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      ERCC2和MTHFR多態(tài)性與中國北方女性乳腺癌易感性間的相關(guān)性研究

      2022-01-19 06:21:18叢佳
      中國現(xiàn)代醫(yī)藥雜志 2021年12期
      關(guān)鍵詞:葉酸多態(tài)性家族

      叢佳

      作者單位:大連市婦女兒童醫(yī)療中心(集團(tuán))乳腺科,遼寧 大連 116033

      乳腺癌是女性中最常見的惡性腫瘤之一,大量研究表明,遺傳、內(nèi)分泌和外部環(huán)境因素等有助于乳腺癌的發(fā)生和發(fā)展,是多因素、多步驟、多環(huán)節(jié)共同作用的結(jié)果[1]。然而多種因素之間的具體機(jī)制仍未完全明了,因此尋找乳腺癌的發(fā)病機(jī)制對(duì)乳腺癌診斷、治療和預(yù)防有重要意義。近年來,生物學(xué)研究證實(shí)乳腺癌具有較強(qiáng)的遺傳傾向,并與易感基因ERCC2和MTHFR的多態(tài)性密切相關(guān)[2~4]。ERCC2是一種重要的DNA修復(fù)蛋白,參與幾種不同的DNA損傷修復(fù)途徑,包括核苷酸切除修復(fù)、堿基切除修復(fù)、鏈間交聯(lián)修復(fù)和重組DNA修復(fù)[5]。ERCC2基因多態(tài)性與各種類型的癌變過程中的mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)水平降低相關(guān)[6]。MTHFR基因是位于人類1號(hào)染色體短臂的末端(1P36.3),是體內(nèi)葉酸平衡和代謝的關(guān)鍵酶,參與甲基化和DNA合成[7]。迄今為止,通過多個(gè)先前的全基因組關(guān)聯(lián)研究以及薈萃分析研究已鑒定出90多種患乳腺癌的SNP[8]。對(duì)乳腺癌患者ERCC2和MTHFR基因差異性鮮有報(bào)道,相關(guān)研究之間存在差異甚至出現(xiàn)相反的結(jié)論[9],因此本研究分析ERCC2基因rs1799793、rs13181和MTHFR基因rs1801133、rs1801131的SNP位點(diǎn)在中國北方女性乳腺癌患者表達(dá)上的差異,并分析乳腺癌易感性與兩種基因的相關(guān)性,為乳腺癌的診斷、治療及預(yù)后評(píng)估提供新的方向。

      1 材料與方法

      1.1 一般資料選取2018年9月~2020年3月我院乳腺科收治的165例乳腺癌女性患者作為觀察組。選取同時(shí)間我院乳腺體檢的健康女性165例作為對(duì)照組。通過回顧患者的醫(yī)療資料,收集每例患者的相關(guān)臨床病理特征。兩組受試者一般資料比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表1。

      表1 兩組一般資料比較

      入組標(biāo)準(zhǔn):18~70歲適齡女性;臨床癥狀及病理檢查符合乳腺癌診斷標(biāo)準(zhǔn);患者或其監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):非當(dāng)?shù)鼐幼艨谡?;近三代直系親屬非本地戶籍者;乳腺癌多發(fā)轉(zhuǎn)移者;資料不全者;有嚴(yán)重的心腦血管疾病、傳染病者;不同意簽署知情同意書者。觀察組165例乳腺癌患者臨床分期:Ⅰ期58例(35.15%),Ⅱ期46例(27.88%),Ⅲ期31例(18.79%),Ⅳ期30例(18.18%);腫瘤大?。?cm 64例(38.79%),≤5cm 101例(61.21%);腫瘤位置:左側(cè)85例(51.52%),右側(cè)80例(48.48%);48例(29.09%)有轉(zhuǎn)移,117例(70.91%)無轉(zhuǎn)移。

      1.2 方法

      1.2.1 方案設(shè)計(jì) 采集兩組的周圍靜脈血2ml,置于無菌EDTA涂層試管中。血液中DNA提取選用血液/細(xì)胞/組織基因組DN提取試劑盒,離心柱型,根據(jù)制造商說明書進(jìn)行操作。使用NanoVue Plus?分光光度計(jì)(biochrom,美國馬薩諸塞州哈佛生物科學(xué)公司)對(duì)分離的DNA樣品進(jìn)行定量,測(cè)其濃度和A260/A280值,2%的瓊脂糖檢測(cè),確保OD260/280=1.8~2.0,濃度在40ng/μl以上,瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA無降解,確保條帶清晰無拖尾,分裝后,保存在-20℃待用。

      1.2.2 SNP的選擇 根據(jù)基因上具有代表性的功能位點(diǎn)和已經(jīng)報(bào)道過的位點(diǎn)來選擇ERCC2和MTHFR基因的SNP位點(diǎn),本研究選擇ERCC2基因的rs1799793、rs13181和MTHFR基因的rs1801133、rs1801131。

      1.2.3 引物的設(shè)計(jì)與制備 根據(jù)引物設(shè)計(jì)原則利用Primer Prime 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,NCBI-Blast軟件進(jìn)行比對(duì)檢測(cè)它的特異性。設(shè)計(jì)好的引物序列由上海生物技術(shù)工程有限公司合成。5OD,用ddH2O稀釋成25μg/μl的工作液。

      1.2.4 基因的分型 基因型位點(diǎn)主要分型方法為TaqMan SNP基因分型,分型檢測(cè)由上海生物技術(shù)工程有限公司合成協(xié)助完成。

      1.3 觀察指標(biāo)采用哈迪溫伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)分析兩組ERCC2和MTHFR基因的多態(tài)性和等位基因分布;分析ERCC2位點(diǎn)單倍型和MTHFR位點(diǎn)單倍型與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn);分析ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者臨床年齡的關(guān)系;分析ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者家族形成的風(fēng)險(xiǎn)。

      1.4 統(tǒng)計(jì)分析應(yīng)用SPSS 21.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,兩組間的計(jì)數(shù)資料用百分比表示,采用χ2檢驗(yàn),計(jì)量資料用(±s)表示,采用t檢驗(yàn)。非條件logistic回歸分析計(jì)算比值比(odds rations,OR)以及95%可信區(qū)間(confidence intervals,CI)表示乳腺癌的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度。所有的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)概率檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,OR>1時(shí),說明暴露使疾病的危險(xiǎn)度增加,是疾病的危險(xiǎn)因素,與疾病是正相關(guān);當(dāng)OR<1時(shí),說明暴露使疾病的危險(xiǎn)度降低,與疾病是負(fù)相關(guān),暴露因素對(duì)疾病有保護(hù)作用;當(dāng)OR=1時(shí),表明暴露因素與疾病無關(guān)聯(lián)。

      2 結(jié)果

      2.1 ERCC2和MTHFR基因多態(tài)性和等位基因分布對(duì)兩組ERCC2 rs1799793、rs13181和MTHFR rs1801133、rs1801131的基因型分布頻率分別進(jìn)行HWE檢驗(yàn),均符合HWE平衡(P>0.05),見表2,具有群體代表性。

      表2 ERCC2和MTHFR基因的多態(tài)性和等位基因分布

      2.2 ERCC2位點(diǎn)單倍型和MTHFR位點(diǎn)單倍型與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)分析對(duì)于ERCC2 rs1799793-rs1318,觀察組單倍型A-C顯著高于對(duì)照組,它與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)(OR=1.75,95%CI:1.39~2.54,P=0.016),而兩組之間在其他基因型的分布上均未觀察到差異(P>0.05);MTHFR rs1801133-rs1801131組成的各單倍型在兩組之間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表3。

      表3 ERCC2位點(diǎn)單倍型和MTHFR位點(diǎn)單倍型與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)分析

      2.3 ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者臨床年齡的風(fēng)險(xiǎn)分析按年齡將乳腺癌患者分為年齡≤40歲及年齡>40歲,MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型T-C與≤40歲乳腺癌患者的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(OR=3.52,95%CI:1.25~10.39,P=0.047),其余各單倍型并未發(fā)現(xiàn)乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與年齡相關(guān)。見表4。

      表4 ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者臨床年齡的風(fēng)險(xiǎn)分析

      2.4 ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者家族形成的風(fēng)險(xiǎn)分析按乳腺癌患者家族形成分為散發(fā)型和家族型,MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型T-A和T-C與家族型乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)正相關(guān)聯(lián)(OR=1.56和4.96,95%CI:0.9~3.72和0.47~7.62,P=0.009和0.033),說明單倍型T-A和T-C的發(fā)生率家族型比散發(fā)型更高;相反,MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型C-C與家族型乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)負(fù)相關(guān)聯(lián)(OR=0.36,95%CI:0.14~0.95,P=0.001),說明單倍型C-C在散發(fā)型乳腺癌中更為常見,而其余各單倍型與乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)與家族形成無關(guān)。見表5。

      表5 ERCC2和MTHFR單倍型與乳腺癌患者家族形成的風(fēng)險(xiǎn)分析

      3 討論

      受各種環(huán)境和遺傳因素的影響,乳腺癌病因是復(fù)雜的和多因素的。除了易感基因的突變外,鑒定基因多態(tài)性(包括基因中的SNP)與乳腺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性可能有助于了解疾病的發(fā)生機(jī)制[10],而單倍型與乳腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[11]。MTHFR是編碼亞甲基四氫葉酸還原酶的基因,參與葉酸代謝。該酶有助于5,10-亞甲基四氫葉酸(5,10-MTHF)不可逆轉(zhuǎn)化為5-甲基四氫葉酸(5-MTHF)。葉酸的主要循環(huán)形式5-MTHF在DNA合成、DNA甲基化以及DNA修復(fù)和維持中起著不可或缺的作用[12,13]。葉酸缺乏已被證明會(huì)導(dǎo)致DNA損傷、DNA甲基化不足和DNA修復(fù)減少,從而增加染色體斷裂的風(fēng)險(xiǎn)。因此,MTHFR活性對(duì)葉酸利用率的潛在影響使MTHFR基因成為癌癥易感性的候選基因。ERCC2基因是參與DNA損傷修復(fù)途徑必不可少的基因,其產(chǎn)物DNA解旋酶在轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)核苷酸切除修復(fù)過程中非常重要,該過程有助于保持基因組的完整性和穩(wěn)定性[14]。DNA修復(fù)能力是各種惡性腫瘤易感性的重要決定因素[15]。DNA修復(fù)基因中的遺傳多態(tài)性可能導(dǎo)致DNA修復(fù)機(jī)制紊亂,導(dǎo)致突變積累,進(jìn)而可能增加乳腺癌的易感性[16]。因此我們研究了ERCC2和MTHFR基因4個(gè)SNP組成的單倍型與乳腺癌患者的乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)關(guān)系,包括診斷時(shí)的年齡、家族史,結(jié)果顯示ERCC2 rs1799793-rs1318觀察組單倍型A-C乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)顯著高于對(duì)照組,它與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān),而兩組之間在其他基因型的分布上無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05);MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型兩組之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。ERCC2多態(tài)性可引起ERCC2基因中密碼子312 Asp向Asn的氨基酸交換[17]。rs13181編碼遺傳多態(tài)性A到C的取代引起751 Lys到Gln氨基酸的改變,可引起ERCC2基因功能的改變。研究中納入ERCC2基因的功能性遺傳多態(tài)性位點(diǎn)rs1799793和rs13181先前已與特定的DNA缺陷相關(guān),即紫外線誘導(dǎo)的DNA損傷的修復(fù)能力不足。一項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)指出,這兩種多態(tài)性均降低了健康受試者淋巴細(xì)胞中組成型ERCC2 mRNA的水平,從而降低了ERCC2蛋白的含量[18]。

      本研究分析了臨床診斷年齡和家族形成與乳腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn),結(jié)果顯示MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型T-C與≤40歲乳腺癌患者的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)聯(lián),rs1801133-rs1801131組成的單倍型T-A和T-C與家族型乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),而單倍型C-C與個(gè)體型乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),即單倍型T-A和T-C的發(fā)生率家族比散發(fā)者更高,單倍型C-C在散發(fā)型乳腺癌中更為常見,同時(shí)T-C在≤40歲的乳腺癌患者中更為常見,說明MTHFR基因的多態(tài)性與乳腺癌的發(fā)生年齡和家族形式相關(guān),可能為功能性MTHFR變體rs1801133 編碼遺傳多態(tài)性由 C突變?yōu)門,引起丙氨酸變?yōu)槔i氨酸,rs1801131編碼遺傳多態(tài)性A到C的取代引起谷氨酸變?yōu)楸彼?,引起蛋白的改變,產(chǎn)生熱不穩(wěn)定且活性較低的酶,導(dǎo)致MTHFR基因的功能變化。在許多流行病學(xué)研究中,rs1801133和rs1801131組成的單倍型對(duì)增加乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的影響已得到廣泛評(píng)估。另一項(xiàng)研究表明,≤50歲的乳腺癌女性中,風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估得以維持[19]。此外,家族史是與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)的主要因素,我們研究顯示單倍型與家族形式和疾病發(fā)病年齡呈正相關(guān)。本研究分析了ERCC2和MTHFR基因與中國北方女性乳腺癌易感性的關(guān)系,此結(jié)果可以為后期ERCC2和MTHFR基因與乳腺癌的研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。但本研究也存在不足,樣本量來源單一,結(jié)果有一定的偏倚,沒有分析ERCC2和MTHFR基因多態(tài)性與乳腺癌嚴(yán)重程度的關(guān)系,在后續(xù)需要加入分析;遺傳標(biāo)記存在局限性,選擇的SNP位點(diǎn)少,后期必須尋找一定數(shù)目、覆蓋度廣泛、更多有功能性的位點(diǎn)來探究與乳腺癌的關(guān)系。

      總之,ERCC2和MTHFR基因多態(tài)性與中國北方女性乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān),同時(shí)MTHFR rs1801133-rs1801131組成的單倍型T-A和T-C與家族型乳腺癌相關(guān),單倍型C-C與散發(fā)型乳腺癌有關(guān),T-C在≤40歲的乳腺癌患者中更為常見。

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