張永兵 范向斌 牙生·艾爾肯 馬新力 伊鴻平 吳明珠
張永兵,吳明珠(編譯)
(新疆農(nóng)業(yè)科學院哈密瓜研究中心 烏魯木齊 830091)
目的與意義: 適應于原產(chǎn)地的地方品種是甜瓜種質(zhì)保存和遺傳改良的重要資源,詳細了解這些地方品種的遺傳變異對于新疆甜瓜種質(zhì)資源的多樣性保護和重要農(nóng)藝性狀的遺傳改良具有重要的意義。本文利用SSR標記方法對新疆甜瓜地方品種進行遺傳多樣性分析,并比較新疆3個主要生態(tài)地區(qū)東疆、南疆和北疆地方品種的遺傳關系,為更好的理解我國甜瓜地方種質(zhì)資源遺傳變異的分布提供依據(jù)。
材料與方法: 利用36個已在甜瓜遺傳特性鑒定中應用的SSR標記,對35份新疆甜瓜地方品種進行擴增檢測,SSR擴增位點的電泳檢測結(jié)果最終轉(zhuǎn)化為“0”、“1”數(shù)據(jù)矩陣。利用軟件PowerMarker (3.25) 計算等位位點數(shù)量、基因多樣性指數(shù)(GD)、觀察雜合度和多態(tài)性信息量(PIC)等參數(shù),利用軟件NTSYS-PC (2.10e)計算供試材料間的Jaccard遺傳相似系數(shù)(JC),基于JC數(shù)據(jù)的UPGMA聚類分析和PCA主成分分析分別在軟件NTSYS-PC (2.10e)的SAHN模塊和DCENTER、EIGEN、MOD3D算法下完成。
結(jié)果與分析: 36個SSR標記中,分布在甜瓜9個連鎖群上的19個SSR標記具有多態(tài)性,共擴增出55個等位基因。通過分析19個多態(tài)性SSR位點的55個等位基因,表明:(1)每個位點擴增的等位基因數(shù)2~5個、平均2.8個,GD指數(shù)的范圍0.06~0.71、平均值為0.42,PIC值的范圍0.05~0.65、平均0.36。除了CMTC168、CMCTN4、CMCTN35、CMTCN41和CMCTN65 5個位點外,其余14個位點均能檢測到表現(xiàn)雜合的地方品種,雜合度數(shù)值范圍為0.06~0.97,平均雜合度為0.22。(2)3個生態(tài)地區(qū)中,東疆的地方品種擴增的多態(tài)性位點比例和等位基因數(shù)量最高,分別達89.47%和2.75個,GD指數(shù)和PIC值最高,分別為0.45和0.39;而來自南疆的地方品種雜合度最高。(3)來自東疆的地方品種中擴增出11個特異的等位基因,特異等位基因占20.0%;而來自南疆和北疆的地方品種則分別擴增出2個特異等位基因,比例為3.6%。(4)地方品種間的JC系數(shù)為0.20~0.96,平均值為0.51,‘黃旦子和‘哈密野瓜之間的JC值最小、‘塞里拜爾和‘阿合奇晚熟間的JC值最大,表明‘黃旦子和‘哈密野瓜遺傳距離較遠,而來自南疆的‘塞里拜爾和‘阿合奇晚熟具有相似的遺傳背景。(5)UPGMA聚類分析中,除野生甜瓜‘哈密野瓜外,其余地方品種被聚為3個類群,類群一與另外2個類群遺傳距離較遠,類群一內(nèi)有2個東疆的地方品種;類群二包含了大部分地方品種,這些地方品種分別來自3個生態(tài)地區(qū),又被劃分為5個亞群,除亞群一和亞群五內(nèi)的地方品種均來自南疆外,其余3個亞群的地方品種來自2個生態(tài)地區(qū);類群三內(nèi)的3個地方品種分別來自3個生態(tài)地區(qū)。(6)PCA分析的第一、二和三維度分別代表了12.4%、9.4%和8.1%的可解釋變異百分比,分析結(jié)果與聚類結(jié)果一致,大多數(shù)來自南疆地區(qū)的地方品種具有聚在一起的趨勢,但與另外2個生態(tài)地區(qū)的地方品種間沒有明顯的界線;來自東疆的地方品種散布區(qū)域較大,呈現(xiàn)出較大的遺傳變異。
結(jié) 論: 除野生甜瓜‘哈密野瓜外,新疆甜瓜地方品種應被劃分為栽培甜瓜中var. inodorus 和 var. cantalupensis 2個變種,由于收集保存前這些地方品種都是開放授粉,因此這2種基因型的地方品種間沒有顯著的差異界限。新疆甜瓜地方品種資源具有較高的遺傳變異和遺傳多樣性,表明我國西部是栽培甜瓜的初生或次生中心之一。此外,新疆不同生態(tài)地區(qū)的地方品種中檢測到一定數(shù)量的特異等位基因,以上結(jié)果說明新疆甜瓜地方品種資源是甜瓜種質(zhì)多樣性維持和今后育種研究的重要基礎。