數(shù)據(jù)噪聲在提取地物光譜信息時產(chǎn)生的干擾)、多元散射校正(MSC,主要是消除顆粒大小對光譜產(chǎn)生的光譜差異,增加光譜與數(shù)據(jù)間的相關(guān)性)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量(SNV,主要用于消除表面散射及光程度變化所帶來的光譜誤差)和向量歸一化(VN,主要通過光譜數(shù)據(jù)減去光譜的吸光度平均值,來消除光程變化對光譜產(chǎn)生的影響)5種預(yù)處理。

      1.3 模型精度評價

      為了提高估算模型的普適性,需對構(gòu)建的估測模型進(jìn)行精度評價,將樣本實(shí)測值帶入估測模型進(jìn)行實(shí)際樣本值與估測模型值之間的精度比較。本研究采用以下3種評價指標(biāo)對構(gòu)建的模型效果進(jìn)行評價:

      (1)決定系數(shù)(R2)。R2用于表示實(shí)測值與預(yù)測值間的擬合程度,數(shù)值范圍為0—1。R2越大, 模型的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性越高。

      (2)均方根誤差(RMSE)。用RMSE來確定模型的預(yù)測能力。RMSE越小,模型的精度越高,預(yù)測能力越好。

      (3)相對誤差(RE)。RE表示預(yù)測值與實(shí)測值的偏差。RE越小, 模型的估算能力越強(qiáng), 則預(yù)測值與實(shí)測值擬合效果更好。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 光譜預(yù)處理

      在原始光譜數(shù)據(jù)的采集中,不僅包含有用信息,同時還受到雜散光、儀器噪聲、樣品背景、基線漂移等因素的干擾,這些因素都影響了特征波長的選取,從而影響光譜的定量和定性分析結(jié)果。因此,為了使提取的光譜信息更加準(zhǔn)確反映樣本曲線的變化,需要對原始光譜進(jìn)行預(yù)處理,盡量消除或減少光照強(qiáng)度、環(huán)境因素和噪聲干擾對光譜信息的影響。本試驗(yàn)采用一階導(dǎo)數(shù)、S-G平滑、MSC、SNV和VN方法對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,原始光譜與處理后的光譜對比見圖1。

      圖1 原始光譜與預(yù)處理后的光譜

      2.2 SPA算法特征變量篩選

      在對樣本進(jìn)行光譜信息采集時,采集的每條光譜曲線包含有數(shù)百甚至數(shù)千個數(shù)據(jù)點(diǎn),同時,光譜信息中含有大量的冗余、共線和重疊信息,大量的數(shù)據(jù)明顯影響建模的精度。本文利用連續(xù)投影算法[12](SPA)篩選油茶光譜數(shù)據(jù)SPAD值的敏感特征波段。作為一種前向特征向量選擇方法,它以較高的精度在光譜分析領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。當(dāng)用于光譜敏感特征波段的篩選時,可以通過設(shè)置特征波段的數(shù)量來降低建模的復(fù)雜性,研究設(shè)置特征波段篩選的數(shù)目范圍為1—15,在均方根誤差達(dá)最小時篩選出共線性最小、相關(guān)性最高的油茶葉片光譜對SPAD值敏感的特征波段。圖2為通過SPA算法對原始光譜及預(yù)處理光譜篩選的特征波段,橫軸表示波長,縱軸表示光譜反射率。由圖2可以看出,在500—1 000 nm波段為主要的敏感特征波段分布范圍,以670—780 nm波段范圍的特征波段最多。

      圖2 基于SPA算法的特征波長選擇結(jié)果

      2.3 模型構(gòu)建

      在R軟件下采用pls包進(jìn)行偏最小二乘回歸(PLSR)模型的構(gòu)建,以連續(xù)投影算法從原始光譜和預(yù)處理光譜中提取的特征波長作為回歸模型的自變量,以油茶葉片的SPAD值作為因變量,采用SPXY算法[13]按7∶3的比例進(jìn)行樣本劃分,將油茶葉片SPAD樣本劃分為35個建模集和15個預(yù)測集,分別進(jìn)行PLSR模型的構(gòu)建和預(yù)測,結(jié)果如表1所示。

      表1 基于PLSR的油茶葉片SPAD值估算模型結(jié)果

      由表1建模集可知,光譜經(jīng)過預(yù)處理后,建模精度較原始光譜數(shù)據(jù)均有不同程度的提高,對5種預(yù)處理方法(一階導(dǎo)數(shù)、S-G平滑、MSC、SNV和VN)建立的PLSR模型的精度對比發(fā)現(xiàn),經(jīng)過MSC預(yù)處理后的建模集決定系數(shù)R2最高達(dá)0.855。S-G平滑建模集決定系數(shù)R2最低為0.623。SNV預(yù)處理與MSC預(yù)處理的建模精度相差較小,從整個建模效果對比可知MSC>SNV>一階導(dǎo)數(shù)>VN>S-G平滑>原始光譜。

      從表1的預(yù)測集可知,原始光譜預(yù)測精度R2為0.794,預(yù)測精度大于預(yù)處理的一階導(dǎo)數(shù)、SNV和VN模型的預(yù)測精度。5種預(yù)處理方法中S-G平滑處理的預(yù)測精度最高,決定系數(shù)R2達(dá)0.835;其次是MSC預(yù)處理,決定系數(shù)R2達(dá)0.818。通過對預(yù)測集結(jié)果的殘差分析可知,S-G平滑處理預(yù)測結(jié)果殘差的正態(tài)檢驗(yàn)不通過,雖然決定系數(shù)R2最高,但模型預(yù)測的結(jié)果不準(zhǔn)確。通過模型綜合分析可知,MSC預(yù)處理的建模集和預(yù)測集的精度具有較好的一致性,建立的模型預(yù)測效果最好,能更好實(shí)現(xiàn)對油茶葉片SPAD值的估算。圖3為不同預(yù)處理光譜SPAD值PLSR模型實(shí)測值和預(yù)測值散點(diǎn)圖。

      圖3 不同預(yù)處理光譜SPAD值PLSR模型實(shí)測值和預(yù)測值散點(diǎn)圖

      3 結(jié)論與討論

      本文以油茶葉片SPAD值為研究對象,以簡化和提高油茶葉片SPAD值模型估測精度為研究目的,對原始光譜曲線分別進(jìn)行了一階導(dǎo)數(shù)、S-G平滑、MSC、SNV和VN預(yù)處理,然后通過SPA算法對油茶葉片光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行SPAD值敏感特征波段篩選,最后采用SPXY算法進(jìn)行模型樣本的劃分,并建立了估算油茶葉片SPAD值的偏最小二乘回歸模型,結(jié)果顯示,光譜經(jīng)不同變換和SPA算法處理后,有效降低了光譜信息的冗余,剔除了大量的重疊信息,還保證了篩選的特征波段之間共線性最小,減少了模型自變量的個數(shù),降低了模型構(gòu)建的復(fù)雜程度,模型精度也得到了提高。

      與直接采用原始光譜數(shù)據(jù)建模相比,光譜經(jīng)不同變換后減少了各種干擾信息的影響,有價值波段信息得到增強(qiáng),采用MSC預(yù)處理建立的估算模型精度最高,其建模集R2,RMSE和RE分別為0.855,2.361和3.194%;預(yù)測集R2,RMSE和RE分別為0.818,1.980和2.533%,預(yù)測效果最好,建立的模型可較好實(shí)現(xiàn)對油茶葉片SPAD值的估算。

      葉綠素是植物葉片中吸收光能的主要物質(zhì),其濃度的多少對植株的生長情況產(chǎn)生重要影響[14]。且植物葉片中其他營養(yǎng)元素的合成也與葉綠素內(nèi)部結(jié)構(gòu)有一定的聯(lián)系,通過對葉綠素含量的監(jiān)測,可有效估算植物營養(yǎng)狀況及生理狀態(tài)[15]。而植物葉片的營養(yǎng)狀況與自身的光譜特征密切相關(guān),植物葉片的光譜反射率隨著葉綠素含量的不同而呈現(xiàn)出不同的光譜響應(yīng)曲線[16]。而高光譜遙感信息量豐富,原始光譜易受環(huán)境、背景及噪聲的影響,不可避免會攜帶一些與測試樣本不相關(guān)的信息,如果直接將原始光譜用于建模,反演模型的精度將受到一定程度的制約。基于此,本文采用一階導(dǎo)數(shù)、S-G平滑、MSC、SNV和VN共5種常用的光譜預(yù)處理方法,對預(yù)處理后的光譜信息進(jìn)行特征波段選取,并嘗試性地對油茶葉片SPAD值進(jìn)行光譜建模。MSC預(yù)處理建立的SPAD值模型預(yù)測能力最好,R2為0.818,SNV預(yù)處理預(yù)測效果最差,R2為0.769。由于光譜曲線經(jīng)MSC處理后部分有用信息得到增強(qiáng),建立的模型質(zhì)量較好。一階導(dǎo)數(shù)、SNV和VN預(yù)處理的模型預(yù)測能力,比直接采用原始光譜建模的預(yù)測能力較差,這說明不同的光譜預(yù)處理方法能直接影響模型預(yù)測效果[17]。

      由于高光譜數(shù)據(jù)包含的信息量大,對高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的方法也多種多樣,如何從數(shù)百甚至數(shù)千個光譜信息中提取針對油茶葉綠素的敏感光譜參數(shù),一直都是高光譜數(shù)據(jù)反演的重點(diǎn)和難點(diǎn)。本文只是進(jìn)行了幾種簡單的光譜預(yù)處理,通過連續(xù)投影算法實(shí)現(xiàn)油茶葉片SPAD值預(yù)測模型構(gòu)建,仍存在不足,未進(jìn)行多種預(yù)處理方法的組合及多個模型對比,建立的模型以及篩選的最佳預(yù)處理方法還需進(jìn)一步探索,模型的穩(wěn)健性及普適性有待進(jìn)一步完善。

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