蔣 敏, 李 恒, 李 會, 史勁松
(江南大學藥學院,江蘇無錫214000)
微生物實驗是我院制藥工程專業(yè)本科教學的核心基礎課程之一,在本專業(yè)技能培養(yǎng)中具有極其重要的意義[1]。目前,開設的常規(guī)基礎實驗可以有效地保證學生掌握微生物學基本實驗技能,但要培養(yǎng)出雙“一流”高校人才,還需注重培養(yǎng)學習興趣和創(chuàng)新思維,重點提升分析解決問題的綜合能力,因此有必要緊密結合前沿性科研成果,圍繞微生物基本實驗核心點,輻射發(fā)散至藥理學、藥物分析等多個實驗方向,對實驗教學內容進行擴充,形成輻射狀的綜合性教學模式,提升本科教學實驗的縱橫向飽滿度。
隨著分子生物學、腸道微生學等學科的迅速發(fā)展,腸道微生態(tài)與機體健康的研究也已經(jīng)普及到食品[2]、化工[3]、醫(yī)藥[4]等多個領域,其作用也日益受到人們的關注與重視[5],可以認為研究微生物/微生物群與其宿主的關系已成為現(xiàn)代應用微生物學的重要發(fā)展方向之一。因此開設圍繞“健康”為主旨的微生物學綜合實驗在制藥工程專業(yè)教學工作中具有一定的意義。
本綜合性實驗依托于學院腸道微生態(tài)的研究成果[6-12],以一株前期分離得到的安全有效的益生菌[13-14]—羅伊氏乳桿菌為研究對象,由學生進行菌株觀察與鑒定,應用腸道厭氧發(fā)酵模擬器-氣相色譜對該菌株腸道“益生”作用進行定量評價,在小鼠腸道菌群失調模型上進行宏觀考察。通過開設此綜合性實驗,不僅可以促進學生鞏固經(jīng)典微生物基本操作,掌握分子生物學、藥物分析、藥理學實驗技能,還可提高學生創(chuàng)新思維和科研熱情。
MRS培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,牛肉膏10 g,酵母提取物5 g,葡萄糖20 g,檸檬酸二銨2 g,乙酸鈉5 g,K2HPO42 g,MnSO4·4H2O 0.25 g(MnSO4·H2O 0.19 g),MgSO4·7H2O 0.58 g,吐溫80 1 mL,蒸餾水1 L,121℃滅菌20 min。
發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):KMOS 8.0、胰蛋白胨3.0、蛋白胨3.0、酵母提取物4.5、膽鹽3 號0.4、L-半胱氨酸鹽酸鹽0.8、氯化鐵血紅素0.05、NaCl 4.5、KCl 2.5、MgCl2·6H2O 0.45、CaCl2·6H2O 0.2、KH2PO40.4、Tween80 1.0、微量元素(MgSO4·7H2O 3.0、MnCl2·4H2O 0.32、FeSO4·7H2O 0.1、CoSO4·7H2O 0.18、CaCl2·2H2O 0.1、ZnSO4·7H2O 0.18、CuSO4·5H2O 0.01、NiCl2·6H2O 0.092)2.0,pH 6.5,121 ℃濕熱滅菌20 min。
10名健康志愿者糞便;羅伊氏乳桿菌為本實驗室保存菌株;本實驗中使用的細菌基因組提取試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒等均購上海生工;PCR過程中所用引物購于上海生工,PCR過程中所用酶及試劑均購自索萊寶生物;乙酸、丙酸、丁酸、戊酸(GC,純度≥99.5%)購自阿拉丁試劑有限公司;其他試劑:分析純,上海國藥集團。
顯微鏡;酶標儀;PCR擴增儀;低速離心機;厭氧工作站(37℃,80% 二氧化碳,10% 氫氣,10% 氮氣);酸度計;渦旋儀;高壓蒸汽滅菌鍋;金屬??;氣相色譜儀;切片機;pH自動控制加液機。
BALB/c小鼠,雌雄各半,體重18~22 g,由上海斯萊克實驗動物責任有限公司提供,飼養(yǎng)溫度(23±2)℃,相對濕度(50±5)%,自由進食和飲水,適應性飼養(yǎng)1周。
菌株活化后接入MRS培養(yǎng)基,37℃靜置培養(yǎng)24 h,取少量菌液并適當稀釋,涂布MRS平板,37℃厭氧培養(yǎng)48 h,于顯微鏡下觀察細胞形態(tài)、生理生化鑒定。
用DNA提取試劑盒提取基因組DNA,采用細菌通用引物進行16 S rDNA的PCR擴增。PCR反應體系為25 μL:10 × PCR Buffer 2.5 μL,dNTPs 2.0 μL,上下游引物各0.5 μL,模板DNA 1.0 μL,ExTaq 酶0.25 μL,ddH2O 18.25 μL。PCR 反應條件:95 ℃ 預變性,2 min;循環(huán)過程為95℃變45 s,退火溫度56℃,45 s,72℃延伸90 s,共進行30個循環(huán);72℃終延伸10 min,4℃保持,共30個循環(huán)。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳后回收純化,送上海生工有限公司測序,測序結果在GenBank中進行BLAST比對,確定種屬類別。
2.3.1 腸道發(fā)酵器的搭建與穩(wěn)定性評價
文獻[15]方法:結合實際研究搭建模擬腸道發(fā)酵器(見圖1),按照配方配置發(fā)酵培養(yǎng)基,高溫滅菌后向系統(tǒng)中通入高純氮氣,控制系統(tǒng)的溫度、攪拌速度、pH等,使其保持穩(wěn)定。取新鮮的健康捐獻者的糞便樣品5 g,滅菌PBS制成20%(w/v)菌懸液,震蕩混勻,離心(8 000 r/min,1 min)取上清,將上清液通過補料口接種到已經(jīng)預運行48 h的發(fā)酵罐中,調節(jié)蠕動泵以輸送新鮮培養(yǎng)基和廢液,使發(fā)酵罐的液位恒定。PCRDGGE檢測證明連續(xù)發(fā)酵的前期(0~8 d),系統(tǒng)中菌群波動較大,處于不穩(wěn)定狀態(tài),當發(fā)酵進入第9、10 d后,DGGE圖譜上條帶相似度高,種類及豐富度基本沒有變化,說明此時發(fā)酵器內的菌群處于穩(wěn)定狀態(tài),UPGMA相似性聚類分析結果基本與DGGE結果一致。因此,本實驗選擇經(jīng)發(fā)酵器連續(xù)厭氧發(fā)酵10 d后的穩(wěn)定的腸道微生物群落為研究對象,研究羅伊氏乳桿菌的腸道調節(jié)作用。
2.3.2 實驗組設計
以穩(wěn)定恒化器中的腸道微生物菌群作為發(fā)酵系統(tǒng),設置兩組實驗:對照組與羅伊氏乳桿菌組(接種量為1%),厭氧條件下連續(xù)培養(yǎng)36 h,取樣檢測。
2.3.3 SCFA 檢測
圖1 模擬腸道發(fā)酵器
文獻[16-17]方法:取1 mL培養(yǎng)液,4℃,12 000 r/min下離心10 min除菌體。取500 μL上清,離心去除沉淀,加入1 mL乙醚萃取15 min,低溫離心分離,取上清進樣。精密稱取乙酸、丙酸、丁酸、戊酸適量,加乙醚制成儲備液,加入內標物(50 μg/mL),待進樣。以標準物和內標物濃度比為橫坐標,對應峰面積為縱坐標,繪制標準曲線,用于計算待測物濃度。采用氣相色譜法檢測短鏈脂肪酸(Short Chain Fatty Acid,SCFA)含量,色譜柱:DB-WAX 30M(I.D.0.32 mm,5 μm);升溫程序:50℃保持3 min,以6℃/min升至120℃,保持0.5 min,以6℃/min升至220℃,保持5 min;載氣(N2)流速3 mL/min,載氣(H2)流速47 mL/min;空氣流量400 mL/min;進樣量1.0 μL;分流比1∶3。數(shù)據(jù)采用Origin 8軟件作圖,結果以平均值±標準差(mean±SD)表示。
2.4.1 實驗動物模型
1周的適應期后,小鼠隨機分成3組,每組8只,取兩組小鼠,連續(xù)7 d灌胃頭孢曲松鈉生理鹽水溶液(1.25 mg/g bw)造模。將模型小鼠平均分為模型組和羅伊氏乳桿菌組兩組,其中羅伊氏乳桿菌組連續(xù)15 d灌胃羅伊氏乳桿菌菌液(濃度為0.5×1010CFU/g bw)。模型組和對照組連續(xù)15 d灌胃等體積生理鹽水。
2.4.2 實驗動物及樣品處理方法
實驗定期進行稱重并監(jiān)測小鼠的攝食量,飲水量,記錄數(shù)據(jù),灌胃結束后將小鼠頸椎脫位處死,腹部75%乙醇消毒,解剖,取盲腸內容物測定SCFA,盲腸內容物取出后,PBS沖洗,4%多聚甲醛固定,75%乙醇脫水、石蠟包埋、切片、染色,顯微鏡下觀察。
顯微鏡下菌落為乳白色,不透明,濕潤,中心不凸起,屬于細菌。參照《伯杰氏細菌鑒定手冊》對菌株分別進行生理生化鑒定,結果如表1所示。進一步分析生理生化鑒定結果可知,該菌株均能利用糖類物質生長,同時產(chǎn)酸,且大部分菌株對膽鹽的耐受能力較強。以菌株的基因組為模板,PCR擴增長度為1.5 kb,該片段提交至GenBank中,與已報道的序列進行BLAST比對,比對結果最終確定本實驗的試驗菌為羅伊氏乳桿菌。
表1 菌株生理生化特征
SCFA是含1~6個碳原子的有機羧酸,是目前最常用的腸道微生態(tài)研究指標之一,其主要包含乙酸、丙酸、丁酸和戊酸[18]。現(xiàn)代藥理學與臨床研究表明,SCFA參與腸上皮細胞的能量供應,不僅可影響腸腔pH和電解質平衡、腸黏膜屏障的通透性、腸道高敏感和腸動力的調節(jié),還與抗炎、抗腫瘤等密切相關。已有研究表明,不同種類SCFA的生理功能各有特點,如丁酸為腸道上皮細胞的主要能量來源,可通過激活氯離子/丁酸通道、促進鈉離子/氫離子交換等途徑促進腸道水與離子的吸收,改善腹瀉情況[19-20],此外,丁酸還可通過抑制組蛋白去乙?;?,抑制端粒酶活動,發(fā)揮抗腫瘤效應[21];丙酸有助于保護腸黏膜屏障,通過STAT3信號通路減少炎癥與氧化損傷[22]等。
不同組SCFA檢測結果如表2所示。數(shù)據(jù)可見,外源添加羅伊氏乳桿菌對腸道SCFA產(chǎn)生的種類沒有影響,但對含量有顯著影響。相較于對照組,添加了羅伊氏乳桿菌后,丙酸、丁酸、戊酸含量分別顯著增加了25.9、3及9倍,而乙酸未發(fā)生顯著變化。體外實驗結果表明,羅伊氏乳桿菌可影響腸道SCFA結構,從而發(fā)揮益生作用。
3.3.1 體重檢測結果
實驗期間無小鼠死亡,各組小鼠飲水量與采食量無顯著差異。對照組小鼠體重在實驗期間無顯著變化,而模型組和羅伊氏乳桿菌組小鼠在造模后體重均有所下降,經(jīng)過15 d灌胃處理后兩組體重均有所回升,但與對照組無顯著差異。
表2 不同組SCFA的產(chǎn)生量
3.3.2 SCFA 檢測結果
不同組小鼠腸道內SCFA含量檢測結果如表3所示。數(shù)據(jù)可見,模型組小鼠腸道內SCFA含量顯著降低,其中總酸含量從(68.15 ± 6.5)mmol/L 下降至(16.27 ±0.79)mmol/L,其中乙酸含量從(32.56 ±2.32)mmol/L 顯著下降至(12.02 ±0.42)mmol/L,丁酸含量從(27.15 ±4.98)mmol/L 顯著下降至(4.25 ±1.22)mmol/L,而丙酸與戊酸幾乎檢測不出。而與模型組相比,羅伊氏乳桿菌組小鼠腸道內總酸含量[(98.55 ±3.23)mmol/L]顯著高于模型組[(16.27 ±0.79)mmol/L],其中乙酸、丁酸、戊酸分別為(35.93±0.99),(26.07 ±4.08),(0.49 ± 0.10)mmol/L,與對照組無顯著差異;與體外結果相一致的是丙酸含量增加最明顯,為(36.05 ±4.41)mmol/L,顯著高于對照組。分析可見,抗生素干擾小鼠腸道菌群平衡,造成了SCFA顯著下降,而羅伊氏乳桿菌能夠顯著改善腸道環(huán)境,提高SCA的產(chǎn)量,但體內與體外的SCFA趨勢結果不完全一致,這可能是由于體外只能實現(xiàn)小部分腸道微生物的培養(yǎng),導致了體內外微生物菌群的差異。
表3 盲腸內容物SCFA含量 mmol/L
3.3.3 腸道組織形態(tài)觀察
圖2所示為隨機抽取的盲腸組織切片光鏡圖,由圖可見,對照組小鼠腸道上皮細胞完整,絨毛排列整齊,模型組腸上皮細胞破壞嚴重,腸絨毛缺損明顯,排列紊亂,而經(jīng)過羅伊氏乳桿菌干擾的小鼠腸上皮結構與對照組相近,腸絨毛排列整齊且致密。
圖2 小鼠盲腸縱切面200×
表4所示為各組腸絨毛高度,數(shù)據(jù)顯示模型組小鼠腸絨毛高度[(76.4 ±7.5)μm]相較于對照組[(149.7 ±4.5)μm]顯著降低(P <0.05),經(jīng)過羅伊氏乳桿菌干預的小鼠腸絨毛高度[(165.9±5.1)μm]較模型組甚至空白對照組都有顯著增長(P<0.05)。結果表明,羅伊氏乳桿菌能夠在抗生素失調模型小鼠中發(fā)揮腸道保護作用。這可能是由于羅伊氏乳桿菌能夠通過調節(jié)腸道SCFA的數(shù)量與結構,改善抗生素引起的腸黏膜損傷,促進腸絨毛的增長等[23]。
表4 各組小鼠盲腸絨毛高度
(1)菌株的培養(yǎng)鑒定實驗可進一步鞏固學生微生物的基本操作技能,在此基礎上增加了常規(guī)的分子操作,拓寬了傳統(tǒng)微生物實驗課的視野,為學生進一步從事相關科研工作奠定了基礎。
(2)以SCFA為定量指標,搭建了體外腸道模擬發(fā)酵器,提高微生物實驗課堂的趣味性,該實驗單元著重培養(yǎng)了學生對氣相色譜、PCR等科研型儀器的操作能力。
(3)藥理學技術等已在多學科領域得到全面普及,動物實驗單元要求學生熟練掌握解剖、取樣等技能以獲取樣本,進行關鍵性指標檢測及常規(guī)病理切片,對培養(yǎng)學生綜合實驗技能和提高科研素養(yǎng)具有重要的意義。
(4)通過本實驗項目的實施,有助于學生掌握精準化腸道微生態(tài)營養(yǎng)產(chǎn)品的開發(fā)與研究的一般方法與科研思路,為未來從事藥學、食品、微生物學等領域相關工作奠定基礎。