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    國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心開發(fā)的基于人工智能的新冠病毒虛擬變異評(píng)估和預(yù)警系統(tǒng)正式上線發(fā)布

    2021-01-26 05:03:55
    石河子科技 2021年6期
    關(guān)鍵詞:多維度預(yù)警系統(tǒng)變異

    隨著全球新冠疫控的持續(xù),新型冠狀病毒基因組在流行過程中持續(xù)發(fā)生變異,對(duì)變異造成的功能影響日漸成為關(guān)注的焦點(diǎn)。目前,在全球多個(gè)國(guó)家和地區(qū)均發(fā)現(xiàn)了包括Alpha、Beta和Delta在內(nèi)的多種感染力增強(qiáng)的變異毒株,尤其是關(guān)鍵位點(diǎn)積累的氨基酸變異,極大地改變了病毒的免疫學(xué)特征,增加了病毒免疫逃逸的風(fēng)險(xiǎn),可能會(huì)降低現(xiàn)有疫苗、抗體、藥物等疫情控制方法的保護(hù)性,影響核酸診斷試劑的適用性,對(duì)疫情的防控構(gòu)成了嚴(yán)峻挑戰(zhàn),亟需一個(gè)基于大數(shù)據(jù)的病毒變異風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估及預(yù)警系統(tǒng),對(duì)現(xiàn)有及未來(lái)可能出現(xiàn)的各種變異造成的影響進(jìn)行系統(tǒng)性評(píng)估和解讀,從而實(shí)施更加精準(zhǔn)有效的疫情防控策略。

    近日,國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心聯(lián)合國(guó)內(nèi)有關(guān)單位發(fā)布了“新型冠狀病毒變異評(píng)估和預(yù)警系統(tǒng)”(SARS-CoV-2Variations Evaluation and Prewaning System,簡(jiǎn)稱VarEPS),成為全球首個(gè)對(duì)SARS-CoV-2基因組已知變異及虛擬變異進(jìn)行多維度風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和預(yù)警的系統(tǒng)。VarEPS系統(tǒng)從基因組學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)角度入手,在基于變異位點(diǎn)頻率評(píng)估的基礎(chǔ)上,從核苷酸變異發(fā)生難易程度、氨基酸替換難度、變異對(duì)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響、單個(gè)氨基酸突變引起的ACE2及中和抗體結(jié)合自由能變化等參數(shù)對(duì)變異進(jìn)行多維度的評(píng)估,全面對(duì)已知變異和潛在的虛擬變異對(duì)病毒的功能造成的影響進(jìn)行綜合分析。該系統(tǒng)不僅可以作為全球病毒變異監(jiān)測(cè)和追蹤的工具,同時(shí)還可以基于虛擬變異和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估模型,為針對(duì)新型變異毒株的精準(zhǔn)防控和抗體疫苗設(shè)計(jì)提供有效的參考信息?;谠撓到y(tǒng)的分析結(jié)果為精準(zhǔn)高效應(yīng)對(duì)SARS-CoV-2突發(fā)疫情提供了重要的決策依據(jù),也為應(yīng)對(duì)其他突發(fā)傳染性公共衛(wèi)生事件提供了技術(shù)儲(chǔ)備。

    (摘自科技部網(wǎng)站(http://www.most.gov.cn/gnwkjdt/202110/t20211021_177426.html)

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