豐敏,杜寧,張洋子,李相陽,許文濤*,劉海燕*
1.華北理工大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,河北 唐山 063210;2.中國農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院,北京 100083;3.北京農(nóng)學(xué)院食品科學(xué)與工程學(xué)院,北京 102206
孔雀石綠(malachite green,MG)又稱為苯胺綠、鹽基塊綠、中國綠、堿基綠,是一種人工合成的三苯甲烷類染料,分子式為C23H25N2Cl,屬于小分子物質(zhì)[1-3]。MG本身的熒光量子產(chǎn)率極低,被認(rèn)為是一種無熒光物質(zhì)。但當(dāng)MG與孔雀石綠適配體(malachite green aptamer,MGA)結(jié)合時(shí),熒光強(qiáng)度顯著增加[4]。MG的結(jié)構(gòu)由1個(gè)中心碳原子連接的3個(gè)苯環(huán)組成,結(jié)構(gòu)靈活,3個(gè)苯環(huán)之間可自由旋轉(zhuǎn),其中,不含二甲氨基取代基的環(huán)(C環(huán))被認(rèn)為是影響MG發(fā)揮作用的核心基團(tuán)。需要注意的是,MG的化學(xué)官能團(tuán)三苯甲烷及N,N-二甲基苯胺均為具有毒性的致癌物質(zhì)。在酵母細(xì)胞和人類卵巢細(xì)胞中,MG的限制濃度為0.1~1 μmol/L[5]。
適配體可將目標(biāo)物包封在其結(jié)合口袋內(nèi),是一段能與目標(biāo)物高特異性、高親和性結(jié)合的短鏈DNA或RNA片段。適配體具有與抗體相似的識(shí)別行為,但其空間結(jié)構(gòu)與抗體相比更為靈活,可通過自身結(jié)構(gòu)的變化來調(diào)節(jié)功能,其中具有熒光特性的適配體可用作熒光探針。傳統(tǒng)的熒光探針需要在核酸上標(biāo)記熒光基團(tuán)、淬滅基團(tuán),若淬滅基團(tuán)未將熒光基團(tuán)完全淬滅,會(huì)導(dǎo)致熒光背景值較高[6]。與傳統(tǒng)的熒光探針相比,熒光適配體是一種典型的無需標(biāo)記的熒光檢測探針,熒光染料能夠與相應(yīng)的適配體結(jié)合形成配體絡(luò)合物,從而顯著增強(qiáng)熒光信號(hào)。研究表明,在適配體的存在下,熒光染料的熒光強(qiáng)度能增加3個(gè)數(shù)量級(jí)[7]。因此,MGA作為一種典型的熒光適配體,具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。
本文根據(jù)近年來MGA的研究成果綜述了MG RNA適配體及其變構(gòu)體和MG DNA適配體的特性、研究現(xiàn)狀,以及影響MG-MGA復(fù)合物熒光強(qiáng)度的因素。同時(shí),還對MG的衍生物和共聚物的特性進(jìn)行了總結(jié)。最后,綜述了MGA在生物傳感、熒光成像等領(lǐng)域的應(yīng)用,以期更好地明確MGA在生物檢測、生物成像等領(lǐng)域的發(fā)展方向。
MG RNA適配體的篩選主要依靠指數(shù)富集進(jìn)化技術(shù)(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),即在體外含有隨機(jī)序列的分子池中選擇可與靶物質(zhì)高親和性結(jié)合的核酸序列,通過MG誘導(dǎo)適配體發(fā)生構(gòu)象變化,MG被包裹在適配體內(nèi),形成配體絡(luò)合物,并不斷的對配體絡(luò)合物進(jìn)行PCR擴(kuò)增、富集、測序等過程,最終將單個(gè)核酸從文庫中篩選出來。1990年,Ellington和Szostak[8]第一次通過SELEX技術(shù)體外篩選獲得適配體;1999年,Grate和Wilson[9]通過SELEX技術(shù)篩選出MGA,這是設(shè)計(jì)無標(biāo)簽熒光團(tuán)探針的第一步。研究發(fā)現(xiàn),MG與其RNA適配體結(jié)合,可以使自身的熒光強(qiáng)度增加2 000多倍[7]。
MG RNA適配體與配體的親和力可以通過等溫滴定量熱法(isothermal titration calorimetry,ITC)、核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)光譜[10]、熒光滴定法、平衡透析法和X-射線晶體學(xué)[11]等方式進(jìn)行表征,其中常用的表征方式為ITC、NMR光譜、熒光滴定法。ITC是一種通過添加不同的結(jié)合成分而導(dǎo)致熱力學(xué)變化的技術(shù),即通過添加MGA產(chǎn)生MG-MGA復(fù)合物,從而引起熱力學(xué)參數(shù)結(jié)合常數(shù)(Ka)、焓變(ΔH)、熵變(ΔS)發(fā)生變化。MG RNA適配體自適應(yīng)結(jié)合的一個(gè)顯著特點(diǎn)是未結(jié)合配體的適配體口袋中不含可檢測結(jié)構(gòu),因此可以通過NMR光譜測定適配體結(jié)合口袋中的堿基配對模式,通過比較堿基配對的模式來判斷適配體的結(jié)合情況[12]。熒光滴定法是通過向MG溶液中加入MGA,再通過檢測MGA加入后的熒光變化來實(shí)現(xiàn)對于MGA的結(jié)合常數(shù)的表征。
MG RNA適配體是一段含有38個(gè)堿基的核苷酸序列,它有2種密切相關(guān)的配體:MG和TMR(tetramethylrosamine)。TMR是一種常規(guī)的線粒體熒光染料,它可在MG的2個(gè)含有二甲氨基的苯環(huán)中間插入醚鍵,從而使MG結(jié)構(gòu)的剛性增強(qiáng)[13]。MG RNA適配體依賴于堆積和靜電相互作用與配體識(shí)別,再通過配體誘導(dǎo)、適配體自適應(yīng)的方式與MG結(jié)合。RNA適配體與配體的結(jié)合部位是RNA適配體的結(jié)合口袋,結(jié)合口袋與配體的結(jié)合主要是通過質(zhì)子的驅(qū)動(dòng)發(fā)揮作用[14]。MG RNA適配體的結(jié)合口袋由1個(gè)基本的四重結(jié)構(gòu)(C7,G24,G29,A31)和1個(gè)Watson-Crick堿基對(G8,C28)組成,兩側(cè)的A9與A30關(guān)閉了口袋的另一側(cè)[15]。除1個(gè)U32堿基外,所有的內(nèi)環(huán)核苷酸都參與了結(jié)合口袋的形成,結(jié)合口袋堿基的堆積導(dǎo)致兩側(cè)形成雙螺旋的莖部結(jié)構(gòu)[11]。而配體的存在使得RNA內(nèi)部堿基互補(bǔ)配對和堆積,導(dǎo)致RNA適配體結(jié)合口袋中的電荷分布發(fā)生變化[16]。
MG RNA適配體的篩選已較為成熟,被廣泛應(yīng)用于生物傳感器中,但RNA適配體合成成本高、不穩(wěn)定、易被核酸酶降解。因此,對MG RNA適配體進(jìn)行劈裂、裁剪等對于提高其穩(wěn)定性具有重要的作用。
1.3.1MG RNA劈裂適配體 劈裂適配體是將原適配體劈裂成2個(gè)或者多個(gè)短片段而形成的核酸探針[17]。經(jīng)過劈裂的核酸片段不具有特定的空間構(gòu)象,因此無特異性背景信號(hào)。而當(dāng)靶物質(zhì)存在時(shí),靶物質(zhì)可使劈裂適配體的空間構(gòu)象發(fā)生變化,形成劈裂適配體-靶物質(zhì)復(fù)合物,進(jìn)而使得熒光強(qiáng)度增加。利用劈裂適配體進(jìn)行檢測,可在提高檢測的靈敏度和特異性的同時(shí)降低背景信號(hào),此外,部分劈裂適配體經(jīng)劈裂后長度縮短,降低了合成成本[18]。
MG RNA適配體是典型的帶有“三通道”的二級(jí)結(jié)構(gòu),在進(jìn)行劈裂的時(shí)候,首先去除適配體的環(huán)狀結(jié)構(gòu),然后對莖上的非結(jié)合位點(diǎn)部分的互補(bǔ)序列進(jìn)行裁剪,減少莖區(qū)域的堿基數(shù)量[19]。Kolpashchikov團(tuán)隊(duì)[20]將38 nt的MGA劈裂成2個(gè)部分,其中一條鏈長為10 nt,另一段鏈長為16 nt,劈裂適配體的堿基數(shù)比原適配體堿基數(shù)減少了12 nt,同時(shí),劈裂適配體減少了與配體結(jié)合中不必要的空間位阻,節(jié)約了合成成本。而且,劈裂的核酸適配體與靶標(biāo)仍然具有高親和力和高效的識(shí)別能力,并降低了與靶標(biāo)類物的親和力,提高了特異性檢測靶標(biāo)的能力。
1.3.2MG RNA截短適配體 截短適配體是對已經(jīng)篩選得到的適配體進(jìn)行裁剪得到的較短的適配體。目前,在研究中得到了一段堿基數(shù)為27 nt且與MG的結(jié)合能力較強(qiáng)的MG RNA截短適配體,它的堿基序列為5′-UCCCGACUGGAACAGGUAACGAAUGGA-3′[6,21-22]。2009年,Xu和Lu[6]將MG RNA截短適配體與ATP的適配體串聯(lián),成功實(shí)現(xiàn)對于ATP的檢測。2019年,Zhao等[21]利用一種基于MG RNA截短適配體結(jié)合金納米粒子構(gòu)建的生物傳感器來檢測MG,該生物傳感器的靈敏度較高,檢測限達(dá)到1.8 nmol/L。
1.3.3其他 為了克服RNA適配體易降解的弊端,2019年,Luo等[23]提出將一種創(chuàng)新的L-型MG RNA適配體應(yīng)用于MG的檢測,L-型適配體的結(jié)構(gòu)是普通適配體結(jié)構(gòu)的鏡像對稱體,研究表明,這種L-型適配體對靶物質(zhì)的識(shí)別能力和親和力與普通適配體類似,但這種適配體的穩(wěn)定性顯著高于普通適配體,其在緩沖液中21 d內(nèi)不會(huì)發(fā)生降解,具有較強(qiáng)的抗酶水解的能力。研究人員將這種L-型MG RNA適配體用于MG的檢測,檢測限可達(dá)到47.7 nmol/L。
影響MG-MGA復(fù)合物熒光強(qiáng)度的因素較多,其中pH、陽離子濃度、溫度以及有機(jī)溶劑對MG-MGA復(fù)合物熒光強(qiáng)度的影響是目前研究的重點(diǎn)[24]。目前,常使用Tris緩沖液與HEPES緩沖液作為MG與其RNA適配體的結(jié)合環(huán)境。又由于MG RNA適配體是在HEPES緩沖液中篩選出來的,因此,對于MG-MGA復(fù)合物熒光強(qiáng)度的影響因素的研究主要基于HEPES緩沖液[6,9,24]。
1.4.1pH 當(dāng)RNA適配體暴露于堿液時(shí),適配體會(huì)被永久降解,因而,堿性條件會(huì)使MG-MGA復(fù)合物的熒光信號(hào)減弱。當(dāng)pH大于9時(shí),RNA發(fā)生變性,適配體結(jié)合域的結(jié)構(gòu)被破壞,導(dǎo)致MG-MGA復(fù)合物解離,熒光信號(hào)減弱;當(dāng)恢復(fù)到最適pH時(shí),熒光仍無法恢復(fù)。當(dāng)pH為5~9時(shí),MG與其RNA適配體的結(jié)合有明顯的熒光信號(hào);當(dāng)pH為6.5~7時(shí),熒光信號(hào)最佳[24]。
1.4.2陽離子 RNA適配體本身帶負(fù)電,因此,MG與其RNA適配體的結(jié)合需要一定的陽離子環(huán)境,而結(jié)合環(huán)境中陽離子的種類及含量對MG-MGA復(fù)合物的形成及其熒光特性至關(guān)重要。二價(jià)陽離子Mg2+和一價(jià)陽離子K+、Na+是各種緩沖液中常見的陽離子,也是對RNA的折疊有顯著影響的陽離子。這些陽離子具有封閉的電子層結(jié)構(gòu),如K+、Mg2+可通過靜電力與RNA相互作用;且這2種離子的半徑與離子-RNA復(fù)合物的形成有著密切關(guān)系,一方面離子的半徑?jīng)Q定了給定螯合位點(diǎn)的空間配位,另一方面離子的半徑越小,電荷密度越大,水合能越大[6,24]。K+、Mg2+的存在被認(rèn)為是MG-MGA復(fù)合物形成的必要條件,如Mg2+的濃度在5~10 mmol/L范圍內(nèi)是熒光信號(hào)增強(qiáng)與穩(wěn)定的最佳條件,熒光強(qiáng)度能保持30 min[24]。研究表明,二價(jià)陽離子不存在時(shí),RNA適配體的結(jié)合口袋中不存在堿基互補(bǔ)配對,缺乏三級(jí)結(jié)構(gòu)。由此可見,二價(jià)陽離子對于三級(jí)結(jié)構(gòu)的維持極為重要[16]。而K+、Na+在穩(wěn)定MG-MGA復(fù)合物的性能方面作用相當(dāng),它們都對復(fù)合物的形成至關(guān)重要,因此,結(jié)合環(huán)境中存在K+或者Na+是必要的,研究表明,Na+能增加MG-MGA復(fù)合物的熒光強(qiáng)度[24]。
1.4.3溫度 MG-MGA復(fù)合物的形成和穩(wěn)定性都受到溫度的影響。當(dāng)MG與其RNA適配體在0 ℃孵育時(shí),復(fù)合物的熒光信號(hào)較弱;當(dāng)孵育溫度為35 ℃時(shí),復(fù)合物較難形成;當(dāng)孵育溫度調(diào)整為4~8 ℃時(shí),熒光強(qiáng)度最大且熒光信號(hào)最穩(wěn)定,但達(dá)到熒光強(qiáng)度最大值的時(shí)間較長(需要幾天的時(shí)間),不能滿足快速檢測的需要。當(dāng)MG與其RNA適配體孵育溫度為16~20 ℃時(shí),熒光強(qiáng)度在16 min時(shí)達(dá)到最大值,且熒光信號(hào)穩(wěn)定(約維持1周)。因此,16~20 ℃為MG與其RNA適配體孵育的最佳溫度[24]。
1.4.4有機(jī)溶劑 有機(jī)溶劑對MG-MGA復(fù)合物的熒光強(qiáng)度有著不同程度的抑制作用,其中含氫鍵的有機(jī)溶劑對熒光強(qiáng)度的抑制作用相對較弱;此外,有機(jī)溶劑對MG-MGA復(fù)合物的熒光信號(hào)有一定的穩(wěn)定作用,且能減少M(fèi)G-MGA復(fù)合物Kd值的變化[24-25]。在羥基存在的情況下,羥基通過攻擊MG的中心碳(C1)將MG漂白,而MG RNA適配體的存在可抑制漂白作用,這種抑制作用主要是因?yàn)镸G RNA適配體可與MG結(jié)合形成MG-MGA復(fù)合物,從而在空間上將羥基排除,使其不能與MG的中心碳(C1)結(jié)合;當(dāng)存在MG RNA適配體的反義互補(bǔ)寡核苷酸鏈時(shí),漂白作用可逆轉(zhuǎn),可以通過MG RNA適配體與反義互補(bǔ)鏈調(diào)節(jié)位阻,從而控制MG的分子反應(yīng)活性[26]。而選用純水做MG與其RNA適配體的結(jié)合緩沖液的溶劑時(shí),MG-MGA復(fù)合物的熒光效果最佳[24]。
目前,對于MG DNA適配體的研究較少,MG能與部分DNA(主要為G-四聯(lián)體結(jié)構(gòu))結(jié)合增強(qiáng)熒光信號(hào)。當(dāng)G-四聯(lián)體作為MG DNA適配體時(shí),MG的3個(gè)苯環(huán)通過末端疊加的方式加在G-四聯(lián)體的2個(gè)外部四分體上,但G-四聯(lián)體結(jié)構(gòu)可以與多種小分子染料結(jié)合并增強(qiáng)它們的熒光信號(hào),因此,基于G-四聯(lián)體與MG的復(fù)合物構(gòu)建的生物傳感器無法滿足高特異性的需求[27]。
2016年,Wang等[27]通過利用目標(biāo)誘導(dǎo)DNA適配體釋放的SELEX方法進(jìn)行擴(kuò)增、純化、篩選,得到1種僅含有26 nt堿基的MG DNA適配體。當(dāng)該適配體遇到MG時(shí),它含有的帶有11個(gè)堿基的結(jié)合口袋能將小分子MG包裹在內(nèi),使MG的熒光信號(hào)增強(qiáng)幾倍到幾十倍。該適配體的Kd值為2.43±0.39 μmol/L,這種熒光適配體的激發(fā)波長為617 nm,發(fā)射波長為650 nm。
MG可通過與MGA結(jié)合顯示出良好的熒光特性,但MG具有一定的毒性,在一定程度上影響了MGA生物傳感器的應(yīng)用。結(jié)晶紫(crystal violet,CV)、TMR、派洛寧Y(Pyronin Y,PY)等都被證明是MGA的結(jié)合配體[12,16],只有了解它們的特性,才能更好地發(fā)揮MGA的優(yōu)勢。
CV是MG的衍生物,CV與MG結(jié)構(gòu)的區(qū)別為CV的3個(gè)苯環(huán)上都含有二甲氨基取代基。但CV與G-四聯(lián)體的復(fù)合物熒光微弱,無法區(qū)分G-四聯(lián)體與其他DNA,也沒有表現(xiàn)出優(yōu)先與G-四聯(lián)體結(jié)合的特性[31]。經(jīng)熒光光譜分析,CV的吸收波長不隨G-四聯(lián)體濃度的增加而變化,且吸收峰的增加緩慢,這主要是由于CV的3個(gè)苯環(huán)上都含有二甲氨基取代基,阻礙了G-四聯(lián)體中CV的插入結(jié)合[29]。
MG、TMR與MGA結(jié)合的親和力高于CV、PY,但TMR無論是單獨(dú)存在還是與MG的RNA適配體結(jié)合后都能呈現(xiàn)熒光,而CV只有在與MG的RNA適配體結(jié)合形成復(fù)合物的情況下才能形成熒光。4種配體與MG RNA適配體的結(jié)合速率為PY>TMR>MG>CV,Mg2+的加入使得適配體結(jié)合配體的速率變慢,但是結(jié)合的穩(wěn)定性增加[12]。值得一提的是,PY濃度過高時(shí)會(huì)產(chǎn)生毒性。當(dāng)PY的濃度為1.7~3.3 μmol/L時(shí),PY主要分布在線粒體中,無細(xì)胞毒性,但能抑制細(xì)胞的生長,阻礙細(xì)胞進(jìn)入G1期;當(dāng)PY的濃度為6.7~33 μmol/L時(shí),PY呈現(xiàn)細(xì)胞毒性,分布于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,PY能誘導(dǎo)G2期聯(lián)體和S期細(xì)胞停滯[32]。
表1 MG DNA適配體與MG RNA適配體的比較Table 1 Comparison of MG DNA aptamer and MG RNA aptamer
此外,孔雀石綠吲哚?;苌?indolyl derivatives,IMG)是在MG的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上將MG的A環(huán)與B環(huán)上的各1個(gè)甲基分別替換為乙基而形成的衍生物。IMG的吸收波長為632 nm,熒光量子產(chǎn)率約為MG的2倍;當(dāng)存在MGA時(shí),IMG的吸收波長紅移到650 nm,熒光量子產(chǎn)率增加且大于MG-MGA復(fù)合物的熒光強(qiáng)度[7]。
聚乙烯醇(poly vinyl alcohol,PVA)與MG形成的MG-聚乙烯醇共聚物(PVAMG)是一種中性的聚合物。研究表明,這種聚合物具有光誘導(dǎo)熒光信號(hào)增強(qiáng)的特性,經(jīng)光照射,這種聚合物含有的帶陽離子的芳香環(huán)能為平行的G-四聯(lián)體結(jié)構(gòu)提供結(jié)合位點(diǎn),MG可以堆積在G-四聯(lián)體的最外層,從而使熒光信號(hào)顯著增強(qiáng)。而且PVAMG與平行G-四聯(lián)體結(jié)合的親和力比與非平行G-四聯(lián)體結(jié)構(gòu)結(jié)合的親和力強(qiáng),但在黑暗條件下,PVAMG與G-四聯(lián)體沒有親和力,熒光信號(hào)微弱;無論在黑暗條件下還是在光照條件下,PVAMG均無細(xì)胞毒性[33]。
目前,MGA主要應(yīng)用于生物檢測領(lǐng)域,利用MG與MGA結(jié)合的高親和力和熒光特性,可以實(shí)現(xiàn)對于MG及其他靶物質(zhì)的檢測。由于MG具有一定的毒性,利用MGA實(shí)現(xiàn)生物體內(nèi)的檢測及體內(nèi)熒光成像的研究較少。
MGA作為一種性能良好的熒光適配體具有廣泛的應(yīng)用前景,MGA既可以作為信號(hào)識(shí)別元件識(shí)別靶物質(zhì)MG,又能通過MG-MGA復(fù)合物的熒光特性實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)輸出。
2010年,Stead等[24]利用固相萃取技術(shù)結(jié)合MGA構(gòu)建了一種快速檢測魚類組織中MG的熒光檢測方法。在該研究中,MGA既作為信號(hào)識(shí)別元件識(shí)別魚類組織中的MG,同時(shí)又作為信號(hào)輸出元件將MG與MGA的結(jié)合信號(hào)轉(zhuǎn)化為熒光信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)的輸出。此研究是MGA用于食品檢測的首次報(bào)道,該方法的特異性好,檢測周期短,一般在4 h內(nèi)可以完成對20個(gè)樣品的檢測。
2009年,Xu和Lu[6]構(gòu)建了一種基于MG-MGA復(fù)合物的熒光信號(hào)實(shí)現(xiàn)ATP檢測的生物傳感器,該團(tuán)隊(duì)將ATP適配體與MGA偶聯(lián),又添加了1條能與ATP適配體和MGA相鄰部分互補(bǔ)的橋連探針。體系中始終存在MG,當(dāng)體系中不存在ATP時(shí),橋連探針與ATP適配體結(jié)合在一起,無法將MGA打開,體系無熒光;當(dāng)體系中存在ATP時(shí),ATP與其適配體結(jié)合并將橋連鏈撬開,MG可以與MGA結(jié)合并發(fā)生構(gòu)象變化,熒光信號(hào)顯著增強(qiáng)。因此,可以通過熒光信號(hào)的強(qiáng)弱實(shí)現(xiàn)ATP的定量檢測。該熒光生物傳感器借助MGA實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)輸出,無需熒光標(biāo)記,通用性強(qiáng),可用其他適配體代替ATP適配體實(shí)現(xiàn)靶物質(zhì)的檢測。
MGA具有高特異性識(shí)別配體的能力,且與MG的親和力高,因此,MGA可以作為MG的信號(hào)識(shí)別元件用于MG的檢測。2014年,王虹智等[34]構(gòu)建了一種夾心結(jié)構(gòu)的電化學(xué)生物傳感器,在修飾電極的表面固定能特異性識(shí)別并捕獲MG的適配體,當(dāng)被檢測物質(zhì)中含有MG時(shí),適配體捕獲MG并將MG固定在電極表面,再接上含有辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)的MG抗體,HRP能分解H2O2產(chǎn)生電化學(xué)信號(hào),從而構(gòu)建了一種可以特異性識(shí)別水產(chǎn)品中MG的電化學(xué)生物傳感器。MGA在該生物傳感器中作為信號(hào)識(shí)別元件,特異性識(shí)別被檢物質(zhì)中的MG,該生物傳感器成本低、靈敏度高、操作簡單、分析快速。
基于MGA的比色生物傳感器是以MGA作為信號(hào)識(shí)別探針,通過MG與MGA的結(jié)合實(shí)現(xiàn)信號(hào)的轉(zhuǎn)化,從而實(shí)現(xiàn)MG的比色檢測。2018年,Jia等[35]構(gòu)建了基于MGA的比色生物傳感器,在該比色生物傳感器中,MGA作為靶物質(zhì)的識(shí)別探針,金納米粒子作為信號(hào)輸出元件,MGA非特異性吸附在金納米粒子上并阻止金納米粒子的高鹽聚集。若體系中存在MG,MG可將吸附在金納米粒子上的MGA剝離,促使金納米粒子發(fā)生聚集,溶液由紅色變?yōu)樗{(lán)色。利用該比色生物傳感器可以實(shí)現(xiàn)MG的檢測,檢測限為15.95 nmol/L。該方法便捷、快速,信號(hào)的產(chǎn)生簡單,可通過肉眼進(jìn)行鑒別。
2019年,Zhao等[21]構(gòu)建的基于MGA與金納米粒子的比色生物傳感器,成功用于檢測水產(chǎn)養(yǎng)殖用水中的MG。該生物傳感器利用MG RNA適配體作為信號(hào)識(shí)別元件,實(shí)現(xiàn)了MG的檢測。當(dāng)MG存在時(shí),MG能與MGA高特異性結(jié)合,使CTAB+-RNA適配體的結(jié)構(gòu)解離,CTAB+釋放,CTAB+可以吸附在檸檬酸鹽封裝的金納米粒子表面,使金納米粒子聚集,抑制金納米粒子的納米酶活性,從而抑制金納米粒子對3,3′,5,5′-四甲基聯(lián)苯胺(3,3′,5,5′-tetramethylbenzidine,TMB)的催化活性,使原體系的藍(lán)色變淺。因此,可以根據(jù)體系顏色的變化比色測定MG的含量,該比色生物傳感器的檢測限為1.8 nmol/L。
將MGA應(yīng)用于體內(nèi)研究需要考慮MG的毒性。有研究表明,當(dāng)MG濃度低于10 μmol/L時(shí),對大腸桿菌的生存沒有任何影響[5]。2018年,Yerramilli和Kim[36]提出了一種利用MGA進(jìn)行熒光成像的新策略。研究人員將MGA作為熒光探針用于檢測細(xì)胞中的RNA,他們將6個(gè)MGA串聯(lián)以增加MGA體系的熒光強(qiáng)度,由于MGA與MG結(jié)合呈現(xiàn)遠(yuǎn)紅外熒光,因此,MGA可與多種波長在綠色或者黃色熒光范圍的熒光蛋白及適配體聯(lián)合使用。研究人員利用串聯(lián)的MGA和誘導(dǎo)型質(zhì)粒誘導(dǎo)MGA在細(xì)菌中表達(dá),結(jié)果顯示,熒光強(qiáng)度增加了20倍且熒光信號(hào)穩(wěn)定,5 μmol/L的MG加入6 h之后仍可以檢測到熒光信號(hào)。而且,當(dāng)串聯(lián)的MGA與其他熒光mRNA及RNA適配體一起使用時(shí),這種強(qiáng)的MG熒光信號(hào)不會(huì)被干擾。
MGA與配體的結(jié)合親和力高、特異性強(qiáng),MGA依賴配體誘導(dǎo)結(jié)合與自適應(yīng)結(jié)合的方式將MG包裹在結(jié)合口袋中并顯著增強(qiáng)MG的熒光信號(hào),通過MG與MGA的結(jié)合即可實(shí)現(xiàn)MG及其他靶物質(zhì)的熒光檢測。MG-MGA生物傳感器克服了傳統(tǒng)的熒光標(biāo)記檢測中背景信號(hào)強(qiáng)的缺陷,方便、快速且檢測靈敏度高。
目前,已經(jīng)篩選得到的MGA數(shù)量較少,篩選方式單一,對于MGA的研究主要停留在實(shí)驗(yàn)室水平且實(shí)際應(yīng)用較少,無法滿足日漸拓寬的檢測需求。因此,可以借助更多的篩選方式進(jìn)行MGA的篩選,得到更多具有優(yōu)良生物學(xué)特性的MGA;同時(shí),也可以通過對MGA進(jìn)行劈裂、截短,提高其穩(wěn)定性及環(huán)境耐受性,促進(jìn)MGA更好的應(yīng)用到實(shí)際檢測中,為生物傳感、熒光成像、疾病診斷等研究領(lǐng)域提供穩(wěn)定、可靠地檢測手段。由于MG的高毒性,MG-MGA生物傳感器在體內(nèi)檢測中的應(yīng)用受到限制,考慮是否可以對MG的結(jié)構(gòu)進(jìn)行改造,從而產(chǎn)生毒性低且能與MGA高親和的MG結(jié)構(gòu)衍生物,再通過MG衍生物與MGA的結(jié)合來實(shí)現(xiàn)靶物質(zhì)的體內(nèi)檢測。同時(shí),可將MGA與納米粒子相結(jié)合來改變納米酶的活性,從而調(diào)控納米酶的催化活性,拓寬納米酶的催化范圍,實(shí)現(xiàn)高靈敏度的靶物質(zhì)檢測。此外,MGA還可以通過一定的擴(kuò)增手段形成水凝膠并進(jìn)入水生生物的細(xì)胞內(nèi),實(shí)現(xiàn)對于水生生物體內(nèi)MG含量的檢測。