張 臣, 王艷麗, 黃中炎, 付曉榮, 王 勉, 張 麗, 汪曉婷△
[1武漢市武昌醫(yī)院(武漢科技大學附屬武昌醫(yī)院)兒科,湖北武漢 430063;2華中科技大學同濟醫(yī)學院附屬武漢兒童醫(yī)院(武漢市婦幼保健院)小兒呼吸二內(nèi)科,湖北武漢 430016]
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)是一種革蘭氏陰性桿菌,通常存在于下消化道。在免疫防御受損或氣道清除機制受損的患者中,KP 可引起下呼吸道的嚴重感染[1]。目前,關(guān)于KP 誘導下呼吸道感染的發(fā)病機制尚未完全清楚。最近的研究表明,KP 感染與Th1/Th17 CD4+T 細胞的存在有關(guān)[2]。此外,KP 感染患者的肺部、痰液和血液中白細胞介素17A(interleukin-17A,IL-17A)或IL-17A+CD4+T細胞水平與疾病嚴重程度相關(guān)[3]。然而,導致KP 相關(guān)感染的遺傳和環(huán)境因素仍不清楚。GTP 酶免疫相關(guān) 蛋 白5(GTPase of immunity-associated protein 5,GIMAP5)對淋巴細胞的存活至關(guān)重要,GIMAP5缺陷的CD4+T細胞在抗原刺激下表現(xiàn)出生存受損和DNA損傷增加[4]。在嚙齒類動物和人類受試者中,GIMAP5喪失功能突變會導致淋巴細胞減少,免疫耐受喪失,隨后出現(xiàn)自身免疫性疾病[5]。在GIMAP5缺陷小鼠中,表現(xiàn)為CD4+T 細胞驅(qū)動的結(jié)腸炎[6]。但目前尚不清楚KP感染是否通過調(diào)節(jié)GIMAP5的活性來控制T 細胞發(fā)育。因此,本項工作以大鼠CD4+T 細胞為研究對象,探討KP感染對細胞中GIMAP5表達、T細胞激活及Th17和Th1細胞體外發(fā)育的影響。
動物:從北京協(xié)和醫(yī)學院實驗動物研究所獲得20 只Sprague-Dawley(SD)雄性大鼠[SPF 級,200~250 g,3 月齡,生產(chǎn)許可證號為SCXK(京)2017-0005]。動物在標準條件下飼養(yǎng),均可自由獲得標準飼料和水。
菌株:KP 菌株購自中國科學院微生物研究所,在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上培養(yǎng),用生理鹽水稀釋為2.4×1011CFU/L,在動物體內(nèi)進行KP誘導。
2.1 細胞分離和培養(yǎng) 使用CD4+T 細胞分離試劑盒(Miltenyi Biotech)從大鼠脾細胞中獲得CD4+T 細胞。將細胞接種在含10%熱滅活胎牛血清(Sigma-Aldrich)、55 μmol/L 2-巰基乙醇(Gibco)、1×105U/L青霉素和100 mg/L 鏈霉素(Sigma-Aldrich)的RPMI-1640 培養(yǎng)液(含L-谷氨酰胺;Gibco)中,加入抗CD3和抗CD28抗體(濃度分別為1和2 mg/L)進行體外細胞刺激,觀察不同刺激時間(24、48 和72 h)對CD4+T細胞GIMAP5 表達的影響。為了誘導大鼠T 細胞亞群,在下列細胞因子和抗體的存在下激活細胞[4]:對于Th1細胞,使用20 μg/L IL-12和5 mg/L 抗大鼠IL-4抗體;對于Th17 細胞,使用0.5 μg/L 轉(zhuǎn)化生長因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)、50 μg/L IL-6、10 μg/L IL-23、10 μg/L IL-1β、5 mg/L 抗大鼠IFN-γ 抗體和5 mg/L 抗大鼠IL-4 抗體;對于調(diào)節(jié)性T 細胞(regulatory T cells,Treg),使用5 mg/L TGF-β??贵w從BD Biosciences 購買,而細胞因子則從Miltenyi Biotech、Immunotools 或BioLegend 購買。對于CD4+T細胞活化和發(fā)育實驗,將CD4+T 細胞分為對照(control、CTRL)組、KP 組和KP+GIMAP 組。除對照組外,將培養(yǎng)至對數(shù)生長期的KP 用PBS 稀釋至2.4×1011CFU/L,并按感染復數(shù)100∶1 的比例混合細菌與CD4+T 細胞共孵育6 h。此外,KP+GIMAP5 組加入GIMAP5重組蛋白(廣州銳博生物科技有限公司設(shè)計并合成)25 μmol/L,在37 ℃下預培養(yǎng)72 h。然后,各組加入抗CD3和抗CD28抗體(濃度分別為1和2 mg/L)體外刺激細胞48 h。收集細胞,進行以下測試。
2.2 Western blot檢查 收集培養(yǎng)細胞并在Laemmli樣品緩沖液中裂解,然后在95 ℃條件下加熱5 min。用BCA 蛋白定量分析試劑盒(Thermo Scientific)測量蛋白濃度。蛋白樣品在SDS-PAGE 上分離,并轉(zhuǎn)移到PVDF 膜上。用1∶1 000 稀釋的Ⅰ抗(GIMAP5 和GAPDH)和1∶2 000稀釋的HRP標記山羊抗兔IgG抗體(均購自Cell Signaling Technology)檢測蛋白表達水平。以GAPDH為內(nèi)參照。
2.3 RT-qPCR 實驗 使用Purelink RNA Mini 試劑盒(Invitrogen)分離RNA。利用高容量cDNA 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Applied Biosystems)將RNA 轉(zhuǎn)化為cDNA,并在Applied Biosystems 7500 型熒光定量PCR 儀上進行RT-qPCR 檢測。mRNA 表達水平用2-ΔΔCt法計算。GAPDH 的正向引物序列為5′-GGGTGTGAACCACGAGAAAT-3′,反向引物序列為5′-CCTTCCACAATGCCAAAGTT-3′;GIMAP5 的 正 向 引 物 序 列 為5′-TACCAGGAGCCCATTCACAAC-3′,反向引物序列為5′-GCCACAGGACATCAGCCAAGAA-3′。
2.4 流式細胞術(shù) 除了早期IL-2 生成的評估在激活后24 h 進行外,其他所有的流式細胞術(shù)都是在激活后3 d 進行的。所有流式抗體采用1∶200 稀釋。為了分析細胞增殖,細胞在激活前用CellTrackerTMViolet(CTV;Invitrogen)進行預染色。用CTV 稀釋法評估細胞增殖水平。為了評估T 細胞的活化,收集洗滌細胞,并用抗大鼠CD44 和CD25 抗體染色。細胞內(nèi)細胞因子染色:收集細胞并洗滌,用50 mg/L PMA+1 mg/L 離子霉素+10 mg/L 布雷菲爾德菌素A(均購自Sigma-Aldrich)重新刺激,4 h 后,沖洗細胞,用固定和滲透緩沖液(BioLegend)固定/滲透,并用抗大鼠IL-2、干擾素γ(interferon-γ,IFN-γ)和IL-17A 染色。對于Treg 檢測,首先用抗大鼠CD25 抗體染色,然后用Foxp3/轉(zhuǎn)錄因子染色緩沖液組(Invitrogen)固定/滲透細胞,并用抗大鼠Foxp3 抗體孵育。所有樣本均在FACS Canto Ⅱ細胞分析儀(BD Biosciences)上處理。使用FlowJo軟件對采集的數(shù)據(jù)進行分析。
2.5 RNA 測序與轉(zhuǎn)錄組學分析 RNA 測序與轉(zhuǎn)錄組學分析由北京博奧生物有限公司完成??俁NA使用Qubit 2.0(Thermo Fisher Scientific)進行量化。采用獨創(chuàng)性路徑分析(Qiagen)進行無偏路徑分析。只有計算出KP 處理組與Th0 對照組差異表達變化>±1 倍且P<0.05 的基因才被考慮用于通路分析。為了生成特定基因集的熱圖,使用了Morpheus 軟件(Broad Institute)?;蛄斜硎菑墓_可用的基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)數(shù)據(jù)庫(Broad Institute)中獲得的,這些基因集的折疊改變基因表達在KP 處理的Th0 和對照Th0 RNAseq 數(shù)據(jù)中被量化。只有KP 處理組與對照組樣本差異表達變化>±1倍且調(diào)整后P<0.05的基因才被納入顯示原始讀取計數(shù)值的熱圖中。
所有數(shù)據(jù)均采用SPSS 21.0軟件進行統(tǒng)計分析,以均值±標準差(mean±SD)表示。兩組間比較采用Student 雙尾檢驗,多組間比較采用方差分析和Sidak多重比較。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
CD4+T 細 胞 受CD3/CD28 刺 激 后,GIMAP5 的mRNA 和蛋白水平與刺激前相比均顯著上調(diào)(P<0.05),見 圖1A、B。此 外,CD3/CD28 刺 激 導 致GIMAP5在細胞中呈時間依賴性積累,見圖1C。
Figure 1. CD3/CD28 activation induced the up-regulation of GIMAP5 expression in CD4+ T cells of rats. A:relative mRNA level of GIMAP5 in resting and activated CD4+T cells was detected by RT-qPCR;B:Western blot showed the expression and quantitative analysis of GIMAP5 protein in CD4+ T cells after activation;C:the protein expression of GIMAP5 in activated CD4+T cells was analyzed by Western blot. Mean±SD. n=6.*P<0.05,**P<0.01 vs resting group.圖1 CD3/CD28激活誘導大鼠CD4+T細胞GIMAP5表達上調(diào)
為了測試KP 感染對T 細胞功能的影響,本研究用KP 感染CD4+T 細胞。結(jié)果顯示,在CD3/CD28 激活期間,用KP 處理大鼠CD4+T 細胞可降低活化T 細胞中GIMAP5 的水平,見圖2A。然后研究分析了KP感染對T 細胞功能的影響。在CD3/CD28 刺激后24 h,與對照組細胞相比,KP 感染組中產(chǎn)生IL-2 的細胞顯著減少(P<0.01),加入GIMAP5 重組蛋白可恢復IL-2 的產(chǎn)生(P<0.05),見圖2B。與這些結(jié)果一致,KP處理抑制大鼠CD4+T細胞的增殖(P<0.01),加入GIMAP5 重組蛋白促進了CD4+T 細胞增殖(P<0.01),見圖2C、D。
Figure 2. KP infection blocked the CD4+ T cell activation in rats. A:Western blot was used to detect the protein expression of GIMAP5 in the CD4+T cells after KP treatment;B:the percentage of IL-2+cells after KP treatment was detected by flow cytometry;C:representative flow cytometry chart showing fluorescent CellTracer ?Violet to assess T cell proliferation;D:FlowJo software was used to calculate the division index to quantify T cell proliferation. Measn±SD. n=6.**P<0.01 vs control(CTRL)group;#P<0.05,##P<0.01 vs KP group.圖2 KP感染阻斷大鼠CD4+T細胞活化
獨創(chuàng)性路徑分析預測了KP 參與上調(diào)T 細胞激活的關(guān)鍵信號通路,其中包括Myc、HIF-1α 和mTOR通路,見圖3A。據(jù)此,基因表達分析證實,KP感染在體外促進了CD4+T 細胞中Myc、HIF-1α 和mTOR 所調(diào)節(jié)的基因的上調(diào),見圖3B。由于HIF-1α、Myc 和mTORC1 是T 細胞有氧糖酵解和Warburg 樣代謝的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[7],進一步RNA序列分析結(jié)果表明,KP感染處理顯著促進了激活后T 細胞中幾種糖酵解基因的上調(diào),見圖3C。
Figure 3. KP infection promoted HIF-1α,Myc and mTORC1 signaling transduction. A:original pathway analysis predicted that KP up-regulated Myc,HIF-1α and mTOR regulatory pathways;B:the thermography showed the expression of the genes regulated by Myc,HIF-1α and mTOR in T cells activated by DMSO(Th0 CTRL)or KP(Th0 KP);C:the thermography showed the expression of glycolytic genes in Th0 CTRL and Th0 KP cells.圖3 KP感染促進了HIF1-α、Myc和mTORC1信號轉(zhuǎn)導
流式細胞術(shù)分析顯示,與對照組相比,KP 感染后Th17 細胞和Th1 細胞的比例顯著升高(P<0.01),加入GIMAP5 重組蛋白可阻斷Th17 和Th1 細胞的發(fā)育,見圖4A、B。重要的是,本研究還觀察到KP 感染耗盡Treg 群體(P<0.01),加入GIMAP5 重組蛋白可誘導Treg產(chǎn)生(P<0.01),見圖4C。
Figure 4. Flow cytometry was used to evaluate the percentages of Th17+ cells(A),Th1 cells(B),and Treg(C). Mean±SD. n=6.**P<0.01 vs CTRL group;#P<0.05,##P<0.01 vs KP group.圖4 流式細胞術(shù)測定Th17細胞、Th1細胞和Treg的比例
KP 因其可引起廣泛感染及高水平抗生素耐藥性而備受關(guān)注[8]。作為對KP 感染的反應(yīng),宿主會觸發(fā)強烈的體液和細胞免疫反應(yīng),包括肺固有層CD3+CD4+T 細胞增多和T 細胞浸潤。小鼠肺部KP 感染是最早證明IL-17A對宿主細胞防御外細菌感染重要性的傳染病模型之一[9]。近年來,研究顯示KP 感染的CD4+T細胞在抗原刺激下表現(xiàn)出生存受損和DNA損傷增加[10]。GIMAP5蛋白主要在淋巴細胞中表達,并在發(fā)育、選擇和穩(wěn)態(tài)過程中調(diào)節(jié)淋巴細胞存活[11]。然而,目前關(guān)于KP 感染是否通過調(diào)節(jié)GIMAP5 的活性來控制T細胞活化卻從未被研究過,尤其是在T細胞亞群的背景下。本研究顯示GIMAP5在CD3/CD28刺激后表達上調(diào),并積聚在CD4+T 細胞中;KP 感染顯著降低了GIMAP5 表達,嚴重影響T 細胞活化,并促進了促炎性Th17和Th1細胞的體外發(fā)育。
GIMAP5可以被轉(zhuǎn)運到增殖細胞的細胞核,發(fā)揮不同的功能,如組蛋白磷酸化和基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控,包括調(diào)控Myc轉(zhuǎn)錄和與HIF-1α相互作用以促進HIF-1α依賴基因的表達,編碼參與糖酵解的酶[4]。GIMAP5 也被證明通過mTORC1抑制富含脯氨酸的AKT1底物1的磷酸化或通過減少絲氨酸的合成來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)化細胞中mTORC1的活性,且GIMAP5可在增殖細胞中維持mTORC1 功能[12]。本研究結(jié)果表明,GIMAP5 的活性可能通過控制HIF-1α、mTORC1 和Myc 的功能,以及T 細胞受體激活的CD4+T 細胞中有氧糖酵解的參與而調(diào)控,這些是其激活的關(guān)鍵因素[7]。值得注意的是,靜息T細胞細胞核中GIMAP5的水平較低,先前的研究表明HIF-1α和Myc的活性可能由mTORC1自身控制[13]。因此,抑制GIMAP5的活性可以阻斷HIF-1α和Myc在CD3/CD28刺激下的高表達水平。這些結(jié)果可以解釋KP 體外感染促進了CD4+T 細胞中Myc、HIF-1α 和mTOR 所誘導的基因的上調(diào)。因此,KP 感染可能對T細胞代謝有更廣泛的影響。
本研究還表明,KP 感染誘導促炎性Th17 和Th1細胞的發(fā)育,且抑制Treg 生成,從而抑制體內(nèi)自身免疫。先前的研究表明,誘導mTORC1、Myc 和HIF-1α可以抑制炎癥條件下Foxp3+T細胞的發(fā)育[14-15]。其他研究表明,糖酵解和mTORC1/HIF-1α 活性抑制有利于Treg 的生成[16]。而抑制有氧糖酵解可限制小鼠模型和人類疾病中T 細胞介導的Th17 生成和發(fā)展[17]。鑒于本研究結(jié)果表明KP在體外可阻斷TGF-β誘導的Treg,因此需要進一步研究GIMAP5 在Treg 生成和功能中的重要性。此外,為了進一步確認GIMAP5在介導KP 感染引起的T 細胞激活和致病性中的作用,應(yīng)進一步在體內(nèi)模型中分析GIMAP5基因缺失對KP感染大鼠T細胞功能的影響。
綜上所述,影響GIMAP5 活性可能是限制KP 感染誘導T 細胞致病性的一個潛在途徑。本研究支持這樣一種觀點,即通過上調(diào)T細胞中GIMAP5的表達來限制Th1/Th17 的發(fā)育是治療KP 感染的一種有價值的方法。