我國科學(xué)家開發(fā)出轉(zhuǎn)錄組快速建庫新方法 有望助力新型冠狀病毒測序

新華社北京2月1日電(記者魏夢佳)北京大學(xué)與清華大學(xué)聯(lián)合課題組近期在國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《美國科學(xué)院院刊》發(fā)表論文，稱開發(fā)出了名為"SHERRY"的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫新方法。研究團(tuán)隊(duì)表示，這種方法大大簡化了建庫過程，不僅可用于高質(zhì)量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，對(duì)包括新型冠狀病毒等樣本的測序質(zhì)量和速度也有望顯著提升。

核糖核酸(RNA)是存在于生物細(xì)胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。目前，RNA測序技術(shù)已廣泛應(yīng)用于繪制物種轉(zhuǎn)錄組圖譜、研究疾病分子調(diào)控機(jī)制等方向。據(jù)了解，針對(duì)不同研究需求，不同起始量的RNA需采用不同的RNA擴(kuò)增方法，但目前常見的擴(kuò)增方法大多操作繁復(fù)、耗時(shí)長。對(duì)于微量樣本的檢測，也存在很多技術(shù)挑戰(zhàn)。

研究人員發(fā)現(xiàn)，被廣泛應(yīng)用于DNA測序建庫技術(shù)的Tn5轉(zhuǎn)座酶可以直接作用于RNA/DNA雜交鏈，從而省去傳統(tǒng)RNA建庫技術(shù)中的擴(kuò)增等必不可少但繁瑣的操作步驟，同時(shí)也避免了預(yù)擴(kuò)增過程中所帶來的偏向性。這種新的基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫方法，被命名為“SHERRY”。

據(jù)作為課題組成員的北京大學(xué)黃巖誼教授和清華大學(xué)王建斌研究員介紹，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，SHERRY建庫質(zhì)量較好，對(duì)堿基序列表現(xiàn)出了較高的均衡率，且操作流程簡單，整個(gè)流程僅需要5個(gè)步驟，可在一個(gè)試管中完成，時(shí)間僅約4小時(shí)，其中手工操作時(shí)間不到半小時(shí)，大大節(jié)省了實(shí)驗(yàn)成本。

課題組專家、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心主任謝曉亮教授表示，新方法應(yīng)用廣泛，首個(gè)臨床應(yīng)用是對(duì)新型冠狀病毒感染者的樣本進(jìn)行測序。與現(xiàn)有的RNA測序建庫方法相比，"SHERRY"更靈敏、更簡單，這對(duì)檢測和分析十分重要。

“我們的團(tuán)隊(duì)目前正在夜以繼日、爭分奪秒地攻關(guān)，希望提供更好的新型冠狀病毒的測序方法，服務(wù)疫情防控需要。”謝曉亮說。

來源：新華網(wǎng)