馮書珍, 謝廣燕, 劉南英, 徐 暢, 盧宇鳳, 馮學(xué)珍
(廣西科技大學(xué) 醫(yī)學(xué)部,廣西 柳州545006)
香山科學(xué)會(huì)議第396次學(xué)術(shù)討論會(huì)與《全國(guó)海洋經(jīng)濟(jì)發(fā)展“十三五”規(guī)劃》中明確指出,海洋微生物將是今后獲得創(chuàng)新藥物的重要資源[1-2]。 海藻作為海洋中最大的植物類群,其內(nèi)生細(xì)菌與真菌是海洋微生物的重要組成部分[3]。 近年研究表明,內(nèi)生菌的生理活性物質(zhì)因具有抗氧化[4-6]、抗菌[7]、抗凝血[8]、抗炎[9]、抑制癌細(xì)胞[10]等作用,漸成為篩選與研究的熱點(diǎn);其中,抗氧化對(duì)于預(yù)防許多由自由基引起的生物衰老及相關(guān)疾病如心血管疾病及癌癥等非常重要[11]。董玉潔等[4]從黃渤海銜接處的長(zhǎng)島海洋生物中分離內(nèi)生真菌,通過清除二苯代苦味?;杂苫―PPH:2,2-二苯基-1-苦 肼基自由基,2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl) 能力的抗氧化活性進(jìn)而篩選獲得阿爾茨海默?。ˋlzhei-mer’s disease,AD)活性菌株;Zheng 等[5]從Artemisia annua L.中分離篩選內(nèi)生細(xì)菌(Bacillus cereus SZ-1), 其清除DPPH自由基的能力超過50%;Huang 等[6]在29 種植物如夾竹桃等中分離內(nèi)生菌大多內(nèi)生菌都能產(chǎn)生抗氧化物質(zhì), 但不同種植物內(nèi)生菌具有種群多樣性,且同一種植物不同微生物種群間亦呈現(xiàn)多樣性。 目前,關(guān)于海藻內(nèi)生菌的研究大多集中于單一物種類型,不同海藻內(nèi)生菌間及內(nèi)生細(xì)菌與內(nèi)生真菌間抗氧化活性的差異研究還較少;這對(duì)于在海洋中正確遴選高生物活性的海藻內(nèi)生菌具有重要意義。
作者以廣西北部灣綠藻門石莼(Ulva lactuca L.)與褐藻門裙帶菜(Undaria pinnatifida Suringar)為研究對(duì)象,分離其內(nèi)生細(xì)菌與內(nèi)生真菌,并通過清除DPPH、羥基自由基、超氧陰離子的能力指征其體外抗氧化活性,探討不同海藻內(nèi)生菌間及內(nèi)生細(xì)菌與內(nèi)生真菌間抗氧化活性的差異,最終篩選抗氧化活性較高的菌株并加以鑒定,以期為海藻內(nèi)生菌的篩選及其抗氧化的天然生物活性成分研究提供指導(dǎo)。
1.1.1 海藻樣品的采集與鑒定于2018年1月采自廣西北部灣海域 (20°54′10″ -21°40′30″ N,109°05′20″-109°11′35″ E),經(jīng)大連海洋大學(xué)邢坤副教授依次鑒定為綠藻門石莼屬黑石礁石莼(Ulva lactuca L.)、 褐藻門裙帶菜屬裙帶菜 (Undaria pinnatifida Suringar)。
1.1.2 培養(yǎng)基馬鈴薯葡萄糖瓊脂(Potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基,LB(Luria-Bertani)瓊脂培養(yǎng)基分別用于海藻內(nèi)生真菌及細(xì)菌的分離;同時(shí),選取去瓊脂的液體培養(yǎng)基用于發(fā)酵與培養(yǎng)。
1.2.1 海藻內(nèi)生菌的分離將采集的海藻樣品用蒸餾水沖洗去掉表面的泥沙,用無菌濾紙吸干樣品表面的水分。 海藻樣品用質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%的Tween-20 浸泡5 min, 無菌水沖洗干凈。 體積分?jǐn)?shù)75%的酒精浸泡5 min,無菌水沖洗3次將表面的酒精沖洗干凈。 用體積分?jǐn)?shù)2%的次氯酸鈉消毒5 min,無菌水沖洗3次(保留最后1次沖洗海藻樣品的無菌水,作為對(duì)照)。 將海藻樣品進(jìn)行研磨,在研缽中加入一定量的無菌蒸餾水,靜置后吸取200 μL涂布于PDA 與LB 平板上, 倒置恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)[11-12]。
1.2.2 海藻內(nèi)生菌的保存與發(fā)酵從平板培養(yǎng)基中挑取單菌落置1.5 mL 裝有液體培養(yǎng)基的離心管,搖床培養(yǎng)8~10 h,將菌液與體積分?jǐn)?shù)50%已滅菌的甘油1∶1 等體積混合,于-20 ℃冰箱內(nèi)保存(有效期1年,如需長(zhǎng)期保藏進(jìn)而劃線培養(yǎng))。為獲得發(fā)酵液,可將保藏液再次轉(zhuǎn)接入新的液體培養(yǎng)基中,200 r/min搖床振蕩培養(yǎng)7~14 d。
1.2.3 海藻內(nèi)生菌樣品溶液的制備獲得的發(fā)酵液,雙層濾紙過濾后得到上清液,用等體積的乙酸乙酯萃取3次,濃縮置于真空干燥箱中干燥,4 ℃保存。 分別精密稱取干燥恒重的乙酸乙酯提取物5 mg,甲醇溶解并定容100 mL,即5.0 mg/mL 的母液,備用。
1.2.4 海藻內(nèi)生菌抗氧化活性的研究
1) 對(duì)DPPH 自由基清除能力的測(cè)定 參照馮學(xué)珍等[13]方法,略做修改。 精確稱取DPPH·粉末用體積分?jǐn)?shù)80%乙醇配制成8 mg/mL 的溶液,避光保存。 取海藻內(nèi)生菌樣品溶液125 μL 加入125 μL DPPH·溶液,渦旋混合均勻,反應(yīng)一定時(shí)間后在517 nm處的吸光度,作為樣品組 (A517nm);125 μL DPPH·溶液加上125 μL 體積分?jǐn)?shù)80%乙醇作為對(duì)照組(A01);以125 μL相同質(zhì)量濃度的樣品和125 μL 體積分?jǐn)?shù)80%乙醇混合作為空白組(Amax1);維生素C 作為陽(yáng)性對(duì)照。 計(jì)算如下式(1):
2)對(duì)羥基自由基(·OH-)清除能力的測(cè)定 參照張婧涵等[14]方法,稍做修改。 在1.5 mL 離心管中依次加入6 mmol/L 硫酸亞鐵溶液300 μL,6 mmol/L水楊酸—乙醇溶液300 μL 后, 把海藻內(nèi)生菌樣品溶液300 μL 分別加入試管中, 然后加入體積分?jǐn)?shù)0.1%的過氧化氫溶液300 μL,搖勻后37 ℃水浴30 min,7000 r/min 離心3 min,在510 nm 處測(cè)定吸光度值A(chǔ)510nm;以相應(yīng)溶劑代替樣本作為空白對(duì)照,吸光度為Amax2;相應(yīng)樣品溶液的吸光度A02;維生素C作為陽(yáng)性對(duì)照。 計(jì)算如下式(2):
3)對(duì)超氧陰離子自由基(·O2-)清除能力的測(cè)定參照陳玫等[15]及韓少華等[16]方法,稍做修改。 1.5 mL離心管中依次加入,900 μL pH = 8 的0.05 mol/L 磷酸鹽緩沖液放入25 ℃水浴中加熱20 min, 分別加入200 μL 海藻內(nèi)生菌樣品溶液和80 μL 25 mmol/L鄰苯三酚溶液, 混勻后于25 ℃水浴中反應(yīng)5 min,加入80 mmol/L HCl 200 μL 終止反應(yīng), 并搖勻,反應(yīng)3 min,7000 r/min 離心3 min,在波長(zhǎng)420 nm 處測(cè)吸光度A420nm; 以相應(yīng)溶劑代替樣品作為空白對(duì)照,測(cè)吸光度為Amax3;相應(yīng)樣品溶液的吸光度A03;維生素C 作為陽(yáng)性對(duì)照。 計(jì)算如下式(3):
1.2.5 分子生物學(xué)鑒定由于獲得的菌株較多,在經(jīng)抗氧化活性差異分析后,對(duì)清除DPPH、羥基自由基與超氧陰離子的綜合能力相對(duì)最強(qiáng)的菌株進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定(最終篩選為石莼內(nèi)生真菌)。 提取內(nèi)生菌DNA 后進(jìn)行18S rDNA PCR 擴(kuò)增, 引物為Fung(5′-GTAGTCAT ATGCTTGTCTC-3′)和NSI(5′-ATTCCCCGTTACC CGTTG-3′)。 PCR 反應(yīng)體系均為25 μL, 其組成為: 引物各1 μL、2×Taq PCR MasterMix(TIANGEN,China)10 μL、內(nèi)生菌DNA 模板1 μL、加ddH2O 至總體積25 μL。 PCR 循環(huán)參數(shù)如下:95 ℃15 min、95 ℃1 min、57 ℃1 min、72 ℃2 min、35個(gè)循環(huán);68 ℃延伸保育10 min 后冷卻至4 ℃。 PCR 產(chǎn)物于1.0 g/dL 的瓊脂糖電泳檢測(cè)后用于測(cè)序(諾禾致源),將測(cè)序結(jié)果基于NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)(NCBI:https://www. ncbi.nlm.nih.gov/) 與已知序列進(jìn)行Blast 比對(duì)分析并繪制進(jìn)化樹。
采 用Excel 2010、Origin 8.0、SPSS (SPSS 20.0 Windows,SPSS Inc,Chicago,USA)、R 語(yǔ) 言 (The R Project for Statistical Computing)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析與作圖,根據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果計(jì)算海藻多糖體外抗氧化活性的半數(shù)清除或抑制濃度(IC50),并計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)誤差,結(jié)果以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(X±SD )”表示;分別對(duì)海藻內(nèi)生細(xì)菌與真菌的體外抗氧化活性進(jìn)行單因素方差分析 (One-way ANOVA, 置信水平95%、99%),處理間的多重比較用S-N-K 法;基于內(nèi)生菌的抗氧化活性進(jìn)行非度量多維尺度分析 (Nonmetric Multidimensional scaling,NMDS), 并 利 用ANOSIM 統(tǒng)計(jì)組間差異顯著性。
經(jīng)海藻內(nèi)生菌的平板培養(yǎng),共篩選獲得石莼內(nèi)生細(xì)菌單菌落153個(gè),內(nèi)生真菌單菌落75個(gè);裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌單菌落219個(gè),內(nèi)生真菌單菌落15個(gè)。
將獲得的內(nèi)生菌進(jìn)行抗氧化活性的測(cè)定,綜合DPPH、羥基自由基、超氧陰離子的清除能力都較強(qiáng)的前12 株菌株進(jìn)行下一步篩選。 由圖1 可知,石莼及裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌與真菌均有一定的抗氧化活性,但不同藻類的細(xì)菌與真菌間存在一定差異。 其中,對(duì)3 種自由基的清除作用均表現(xiàn)較好的菌株,分別為石莼的內(nèi)生細(xì)菌SX-2、SX-5、SX-12, 內(nèi)生真菌SZ-5、SZ-7、SZ-8;裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌QX-1、QX-6、QX-8,內(nèi)生真菌QZ-4、QZ-6、QZ-9。
圖1 海藻內(nèi)生細(xì)菌與真菌抗氧化活性的初步測(cè)定Fig. 1 Preliminary determination of antioxidant activities of endophytic bacteria and fungi
2.3.1 對(duì)DPPH 自由基的清除作用不同藻類不同內(nèi)生菌的不同質(zhì)量濃度對(duì)清除DPPH 自由基的活性分析,結(jié)果見圖2,可知:石莼與裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌、真菌對(duì)DPPH 的清除活性均隨質(zhì)量濃度增加而升高;除裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌QX-8 外,當(dāng)質(zhì)量濃度為5.0 mg/mL 時(shí),其清除率均可達(dá)到80%以上。 其中,石莼與裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌對(duì)DPPH 的清除IC50均顯著高于內(nèi)生真菌(P<0.05),說明內(nèi)生細(xì)菌的抗氧化活性顯著低于內(nèi)生真菌;且裙帶菜內(nèi)生真菌QZ-4、QZ-6 的IC50分 別 為 (0.37±0.03) mg/mL、(0.39±0.07) mg/mL,顯著高于其他10 株菌株(P<0.05)(表1)。 除裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌QX-8 外, 當(dāng)質(zhì)量濃度為5.0 mg/mL 時(shí),其清除率均可達(dá)到80%以上。
圖2 海藻內(nèi)生菌對(duì)DPPH 的清除能力Fig. 2 Scavenging capacity of algal endophytes on DPPH
表1 海藻內(nèi)生菌對(duì)自由基清除的半抑制濃度(IC50)Table 1 IC50 for free radical-scavenging capacity
2.3.2 對(duì)羥基自由基的清除作用由圖3 可知,12株內(nèi)生菌對(duì)·OH-自由基的清除作用均隨質(zhì)量濃度的升高而增強(qiáng)。 石莼內(nèi)生真菌與裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌在5.0 mg/mL 時(shí)對(duì)·OH-自由基的清除作用可達(dá)到92%以上,經(jīng)計(jì)算IC50為((1.02±0.29)~(1.30±0.36))mg/mL(表1); 其次是石莼內(nèi)生細(xì)菌SX-2、SX-5、SX-12,5.0 mg/mL 時(shí)對(duì)·OH-自由基的清除率分別可達(dá)82%、88%、75%; 裙帶菜的內(nèi)生真菌QZ-4、QZ-6、QZ-9 對(duì)·OH-自由基的清除能力相對(duì)較弱, 在最大質(zhì)量濃度5.0 mg/mL 時(shí)清除率僅為38%~45%,經(jīng)計(jì)算IC50分別為 (6.86±1.52)、(0.20±2.31)、(5.59±1.08) mg/mL。
圖3 海藻內(nèi)生菌對(duì)羥基自由基的清除能力Fig. 3 Scavenging capacity of algal endophytes on hydroxyl radical
圖4 海藻內(nèi)生菌對(duì)超氧陰離子的清除能力Fig. 4 Scavenging capacity of algal endophytes on superoxide anion
以表1 計(jì)算所得的IC50值進(jìn)行下一步的組間分析,非度量多維尺度分析NMDS 與ANOSIM 統(tǒng)計(jì)結(jié)果可知(圖5):不同藻類,石莼與裙帶菜內(nèi)生菌的抗氧化活性之間能較好地分開, 且差異顯著(globe test:P<0.05); 同種藻類不同內(nèi)生菌之間可表現(xiàn)為:石莼內(nèi)生真菌與內(nèi)生細(xì)菌的抗氧化活性之間差異顯著(globe test:P<0.05);裙帶菜內(nèi)生真菌與內(nèi)生細(xì)菌間亦能較好地分開,差異顯著(globe test:P<0.01)。
2.3.3 對(duì)超氧陰離子的清除作用石莼與裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌與真菌對(duì)自由基的清除作用表現(xiàn)為質(zhì)量濃度越高,作用越強(qiáng)(圖4)。 其中,石莼真菌SZ-5、SZ-7、SZ-8 在最高質(zhì)量濃度5.0 mg/mL 時(shí)對(duì)自由基的清除率都幾近100%,IC50分別為(1.14±0.35)、(1.14±0.24)、(1.46±0.41) mg/mL,其清除率顯著其他菌株(表1;P<0.05);其次,裙帶菜真菌QZ-4、QZ-6、QZ-9 在質(zhì)量濃度為5.0 mg/mL 時(shí)清除率可分別達(dá)88%、89%、88%,IC50分別為 (2.24±0.63)、(1.69±0.35)、(1.66±0.42) mg/mL;在質(zhì)量濃度為5.0 mg/mL 時(shí), 石莼與裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌的清除率均低于60%。 整體來說,石莼與裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌其IC50值均顯著高于內(nèi)生真菌(P<0.05),說明石莼與裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌對(duì)超氧陰離子的清除作用顯著低于內(nèi)生真菌。
圖5 海藻內(nèi)生菌間抗氧化活性的NMDS 分析Fig. 5 Non-metric multidimensional scaling of the algal entophytes
石莼內(nèi)生真菌SZ-5 菌株在最高質(zhì)量濃度時(shí)的清除DPPH、 羥基自由基與超氧陰離子的綜合能力相對(duì)最強(qiáng),因此對(duì)其進(jìn)行下一步的分子鑒定。以SZ-5 菌株DNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增, 其產(chǎn)物純化后進(jìn)行Sanger 測(cè)序, 并基于NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)與已知序列進(jìn)行Blast 比對(duì)分析。結(jié)果顯示(圖6),菌株SZ-5 的18S rDNA 序 列 與 NCBI 中 出 芽 短 梗 霉(Aureobasidium pullulans )JX303663.1 的18S 序列,相似度較高;初步確定該分離的菌株為短梗霉菌屬真菌。
圖6 SZ-5 菌株同源性比較的進(jìn)化樹Fig. 6 Homology comparison of 18S rDNA gene from SZ-5 strains
抗氧化活性主要是對(duì)生物在外界條件脅迫下產(chǎn)生的活性氧的消除作用[17]。 現(xiàn)有關(guān)海藻內(nèi)生菌的研究多集中在其抗菌方面:孫好芬等[18]對(duì)青島海域松節(jié)藻、多管藻、裙帶菜中分離純化出18 株內(nèi)生真菌,均具有較好的抑菌活性;孫杰等[19]對(duì)煙臺(tái)淺海處鼠尾藻、裙帶菜、海帶中分離內(nèi)生真菌并檢測(cè)其抑菌活性,結(jié)果表明均有>50%的抑菌活性;但是相對(duì)于抗氧化活性的研究還較少。 廣西北部灣海域綠藻門石莼、 褐藻門裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌與真菌, 均對(duì)DPPH 自由基、羥基自由基、超氧陰離子具有一定的清除能力,大部分具有良好的抗氧化活性,清除活性均隨濃度增加而升高,說明海藻內(nèi)生菌是抗氧化活性產(chǎn)物尋找的良好資源。
石莼與裙帶菜的內(nèi)生菌抗氧化活性之間存在顯著差異,說明不同藻類內(nèi)生菌存在抗氧化活性的種群多樣性。 孫劍秋等[20]對(duì)北京植物園4 科6 種藥用植物的研究結(jié)果,也同樣發(fā)現(xiàn)不同植物中內(nèi)生真菌種類存在顯著差異。 這可能是由于,植物內(nèi)生菌具有豐富的生物多樣性,宿主植物不同,則分離得到的內(nèi)生菌種類、數(shù)目均有差異[18];其抗氧化活性也可能存在差異。 目前,宿主與內(nèi)生菌的選擇性和多樣性機(jī)制尚未闡明,但已有研究表明,內(nèi)生菌大多能產(chǎn)生與宿主相似或相同的生物活性[21-22]。 課題組前期研究表明[13],廣西北部灣石莼等多糖均具有較好的抗氧化活性(DPPH),作者試圖將內(nèi)生菌與宿主間建立耦合關(guān)系,結(jié)果并不理想,仍需深入研究。
同種藻類內(nèi)生菌間, 除裙帶菜內(nèi)生真菌外,整體表現(xiàn)為,石莼與裙帶菜的內(nèi)生細(xì)菌對(duì)DPPH、羥基自由基與超氧陰離子的半抑制濃度IC50值均顯著高于內(nèi)生真菌,說明石莼與裙帶菜內(nèi)生細(xì)菌對(duì)超氧陰離子的清除作用顯著低于內(nèi)生真菌。 石莼與裙帶菜的內(nèi)生真菌整體來說其抗氧化活性顯著高于內(nèi)生細(xì)菌,指示在海藻內(nèi)生菌的抗氧化活性物質(zhì)篩選中可以將內(nèi)生真菌作為優(yōu)先研究的對(duì)象。 其中,石莼內(nèi)生真菌SZ-5 菌株在最高質(zhì)量濃度時(shí)的清除DPPH、 羥基自由基與超氧陰離子的綜合能力相對(duì)最強(qiáng),按真菌形態(tài)分類鑒定方法進(jìn)行鑒定為短梗霉菌屬真菌Aureobasidium spp.,可以作為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究的對(duì)象,從而為抗氧化藥物的研究與開發(fā)奠定基礎(chǔ)。