芝麻過敏原Ses i 3同源建模及B細(xì)胞線性抗原表位預(yù)測(cè)

馬秀麗，張九凱，孫勁旅，李 宏，黃文勝，韓建勛，葛毅強(qiáng)，4*，陳 穎*

（1 中國檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院 北京100176 2 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院 北京100083 3 北京協(xié)和醫(yī)院變態(tài)反應(yīng)科 北京100730 4 中國農(nóng)村技術(shù)開發(fā)中心 北京100045）

芝麻（Sesamum indicum）是重要的油料、蛋白基料、香料化工、醫(yī)藥保健用品等常用加工原料，廣泛添加于糕點(diǎn)、菜肴和飲品中。同時(shí)，芝麻也是常見的食物過敏原之一，因其致敏的發(fā)病率逐年升高，故引發(fā)了越來越多的關(guān)注[1-3]。

研究表明，芝麻主要過敏原包括：2 種2S 白蛋白Ses i 1（9～14 ku）和Ses i 2（7 ku），7S 類豌豆球蛋白Ses i 3 （45 ku），2 種油脂蛋白Sesi 4（17 ku）和Ses i 5（15 ku），2 種11S 球蛋白Ses i 6（52.2 ku）和Ses i 7（56.6 ku）[4-8]，其中，芝麻7S類豌豆球蛋白中含量最豐富的是Ses i 3，它是芝麻的主要過敏原之一，能被75%以上的芝麻過敏患者血清IgE 所識(shí)別[6]。分子質(zhì)量為45 ku（SDSPAGE），缺乏二硫鍵，屬于Cupin 超家族（AF045）。由cDNA 推導(dǎo)的Ses i 3 前體共有585 個(gè)氨基酸[9]，202～354 aa 和395～560 aa 是其2 個(gè)結(jié)構(gòu)域，2 個(gè)cupin 串聯(lián)排列，與β-伴大豆球蛋白cupin 結(jié)構(gòu)相似。在Ara h 1 中已知的IgE 結(jié)合抗原表位（TPGQFEDFFP） 上，Ses i 3 和Ara h 1 相應(yīng)的區(qū)域有高達(dá)80%的同源性，因此二者的IgE 抗體之間有交叉反應(yīng)[6]。另外，Ses i 3 與該家族中的開心果、榛子、花生中的7S 豌豆球蛋白過敏原之間分別有47%，42%，36%的同源性[10]?？乖砦皇沁^敏原分子引發(fā)食物過敏反應(yīng)的免疫學(xué)物質(zhì)基礎(chǔ)，是能夠參與結(jié)合抗體的重要組成部分。通過對(duì)抗原表位的預(yù)測(cè)和比對(duì)，能夠進(jìn)一步判斷芝麻過敏原抗原表位以及與其它過敏原之間的交叉反應(yīng)情況。B 細(xì)胞表位預(yù)測(cè)多是線性表位預(yù)測(cè)，是表位預(yù)測(cè)的重要環(huán)節(jié)。預(yù)測(cè)多是根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸序列，涉及抗原蛋白組成氨基酸的理化性質(zhì)、統(tǒng)計(jì)顯著性、結(jié)構(gòu)性質(zhì)等特征屬性而衍生出一系列的算法進(jìn)行表位預(yù)測(cè)。其中，包括親水性、表面可及性、柔韌性、抗原指數(shù)等方案以及二級(jí)結(jié)構(gòu)等預(yù)測(cè)算法。在預(yù)測(cè)過程中需要聯(lián)用多種方案，以提高預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性[11]。蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)是深入了解過敏原的一個(gè)重要方面。然而其解析仍是一個(gè)難點(diǎn)。目前PDB（Protein data bank）數(shù)據(jù)庫是全球唯一的收錄大型生物分子（蛋白質(zhì)和核苷酸）3D 結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫。結(jié)合目前迅速發(fā)展的生物信息學(xué)軟件，如SWISS-MODEL 等，可實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)和模擬。通過生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)蛋白性質(zhì)、結(jié)構(gòu)等，有助于提高表位等免疫試驗(yàn)設(shè)計(jì)上的合理性[12]。本研究將分子生物學(xué)技術(shù)與生物信息學(xué)技術(shù)相結(jié)合，使用多參數(shù)軟件預(yù)測(cè)芝麻過敏原Ses i 3 的抗原表位，并對(duì)其三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行模擬，為深入了解芝麻過敏原，進(jìn)而為芝麻過敏原的精準(zhǔn)檢測(cè)和診斷提供參考。

1 材料與方法

1.1 芝麻過敏原Ses i 3 的氨基酸序列

在Uniprot 數(shù)據(jù)庫中獲得Ses i 3 的氨基酸序列，登錄號(hào)：Q9AUD0，共585 個(gè)氨基酸，序列如下：MSCGGRLCLVLFALLLASAVVASESKDPELKQCK HQCKAQQQISKEQKEACIQACKEYIRQKHQGEH GRGGGDILEEEVWNRKSPIERLRECSRGCEQQH GEQREECLRRCQEEYQREKGRQDDDNPTDPEKQ YQQCRLQCRRQGEGGGFSREHCERRREEKYREQ QGREGGRGEMYEGREREEEQEEQGRGRIPYVFE DQHFITGFRTQHGRMRVLQKFTDRSELLRGIENY RVAILEAEPQTFIVPNHWDAESVVFVAKGRGTISL VRQDRRESLNIKQGDILKINAGTTAYLINRDNNER LVLAKLLQPVSTPGEFELFFGAGGENPESFFKSFS DEILEAAFNTRRDRLQRIFGQQRQGVIVKASEEQ VRAMSRHEEGGIWPFGGESKGTINIYQQRPTHSN QYGQLHEVDASQYRQLRDLDLTVSLANITQGAMT APHYNSKATKIALVVDGEGYFEMACPHMSRSRG SYQGETRGRPSYQRVASRLTRGTVVIIPAGHPFVA VASSNQNLQVLCFEVNANNNEKFPLAGRRNVMN QLEREAKELAFGMPAREVEEVSRSQQEEFFFKGP RQQQQGRADA。

1.2 芝麻過敏原Ses i 3 蛋白理化性質(zhì)分析

Expert Protein Analysis System （ExPASy）Proteomics tools（http：//www.Expasy.ch/tools/）所提供的Prot-Param 在線軟件，預(yù)測(cè)其氨基酸組成、等電點(diǎn)、分子質(zhì)量、親水/疏水性等基本理化性質(zhì)。DNAStar 生物分析軟件中的子程序Protean，其Jameson-Wolf 方案預(yù)測(cè)抗原指數(shù)，Hopp-Woods 和Kyte-Doolittle 方案預(yù)測(cè)親水性，Emini 方案預(yù)測(cè)分析蛋白表面可及性，Karplus-Schulz 方案預(yù)測(cè)分析蛋白柔韌性[13-16]。

1.3 芝麻過敏原Ses i 3 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

DNAStar 生物分析軟件中的子程序Protean，選擇Chou-Fasman 方案、Gamier-Robson 方案以及Deleage-Roux 方案對(duì)α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷的預(yù)測(cè)。生物信息分析軟件SOPMA 網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器 （http：//npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html）包括Garnier-Gibrat-Robson （GOR）方法、雙重預(yù)測(cè)方法、Levin 同源預(yù)測(cè)方法、PHD 方法、CNRS 的SOPMA方法，可實(shí)現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)，預(yù)測(cè)結(jié)果為5 種方法的合并結(jié)果[17]。將Ses i 3 序列提交至SOPMA網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器，“Number of conformational states”設(shè)置 為“4（Helix，Sheet，Turn，coil）”，“Similarity threshold”設(shè)置為“8”，“Window width”設(shè)置為“17”[17]。

1.4 芝麻過敏原Ses i 3 抗原表位預(yù)測(cè)

1）BepiPred 預(yù)測(cè) BepiPred 1.0 Server 使用隱馬爾可夫模型（Hidden Markov Model，HMM）和親水性參數(shù)評(píng)分來預(yù)測(cè)線性B 細(xì)胞結(jié)合表位[18-19]。登錄BepiPred 1.0 Server 網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器，提交Ses i 3 序列，設(shè)置選擇默認(rèn)值。

2）綜合預(yù)測(cè) 將蛋白的特性（親水性、柔韌性、表面可及性等）與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)匯總分析。預(yù)測(cè)序列不同區(qū)段的親水性、表位可及性、柔韌性和抗原指數(shù)，篩選出親水性、抗原指數(shù)同為正值，表面可及性大于1，有柔韌性的合適區(qū)段，作為預(yù)測(cè)蛋白的B 細(xì)胞線性表位。

1.5 芝麻過敏原Ses i 3 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

Swiss-Model[20]（http：//www.swissmodel.expasy.org/）網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器，運(yùn)用結(jié)構(gòu)仿真模擬（ProMod II程序）和能量最小化分析（GROMOS96 程序）構(gòu)建目標(biāo)序列的結(jié)構(gòu)，根據(jù)同源蛋白質(zhì)的晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)出目標(biāo)蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)模型。登錄在線軟件Swiss-Model，上傳Ses i 3.fasta 序列文件，選擇自動(dòng)模式。從搜索結(jié)果中選擇同源性最高的蛋白作為模板（Template），下載模板序列后，同時(shí)提交Ses i 3 和模板序列至Swiss-Model 服務(wù)器進(jìn)行自動(dòng)建模，獲得蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果。利用Structure Assessment 模塊對(duì)預(yù)測(cè)的Ses i 3 蛋白三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行穩(wěn)定性評(píng)估分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 Ses i 3 蛋白B 細(xì)胞線性表位預(yù)測(cè)

2.1.1 Ses i 3 蛋白的基本理化性質(zhì) 利用Prot-Param 預(yù)測(cè) Ses i 3 蛋白得到分子式為C2882H4570N904O901S24，原子數(shù)為9 281，分子質(zhì)量為67.1 ku，理論等電點(diǎn)為4.64，在氨基酸的分布上：Glu（E）含量最高，共計(jì)67 個(gè)，占11.5%，其次是Arg（R），共計(jì)62 個(gè)，占10.6%。該蛋白的理論等電點(diǎn)為（pI）為7.55，平均親水系數(shù) （Grand average of hydropathicity，GRAVY）為：-0.902，預(yù)測(cè)為親水性蛋白，說明蛋白整體的親水性較好。

2.1.2 DNAStar 預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白B 細(xì)胞線性表位結(jié)果 抗原的線性表位一般都暴露在過敏原分子的外部，位于柔韌性區(qū)域內(nèi)，由極性氨基酸殘基組成，線性表位所含氨基酸一般大于3 個(gè)[21]。DNAStar 軟件預(yù)測(cè)Ses i 3 的抗原指數(shù)、親水性、表面可及性和柔韌性如圖1所示。從圖中可以看出，柔韌性指數(shù)中有矩形覆蓋的部分為抗原表位的優(yōu)勢(shì)區(qū)域，Ses i 3 中柔韌性好的區(qū)域分布相對(duì)平均；有20 多個(gè)區(qū)域的抗原指數(shù)較高；親水性較好的區(qū)域主要集中在序列前半部分；有近20 個(gè)區(qū)域的表面可及性好。其中，親水性、抗原指數(shù)為正值，表面可及性大于1，柔韌性預(yù)測(cè)結(jié)果中有矩形覆蓋的合適區(qū)段，作為DNAStar 預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白的B 細(xì)胞線性表位的一類指標(biāo)。另外，蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)是抗原表位預(yù)測(cè)另一個(gè)重要參數(shù)。α-螺旋和β-折疊結(jié)構(gòu)不易變形，難以與抗體結(jié)合，處于這2 個(gè)區(qū)域內(nèi)的氨基酸序列成為抗原表位的可能性較小。β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲由于其突出的結(jié)構(gòu)，極易與抗體結(jié)合，這2 個(gè)區(qū)域內(nèi)的氨基酸序列極有可能成為抗原表位。DNAStar 的子程序能夠預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)。通過Chou-Fasman 方案、Gamier-Robson 方案以及Deleage-Roux 方案預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果如圖2所示，β-轉(zhuǎn)角（T）或無規(guī)則卷曲（C）出現(xiàn)的區(qū)域在整個(gè)氨基酸序列分布均勻，預(yù)示這些區(qū)域出現(xiàn)線性表位可能性較高。

圖1 Ses i 3 蛋白柔韌性、抗原指數(shù)、親水性、表面可及性分析Fig.1 Prediction of antigenicity，hydrophilicity，surface probability and flexibility of Ses i 3

圖2 DNAStar 預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果Fig.2 Prediction of secondary structure of protein Ses i 3 using DNAStar

綜合考慮DNAstar 預(yù)測(cè)的親水性指數(shù)、抗原指數(shù)、表面可及性指數(shù)、柔韌性指數(shù)以及二級(jí)結(jié)構(gòu)的結(jié)果，預(yù)測(cè)的線性表位如表1所示（加粗部分）。

表1 DNAStar 預(yù)測(cè)B 細(xì)胞線性表位預(yù)測(cè)結(jié)果Table 1 Prediction of B-cell epitopes using DNAStar

2.1.3 SOMPA 預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白B 細(xì)胞線性表位結(jié)果 利用SOPMA 網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器對(duì)該蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)，結(jié)果如圖3所示，其中構(gòu)成α-螺旋的氨基酸占比為36.24%，構(gòu)成β-折疊的氨基酸占比為19.32%，構(gòu)成β-轉(zhuǎn)角的氨基酸占比為10.09%，構(gòu)成無規(guī)則卷曲的氨基酸占比為34.36%，詳細(xì)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表2所示。可以看出，近一半的氨基酸殘基構(gòu)成了β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲，這部分是抗原表位的優(yōu)勢(shì)區(qū)域，結(jié)合2.1 節(jié)中預(yù)測(cè)的氨基酸特性，由此預(yù)測(cè)出Ses i 3 的線性表位如表3所示。

2.1.4 BepiPred 1.0 預(yù)測(cè)Ses i 3 蛋白B 細(xì)胞線性表位結(jié)果 將Ses i 3 蛋白提交至Bepi Pred網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器后，通過Markov 模型和規(guī)?；椒ńY(jié)合來預(yù)測(cè)B 細(xì)胞線性表位。BepiPred 具有生物序列比對(duì)、同源性分析、基因識(shí)別、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、信號(hào)肽預(yù)測(cè)、抗原表位預(yù)測(cè)等功能[22]，廣泛的應(yīng)用于生物信息學(xué)領(lǐng)域，是最佳的單一模式預(yù)測(cè)方法，其預(yù)測(cè)結(jié)果如表3所示。

將上述3 種方法所預(yù)測(cè)得到區(qū)域進(jìn)行比對(duì)，發(fā)現(xiàn)3 種預(yù)測(cè)結(jié)果大體一致。根據(jù)文獻(xiàn)[23]介紹的方式進(jìn)行多種軟件結(jié)合，篩選最終的預(yù)測(cè)肽段。根據(jù)表3的預(yù)測(cè)結(jié)果，本研究選擇同時(shí)涵蓋2 種及以上的預(yù)測(cè)區(qū)域作為最終的線性表位區(qū)域，既提高了預(yù)測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性，也能保證更多的線性表位優(yōu)勢(shì)區(qū)域可供選擇，預(yù)測(cè)的表位肽段信息詳見表4。圖4為Ses i 3 所有預(yù)測(cè)到的B 細(xì)胞線性表位的空間分布情況，所展現(xiàn)的是不同角度的觀測(cè)結(jié)果，可以看出預(yù)測(cè)表位多分布在無規(guī)則卷曲處?？梢园l(fā)現(xiàn)，預(yù)測(cè)的Ses i 3 線性表位在整個(gè)序列中分布比較均勻，整個(gè)蛋白序列的前、中、后段都有預(yù)測(cè)的表位區(qū)域分布。并且短肽段的表位所占比例較多，其中表位4 和表位10 的序列相同，這里作為同種表位。Ses i 3 與Cupin 超家族中的其它過敏原有較高的同源性，并且在報(bào)道的已知表位上存在著部分區(qū)域氨基酸序列高度相似的情況，也存在某些表位關(guān)鍵氨基酸相同的情況。將預(yù)測(cè)的表位與該家族中有已知表位的7S 豌豆球蛋白過敏原（腰果中的Ana o 1、英國胡桃中的Jug r 2、花生中的Ara h 1、扁豆中的Len c 1）序列進(jìn)行比對(duì)[24-28]，將有重疊的部分進(jìn)行展示，結(jié)果如圖5所示，黃色區(qū)域?yàn)橐阎€性抗原表位，綠色區(qū)域?yàn)镾es i 3 預(yù)測(cè)表位。在預(yù)測(cè)的表位中，其中有10 個(gè)肽段的位置與已經(jīng)報(bào)道的表位區(qū)域存在部分重合的現(xiàn)象，說明生物信息學(xué)方法在預(yù)測(cè)過敏原蛋白抗原表位時(shí)有較高的準(zhǔn)確度。

圖3 SOPMA 預(yù)測(cè)Ses i 3 二級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.3 Prediction of secondary structure of Ses i 3 using SOPMA

表2 SOPMA 預(yù)測(cè)Ses i 3 二級(jí)結(jié)構(gòu)Table 2 Prediction of secondary structures of Ses i 3 using SOPMA

表3 3 種信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)結(jié)果Table 3 Prediction by three bioinformation tools

表4 B 細(xì)胞線性表位最終預(yù)測(cè)結(jié)果Table 4 Final prediction of B-cell liner peptides

圖4 預(yù)測(cè)芝麻過敏原蛋白Ses i 3 B 細(xì)胞線性抗原表位空間構(gòu)象Fig.4 Spatial conformation of predicted B cell liner antigenic epitopes in sesame allergen Ses i 3

圖5 芝麻過敏原Ses i 3 與Cupin 超家族過敏原序列比對(duì)結(jié)果[24-28]Fig.5 Sequence alignment of sesame allergen Ses i 3 and Cupin allergens[24-28]

2.2 Ses i 3 蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

使用Swiss-Model 服務(wù)器預(yù)測(cè)蛋白三維結(jié)構(gòu)時(shí)，軟件首先會(huì)選擇一系列被PBD（http：//www.rcsb.org/pdb/）數(shù)據(jù)庫收錄且結(jié)構(gòu)已知的同源性蛋白質(zhì)。從篩選結(jié)果中選擇相似性較高的作為模板，建立模型。經(jīng)過評(píng)估后選擇合適的模型作為最終的預(yù)測(cè)結(jié)果。經(jīng)過SWISS-MODEL 分析，與Ses i 3 同源性最高的是碧根果中新發(fā)現(xiàn)的一種7S 類豌豆球蛋白過敏原[29]，命名為Car i 2，與Ses i 3同屬于Cupin 超家族，在PDB 數(shù)據(jù)庫中編號(hào)為5e1r.2。比對(duì)后發(fā)現(xiàn)兩者同源性達(dá)到了48.74%，通常當(dāng)目標(biāo)蛋白與模板蛋白的同源性達(dá)到30%以上時(shí)，建立的模型才有可靠性，因此可選擇5e1r.2 建模，結(jié)果如圖6所示。通過軟件所帶的“Structure Assessment”（結(jié)構(gòu)評(píng)價(jià)）功能，評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性，得到圖7所示的反映立體化學(xué)質(zhì)量參數(shù)Ramachandran 圖。Ramachandran 圖表示的是α碳的兩面角，在實(shí)際中要保持蛋白質(zhì)構(gòu)象的穩(wěn)定，主鏈就需要具備合理φ 角和ψ 角。骨架的集合需要分布在Ramachandran 圖的可接受區(qū)域，否則將形成空間結(jié)構(gòu)空間位阻[30]。通過分析ψ 角和φ 角分布情況，顯示高達(dá)93.96%骨架的φ 角和ψ 角位于分布在Ramachandran Favoured，即可接受區(qū)域內(nèi)。如圖7所示深綠色和淺綠色部分，是最理想的ψ 角和φ 角分布區(qū)域，只有極少數(shù)（1.28%）分布在白色區(qū)域Ramachandran Outliers，即不合理區(qū)域。因此，以5e1r.2 為模板預(yù)測(cè)的Ses i 3 蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)是穩(wěn)定可靠的，是高質(zhì)量的模型結(jié)構(gòu)。

圖6 蛋白空間結(jié)構(gòu)Fig.6 Steric structure of protein

3 結(jié)論

圖7 Ses i 3 蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)的拉氏構(gòu)象Fig.7 Ramachandran plot analysis of Ses i 3 three-dimensional model

對(duì)于B 細(xì)胞線性表位的預(yù)測(cè)有多種方式，然而主要都是借助于多種參數(shù)，如二級(jí)結(jié)構(gòu)、親水性、表面可及性、抗原性以及柔韌性等。其中，親水性和表面可及性在形成表位時(shí)十分關(guān)鍵，然而也離不開二級(jí)級(jí)結(jié)構(gòu)等其它因素的綜合影響[31]。蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的維持主要依賴于高化學(xué)鍵能的α-螺旋和β-折疊，它們通常位于蛋白質(zhì)內(nèi)部，與抗體嵌合困難，難以成為抗原表位；相反，β-轉(zhuǎn)角及無規(guī)則卷曲柔韌性好，結(jié)構(gòu)松散，易扭曲，多位于蛋白質(zhì)表面，易與抗體嵌合，容易成為抗原表位。

本研究根據(jù)蛋白的氨基酸序列，利用生物信息學(xué)軟件及服務(wù)器DNAStar、SOPMA 和BepiPred-1.0 3 種方法結(jié)合蛋白質(zhì)特性和二級(jí)結(jié)構(gòu)，預(yù)測(cè)分析了Ses i 3 的B 細(xì)胞線性表位，利用Swiss-Model 進(jìn)行同源建模并預(yù)測(cè)了三級(jí)結(jié)構(gòu)，對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性進(jìn)行評(píng)估，提高了預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。結(jié)果表明，Ses i 3 蛋白存在多個(gè)可能的抗原表位，SESKDP，RQKHQGEHG，NRKSP，QHG，YQREK GRQDDDNPTDPEKQY，RRQG，KYREQQGREG GRGE，EGR，EQGR，QHG，RQDR，ENP，RHE，ESK，RPTH，ASQ，SRSRGSYQGETRGRP，ANNNE，SRSQQ，GPRQQQQGR 最有可能成為其線性表位，在整個(gè)氨基酸序列中分布均勻，并且與同家族已知的過敏原線性表位上存在著部分區(qū)域氨基酸序列高度相似的情況。本研究的表位預(yù)測(cè)結(jié)果增加了對(duì)芝麻過敏原的認(rèn)識(shí)，為定位表位縮小了范圍，為抗體制備，免疫檢測(cè)提供了一定的理論基礎(chǔ)。探究芝麻過敏原Ses i 3 的三級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)過敏原的空間表位篩選，以及過敏原識(shí)別和檢測(cè)具有重要的參考和借鑒作用。