余詩(shī)強(qiáng) 熊安然 潘予琮 汪 悅 張亞靜 蔣林樹* 熊本海*
(1.北京農(nóng)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,奶牛營(yíng)養(yǎng)學(xué)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 102206;2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,北京 100193;3.河北省高碑店市職教中心,保定 074000)
奶牛瘤胃是一個(gè)大型生物反應(yīng)器,瘤胃中的微生物能夠幫助奶牛將大量不能被宿主直接利用的物質(zhì)轉(zhuǎn)化成能被利用的高質(zhì)量的營(yíng)養(yǎng)素,如消化宿主動(dòng)物不能消化的纖維素、半纖維素等物質(zhì),顯著增加飼糧中總能的可利用程度;同時(shí)宿主-瘤胃-微生物相互作用參與機(jī)體許多重要的生理過程,因此瘤胃微生物區(qū)系的組成與結(jié)構(gòu)影響宿主對(duì)飼糧營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化與吸收[1-2]。長(zhǎng)期以來(lái),大量研究一直致力于改善飼糧配方和使用飼料添加劑來(lái)優(yōu)化、調(diào)節(jié)瘤胃的菌群結(jié)構(gòu),以此促進(jìn)瘤胃發(fā)酵,提高飼糧中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的利用效率[3]。植物提取物作為新型飼料添加劑,具有綠色、無(wú)毒、無(wú)殘留等優(yōu)點(diǎn),能解決抗生素帶來(lái)的藥物殘留等問題,是替代抗生素優(yōu)選物質(zhì)[4],同時(shí),植物提取物可以調(diào)節(jié)反芻動(dòng)物瘤胃菌群結(jié)構(gòu),改善瘤胃發(fā)酵、減少甲烷排放、提高動(dòng)物的飼糧利用率和生產(chǎn)性能[5]。
青蒿(ArtemisiaannuaL.),又名草蒿、香蒿等,是菊科艾屬一年生草本植物,其富含植物營(yíng)養(yǎng)活性物質(zhì),例如單萜、倍半萜和酚類等化合物,生物學(xué)功能廣泛[6]。青蒿在世界各地分布廣泛,可以被動(dòng)物食用,具有改善畜產(chǎn)品品質(zhì),增強(qiáng)動(dòng)物機(jī)體抗菌、抗炎、抗氧化和免疫調(diào)節(jié)能力[7-8]。青蒿是一種非常規(guī)飼料,其無(wú)毒無(wú)害、無(wú)耐藥性,在畜牧生產(chǎn)上應(yīng)用廣泛,是營(yíng)造動(dòng)物安全養(yǎng)殖環(huán)境的理想飼料資源[9],飼糧中添加適量青蒿提取物能調(diào)節(jié)機(jī)體免疫功能,提高腸道消化酶活性,增強(qiáng)機(jī)體抗病能力,提高動(dòng)物的生產(chǎn)性能[10]。在奶牛飼糧中添加120 g/d的青蒿提取物能顯著改善奶牛機(jī)體的脂質(zhì)代謝途徑,提高乳腺上皮細(xì)胞活性,激活腺苷酸活化蛋白激酶-哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(AMPK-mTOR)信號(hào)通路,促進(jìn)奶牛乳汁中乳脂合成[11],其能提高奶牛體外發(fā)酵試驗(yàn)中瘤胃液氨態(tài)氮(NH3-N)濃度和干物質(zhì)消化率,降低中性洗滌纖維含量和乙丙比,并抑制甲烷產(chǎn)生[12]。青蒿提取物能改善反芻動(dòng)物瘤胃發(fā)酵,促進(jìn)短鏈脂肪酸(SCFA)生成,提高代謝能(ME)、泌乳凈能(NEL)和有機(jī)物消化率,在抑制甲烷產(chǎn)生方面具有積極作用[13]。但目前青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃發(fā)酵的影響尚未見報(bào)道。因此,本試驗(yàn)擬通過飼養(yǎng)試驗(yàn)深入研究青蒿提取物對(duì)瘤胃發(fā)酵參數(shù)和微生物區(qū)系的影響,以期為青蒿提取物在奶牛生產(chǎn)實(shí)踐中的應(yīng)用提供理論依據(jù)。
本試驗(yàn)所用的青蒿提取物為棕黃色粉末,選購(gòu)自陜西某天然制品有限公司,其主要成分和含量如下:青蒿素39.0%,粗灰分13.0%,粗纖維27.9%,粗蛋白質(zhì)6.3%,水分5.0%,多糖8.3%,揮發(fā)油0.5%。
選取健康、泌乳中期、體況相似、胎次為2~4胎、日產(chǎn)奶量為(33.0±3.9)kg/d的荷斯坦奶牛20頭為試驗(yàn)動(dòng)物。試驗(yàn)牛采用散欄帶臥床式飼養(yǎng),每天07:00、13:00和18:00對(duì)奶牛進(jìn)行投料,09:30、15:30、21:30進(jìn)行擠奶。試驗(yàn)期間奶牛自由采食,自由飲水,牛舍每天清掃、清糞?;A(chǔ)飼糧參照NRC(2001)奶牛飼養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)配制,以全混合日糧(TMR)形式飼喂,基礎(chǔ)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)水平見表1。
表1 基礎(chǔ)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)水平(干物質(zhì)基礎(chǔ))Table 1 Composition and nutrient levels of the basal diet (DM basis) %
本研究于2019年5—7月在奶牛營(yíng)養(yǎng)學(xué)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室延慶基地進(jìn)行。試驗(yàn)牛隨機(jī)分為4組(1個(gè)對(duì)照組和3個(gè)試驗(yàn)組),每組5頭,對(duì)照組飼喂基礎(chǔ)飼糧,試驗(yàn)組飼喂在基礎(chǔ)飼糧中分別添加0.25%[50 g/(d·頭)]、0.50% [100 g/(d·頭)]、0.75% [150 g/(d·頭)]青蒿提取物的試驗(yàn)飼糧。試驗(yàn)期45 d,其中預(yù)試期10 d,正試期35 d。
1.4.1 瘤胃液的采集
在正試期的第35天,于晨飼前1 h經(jīng)口腔采集瘤胃液,使用滅菌的4層紗布進(jìn)行過濾分裝于15 mL離心管和5 mL凍存管中,保存于-80 ℃?zhèn)溆?,用于NH3-N、揮發(fā)性脂肪酸(VFA)濃度和瘤胃菌群的測(cè)定。
1.4.2 樣品測(cè)定
pH:使用PHS-10型便捷式pH計(jì)測(cè)定。
NH3-N濃度:參照王加啟[14]的比色法測(cè)定。
VFA濃度:采用內(nèi)標(biāo)法測(cè)定。使用安捷倫7890B型號(hào)氣相色譜儀測(cè)定。色譜條件為FID檢測(cè)器,流速為30 mL/min的N2作為載氣,空氣發(fā)生器提供流速為40 mL/min的氫氣,空氣流速400 mL/min,總流量為54 mL/min,吹掃流量3 mL/min,分流比50∶1,線速度為27.8 cm/s,DB-FFAP(15 m×0.32 mm×0.25 μm)填充柱,柱溫180 ℃,檢測(cè)溫度280 ℃,進(jìn)樣口溫度250 ℃,進(jìn)樣量2 μL。
1.4.3 瘤胃菌群多樣性
1)將-80 ℃下保存的瘤胃液樣品置于無(wú)菌操作臺(tái),并放入冰水混合物中解凍后,根據(jù)Power Soil DNA Isolation Kit試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行總DNA提取。
2)使用細(xì)菌V3~V4區(qū)域引物338F(5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’)、806R(5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。具體PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)條件見表2。為避免試驗(yàn)誤差,檢測(cè)的瘤胃液樣本均設(shè)3個(gè)重復(fù),并將重復(fù)樣本的PCR擴(kuò)增得到的產(chǎn)物混勻,進(jìn)行凝膠電泳定量質(zhì)檢。
表2 PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)條件Table 2 PCR reaction system and reaction conditions
3)構(gòu)建瘤胃細(xì)菌區(qū)系16S rRNA基因文庫(kù),為目的DNA片段兩端加上特定的接頭序列。
4)基于Illumina平臺(tái)的Hiseq雙端測(cè)序,Illumina HiSeq測(cè)序得到的原始圖像數(shù)據(jù)文件,經(jīng)堿基識(shí)別(base calling)分析轉(zhuǎn)化為原始測(cè)序序列(sequenced reads),結(jié)果以FASTQ(fq)文件格式存儲(chǔ),其中包含測(cè)序序列(reads)的序列信息以及其對(duì)應(yīng)的測(cè)序質(zhì)量信息。
5)根據(jù)PE reads之間的Overlap關(guān)系,將Hiseq測(cè)序得到的雙端序列數(shù)據(jù)拼接(merge)成1條序列Tags,同時(shí)對(duì)reads的質(zhì)量和merge的效果進(jìn)行質(zhì)控過濾。主要有3個(gè)步驟:第1步,PE reads拼接,使用FLASH v1.2.7軟件,通過overlap對(duì)每個(gè)樣品的reads進(jìn)行拼接,得到的拼接序列即原始Tags數(shù)據(jù)(raw Tags);第2步,Tags過濾,使用Trimmomatic v0.33軟件,對(duì)拼接得到的raw Tag進(jìn)行過濾,得到高質(zhì)量的Tags數(shù)據(jù)(clean Tags);第3步,去除嵌合體,使用UCHIME v4.2軟件,鑒定并去除嵌合體序列,得到最終有效數(shù)據(jù)(effective Tags)。質(zhì)控過濾后,利用QIIME(version 1.8.0)軟件中UCLUST對(duì)Tags按照97%相似性水平進(jìn)行聚類,得到每個(gè)樣品的操作分類單元(OTU)。通過OTU的代表序列與微生物參考數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),進(jìn)行物種注釋,分析α-多樣性,利用R語(yǔ)言工具繪制稀釋性曲線和Venn圖。使用QIIME軟件進(jìn)行β-多樣性分析,繪制主坐標(biāo)分析(PCoA)圖。不同組差異性利用CAA和Heatmap圖進(jìn)行分析。
數(shù)據(jù)經(jīng)Excel 2016進(jìn)行初步整理后,采用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行方差分析,組間比較采用Duncan氏法進(jìn)行多重比較,并以P<0.05為差異顯著性判斷標(biāo)準(zhǔn)。
由表3可知,與對(duì)照組相比,添加0.25%青蒿提取物,瘤胃液NH3-N和丙酸濃度顯著升高(P<0.05),乙丙比顯著降低(P<0.05),瘤胃液pH、總揮發(fā)性脂肪酸、乙酸、丁酸、異丁酸、異戊酸和戊酸濃度無(wú)顯著變化(P>0.05);添加0.50%青蒿提取物,瘤胃液丙酸、異丁酸和戊酸濃度顯著升高(P<0.05),乙丙比顯著降低(P<0.05),瘤胃液pH、NH3-N、總揮發(fā)性脂肪酸、乙酸、異戊酸和丁酸濃度無(wú)顯著變化(P>0.05);添加0.75%青蒿提取物,瘤胃液總揮發(fā)性脂肪酸、丙酸、丁酸和戊酸濃度顯著升高(P<0.05),乙酸、異丁酸濃度和乙丙比顯著降低(P<0.05),瘤胃液pH、異戊酸和NH3-N濃度無(wú)顯著變化(P>0.05)。
表3 青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃發(fā)酵參數(shù)的影響Table 3 Effect of Artemisia annua L.extract on rumen fermentation parameters of dairy cows
2.2.1 青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃細(xì)菌群落多樣性的影響
2.2.1.1 凝膠電泳分析
由凝膠電泳結(jié)果(圖1)可知,對(duì)24個(gè)瘤胃液樣品(根據(jù)飼喂青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃常規(guī)發(fā)酵參數(shù)的影響進(jìn)行劑量篩選,最終以添加水平0.75%為試驗(yàn)組進(jìn)行高通量測(cè)序,共24個(gè)瘤胃液樣品)進(jìn)行16S rRNA基因的V3~V4區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物條帶正確清晰、濃度合適,質(zhì)量滿足建庫(kù)要求。
M:標(biāo)記;1~24:24個(gè)樣品;CK:以純水為空白。M:marker;1 to 24:24 samples;CK:pure water was used as blank.圖1 PCR擴(kuò)增樣品瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Agarose gel electrophoresis of PCR amplified samples
2.2.1.2 細(xì)菌群落多樣性分析
基于16S rRNA基因測(cè)序數(shù)據(jù),繪制瘤胃液菌群樣本的稀釋曲線和物種積累曲線,圖2中各樣本曲線均達(dá)到平臺(tái)期,說(shuō)明測(cè)序數(shù)量已經(jīng)足夠包含樣本中絕大部分微生物信息。由Coverage指數(shù)可知,各樣本的覆蓋率達(dá)到99%以上(表4),故可以準(zhǔn)確地反映瘤胃中微生物群落的種類和結(jié)構(gòu)多樣性。本試驗(yàn)測(cè)序以97%的相似性閾值將序列劃分為不同的OTU,在瘤胃液菌群中獲得969個(gè)有效OTU,對(duì)照組與試驗(yàn)組(0.75%青蒿提取物組)共享969個(gè)OTU,對(duì)照組獨(dú)享0個(gè)OTU,試驗(yàn)組獨(dú)享5個(gè)OTU。由表4可知,與對(duì)照組相比,添加0.75%青蒿提取物顯著提高了Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)(P<0.05),Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)無(wú)顯著變化(P>0.05)。
表4 瘤胃液細(xì)菌α-多樣性指數(shù)Table 4 Rumen bacterial alpha-diversity index
C:對(duì)照組;T:試驗(yàn)組(0.75%青蒿提取物組)。下圖同。C:control group;T:experimental group (0.75% Artemisia annua L.extract group).The same as below.圖2 樣品稀釋曲線Fig.2 Sample dilution curve
圖3 OTU Venn圖Fig.3 OTU Venn diagram
2.2.2 青蒿提取物對(duì)瘤胃液菌群相對(duì)豐度的影響
分析瘤胃液菌群在門水平的組成比例及變化,檢測(cè)到14個(gè)菌門,其中不同組瘤胃液細(xì)菌區(qū)系中相對(duì)豐度在0.01%以上的門均有10個(gè)。由表5和圖4可知,在門水平上,不同組奶牛瘤胃液細(xì)菌區(qū)系的優(yōu)勢(shì)菌群一致,但在2組間相對(duì)豐度不同,相對(duì)豐度在1%以上的菌門均有4個(gè),分別為擬桿菌門、厚壁菌門、變形菌門和SR_[Absconditabacteria]。其在試驗(yàn)組中的相對(duì)豐度分別為52.37%、32.94%、10.48%、1.38%,在對(duì)照組中的相對(duì)豐度分別為56.12%、31.22%、6.91%、2.30%。泌乳期荷斯坦奶牛瘤胃液的優(yōu)勢(shì)菌門主要有擬桿菌門、厚壁菌門。對(duì)照組中擬桿菌門、厚壁菌門的相對(duì)豐度分別為56.12%、31.22%,試驗(yàn)組中擬桿菌門、厚壁菌門的相對(duì)豐度分別為52.37%、32.94%。與對(duì)照組相比,試驗(yàn)組擬桿菌門相對(duì)豐度顯著下降3.7%(P<0.05),厚壁菌門相對(duì)豐度上升1.72%(P>0.05),變形菌門相對(duì)豐度顯著上升3.57%(P<0.05),SR_[Absconditabacteria]相對(duì)豐度顯著下降0.92%(P<0.05),疣微菌門相對(duì)豐度顯著下降0.26%,其他菌門相對(duì)豐度無(wú)顯著變化(P>0.05)。
圖4 門水平上青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃液細(xì)菌區(qū)系組成的影響Fig.4 Effects of Artemisia annua L.extract on bacterial flora composition in rumen fluid of dairy cows at phylum level
表5 青蒿提取物對(duì)瘤胃菌群相對(duì)豐度的影響(門水平)Table 5 Effects of Artemisia annua L.extracts on relative abundance of rumen microflora (phylum level) %
分析2組瘤胃液菌群在屬水平的組成和變化,共檢測(cè)到相對(duì)豐度大于0.01%的屬共有128個(gè)。由表6和圖5可知,在屬水平上,不同組奶牛瘤胃液細(xì)菌區(qū)系的優(yōu)勢(shì)菌群一致,但在2組間相對(duì)豐度不同,主要的屬有10個(gè)(大于1%)分別為普雷沃氏菌屬1、uncultured_rumen_bacterium、琥珀酸弧菌科UCG-002、理研菌科RC9群、丁酸弧菌屬2、月形單胞菌屬1、解琥珀酸菌科、瘤胃球菌科NK4A214群、瘤胃球菌屬2、克里斯滕森菌科R-7。與對(duì)照組相比,試驗(yàn)組普雷沃氏菌屬1、理研菌科RC9群和解琥珀酸菌屬相對(duì)豐度顯著提高(P<0.05),丁酸弧菌屬2、瘤胃球菌科NK4A214群和瘤胃球菌屬2相對(duì)豐度顯著下降(P>0.05)。
表6 青蒿提取物對(duì)瘤胃菌群相對(duì)豐度的影響(屬水平)Table 6 Effects of Artemisia annua L.extract on relative abundance of rumen microflora (genus level) %
2.2.3 青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃液細(xì)菌組成影響相似性分析
通過β-多樣性分析,評(píng)估2組之間菌群結(jié)構(gòu)的差異性。圖6為基于非加權(quán)距離算法的PCoA,坐標(biāo)軸1和坐標(biāo)軸2分別占總變異量的50.07%和14.21%。ANOSIM的R值為0.57,說(shuō)明對(duì)照組與試驗(yàn)組之間的菌群結(jié)構(gòu)存在顯著差異(P<0.05)。
圖6 PCoA聚類分析Fig.6 PCoA cluster analysis
2.2.4 青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃細(xì)菌組成與發(fā)酵參數(shù)的相關(guān)性分析
圖7展示了奶牛瘤胃細(xì)菌屬水平相對(duì)豐度(排名前15的菌屬)與發(fā)酵參數(shù)的相關(guān)關(guān)系。其中琥珀酸弧菌科UCG-002相對(duì)豐度與乙酸(R=0.655,P<0.01)、總揮發(fā)性脂肪酸(R=0.627,P<0.01)和丙酸(R=0.508,P<0.01)濃度呈極顯著正相關(guān);瘤胃球菌科UCG-014相對(duì)豐度與總揮發(fā)性脂肪酸濃度呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.345,P<0.05),與丁酸濃度呈極顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.415,P<0.01),與產(chǎn)奶量呈顯著正相關(guān)(R=0.504,P<0.05);瘤胃球菌屬1相對(duì)豐度與乙酸濃度呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.433,P<0.05),與總揮發(fā)性脂肪酸(R=-0.345,P<0.05)、丙酸(R=-0.120,P<0.05)濃度呈顯著負(fù)相關(guān),與產(chǎn)奶量呈顯著正相關(guān)(R=0.504,P<0.05);普雷沃氏菌科1與乙酸(R=-0.896,P<0.01)、總揮發(fā)性脂肪酸(R=-0.585,P<0.01)、NH3-N(R=-0.656,P<0.01)和戊酸(R=-0.449,P<0.01)濃度呈極顯著負(fù)相關(guān),與乙丙比呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.193,P<0.05);普雷沃氏菌科UCG-001相對(duì)豐度與乙酸濃度呈極顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.789,P<0.01),與總揮發(fā)性脂肪酸(R=0.480,P<0.05)和異戊酸濃度(R=0.338,P<0.05)呈顯著負(fù)相關(guān);理研菌科RC9群相對(duì)豐度與乙酸(R=-0.531,P<0.01)和總揮發(fā)性脂肪酸(R=-0.448,P<0.01)濃度呈極顯著負(fù)相關(guān),與NH3-N(R=-0.372,P<0.05)和丙酸(R=-0.423,P<0.05)濃度呈顯著負(fù)相關(guān);琥珀酸菌屬相對(duì)豐度與乙酸濃度呈極顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.486,P<0.01);毛螺菌科NK3A20群相對(duì)豐度與乙酸濃度呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.462,P<0.05);瘤胃球菌科NK4A214群相對(duì)豐度與丙酸濃度呈顯著負(fù)相關(guān)(R=-0.368,P<0.05)。
瘤胃液pH是反映瘤胃健康的直接指標(biāo),其與飼糧組成和添加劑類型的關(guān)聯(lián)密切,反映瘤胃內(nèi)各種有機(jī)酸和代謝物產(chǎn)生與吸收的情況[15]。奶牛瘤胃液正常pH在5.5~6.8[16],本試驗(yàn)中各組瘤胃液pH均處于正常生理范圍內(nèi),這與蘇漢書等[12]在奶牛瘤胃體外發(fā)酵的研究結(jié)果一致。此外,在山羊的基礎(chǔ)飼糧中添加青蒿提取物,發(fā)現(xiàn)青蒿提取物對(duì)山羊瘤胃液pH無(wú)顯著影響[17],這也印證了奶牛飼糧中添加青蒿提取物不會(huì)改變瘤胃內(nèi)的酸堿平衡。
瘤胃中NH3-N是微生物菌體蛋白(MCP)合成的原料,是反映瘤胃微生物生長(zhǎng)情況的指標(biāo),NH3-N濃度在10~50 mg/dL最適宜瘤胃微生物生長(zhǎng)[18]。本試驗(yàn)中,瘤胃中NH3-N濃度在此范圍內(nèi),并且在青蒿提取物0.25%和0.50%的添加水平下NH3-N濃度相對(duì)于對(duì)照組顯著提高,而在0.75%的添加水平下無(wú)顯著變化,說(shuō)明青蒿提取物在一定程度上可以促進(jìn)瘤胃NH3-N的合成,這與秦韜等[19]的研究結(jié)果一致。瘤胃內(nèi)NH3-N濃度與MCP的含量密切相關(guān),可以推測(cè)青蒿提取物能提高瘤胃微生物的活性,促進(jìn)蛋白分解菌的生長(zhǎng),進(jìn)而促進(jìn)MCP和NH3-N的生成。
瘤胃內(nèi)碳水化合物發(fā)酵后生成VFA,其主要包括丙酸、丁酸、乙酸、異丁酸、戊酸、異戊酸等,均是奶牛主要的能量來(lái)源[20],乙酸、丙酸和丁酸約占總揮發(fā)性脂肪酸濃度95%以上,乙酸是反芻動(dòng)物合成脂肪的前體,是動(dòng)物合成乳脂的主要成分,丁酸也可作為乳腺和脂肪組織合成脂肪酸的原料,丙酸經(jīng)肝臟糖原異生作用生成葡萄糖為機(jī)體供能,丙酸比例越高,其可為機(jī)體提供的能量就越高[21]。有研究報(bào)道,在反芻動(dòng)物飼糧中添加青蒿提取物可以提高瘤胃內(nèi)乙酸、丙酸、丁酸和總揮發(fā)性脂肪酸濃度[22],在本試驗(yàn)中,添加0.75%的青蒿提取物顯著降低了瘤胃內(nèi)乙酸濃度和乙丙比,總揮發(fā)性脂肪酸、丙酸和丁酸濃度顯著增加,這與王小晶等[23]的研究結(jié)果一致。這說(shuō)明在奶牛飼糧中添加青蒿提取物可以促進(jìn)瘤胃發(fā)酵,改變瘤胃內(nèi)VFA的比例。
研究表明,當(dāng)樣本覆蓋率達(dá)到97%以上時(shí),說(shuō)明測(cè)序樣本取樣充分[24],本試驗(yàn)中樣本覆蓋率高于99%,證明本次測(cè)序結(jié)果能夠真實(shí)地反映奶牛瘤胃微生物種類和結(jié)構(gòu)多樣性。報(bào)道指出,奶牛瘤胃微生物區(qū)系的種類和數(shù)量與奶牛種類、飼糧及添加劑種類有關(guān)[3]。研究表明,采用ITS高通量測(cè)序和16S rRNA高通量測(cè)序?qū)α鑫肝⑸镞M(jìn)行分析能得到612~1 797個(gè)OTU[25-26],本試驗(yàn)測(cè)得試驗(yàn)?zāi)膛A鑫肝⑸飬^(qū)系共969個(gè),處于兩者之間,這說(shuō)明添加青蒿提取物改變了奶牛的瘤胃細(xì)菌區(qū)系的種類和數(shù)量,試驗(yàn)中2組共有964個(gè)OTU,青蒿提取物組獨(dú)有5個(gè)OTU。Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)反映瘤胃微生物區(qū)系的多樣性,Shannon指數(shù)越大或Simpson指數(shù)越小時(shí)微生物區(qū)系越高;Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)反映瘤胃微生物區(qū)系的豐富度,Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)越大,微生物區(qū)系越豐富[27]。本試驗(yàn)中Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)無(wú)顯著變化,Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)顯著提高,說(shuō)明青蒿提取物不影響瘤胃微生物的多樣性,但會(huì)增加其豐富度。
奶牛瘤胃微生物中優(yōu)勢(shì)菌門為擬桿菌門和厚壁菌門[28-29],本試驗(yàn)中奶牛瘤胃優(yōu)勢(shì)菌門也為擬桿菌門和厚壁菌門。飼糧中的非纖維性碳水化合物主要依靠擬桿菌門細(xì)菌降解[30],而纖維降解主要依靠厚壁菌門細(xì)菌[31],如溶纖維丁酸弧菌和解纖維梭菌等。Zened等[32]研究發(fā)現(xiàn),奶牛瘤胃內(nèi)細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌門不會(huì)因飼糧改變而改變,始終為擬桿菌門和厚壁菌門。本試驗(yàn)中,添加青蒿提取物后擬桿菌門相對(duì)豐度顯著下降,厚壁菌門相對(duì)豐度無(wú)顯著變化,說(shuō)明青蒿提取物抑制了擬桿菌門微生物的生長(zhǎng)與增殖。研究表明,變形菌門可降解可溶性碳水化合物[33],本試驗(yàn)添加青蒿提取物后變形菌門相對(duì)豐度顯著增加,說(shuō)明青蒿提取物能促進(jìn)奶牛瘤胃可溶性碳水化合物的降解,這也解釋了總揮發(fā)性脂肪酸濃度顯著升高的原因。SR_[Absconditabacteria]和疣微菌門相對(duì)豐度與哺乳動(dòng)物胃腸道免疫有顯著關(guān)系[34-35],本試驗(yàn)中SR_[Absconditabacteria]和疣微菌門相對(duì)豐度在添加青蒿提取物后顯著下降,這表明在飼糧中添加青蒿提取物可能與增強(qiáng)機(jī)體免疫力有關(guān),這也印證了前期本試驗(yàn)中青蒿提取物可以提高奶牛免疫能力的試驗(yàn)結(jié)果。
每2個(gè)變量之間的相關(guān)強(qiáng)度用顏色和*表示,紅色表示正相關(guān),藍(lán)色表示負(fù)相關(guān),*表示0.01
在屬水平上,奶牛瘤胃內(nèi)微生物優(yōu)勢(shì)菌屬為普雷沃氏菌屬、琥珀酸菌屬和理研菌屬[36-37],這與本研究結(jié)果一致,普雷沃氏菌屬于擬桿菌門,在瘤胃中分布廣泛,數(shù)量多,包括半纖維素分解菌和蛋白分解菌,如棲瘤胃普雷沃菌、布氏普雷沃氏菌和短普雷沃氏菌等,其可降解植物性半纖維素、蛋白質(zhì)、非纖維多糖、參與多種微生物代謝[38],本試驗(yàn)添加青蒿提取物后,奶牛瘤胃液中普雷沃氏菌屬相對(duì)豐度顯著提高,說(shuō)明添加青蒿提取物在一定程度上促進(jìn)了奶牛瘤胃內(nèi)蛋白質(zhì)的分解利用,影響瘤胃內(nèi)NH3-N和總揮發(fā)性脂肪酸濃度,這與瘤胃發(fā)酵常規(guī)指標(biāo)的結(jié)果相一致。理研菌科與自身免疫有關(guān)[39],本試驗(yàn)中添加青蒿提取物后瘤胃液中理研菌科RC9群相對(duì)豐度顯著增加,這可能與青蒿提取物改變奶牛免疫性能有關(guān)。丁酸弧菌屬也是瘤胃中分解利用纖維素的菌屬[40],飼喂青蒿提取物后瘤胃液中丁酸弧菌屬2相對(duì)豐度顯著下降可能是由于其他降解纖維素菌的增加,導(dǎo)致丁酸弧菌屬2的競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)降低,進(jìn)而比例下降。解琥珀酸菌屬可以將瘤胃微生物分解碳水化合物后產(chǎn)生的琥珀酸代謝成丙酸鹽,進(jìn)而生成丙酸[41],添加青蒿提取物后瘤胃液中解琥珀酸菌屬相對(duì)豐度顯著上升,這可能是導(dǎo)致瘤胃液中丙酸濃度顯著上升的主要原因。瘤胃球菌屬在瘤胃中可以降解粗飼料中的纖維素、半纖維素和木質(zhì)素,產(chǎn)生大量的纖維素酶和木聚糖酶,通過酶作用生成乙酸[42]。添加青蒿提取物后瘤胃球菌科NK4A214群和瘤胃球菌屬2相對(duì)豐度顯著下降,導(dǎo)致瘤胃液中乙酸濃度下降,這與前人研究結(jié)果[27]相同。本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),普雷沃氏菌屬1和理研菌科RC9群相對(duì)豐度與總揮發(fā)性脂肪酸濃度呈極顯著負(fù)相關(guān),說(shuō)明這2種菌可能參與總揮發(fā)性脂肪酸的代謝,這與程冠文[43]研究結(jié)果相一致。同時(shí),瘤胃球菌屬1、普雷沃氏菌屬1、普雷沃氏菌科UCG-001、理研菌科RC9群和琥珀酸菌屬相對(duì)豐度與乙酸濃度呈負(fù)相關(guān),這些菌屬促進(jìn)了乙酸的代謝,影響了乙丙比,這也揭示了本研究中瘤胃液中乙酸濃度顯著降低的原因。瘤胃球菌科UCG-014和瘤胃球菌屬1與調(diào)節(jié)機(jī)體免疫有關(guān)[44-45],在本試驗(yàn)中2種菌屬相對(duì)豐度與產(chǎn)奶量呈顯著正相關(guān),表明這2種菌屬可能通過調(diào)節(jié)機(jī)體免疫力以促進(jìn)奶牛產(chǎn)奶。綜上可知,青蒿提取物可以通過改善瘤胃微生物相對(duì)豐度,調(diào)節(jié)瘤胃發(fā)酵,進(jìn)而提高奶牛機(jī)體免疫能力和產(chǎn)奶量。
在奶牛飼糧中添加0.75%青蒿提取物顯著提高Ace指數(shù)和Chao1指數(shù),使變形菌門、普雷沃氏菌屬1、理研菌科RC9群等相對(duì)豐度顯著提高,擬桿菌門、丁酸弧菌屬2等相對(duì)豐度顯著降低;降低瘤胃中乙酸濃度和乙丙比,提高總揮發(fā)性脂肪酸、丙酸、丁酸和戊酸濃度,對(duì)瘤胃發(fā)酵和微生物結(jié)構(gòu)變化有積極作用。
Prevotella1:普雷沃氏菌屬1;Uncultured rumen_bacterium:未分類瘤胃細(xì)菌;Succinivibrionaceae_UCG-002:琥珀酸球菌科UCG-002;Rikenellaceae_RC9_gut_group:理研菌科RC9群;Succiniclasticum:解琥珀酸菌屬;Selenomonas1:月形單胞菌屬1;Butyrivibrio2:丁酸弧菌屬2;Ruminococcus2:瘤胃球菌屬2;Christensenellaceac_R-7_group:克里斯滕森菌科R-7群;Ruminococcaceae_NK4A214_group:瘤胃球菌科NK4A214群;Others:其他;Unclassified:未分類。
圖5 屬水平上青蒿提取物對(duì)奶牛瘤胃液細(xì)菌區(qū)系組成的影響
Fig.5 Effects ofArtemisiaannuaL.extract on bacterial flora composition in rumen fluid of dairy cows at genus level
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動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào)2021年11期