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    基于卷積神經網絡的房室肥大心電圖的自動識別與分類診斷

    2020-02-24 12:01:44佟彥妮張瑞卿沈陽蔣華常世杰沙憲政
    中國醫(yī)療器械雜志 2020年1期
    關鍵詞:房室右心室心房

    佟彥妮,張瑞卿,沈陽,蔣華,常世杰,沙憲政

    1 中國醫(yī)科大學 生物醫(yī)學工程系,沈陽市,110122

    2 中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院 心血管內科,沈陽市,110054

    0 引言

    心房、心室肥大是由于心臟房室負荷過重,引起普通心肌壁增厚,房室腔擴大。房室肥大常由某些心臟疾病,如二尖瓣心臟病、先天性心臟病、室間隔缺損等引起。通過心電圖(ECG)對心臟運作的觀察,其得出的結論可作為臨床上判別房室肥大的標準之一。心房、心室分別除極產生的對應于ECG上的P波、QRS波群,其形態(tài)與幅值對房室肥大的診斷具有重要意義。傳統(tǒng)分析ECG的標準模式通常由以下步驟組成:預處理[1]、心拍分割[2-3]、特征提取[4]與分類。近年來,卷積神經網絡(CNN)作為深度學習的模型之一,其內部通過卷積層、池化層、全連接層的不同組合并與不同形式的損失函數相結合以實現(xiàn)不同的功能,應用于多個領域。由CNN衍生出來的模型包括U-Net[5]、Faster R-CNN[6]、YOLO[7]、GAN[8]等分別應用于信號圖像分割、目標檢測、有監(jiān)督與無監(jiān)督學習等方面。CNN的應用也拓展到了ECG識別分析領域,ACHARYA等[9]利用CNN區(qū)分3類心律失常與正常ECG,其測試集的敏感度、特異度以及準確率分別達到了98.09%、93.13%和92.50%;HANNUN等[10]利用ResNet CNN對12類不同節(jié)律的ECG進行分類,其測試結果的AUC均值為0.97,F(xiàn)1-Score為0.837。

    本研究采用傳統(tǒng)與卷積神經網絡方法相結合的方式,搭建10層一維CNN識別分析房室肥大ECG,以實現(xiàn)臨床ECG的輔助分類診斷。

    1 方法

    1.1 預處理

    本研究所使用的心電圖數據由中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院數據庫(CMUH1)提供。其中數據均采集于2013—2017年間來院進行標準12導聯(lián)靜態(tài)心電圖檢查的患者。心電圖采樣率為560 Hz。因房室肥大心電圖P波、QRS波的異常改變在Ⅰ、Ⅱ、V1與V5導聯(lián)較為顯著,本文從12導聯(lián)原始心電數據中僅提取這4個導聯(lián)的記錄,每條記錄時長為2.5 s。

    數據挑選完成后,利用db5小波對心電信號進行8層分解以濾除基線漂移和高頻噪聲。圖1顯示了原始以及分解重構后的心電信號。

    圖1 利用小波變換對心電信號濾波前后對比圖Fig.1 Comparison of ECG signal before and after filtering by wavelet transform

    對于濾除噪聲后的心電數據,利用Pan-Tompkins算法,檢測R波峰值點。定位R波波峰后,在其前、后方各取140、224個點,并以這365個點構成一個心拍。對心拍采集的描述如圖2所示。

    圖2 R波定位及心拍采集Fig.2 R wave detection and beats selection

    本實驗從CMUH1中隨機挑選出29例右心房肥大(RAH)、21例左心房肥大(LAH)、68例右心室肥大(RVH)、339例左心室肥大(LVH)以及400例正常(Normal)心電圖(患者的性別、年齡以及檢查時間均隨機),并對其進行分割以采集心拍。因心房肥大心電圖數據量較少,分割心拍不僅可以擴增數據并且可以減少冗余信息。其中正常心電圖指無肥大癥狀的心電圖。心電圖各導聯(lián)為同步測量,其從不同方位反映出心臟的運作狀況,因此將從四個導聯(lián)I、II、V1、V5提取出的心拍數據以并聯(lián)的形式連接,每四個心拍的并聯(lián)組合作為數據集中的一條樣本數據。最終右心房肥大、左心房肥大、右心室肥大、左心室肥大以及正常心電圖的心電樣本數分別為69、52、176、826以及1 042。根據每條樣本數據所屬類別,為其打上不同的標簽??紤]到左、右心房肥大心電信號的數據量較少,而且心房肥大心電圖的異常主要體現(xiàn)在P波的異常,因此在實驗中將左、右心房肥大兩類心電圖合并為心房肥大一類心電圖。標簽0、1、2、3分別對應正常、心房肥大(AH)、右心室肥大、左心室肥大心電圖。

    1.2 CNN

    本研究使用的CNN結構如圖3所示。前半部分的卷積模塊實現(xiàn)了CNN的特征提取功能。模塊中的前6層為3組卷積層與池化層的交替組合,可以逐級提取由粗粒度到細粒度的特征。卷積操作中,輸入層的部分神經元與輸出層的單個神經元進行局部連接,輸入與對應的連接權值加權求和并與偏置值相加,最后通過激活函數激活以得到輸出值。本研究選取ReLu激活函數[11]為模型注入非線性元素,可以有效避免模型訓練過程中出現(xiàn)的梯度消失問題。池化操作中,選取卷積核所覆蓋區(qū)域的最大值作為輸出值。最大池化層可極大地減少需要訓練的參數,對于在訓練過程中擁有大量參數的CNN模型,池化層可以降低計算負擔,同時增強模型的魯棒性。卷積模塊中每層輸出的特征圖數量均為128。CNN模型的后半部分由三個全連接層組成,其中嵌入了Dropout正則化[12],在訓練過程中,其以0.5的概率隨機丟棄全連接層中的神經元以避免過擬合的發(fā)生。網絡的最后一個全連接層由Softmax函數[13]激活,從而實現(xiàn)多分類的輸出。

    圖3 本研究所用CNN結構圖Fig.3 Structure of CNN in the study

    網絡搭建完成后,將處理好的心電數據制作成數據集以適應模型的輸入。訓練集表達為A={(Xi,Yi),i=1,2,…,n},Xi代表由四個導聯(lián)的心拍數據并聯(lián)構成的輸入,Y∈{0,1,2,3}為Xi所對應的真實標簽。這里Yi=0,Yi=1,Yi=2和Yi=3分別代表正常、心房肥大(AH)、右心室肥大以及左心室肥大心電圖。網絡各層之間通過權重ω=(ω[1],ω[2],…,ω[n])和偏置b=(b[1],b[2],…,b[n])連接,n代表某一層在網絡中的排列順序。網絡輸出層的神經元數量與分類個數相對應,每個神經元通過Softmax激活后得到預測值其含義為模型的損失函數表達如下:

    整個CNN的訓練以最小化損失函數為目的。訓練過程中,權重ω和偏置b通過模型內置的Adam優(yōu)化器[14]進行更新,優(yōu)化器中的超參數β1,β2分別設置為0.9,0.999。

    2 結果

    區(qū)分房室肥大與正常心電圖的結果通過ROC(Receiver Operating Characteristic)曲線(圖4)展示。ROC曲線的橫縱軸分別代表假陽性率(FPR)與真陽性率(TPR)。這里,房室肥大與正常心電圖的真實標簽分別為陽性與陰性。AUC值為ROC曲線下的面積,其值越大代表模型的分類效果越好。本實驗的訓練集與測試集劃分如下,隨機抽?。ɑ颊叩男詣e、年齡以及檢查時間均隨機)533條正常心電圖數據與549條房室肥大心電圖數據作為訓練集,余下的509條正常心電圖數據與574條房室肥大心電圖數據則作為測試集。

    從所有的心電數據中隨機抽取一半作為訓練集(1 082條數據),余下的則作為測試集,四分類的混淆矩陣結果如表1所示。

    心房肥大,左、右心室肥大與正常心電圖四分類的五折交叉驗證結果如表2所示。表中選取Sensitivity(真陽性率)、Precision(精確率)以及F1分數對模型的分類性能進行展現(xiàn)。其中F1-score計算如下:

    圖4 房室肥大與正常心電圖二分類ROC曲線圖Fig.4 ROC of differentiating AVH and Normal ECG

    Recall等同于真陽性率。

    表1 四分類的混淆矩陣結果Tab.1 Confusion matrix for 4 classes

    表2 四分類的五折交叉驗證結果Tab.2 Five-fold validation results of 4 classification

    3 討論

    在識別房室肥大心電圖的實驗中,網絡的最后輸出層只有一個神經元,并使用Sigmoid函數激活以得到輸入心電圖為陽性的概率。根據測試集的結果繪制的ROC曲線圖,其AUC值達到0.991,證明該CNN模型可以很好地對房室肥大心電圖進行識別。在對心房肥大以及左、右心室肥大心電圖的分類診斷中,綜合觀察表1的混淆矩陣與表2的交叉驗證結果得到,正常以及左心室肥大的分類效果整體要優(yōu)于心房肥大和右心室肥大。分析原因得出,深度學習取得良好效果的關鍵之一是訓練集的數量要大,而心房肥大以及右心室肥大心電圖的數據量要明顯低于其他兩類,造成其分類結果較差。但由于右心室肥大心電圖在對應導聯(lián)特征較為突出,與其他三類相比差別也較大,因此其分類的敏感度較高可以達到0.992。此外,正常心電圖與左心室肥大心電圖分類時,結果會出現(xiàn)混淆,臨床上左心室肥大最突出的特征即為R波電壓增高,這個特點也是醫(yī)生判定左心室肥大的重要依據,而有些心電圖其R波電壓會突增,但未達到左心室肥大的診斷標準,此時會比較容易出現(xiàn)誤判。通過對表1、2的觀察還可得出,大部分分類錯誤的心房肥大心電圖會被視作正常心電圖,分析得到,在臨床上心房肥大心電圖的異常主要表現(xiàn)為P波寬度或幅值的異常,與正常心電圖相比此變化有時較為細微,也是認為觀察時容易漏掉的細節(jié),因此計算機在進行判斷時也容易發(fā)生誤診。

    本實驗綜合考慮一維心電信號的特性,構造CNN網絡并為其設置合理的參數,實現(xiàn)了心電信號特征的自動提取與篩選,并利用提取到的特征對房室肥大心電圖進行自動分析診斷。其最后的測試結果也展現(xiàn)了較高的靈敏度與準確率,證明本方法可以輔助醫(yī)生對心電圖進行識別診斷,提高臨床工作效率,并更好地服務于患者。接下來的研究中,會擴展算法在心電領域的應用范圍,利用更多類型的心臟病對算法進行測試,并加以改進算法,使其發(fā)揮出更大的價值服務于社會。

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