胃內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和潛在致病菌

劉金哲 薛 艷 周麗雅#

清華大學(xué)附屬北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院消化內(nèi)科1(102218) 北京大學(xué)第三醫(yī)院消化科2

30余年來的研究和實(shí)踐證實(shí)，幽門螺桿菌(Helicobacterpylori,Hp)是導(dǎo)致慢性胃炎、消化性潰瘍、胃癌等疾病發(fā)生、發(fā)展的重要因素，早期根除Hp可降低胃癌發(fā)病率。然而微生物組學(xué)研究進(jìn)展表明，胃內(nèi)除Hp外，尚存在數(shù)百種微生物，其中一部分能定植于胃黏膜，可能具有潛在致病性。歐洲Maastricht Ⅴ共識(shí)明確指出胃內(nèi)有其固有菌群，且可能在Hp相關(guān)疾病的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用[1]。由胃內(nèi)環(huán)境、Hp和其他胃內(nèi)菌群共同構(gòu)成的胃內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)保持穩(wěn)定能促進(jìn)人體健康，反之則會(huì)導(dǎo)致疾病發(fā)生、發(fā)展。本文就胃內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、功能以及潛在致病菌的研究進(jìn)展作一綜述。

一、胃內(nèi)固有菌群

細(xì)菌培養(yǎng)是傳統(tǒng)的微生物研究方法，也是早年消化系統(tǒng)疾病研究最常用的手段，但當(dāng)時(shí)的研究者認(rèn)為胃內(nèi)菌群系口腔、咽喉部和呼吸道來源的過路菌，對(duì)胃腸道疾病的診治意義不大。近十余年來，隨著觀念的轉(zhuǎn)變，胃內(nèi)菌群的培養(yǎng)重新得到重視，基因測(cè)序技術(shù)則較傳統(tǒng)培養(yǎng)方法能獲得更多的胃內(nèi)菌群信息。Bik等[2]最早對(duì)胃黏膜標(biāo)本行二代測(cè)序，共發(fā)現(xiàn)128種細(xì)菌，其中50%以上不能分離培養(yǎng)，67%是來自口腔的細(xì)菌。Delgado等[3]通過比較口腔、咽喉與胃黏膜菌群數(shù)據(jù)庫(kù)，發(fā)現(xiàn)胃黏膜有著獨(dú)特的微生態(tài)結(jié)構(gòu)，證實(shí)胃內(nèi)有其固有菌群，而不是單純來源于口腔和咽喉的過路菌。朱鳴等[4]采用細(xì)菌培養(yǎng)結(jié)合16S rDNA測(cè)序分析老年人群的胃內(nèi)菌群，發(fā)現(xiàn)常見細(xì)菌包括鏈球菌、大腸埃希菌、奈瑟菌、羅氏菌等。中國(guó)疾病預(yù)防控制中心應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)鑒定Hp陽(yáng)性上消化道疾病患者的胃內(nèi)其他細(xì)菌種類，發(fā)現(xiàn)最常見的是淺黃奈瑟菌、唾液鏈球菌和黏滑羅氏菌[5]。

吞咽下的細(xì)菌碎片、被胃液和免疫系統(tǒng)殺死的細(xì)菌不能在胃內(nèi)定植，不屬于胃內(nèi)固有菌群范疇。為區(qū)分這些“過路菌”，前沿研究多采用能反映有代謝活性的菌群特征的反轉(zhuǎn)錄測(cè)序技術(shù)。由于死亡細(xì)菌的RNA被降解，故提取胃黏膜組織樣本的RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA再行測(cè)序可得到存活菌群的信息。Schulz等[6]應(yīng)用16S rRNA測(cè)序技術(shù)處理上消化道來源標(biāo)本，分析發(fā)現(xiàn)口腔、胃和十二指腸菌群因部位不同而存在顯著差異，唾液、胃液和十二指腸液與胃黏膜、十二指腸黏膜菌群亦有較大差異；與唾液相比，胃液中韋榮球菌減少而梭菌屬豐富，丙酸桿菌等多種細(xì)菌豐度降低，提示胃液對(duì)菌群有明顯選擇性；Hp在胃黏膜菌群中居主導(dǎo)地位。

胃內(nèi)菌群受多種因素影響，與腸道菌群相比，具有密度小、特異性低、穩(wěn)定性差、波動(dòng)性高等特征。關(guān)于胃內(nèi)固有菌群，目前研究比較明確的有以下三點(diǎn)：第一，胃內(nèi)最常見的5個(gè)菌門為變形菌門、擬桿菌門、厚壁菌門、放線菌門和梭菌門。5個(gè)菌門中分布最廣泛的分別是變形菌門中的螺桿菌、嗜血桿菌、放線桿菌和奈瑟菌；擬桿菌門的普氏菌屬；放線菌門的羅氏菌、放線菌和微球菌；厚壁菌門的鏈球菌和桿狀菌[7]。第二，Hp主導(dǎo)胃黏膜相關(guān)菌群，Hp過度增殖可能干擾胃內(nèi)微生態(tài)環(huán)境，引起微生態(tài)紊亂和炎癥反應(yīng)，導(dǎo)致胃內(nèi)菌群失調(diào)和疾病發(fā)生。第三，胃黏膜菌群不同于胃液菌群，其內(nèi)除Hp外還可能包含其他潛在致病菌。探討胃內(nèi)固有菌群有助于提高對(duì)慢性胃病的認(rèn)識(shí)。

二、胃內(nèi)微生態(tài)環(huán)境

胃黏膜環(huán)境是胃內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分，進(jìn)行菌群分析不可忽視胃黏膜結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，特別是胃酸的理化特性和黏液層的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。胃酸是抑制細(xì)菌的主要成分，長(zhǎng)期以來胃黏膜被認(rèn)為是無菌器官，理由即為較多學(xué)者認(rèn)為胃酸可殺死大多數(shù)細(xì)菌。但事實(shí)上胃酸并不能殺死全部微生物，Hp就是最好的證據(jù)。除Hp外，螺桿菌屬的其他菌種也可逃避胃酸的侵蝕，其他微生物也可能借助Hp的生物膜順利定植。盡管如此，胃十二指腸仍是消化道菌群密度最低的區(qū)域。胃酸是調(diào)控胃內(nèi)菌群最重要的因素，因而也是決定胃內(nèi)環(huán)境最重要的因素。正常人胃酸維持在pH 1.0～2.0，萎縮性胃炎患者和老年人胃酸分泌異常，感染機(jī)會(huì)增加，慢性炎癥進(jìn)展至腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)也相應(yīng)增加。

傳統(tǒng)意義的胃黏膜指表皮細(xì)胞以下的成分，由黏液細(xì)胞或上皮分泌的黏液往往被忽視。圖1所示消化道黏液層的微觀結(jié)構(gòu)模式，其內(nèi)層緊貼黏膜上皮，水分被吸收，結(jié)構(gòu)較為致密，外層則相對(duì)疏松。黏液層的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)決定了胃內(nèi)菌群的分布規(guī)律，外層含有更多的微生物，可發(fā)揮生物屏障功能；內(nèi)層不利于細(xì)菌移動(dòng)，故細(xì)菌很少侵犯上皮細(xì)胞。內(nèi)層黏液中的免疫成分如抗菌肽、IgA等濃度相對(duì)較高，可進(jìn)一步防止高侵襲力的菌種侵犯。除胃酸和黏液層外，胃液中的固有免疫系統(tǒng)成分也是胃內(nèi)環(huán)境的重要組分。膽汁反流、抑酸劑、免疫抑制劑、胃黏膜萎縮等可降低胃酸pH值，破壞黏液層結(jié)構(gòu)，減少胃黏膜固有免疫組分，從而破壞胃內(nèi)微生態(tài)環(huán)境，使胃內(nèi)固有菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生較大改變，菌群失調(diào)可能加速疾病進(jìn)展。

DC:樹突細(xì)胞；PC:漿細(xì)胞；APC:抗原呈遞細(xì)胞；TC:T細(xì)胞圖1 胃內(nèi)微生態(tài)環(huán)境模式圖

三、胃內(nèi)菌群的功能

胃內(nèi)微生物具有維持內(nèi)分泌平衡、免疫調(diào)節(jié)、促進(jìn)消化和吸收等重要功能。2011年荷蘭Van den Abbeele等[8]提出了宿主選擇和共同進(jìn)化學(xué)說，闡明人體通過自身免疫系統(tǒng)保留胃腸道內(nèi)有益微生物并消除病原菌。關(guān)于這些能在胃內(nèi)定植的微生物對(duì)人體起有何種作用，免疫屏障和輔助消化是目前研究得比較清楚的兩個(gè)部分。

首先，益生菌可發(fā)揮免疫屏障功能，抵御外來病原菌的侵襲。益生菌除競(jìng)爭(zhēng)性拮抗外來病原菌定植外，還能增強(qiáng)胃黏膜免疫如分泌強(qiáng)免疫原性分子、提高IgA濃度。龔四堂課題組的研究[9]發(fā)現(xiàn)，表達(dá)尿素酶B的重組枯草芽孢桿菌孢子能促使胃黏膜產(chǎn)生體液免疫，進(jìn)而抑制Hp增殖。楊若明課題組最近報(bào)道布拉酵母菌可保護(hù)機(jī)體免受螺桿菌侵襲，其主要作用機(jī)制為升高胃液和血清中的螺桿菌特異性IgA濃度[10]。其次，微生物攜帶有很多功能基因，能編碼分解脂肪酸等物質(zhì)的酶類，參與構(gòu)成人體消化酶輔助消化和吸收。再次，Hp在維持內(nèi)分泌調(diào)節(jié)方面也起有重要作用。紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院Blaser等[11]詳細(xì)論述了Hp對(duì)胃泌素和生長(zhǎng)抑素的調(diào)節(jié)作用，兒童根除Hp后體內(nèi)調(diào)節(jié)性T細(xì)胞數(shù)量和胃泌素水平下降，生長(zhǎng)抑素、胃饑餓素和胃酸水平升高。此外，胃內(nèi)菌群對(duì)胃腸道生理特別是酸分泌、免疫激活和神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)具有潛在調(diào)節(jié)作用，探究這些潛在功能是胃內(nèi)微生態(tài)研究的重要課題。

四、菌群間的相互作用

正常菌群對(duì)機(jī)體具有免疫屏障作用，可拮抗病原菌入侵和定植，亦可抑制條件致病菌的大量增殖和移位，這些效應(yīng)的實(shí)現(xiàn)建立在菌群間直接相互作用的基礎(chǔ)之上。一般而言，細(xì)菌之間存在生態(tài)位競(jìng)爭(zhēng)，即通過產(chǎn)生抗菌物質(zhì)、代謝產(chǎn)物和群體感應(yīng)效應(yīng)相互抑制。菌群間關(guān)系復(fù)雜，既有相互拮抗又有互利共生，如口腔菌群中的鏈球菌代謝物乳酸可促進(jìn)韋榮球菌生長(zhǎng)，韋榮球菌代謝物甲萘醌為卟啉單胞菌所必須，卟啉單胞菌則可抑制鏈球菌生長(zhǎng)。在胃內(nèi)菌群中，緩癥鏈球菌可促使Hp由螺旋狀變形為球狀，從而抑制Hp生長(zhǎng)[12]。布拉酵母菌能抑制豬螺桿菌(H.suis)造成的胃黏膜淋巴濾泡形成[10]。

胃內(nèi)菌群中的某些微生物可改變宿主的免疫特性，從而間接影響胃內(nèi)微生態(tài)和人體其他部位的微生態(tài)結(jié)構(gòu)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)肝螺桿菌(H.hepaticus)定植可通過抑制機(jī)體免疫功能間接促進(jìn)結(jié)核分枝桿菌增殖并增強(qiáng)其致病性[13]。而Hp可通過促進(jìn)T細(xì)胞成熟降低活動(dòng)性結(jié)核風(fēng)險(xiǎn)[14]。流行病學(xué)調(diào)查顯示Hp感染與變應(yīng)性哮喘之間呈負(fù)相關(guān)，動(dòng)物實(shí)驗(yàn)亦證實(shí)Hp可減少氣道過敏性疾病發(fā)生[15]。

五、胃內(nèi)致病菌

大量臨床資料和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)Hp是慢性胃炎、消化性潰瘍、胃癌等疾病的致病因子。但嚴(yán)格地說，Hp作為致病菌并不符合科赫法則，因?yàn)榻】等巳阂部赡軘y帶Hp。Hp是一種苛養(yǎng)菌，培養(yǎng)陽(yáng)性率通常不高，最近應(yīng)用測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了更多的Hp攜帶者。一項(xiàng)研究[16]顯示，在消化性潰瘍出血患者中，胃黏膜標(biāo)本PCR測(cè)序、快速尿素酶試驗(yàn)(RUT)和組織學(xué)檢測(cè)三種方法檢出Hp感染的敏感性分別為97.2%、47.7%和71.6%。瑞典學(xué)者應(yīng)用宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)，傳統(tǒng)方法檢測(cè)顯示Hp陰性的人群，多數(shù)胃內(nèi)菌群仍以Hp為主[17]。因此，在Hp感染率逐漸下降而慢性胃炎發(fā)病率上升的趨勢(shì)下[18]，我們不得不思考Hp和胃內(nèi)其他微生物的致病性問題。

有學(xué)者認(rèn)為Hp過度生長(zhǎng)可表現(xiàn)出致病性，胃竇Hp密度超過105cfu/mg組織蛋白可致十二指腸潰瘍發(fā)生，低于此密度則一般無潰瘍[19]。但也有學(xué)者提出Hp豐度不一定是主要致病因素，比利時(shí)學(xué)者發(fā)現(xiàn)尿素酶活性與炎癥程度無關(guān)，但高Hp負(fù)荷會(huì)給根除治療帶來一定困難[20]。Hp感染者的患病情況個(gè)體差異較大，尤其是種族差異，如Hp感染的亞洲之謎(Asian enigma)，即亞洲印度、巴基斯坦、孟加拉國(guó)等Hp高感染率國(guó)家的胃癌發(fā)病率反而低于中、日、韓等Hp感染率相對(duì)較低的國(guó)家[21]。另有數(shù)據(jù)顯示Hp感染與哮喘、肥胖等現(xiàn)代疾病呈負(fù)相關(guān)。特別值得一提的是，根除Hp在降低胃癌發(fā)病率的同時(shí)可增加食管癌發(fā)病率。研究[22]顯示CagA陽(yáng)性Hp感染對(duì)亞洲人群的食管鱗癌是一種保護(hù)因素。Hp的VacA、CagA、BabA2等毒力因子與其致病性密不可分，前期CagA-菌株感染甚至能減輕后續(xù)CagA+菌株造成的炎癥損傷[23]。

螺桿菌屬包含30多個(gè)菌種，Hp以外的螺桿菌(non-Helicobacterpylorihelicobacter,NHPH)對(duì)人體健康和根除Hp有重要影響。調(diào)查發(fā)現(xiàn)中國(guó)北京地區(qū)1 499例Hp檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性患者中11.87%同時(shí)存在海爾曼螺桿菌(H.heilmanniis.l.)感染，包括豬螺桿菌、貓螺桿菌(H.felis)、畢氏螺桿菌(H.bizzozeronii)等[24]，部分菌種已在感染動(dòng)物模型中被證實(shí)可損傷胃黏膜。豬螺桿菌是最常見的NHPH，通常用于制作胃黏膜相關(guān)淋巴樣組織(MALT)淋巴瘤動(dòng)物模型[10]。

正常生理?xiàng)l件下，胃內(nèi)菌群有助于機(jī)體防御病原菌入侵、菌群移位，以及建立完善的免疫系統(tǒng)，但伴隨著胃黏膜的病理改變，胃內(nèi)菌群更替、紊亂甚至出現(xiàn)過度增殖，可能加劇胃黏膜病理?yè)p傷。Lofgren等[25]的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)，在Hp與胃內(nèi)菌群的聯(lián)合作用下，胰島素-胃泌素轉(zhuǎn)基因(transgenic FVB/N insulin-gastrin,INS-GAS)小鼠發(fā)生胃黏膜上皮內(nèi)瘤變的時(shí)間明顯早于單獨(dú)Hp感染小鼠；Hp感染導(dǎo)致小鼠胃內(nèi)擬桿菌門減少、厚壁菌門增多，進(jìn)而加重胃黏膜損傷。由此推測(cè)Hp在胃癌發(fā)生中起始動(dòng)作用，伴隨胃黏膜萎縮、胃酸分泌減少出現(xiàn)的菌群失調(diào)則促進(jìn)胃癌發(fā)生、發(fā)展。臨床證據(jù)顯示，在癌前狀態(tài)(腸化生或異型增生)下，根除Hp并不能降低胃癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[26]。也有研究[27]發(fā)現(xiàn)胃癌患者的胃內(nèi)菌群密度和生物多樣性顯著高于胃炎患者，提示源自胃內(nèi)菌群的其他因素在胃癌發(fā)生中起有不可忽視的作用。已有研究表明胃癌與胃內(nèi)菌群失調(diào)密切相關(guān)，國(guó)內(nèi)、外眾多研究團(tuán)隊(duì)致力于尋找胃癌特異性菌群。香港中文大學(xué)Coker研究團(tuán)隊(duì)于2017年在美國(guó)消化疾病周報(bào)道了5種胃癌組織特異性細(xì)菌，分別是胃炎消化鏈球菌(Peptostreptococcusstomatis)、咽峽炎鏈球菌(Streptococcusanginosus)、微小小單胞菌(Parvimonasmicra)、乏生斯萊克菌(Slackiaexigua)和侵肺戴阿利斯特菌(Dialisterpneumosintes)。這些胃癌相關(guān)菌群可能在胃黏膜萎縮后期發(fā)揮效應(yīng)。此外，口腔菌群紊亂有助于Hp定植，甚至有學(xué)者提出牙周疾病的病原菌是胃癌發(fā)生的重要因素[28]。

根除Hp的同時(shí)也根除了其他胃內(nèi)菌群，因此根除Hp降低胃癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的效應(yīng)也可能得益于其他胃內(nèi)菌群的消除。在病變?cè)缙谖葛つど形窗l(fā)生萎縮之前根除Hp可逆轉(zhuǎn)病理?yè)p傷，之后則無效，胃內(nèi)菌群恰恰是在這一不可逆點(diǎn)之前出現(xiàn)更替：Hp與其他胃內(nèi)菌群在健康人體內(nèi)都作為共生菌存在，胃內(nèi)環(huán)境改變后，Hp過度增殖啟動(dòng)胃黏膜萎縮，萎縮黏膜產(chǎn)生胃酸的能力下降，胃內(nèi)pH值下降，具有耐酸能力的Hp失去競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)，密度在胃黏膜發(fā)生萎縮后逐漸降低，胃內(nèi)其他菌群開始占據(jù)主導(dǎo)地位(圖2)。

圖2 Hp與其他胃內(nèi)菌群的交替

胃內(nèi)菌群失調(diào)與胃癌間的相關(guān)性雖已得到證實(shí)，但兩者的因果關(guān)系仍不確定。菌群失調(diào)既可能出現(xiàn)于胃癌發(fā)生前，促進(jìn)胃癌的發(fā)生、發(fā)展，也可能是繼發(fā)于胃癌發(fā)生后胃黏膜生理環(huán)境的改變。越來越多的研究證據(jù)支持前者，即胃內(nèi)微生物組學(xué)改變可促進(jìn)癌癥進(jìn)展，但這一觀點(diǎn)需要更嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)加以證實(shí)[29]。

六、胃內(nèi)菌群與Hp的耐藥性

Hp耐藥性增加除與其自身耐藥性相關(guān)外，還可能與胃內(nèi)固有菌群有關(guān)。首先，Hp感染與胃內(nèi)菌群關(guān)系密切。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)Hp在普通動(dòng)物胃內(nèi)較難定植，經(jīng)抗菌藥物干預(yù)的動(dòng)物和和無菌動(dòng)物的Hp感染率大幅升高，因此根除Hp應(yīng)充分考慮調(diào)節(jié)胃內(nèi)微生態(tài)環(huán)境這一因素。第二，胃黏膜培養(yǎng)中可能出現(xiàn)鏈球菌、奈瑟菌、葡萄球菌、肺炎克雷伯菌等雜菌生長(zhǎng)，不論這些細(xì)菌是來自呼吸道、口腔或鼻腔的過路菌還是胃黏膜內(nèi)定植的細(xì)菌，均會(huì)影響臨床Hp檢測(cè)結(jié)果，如肺炎克雷伯菌、葡萄球菌屬的一些種類尿素酶陽(yáng)性，可干擾尿素呼氣試驗(yàn)(UBT)或RUT結(jié)果，導(dǎo)致Hp診斷結(jié)果假陽(yáng)性，同樣也可使Hp根除結(jié)束后的復(fù)查結(jié)果呈假陽(yáng)性[30]。第三，胃內(nèi)環(huán)境的特殊性決定了胃內(nèi)菌群以生物膜的形式存在，數(shù)量占優(yōu)的Hp聚集，通過代謝作用形成相對(duì)偏中性的環(huán)境，以利于自身或其他共生菌定植。Hp的根除使葡萄球菌、鏈球菌等正常菌群產(chǎn)生耐藥性，理論上，耐藥質(zhì)粒有機(jī)會(huì)傳遞給Hp，導(dǎo)致Hp耐藥。此外，螺桿菌屬尚存在多種生化特性與Hp相似的菌種，如H.cinaedi也能導(dǎo)致胃炎發(fā)生，目前對(duì)這些Hp以外的螺桿菌耐藥性和致病性的研究遠(yuǎn)遠(yuǎn)不足。因此，調(diào)查Hp根除人群的胃內(nèi)差異菌群具有重要科研和臨床意義。

七、IgA結(jié)合菌群

胃液中的IgA是防御病原菌侵襲的重要屏障，Hp可誘導(dǎo)胃黏膜產(chǎn)生Hp特異性IgA[31]，然而這些特異性IgA多為非分泌型，Hp感染者胃液中的分泌型IgA水平降低，保護(hù)作用減弱，造成感染狀態(tài)持續(xù)[32]。其他胃內(nèi)菌群如侵入黏膜上皮，同樣會(huì)誘導(dǎo)特異性抗體產(chǎn)生，特異性IgA分泌至腸腔內(nèi)，可特異性地阻斷相應(yīng)細(xì)菌進(jìn)一步侵襲。日本北海道大學(xué)Tsuruta等[33-35]對(duì)胃腸道IgA結(jié)合菌群作了一系列研究，發(fā)現(xiàn)流式細(xì)胞分析是檢測(cè)該類菌群較為敏感的方法。以熒光標(biāo)記IgA抗體標(biāo)記IgA結(jié)合菌群，借助流式細(xì)胞分析可達(dá)到分離該類菌群的目的。目前IgA流式篩選聯(lián)合測(cè)序技術(shù)已應(yīng)用于腸道細(xì)菌研究，特別是炎癥性腸病的研究，可用于致結(jié)腸炎菌群的鑒別[36]。鑒定胃內(nèi)潛在致病菌可借鑒這一方法。

八、結(jié)語

人體胃內(nèi)所有的微生物和胃內(nèi)環(huán)境共同構(gòu)成胃內(nèi)微生態(tài)系統(tǒng)，該系統(tǒng)結(jié)構(gòu)復(fù)雜，各個(gè)組分之間相互作用，包括Hp與其他胃內(nèi)菌群的相互作用、胃內(nèi)菌群間的相互作用，以及胃內(nèi)菌群與胃黏膜免疫系統(tǒng)間的相互作用。因影響因素眾多，胃內(nèi)固有菌群個(gè)體差異較大，導(dǎo)致其內(nèi)在規(guī)律難以描述。Hp在胃黏膜菌群中居主導(dǎo)地位，攜帶Hp的人群比例遠(yuǎn)高于傳統(tǒng)方法的檢出率。胃內(nèi)固有菌群在Hp相關(guān)疾病中的作用已為越來越多的研究所證實(shí)，其中的潛在致病菌尚待深入研究探討。慢性呼吸系統(tǒng)、泌尿和生殖系統(tǒng)感染性疾病的常見病原菌多種多樣，慢性胃炎的病原菌亦可能不僅僅只有Hp。微生物組學(xué)研究已證實(shí)胃內(nèi)尚有其他微生物定植，其中哪些細(xì)菌可引起慢性胃炎，應(yīng)引起各國(guó)胃腸病學(xué)家的足夠重視。