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      布萊凱特黑牛CB1基因克隆測序及表達(dá)分析

      2021-03-10 08:29:06劉賢勛劉瑞莉吳磊柏學(xué)進(jìn)于堃肖超柱董雅娟
      畜牧與獸醫(yī) 2021年3期
      關(guān)鍵詞:登錄號凱特脂肪組織

      劉賢勛,劉瑞莉,吳磊,柏學(xué)進(jìn),于堃,肖超柱,董雅娟,3*

      (1. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院動物胚胎工程中心,山東 青島 266109;2. 山東省黑牛繁育工程技術(shù)研究中心,山東 青島 266109;3. 山東布萊凱特黑牛科技股份有限公司,山東 淄博 256306)

      內(nèi)源性大麻素系統(tǒng)是一種普遍存在的脂質(zhì)信號傳導(dǎo)系統(tǒng),主要由內(nèi)源性大麻素和大麻素受體(canna-binoid receptors)組成。大麻素受體是指對△9-THC等大麻素有應(yīng)答的受體。大麻素受體有兩種類型,CB1和CB2,它們都是G蛋白偶聯(lián)受體[1]。CB1主要分布于中樞神經(jīng)系統(tǒng)(大腦皮層,小腦,海馬等)和外周神經(jīng)系統(tǒng)(骨骼肌,脂肪組織,肝臟等)。CB1最早在1991年通過研究CB1 mRNA在腦部的分布和選擇性大麻受體CB1激動劑[3H]CP5940在基底核、腦干和海馬的高密度分布后發(fā)現(xiàn)[2]。在臨床研究上,CB1抑制劑利莫那班使肥胖大鼠血漿中的瘦素、胰島素和葡萄糖分別降低81%、78%、67%,還能降低甘油三酯、游離脂肪酸和低密度脂蛋白固醇的水平[3]。且另有研究證明在正常飲食下,CB1基因敲除小鼠與野生型小鼠相比,血脂含量分別減少24%和60%,這些作用與外周代謝和攝食減少有關(guān)[4]。激動CB1受體可以增加體質(zhì)量,升高血脂,減退胰島B細(xì)胞功能,抑制CB1受體可逆轉(zhuǎn)此效應(yīng)[5]。研究表明,豬CB1基因可通過調(diào)控脂肪降解限速酶肉堿脂酰轉(zhuǎn)移酶1(CPT1)基因進(jìn)而影響脂肪沉積,推測豬CB1基因可能是CPT1的上游基因[1]。因此,推測CB1基因在脂肪代謝方面參與相關(guān)調(diào)節(jié)過程,目前尚無關(guān)于牛CB1基因及其編碼蛋白質(zhì)的理化特性和結(jié)構(gòu)分析的報道。

      本試驗動物布萊凱特黑牛是通過體細(xì)胞克隆,胚胎移植等技術(shù)培育而成的優(yōu)良種質(zhì)[6]。本研究以布萊凱特黑牛為研究對象,克隆測序檢測CB1基因的CDS序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析;運用熒光定量檢測CB1基因mRNA相對表達(dá)量;以及運用免疫組化技術(shù)檢測CB1蛋白的表達(dá)位點,運用免疫印跡檢測CB1蛋白的相對表達(dá)量,探究CB1基因在牛脂代謝及脂肪沉積等方面的調(diào)控作用,為肉牛肉質(zhì)性狀的分子選育提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 試驗材料

      1.1.1 試驗動物與樣品采集

      試驗樣本選自青島農(nóng)業(yè)大學(xué)科研成果轉(zhuǎn)化基地、教學(xué)實習(xí)基地的山東布萊凱特黑牛科技股份有限公司。選取飼養(yǎng)環(huán)境相同的12月齡布萊凱特黑牛,采集脂肪、肺臟、背最長肌、心臟、肝臟、脾臟、腎臟7種組織置于液氮保存,采集脂肪組織置于4%多聚甲醛中保存。

      1.1.2 主要試劑及儀器

      氨芐,IPTG,X-Gal,大連寶生物工程有限公司;瓊脂糖凝膠回收試劑盒,天根生化科技(北京)有限公司;T載體連接試劑盒,上海生工生物股份有限公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒,青島擎科生物有限公司;iTaqUniwersal SYBR Green Supermix 5 mL(5×1 mL Vials),青島鑫宇恒一科技有限公司;PCR儀,德國Eppendorf;凝膠成像系統(tǒng),Alpha Innotech;熒光定量儀,Bio-Rad公司;Leica RM2235切片機(jī),德國萊卡公司。

      1.2 試驗方法

      1.2.1 布萊凱特黑牛CB1基因的克隆測序

      登錄NCBI網(wǎng)站查找牛CB1 mRNA序列(登錄號:NM_001242341.2),使用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計該基因CDS區(qū)域序列的引物(見表1)。引物是由北京擎科生物科技有限公司青島分公司合成。按照Trizol試劑使用說明書對布萊凱特黑牛脂肪組織進(jìn)行總RNA的提取,使用紫外分光光度計檢測其濃度和純度(OD值在 1.8~2.0),符合要求后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA。PCR 擴(kuò)增體系共 20 μL:Mix 10 μL,上、下游引物各 0.5 μL, cDNA 1 μL,H2O 8 μL。PCR反應(yīng)程序為:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃度變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸40 s,共30個循環(huán),72 ℃再延伸10 min,最后降至4 ℃,產(chǎn)物置于4 ℃保存。PCR 產(chǎn)物用1.5% 瓊脂糖凝膠進(jìn)行檢測后使用PCR清潔試劑盒回收目的條帶。采用TA克隆的方法,將回收產(chǎn)物與pMD19-T 載體 16 ℃孵育 30 min 進(jìn)行連接,隨后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞中,將細(xì)菌均勻涂布在預(yù)先準(zhǔn)備好的氨芐青霉素平板上,倒置放于 37 ℃培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng),挑取白色單菌落,在含有氨芐青霉素的液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),搖床 37 ℃ 200 r/min 振蕩培養(yǎng)過夜,送往上海生工生物有限公司測序。

      1.2.2 布萊凱特黑牛CB1基因生物信息學(xué)分析

      通過NCBI將布萊凱特黑牛CB1基因編碼區(qū)的核苷酸序列與牛(登錄號NM_001242341.2)、山羊(登錄號:XM_018053156.1)、綿羊(登錄號:XM_004011281.3)、豬(登錄號:NM_001009331.1)、雞(登錄號:NM_001038652.1)、獼猴(登錄號:NM_001032825.1)人(登錄號:U73304.1)、黑猩猩(登錄號:NM_001013017.1)、鼠(登錄號:D86916.1)、馬(登錄號:NM_001257151.1)CB1基因核苷酸序列進(jìn)行同源性比對以及使用Mega5.0軟件構(gòu)建CB1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹。使用在線生物學(xué)網(wǎng)站(https://services.healthtech.dtu.dk/)分析CB1基因編碼的蛋白質(zhì)的基本物理和化學(xué)性質(zhì)、潛在磷酸化位點、O-糖基化位點、N-糖基化位點和信號肽;Predict Protein預(yù)測CB1蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu);通過SWISS-MODEL分析預(yù)測CB1蛋白三級結(jié)構(gòu)。

      1.2.3 布萊凱特黑牛CB1基因熒光定量PCR檢測

      將提取的各組織總 RNA 反轉(zhuǎn)錄后的 cDNA 作為模板,實時熒光定量PCR(qPCR)檢測CB1基因在脂肪、肺臟、背最長肌、心臟、肝臟、脾臟、腎臟中的相對表達(dá)量。選取GAPDH基因(GenBank登錄號:NM_001034034.2)為內(nèi)參基因,根據(jù)上述序列設(shè)計熒光定量引物(表1),將96孔板置于冰上,按序滴加10 μL SYBR Green 預(yù)混液,7.8 μL RNA-free Water,0.6 μL 上游引物0,0.6 μL下游引物,1 μL cDNA模板。PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性10 min;94 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,40個循環(huán)。檢測數(shù)據(jù)采用2-ΔΔCT值法計算。

      表1 CB1基因引物信息

      1.2.4 CB1免疫組化檢測

      取出固定在4%多聚甲醛中的脂肪組織進(jìn)行修整,將其在PBS緩沖液中浸泡10 h,然后用不同濃度的乙醇脫水,二甲苯透明,在蠟中浸泡1 h,將其放在盒子中并切成小塊,厚度是5 μm。在58 ℃的烤箱中放置12 h,取出后再依次用二甲苯、不同濃度的乙醇、枸櫞酸鈉緩沖液浸泡,用PBS緩沖液沖洗后,添加山羊血清和稀釋的一抗,在4 ℃過夜,滴加二抗(辣根過氧化物酶),將其置于37 ℃的培養(yǎng)箱中30 min,顯色。密封后,在熒光顯微鏡下檢查拍片。

      1.2.5 CB1免疫印跡檢測

      將肌肉和脂肪組織樣品放入預(yù)冷的研缽中,用液氮徹底研磨,保持低溫,將粉末轉(zhuǎn)移到含有1.5 mL RIPA裂解液的離心管中,充分混合,然后在冰上放置30 min。每隔10 min 劇烈搖動30 s,加入5×SDS 5 μL,懸浮并搖動20 s,以3 500 r/min離心1 min。開水處理5 min,以12 000 r/min離心5 min,取上清液作為來自肌肉和脂肪組織的總蛋白。濃縮總蛋白并通過SDS-PAGE分離,然后轉(zhuǎn)移到PVDF膜上進(jìn)行Western blot分析。將抗體在第一抗體中稀釋CB1(1∶1 500),加入GAPDH(1∶1 000),第二抗體用TBST稀釋3 000倍。使用發(fā)光試劑盒在暗室中進(jìn)行曝光和顯影。然后掃描底片并使用Image J 分析目的條帶的光密度。

      1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

      運用SPSS 17. 0軟件對實時熒光定量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,各組織間運用One-way ANOVN 方法分析。采用Image J軟件對Western blot試驗進(jìn)行灰度分析。數(shù)據(jù)以 “平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤”表示。

      2 結(jié)果

      2.1 CB1基因CDS區(qū)序列克隆鑒定

      以反轉(zhuǎn)錄得到的脂肪組織cDNA 為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,得到1 495 bp 左右的擴(kuò)增片段, 與預(yù)期大小一致(圖1),可進(jìn)行下一步試驗。

      M. DL2000 Marker;1~6. CB1基因在59~65 ℃下所處泳道

      2.2 CB1基因序列的生物信息學(xué)分析

      2.2.1CB1基因序列分析

      用DNAStar生物軟件分析發(fā)現(xiàn)布萊凱特黑牛CB1基因與牛、山羊、綿羊、豬、雞、獼猴、人、黑猩猩、鼠、馬的同源性分別為99.9%、98.1%、98.1%、87.2%、80.5%、91%、91.1%、91.3%、13.6%、89.9%,分析得出,布萊凱特黑牛CB1基因具有很高的保守性,在生物進(jìn)化過程中很穩(wěn)定。利用Mega5.0軟件構(gòu)建CB1基因系統(tǒng)發(fā)育樹,由圖2可知布萊凱特黑牛與牛、山羊、綿羊的關(guān)系較近。

      圖2 CB1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹

      2.2.2CB1基因蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和潛在位點分析

      CB1基因CDS全長1 495 bp,CB1基因共編碼477個氨基酸,相對分子質(zhì)量為51 344.36,分子式為C2193H3438N682O657S46,總原子數(shù)7 016,理論等電點pI為10.81。不穩(wěn)定系數(shù)為74.70,為不穩(wěn)定蛋白,估計半衰期為1.9 h,脂肪系數(shù)為47.89,總平均親水性為-0.418。

      CB1基因氨基酸序列中共存在 100個潛在的磷酸化位點(圖3),69個絲氨酸磷酸化位點,30個蘇氨酸磷酸化位點,1 個酪氨酸磷酸化位點。分析表明共存在71個 O-糖基化潛在位點,1 個 N-糖基化潛在位點(圖 4) 位于第 35 氨基酸;SignalP 4.1 Server 預(yù)測該氨基酸序列不存在信號肽。

      2.2.3 CB1蛋白高級結(jié)構(gòu)預(yù)測

      CB1蛋白二級結(jié)構(gòu)(圖5)結(jié)果顯示,布萊凱特黑牛CB1肽鏈中α螺旋占總結(jié)構(gòu)的9.85%,延長鏈占16.14%。無規(guī)則卷曲占70.23%,β轉(zhuǎn)角占3.77%。對CB1基因進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)預(yù)測,結(jié)果如圖5。

      注:橫坐標(biāo)為氨基酸位點,縱坐標(biāo)為預(yù)測評分值

      注:橫坐標(biāo)為氨基酸位點,縱坐標(biāo)為預(yù)測評分值

      圖5 CB1蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測(a)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測(b)

      2.3 CB1基因在布萊凱特黑牛不同組織間的表達(dá)差異

      以布萊凱特黑牛脂肪cDNA為模板,CB1基因和GAPDH基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。結(jié)果顯示,擴(kuò)增產(chǎn)物CB1和GAPDH基因分別為147 bp、104 bp(圖6),產(chǎn)物與預(yù)期一致,條帶清晰無雜質(zhì)。如圖7所示,CB1基因在各個組織中均有表達(dá),在脂肪組織中表達(dá)量最高,極顯著高于其他組織(P<0.01),其次在肺臟、肝臟、腎臟、背最長肌中表達(dá),在心臟和脾臟中表達(dá)量最低。

      圖6 CB1和GAPDH基因PCR結(jié)果

      注:不同組織間的差異用字母表示,不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05);不同大寫字母表示差異極顯著(P<0.01);相同字母或無字母標(biāo)注表示差異不顯著(P>0.05)

      2.4 CB1蛋白表達(dá)分析

      免疫組化結(jié)果如圖8所示,細(xì)胞核呈藍(lán)色,目標(biāo)蛋白呈棕黃色,CB1蛋白在脂肪中呈區(qū)域性分布,主要在細(xì)胞膜中表達(dá)。

      2.5 CB1基因免疫印跡檢測

      運用Western blot試驗驗證目的蛋白的表達(dá),得到2條清晰可見的蛋白條帶(圖9),結(jié)果表明,CB1蛋白抗體具有良好特異性,進(jìn)一步對蛋白免疫印跡結(jié)果進(jìn)行灰度分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),脂肪組織蛋白表達(dá)量極顯著高于肌肉組織。

      圖8 脂肪組織CB1蛋白的表達(dá)特征

      圖9 CB1蛋白在不同組織的表達(dá)水平

      3 討論

      1991年Gerard等[7]克隆了人的CB1受體,人的CB1受體基因位于染色體6q14-q15區(qū)域,編碼472個氯基酸。目前,許多物種的CB1受體均已被確認(rèn),但研究主要集中在哺乳動物。序列比對發(fā)現(xiàn),CB1基因的mRNA序列在不同物種間存在一定的差異,但在生物進(jìn)化和分化過程中仍然非常保守,顯示出高度的同源性。通過成功克隆布萊凱特黑牛CB1基因分析發(fā)現(xiàn)CB1表現(xiàn)為偏堿性、是不穩(wěn)定蛋白,為水溶性蛋白,表現(xiàn)為親水性。同源性對比發(fā)現(xiàn),主要在80.5%~99.9%,說明該基因在生物進(jìn)化過程中比較保守,符合生物進(jìn)化特征,并具有廣泛的同源性。信號肽預(yù)測分析發(fā)現(xiàn),該氨基酸序列不存在信號肽,不屬于分泌蛋白,說明該結(jié)構(gòu)不具有把蛋白質(zhì)引導(dǎo)到不同膜結(jié)構(gòu)的亞細(xì)胞器功能。該結(jié)果與豬上CB1的預(yù)測結(jié)果一致[8]。磷酸化位點和糖基化位點預(yù)測發(fā)現(xiàn),共100個潛在磷酸化位點,而磷酸化主要發(fā)生于絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸等氨基酸殘基[9],N-糖基化潛在位點0個,蛋白質(zhì)的磷酸化修飾對布萊凱特黑牛CB1蛋白的生物學(xué)功能具有重要的調(diào)節(jié)能力,更進(jìn)一步說明CB1基因在調(diào)節(jié)細(xì)胞功能上發(fā)揮著主要作用。根據(jù)分析預(yù)測CB1蛋白二級結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)主要以無規(guī)則卷曲為主。鄭海軍等[10]推測,無規(guī)則卷曲易受側(cè)鏈相互影響而改變空間構(gòu)象,α螺旋和無規(guī)則卷曲是蛋白質(zhì)肽鏈中構(gòu)成配體-受體結(jié)合的活性部位,與三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測相一致。

      CB1是脂質(zhì)類信號系統(tǒng)內(nèi)源性大麻素信號系統(tǒng)的主要受體,它在動物體內(nèi)的脂肪代謝、胰島素抵抗及葡萄糖攝取等機(jī)制中發(fā)揮著重要的作用,在外周脂肪中CB1基因直接調(diào)控脂肪代謝,促進(jìn)機(jī)體脂肪的沉積[11-12],并且CB1基因可以調(diào)控PPARs基因等多個脂肪代謝相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)而調(diào)控脂肪代謝[13]。本試驗對CB1基因在布萊凱特黑牛不同組織的表達(dá)規(guī)律進(jìn)行,發(fā)現(xiàn)CB1在各個組織中均有表達(dá),但是不同組織間的表達(dá)差異較大,脂肪組織表達(dá)量最高,在肺臟中的表達(dá)量僅次于脂肪, 在肝臟、腎臟、背最長肌中中度表達(dá), 在心臟和脾臟組織中低度表達(dá)。魏星燦[14]研究發(fā)現(xiàn)CB1基因mRNA表達(dá)譜顯示該基因在豬的脂肪組織(腹腔大網(wǎng)膜、腎周脂肪和背膘)中的表達(dá)量與肝臟和肌肉中的表達(dá)量差異性均顯著,這與本試驗結(jié)果相一致。另有研究證明,激活小鼠CB1受體使肝臟脂肪合成轉(zhuǎn)錄因子固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白-1C等基因表達(dá)增高,引起小鼠攝食增加和肥胖[15]。諸多研究結(jié)果表明CB1基因與動物脂肪代謝密切相關(guān),可能在動物脂肪代謝過程中參與相關(guān)調(diào)節(jié)。但目前對布萊凱特黑牛CB1基因的相關(guān)研究較少,具體的功能和調(diào)控機(jī)制仍不清楚,有待進(jìn)一步深入研究。

      本研究結(jié)果表明,在布萊凱特黑牛脂肪組織中,CB1蛋白主要位于細(xì)胞膜上,說明CB1蛋白通過接受外來傳入的信號,參與細(xì)胞內(nèi)的調(diào)控代謝,從而維持細(xì)胞內(nèi)的脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)。與吳宏偉[16]研究結(jié)果一致。CB1是通過與細(xì)胞膜上的CB1受體結(jié)合傳輸信號,活化的CB1受體在腺苷酸環(huán)化酶和細(xì)胞外信號調(diào)節(jié)激酶中起著重要的作用[17]。本試驗發(fā)現(xiàn)CB1蛋白在脂肪組織和肌肉組織均有表達(dá),且在脂肪組織的表達(dá)量極顯著高于肌肉組織,本結(jié)果與上述熒光定量mRNA的表達(dá)水平相一致[13]。已有研究表明,豬CB1基因可通過調(diào)控CPT1基因進(jìn)而影響脂肪沉積[1],且本研究表明CB1蛋白在脂肪組織中表達(dá)量較高,推測CB1基因可能參與脂肪沉積的相關(guān)調(diào)控,具體調(diào)控機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

      4 結(jié)論

      綜上推測,布萊凱特黑牛CB1基因參與脂質(zhì)代謝的相關(guān)過程,對調(diào)控脂肪的沉積發(fā)揮重要作用,為肉牛肉質(zhì)性狀的分子選育提供參考,為布萊凱特黑牛品種選育提供分子理論基礎(chǔ),對加快布萊凱特黑牛育種工作具有一定意義。

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