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      仿刺參葡聚糖結(jié)合蛋白的重組表達(dá)與功能研究

      2021-11-15 07:03:02賈昌鋒陳知雨雷一萱孔令明
      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年19期
      關(guān)鍵詞:刺參陰性菌革蘭氏

      賈昌鋒,陳知雨,雷一萱,張 雷,孔令明

      (山東大學(xué)海洋學(xué)院,山東 威海 264209)

      機(jī)體免疫系統(tǒng)是生物抵抗病原體或病原微生物侵害的主要手段。由于無脊椎動(dòng)物缺乏抗體生成機(jī)制,因此無法進(jìn)行適應(yīng)性免疫反應(yīng),但它們卻具有高效的固有免疫[1]。固有免疫是用于生物機(jī)體免疫和防御的一種古老且高效的手段,能夠通過模式識(shí)別受體(Pattern recognition receptor,PRR)識(shí)別外界的病原微生物,并將相關(guān)識(shí)別信號(hào)傳遞到細(xì)胞核中,進(jìn)而誘導(dǎo)相關(guān)的免疫效應(yīng)因子進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和表達(dá)[2,3]。β-1,3-葡聚糖結(jié)合蛋白(β-1,3-glucan-binding pro?tein,GBP)作為一種免疫應(yīng)答反應(yīng)的模式識(shí)別受體,可介導(dǎo)入侵病原體的識(shí)別,激活蛋白酶聯(lián)反應(yīng),促進(jìn)抗菌肽的合成,提高對(duì)細(xì)菌的抵抗力,在生物的先天免疫中起著關(guān)鍵作用[4,5]。GBP 首次是從家蠶(Bom?byx mori)的血淋巴中分離出來[6],而在甲殼動(dòng)物中,其在淡水螯蝦(Pacifastacus leniusculus)中最先被發(fā)現(xiàn)[7]。此外,GBP 與某些革蘭氏陰性菌結(jié)合蛋白(Gram-negative bacteria binding protein,GNBP)在對(duì)β-1,3 和β-1,3-1,4 葡聚糖酶的結(jié)合區(qū)域中表現(xiàn)出同源性,且其可以識(shí)別脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)和β-1,3-葡聚糖(β-1,3-glucan,βG)[8]。目前,海洋無脊椎動(dòng)物中GBP 的研究主要集中在甲殼類和貝類中,如中國(guó)對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinen?sis)[9]、南美白對(duì)蝦(Litopenaeus vannamei)[10,11]、日本對(duì)蝦(Marsupenaeus japonicus)[12]、羅氏沼蝦(Macro?brachium rosenbergii)[13]、短溝對(duì)蝦(Penaeus semisul?catus)[14]、文蛤(Meretrix meretrix)[15]等,結(jié)果表明它們?cè)谑艿讲≡碳r(shí),會(huì)被誘導(dǎo)表達(dá)進(jìn)而參與到生物的先天免疫中[10,14]。

      仿刺參(Apostichopus japonicus)隸屬棘皮動(dòng)物門(Echinodermata)海參綱(Holothuroidea)楯手目(As?pidochirotida)刺參科(Stichopodidae),為海味“八珍”之一,有著很高的醫(yī)藥和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值[16-18]。其在中國(guó)山東和遼寧半島以及河北沿岸分布較為廣泛[19-21]。近年來,由于人們生活水平和健康意識(shí)的不斷提高,仿刺參市場(chǎng)需求量呈現(xiàn)逐年增加的態(tài)勢(shì),水產(chǎn)養(yǎng)殖規(guī)模呈現(xiàn)持續(xù)擴(kuò)大態(tài)勢(shì),使得仿刺參逐漸成為中國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟(jì)物種之一[19]。據(jù)報(bào)道,當(dāng)前中國(guó)仿刺參水產(chǎn)養(yǎng)殖面積達(dá)238 183 hm2,產(chǎn)量高達(dá)174 340 t[22]。但由于持續(xù)惡化的海洋環(huán)境、海洋富營(yíng)養(yǎng)化程度的日趨加重,養(yǎng)殖周期長(zhǎng)和其自身免疫力低下等因素,仿刺參養(yǎng)殖業(yè)常會(huì)受到大規(guī)模的病害威脅,大范圍死亡事件時(shí)有發(fā)生。這極大地制約了仿刺參養(yǎng)殖業(yè)的持續(xù)發(fā)展[20,23]。而使用常見的化學(xué)藥物(如二氧化氯、高錳酸鉀、福爾馬林及抗生素等)進(jìn)行治療,會(huì)對(duì)仿刺參造成毒害作用。β-1,3-葡聚糖結(jié)合蛋白可增強(qiáng)生物抗菌力,但尚未見其在仿刺參中的相關(guān)報(bào)道。本研究利用分子生物學(xué)手段克隆仿刺參β-1,3-葡聚糖結(jié)合蛋白,并對(duì)其功能進(jìn)行探索,有助于了解仿刺參抵抗病原微生物入侵的機(jī)制,可為水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)提供疾病防治的理論依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 仿刺參 仿刺參(約65 g/只)購于威海帝王宮水產(chǎn)市場(chǎng),試驗(yàn)前將其放于流動(dòng)海水池(溫度20 ℃)中飼養(yǎng)一周。然后選取健康的個(gè)體進(jìn)行解剖,并將解剖所得組織投入液氮,-80 ℃保存,用于總RNA 的提取。

      1.1.2 試驗(yàn)細(xì)菌 利用3 種革蘭氏陽性菌和3 種革蘭氏陰性菌完成AJ-GBP 重組蛋白的相關(guān)活性分析。其分別為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、藤黃短小桿菌(Curtobacterium luteum)、鰻弧菌(Vibrio anguillarum)、大腸桿菌(Escherichia coli)和綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)。

      1.2 方法

      1.2.1 總RNA 的提取與cDNA 合成 利用TransZol(TransGen Biotech 公司)從仿刺參各組織中提取總RNA,并用1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)總RNA 提取質(zhì)量。參照EasyScript First-Strand cDNA Synthesis Su?perMix(TransGen Biotech 公司)進(jìn)行cDNA 第一條鏈的合成,引物見表1。

      表1 AJ-GBP 基因擴(kuò)增和表達(dá)所用引物

      1.2.2 構(gòu)建AJ-GBP 原核重組表達(dá)載體 根據(jù)已測(cè)序的仿刺參轉(zhuǎn)錄組,獲得仿刺參GBP 的cDNA 序列并設(shè)計(jì)一對(duì)基因特異性引物(AJ-GBP F,AJ-GBP R),用于后續(xù)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)PCR。PCR 反應(yīng)采用EasyPfu DNA Polymerase 試劑盒(TransGen Biotech公司)。其體系(50 μL)為:引物(8 μmol/L)各2 μL,2×easypfu 為25 μL,cDNA 為0.5 μL,ddH2O 為20.5 μL。 PCR 反應(yīng)條件如下:94 ℃4 min;94 ℃30 s,52 ℃30 s,72 ℃1 min,40個(gè)循環(huán);72 ℃10 min。然后利用MiniBEST DNA Fragment Purification Kit(TaKa?Ra Bio 公司)完成PCR 產(chǎn)物的回收,并將獲得AJGBP基因片段與pEASY-Blunt E2(TransGen Biotech公司)進(jìn)行連接。利用BL21(DE3)pLysS Chemically Competent Cell 試劑(TransGen Biotech 公司)將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌BL21 感受態(tài)細(xì)胞,挑選5~10 個(gè)單菌落并接種于含有AMP(Solarbio 公司)濃度為100 μg/mL 的LB 肉湯(Solarbio 公司)。使用rTaq試劑(TaKaRa Bio 公司)和載體上引物(T7P)、AJ-GBP基因下引物(AJ-GBP R)進(jìn)行菌液PCR,鑒定陽性重組子。PCR 體系(50 μL)為:T7P(8 μmol/L)為2 μL,AJ-GBP R(8 μmol/L)為2 μL,rTaq為0.25 μL,dNTP(2.5 μmol/L)為4 μL,10×Buffer 為5 μL,菌液為0.5 μL,ddH2O 為36.25 μL。之后將確定的重組陽性子進(jìn)行測(cè)序。

      1.2.3AJ-GBP基因序列分析AJ-GBP的cDNA 序列和氨基酸序列利用國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)和專業(yè)蛋白分析系(http://www.expasy.org/)進(jìn)行分析。采用Sig?nalP 5.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)預(yù)測(cè)信號(hào)肽。使用SWISS-MODEL(http://swissmodel.expasy. org/)預(yù)測(cè)三維結(jié)構(gòu)。 使用SMART service(http://smart. embl-heidelberg. de/) 和 HMMER(https://www.ebi.ac.uk/Tools/hmmer/)預(yù)測(cè)特定保守區(qū)域。利用NetNGlyc 1.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)糖基化位點(diǎn)。

      1.2.4 AJ-GBP 蛋白重組表達(dá) 將重組陽性菌株按1∶10 接種于1 mL 含有AMP 的新鮮LB 肉湯中(AMP濃度為100 μg/mL),37 ℃180 r/min 過夜培養(yǎng)。然后將此菌液按1∶100 接種于150 mL 新鮮LB 肉湯(含有AMP,且AMP 濃度為100 μg/mL)中,37 ℃180 r/min培養(yǎng)至OD600為0.6。加入IPTG(終濃度0.8 μmol/L),37 ℃180 r/min 培養(yǎng)5 h。離心收集細(xì)菌,用PBS 緩沖液清洗3 遍后重懸。將細(xì)菌破碎后12 000 r/min離心20 min 收集沉淀包涵體蛋白。沉淀包涵體蛋白先用Buffer A(5 mmol/L EDTA,50 mmol/L Tris-HCL)清洗2 次,再用Buffer B(5 mmol/L EDTA,50 mmol/L Tris-HCl,2 mol/L 尿素)清洗2 次,最后用Buffer C(10 mmol/L Tris-HCL 0.1 mol/L NaH2PO4,8 mol/L 尿素)溶解。采用0.45 μm 濾膜過濾后,再使用Milli?pore10 kd 超濾離心管(Millipore)純化重組蛋白,從而獲得純化重組蛋白。

      1.2.5 AJ-GBP 重組蛋白活性分析

      1)細(xì)菌凝集活性分析。將枯草芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、藤黃短小桿菌、大腸桿菌和綠膿桿菌分別接種到LB 肉湯中,37 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6;鰻弧菌接種TCBS 培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6。然后用無菌生理鹽水稀釋至OD600為0.001。5 000 r/min離心10 min 獲得沉淀菌體,用TBS 緩沖液洗滌沉淀3次后將沉淀重懸,使菌數(shù)為2×109個(gè)/mL。再將75 μL重組蛋白(約600 μg/mL)分別加入96 孔板中,加入30 μL 菌液,室溫孵育1 h。陰性對(duì)照組則用牛血清白蛋白(BSA)代替重組蛋白。在倒置顯微鏡下查看細(xì)菌凝集情況,從而獲得試驗(yàn)結(jié)果。

      2)抑菌活性分析。將枯草芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、藤黃短小桿菌、大腸桿菌和綠膿桿菌分別接種到LB 肉湯中,37 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6;鰻弧菌接種到TCBS 培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6。然后把各菌液用新鮮培養(yǎng)基稀釋20 倍后備用。向96 孔細(xì)胞培養(yǎng)板中各加入100 μL 菌液和100 μL 重組蛋白并將二者混勻,37 ℃培養(yǎng)3 h 后,利用酶標(biāo)儀每隔30 min 記錄一次OD600值。BSA 為對(duì)照組,并設(shè)置3 個(gè)平行,統(tǒng)計(jì)OD600值并繪制不同組的生長(zhǎng)曲線。

      3)細(xì)菌結(jié)合活性分析。將枯草芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、藤黃短小桿菌、大腸桿菌和綠膿桿菌分別接種到LB 肉湯中,37 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6;鰻弧菌接種到TCBS 培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)至OD600為0.6。將各菌液5 000 r/min 離心10 min 獲得沉淀菌體,利用TBS 緩沖液洗滌沉淀3 次后將沉淀重懸,使其含有3.5×108個(gè)/mL 細(xì)胞。取200 μL 菌懸液與200 μL 重組蛋白(約600 μg/mL)混勻,室溫條件下振蕩孵育30 min。5 000 r/min 離心10 min 棄上清液并收集菌體。利用TBS 洗滌菌體4 次,將第4 次洗滌液和菌體分別加入蛋白上樣緩沖液,然后進(jìn)行10 min 沸水浴,離心收集上清液后進(jìn)行SDS-PAGE 以及Western blotting 檢測(cè)目的條帶。

      4)糖結(jié)合活性分析。分別取葡聚糖(80 μg/mL)、脂多糖(80 μg/mL)、肽聚糖(80 μg/mL)各50 μL 加入96 孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,37 ℃過夜晾干;次日60 ℃孵育30 min,然后在每孔各加入200 μL 含5% 脫脂奶粉的PBS,37 ℃封閉2 h;倒掉封閉液,再在每孔中加入200 μL PBST(20%Tween-20∶PBS=1∶100)洗4 次,每次5 min;后在每孔中加入50 μL 蛋白(蛋白用含1% 脫脂奶粉的PBS 二倍梯度稀釋,共6 組蛋白;對(duì)照組使用BSA);在細(xì)胞培養(yǎng)板中加入200 μL 的PBST(20%Tween-20∶PBS=1∶100)洗4 次,每次5 min;將一抗(大鼠抗His-tag 抗體)用1% 脫脂奶粉的PBS 按照1∶300 稀釋后將其在每孔中各加入100 μL,室溫條件下放置2 h;倒去一抗,再在細(xì)胞培養(yǎng)板中加入200 μL 的PBST(20%Tween-20∶PBS=1∶100)洗4 次,5 min/次;將辣根過氧化物酶標(biāo)記的兔抗大鼠二抗用1% 脫脂奶粉的PBS 按1∶3 000 稀釋后在細(xì)胞培養(yǎng)板各加入100 μL,室溫條件下放置2 h;倒掉二抗后在每孔中加入200 μL 的PBST(20%Tween-20:PBS=1∶100)洗4 次,5 min/次。利用EL-TMB 顯色試劑盒(Sangon Biotech 公司)得到顯色結(jié)果,并在酶標(biāo)儀450 nm 處讀取吸光度。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 AJ-GBP 基因克隆與序列分析

      克隆所得AJ-GBP基因全長(zhǎng)660 bp,開放閱讀框(Open reading frame,ORF)長(zhǎng)657 bp,可翻譯成219個(gè)氨基酸。AJ-GBP重組蛋白是糖基水解酶家族16 中的一員,分子質(zhì)量為24.64 kDa,等電點(diǎn)為5.94,無信號(hào)肽,鏈型為單鏈,拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)為線型,且AJ-GBP具有2 個(gè)蛋白激酶C 磷酸化位點(diǎn)(S36EK,S83AR),3個(gè)酪蛋白激酶II 磷酸化位點(diǎn)(S36EKE,S55PAD,T186FGD),1 個(gè)β-1,3-葡聚糖酶位(W127-E132-I133-D134),1 個(gè)β-1,3-多糖連接識(shí)別基序(FH?NYTLVWTADSLDFYLDG),1個(gè)多糖結(jié)合基序(VFAQLPKGDWLWPAIWLLP)和1 個(gè)葡聚糖酶基序(WPASGEIDLVES)。此外,在AJ-GBP 重組蛋白的第17 位和第193 位發(fā)現(xiàn)有糖基化位點(diǎn)存在(圖1)。

      圖1 AJ-GBP 氨基酸序列中位點(diǎn)和基序預(yù)測(cè)

      2.2 AJ-GBP 重組蛋白活性鑒定

      2.2.1 細(xì)菌凝集活性分析 細(xì)菌凝集試驗(yàn)對(duì)AJGBP 重組蛋白凝集枯草芽孢桿菌等6 種細(xì)菌的能力進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果如圖2 所示。由圖2 可知,AJ-GBP重組蛋白對(duì)革蘭氏陽性菌以及革蘭氏陰性菌具有明顯的凝集效果。

      圖2 AJ-GBP 的凝菌結(jié)果

      2.2.2 抑菌活性分析 抑菌試驗(yàn)對(duì)AJ-GBP 重組蛋白抑制6 種細(xì)菌的能力進(jìn)行測(cè)定,如圖3 所示。由圖3 可知,AJ-GBP 重組蛋白能夠抑制革蘭氏陰性菌和革蘭氏陽性菌的生長(zhǎng),但對(duì)金黃色葡萄球菌和綠膿桿菌的抑制作用并不明顯。

      圖3 AJ-GBP 的抑菌結(jié)果

      2.2.3 細(xì)菌結(jié)合活性分析 細(xì)菌結(jié)合試驗(yàn)測(cè)定AJGBP 重組蛋白對(duì)6 種細(xì)菌結(jié)合能力。圖4A 中2~7 泳道均有明顯的重組蛋白條帶,說明AJ-GBP 對(duì)枯草芽孢桿菌、大腸桿菌、鰻弧菌、金黃色葡萄球菌、藤黃短小桿菌、綠膿桿菌均有結(jié)合活性。圖4B 中除泳道2 外,其余泳道中均無重組蛋白殘留,說明未與菌體結(jié)合的重組蛋白已被洗凈。結(jié)果表明,AJ-GBP 重組蛋白對(duì)革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌有明顯的結(jié)合活性。

      圖4 AJ-GBP 的菌結(jié)合活性

      2.2.4 糖結(jié)合活性分析 對(duì)葡聚糖、肽聚糖、脂多糖進(jìn)行糖結(jié)合試驗(yàn),結(jié)果表明,AJ-GBP 重組蛋白對(duì)葡聚糖有明顯的結(jié)合活性(圖5),且結(jié)合強(qiáng)度與蛋白濃度成正比。但AJ-GBP 重組蛋白對(duì)脂多糖、肽聚糖沒有明顯的結(jié)合活性。

      圖5 AJ-GBP 與葡聚糖結(jié)合活性

      3 討論

      試驗(yàn)成功地將仿刺參GBP基因的cDNA 進(jìn)行克隆,并命名為AJ-GBP,其全長(zhǎng)660 bp。AJ-GBP 重組蛋白具有219 個(gè)氨基酸,但不具有信號(hào)肽。研究表明,中國(guó)對(duì)蝦的GBP(FcβGBP-HDL)也被證實(shí)沒有信號(hào)肽[9]。此外,序列比對(duì)結(jié)果顯示,AJ-GBP 屬于糖基水解酶家族16,且沒有蝦β-GRP 特有的細(xì)胞黏著位點(diǎn)RGD,而在氨基酸序列的107 位置發(fā)現(xiàn)KGD。RGD 主要存在于甲殼類動(dòng)物GBP 中,可激活酚氧化酶級(jí)聯(lián)反應(yīng)以清除入侵的病原體[12,24],而KGD 則在維持蛋白穩(wěn)定性方面發(fā)揮了巨大作用[25,26]。

      GBP 可以通過結(jié)合、凝集和激活酚氧化酶活性等方式來激活對(duì)入侵病原微生物的免疫防御機(jī)制[10]。研究結(jié)果表明,AJ-GBP 重組蛋白對(duì)革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌均具有明顯的凝集作用。說明AJ-GBP 可能參與了仿刺參的免疫防御機(jī)制。且AJ-GBP 重組蛋白雖然能抑制革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌生長(zhǎng),但對(duì)金黃色葡萄球菌和綠膿桿菌的抑制作用并不明顯。然而研究人員從南美對(duì)蝦中獲取的GBP 不具有抑菌能力[10],表明GBP 具有一定的物種特異性。AJ-GBP 重組蛋白對(duì)革蘭氏陰性菌和革蘭氏陽性菌有明顯的結(jié)合活性。由于在無脊椎動(dòng)物中,識(shí)別入侵病原體或病原微生物是免疫防御機(jī)制的第一步[11],因此AJ-GBP 可能參與了仿刺參的固有免疫反應(yīng),并在其中發(fā)揮了關(guān)鍵性作用。這點(diǎn)在羅氏沼蝦、中國(guó)對(duì)蝦、南美對(duì)蝦中已被證實(shí)[9,10,13]。此外,大多數(shù)GBP 對(duì)葡聚糖具有明顯的結(jié)合活性。AJ-GBP 重組蛋白也證明了這一點(diǎn),其對(duì)葡聚糖具有明顯的結(jié)合活性,而對(duì)脂多糖、肽聚糖沒有明顯的結(jié)合活性。但有報(bào)道稱,從淡水螯蝦和澳大利亞紅螯螯蝦(Cherax quadricarinatus)中分離出的GBP 對(duì)脂多糖和葡聚糖具有結(jié)合活性[27,28]。GBP 糖結(jié)合能力的不同表明來自不同生物的蛋白之間存在差異性,再一次說明GBP 具有物種特異性。綜上所述,AJ-GBP 重組蛋白具有明顯的抗菌活性,因此其在制備生物抗菌藥物、解決當(dāng)前養(yǎng)殖中抗生素抗藥性具有十分重要的意義。

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