趙巧雅,吳 靜,姜亦飛,孫海濤,譚善杰,黃 兵
(1.山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所,濟(jì)南 250023;2.山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,濟(jì)南 250100;3.臨沂市畜牧獸醫(yī)局,山東 臨沂 276001)
家兔鼻炎是規(guī)?;B(yǎng)兔場和個體養(yǎng)殖戶經(jīng)常發(fā)生的臨床癥狀,其病因極為復(fù)雜,直接影響家兔出欄率,給養(yǎng)兔戶造成一定的經(jīng)濟(jì)損失[1]。傳統(tǒng)微生物鑒定方法主要是通過革蘭氏染色鏡檢、生化反應(yīng)以及利用伯杰氏手冊等材料進(jìn)行對比分析,存在精度低、不利于大批量菌群分析鑒定等缺點(diǎn)[2-3]。而16S rRNA存在于所有細(xì)菌染色體中,利用16S rRNA測序技術(shù)對樣品中的細(xì)菌進(jìn)行系統(tǒng)鑒定,具有高通量、可實(shí)現(xiàn)不可培養(yǎng)細(xì)菌的準(zhǔn)確鑒定等一系列優(yōu)勢[4]。本試驗(yàn)采用傳統(tǒng)方法結(jié)合測序?qū)Ρ茄装Y狀兔的帶菌情況進(jìn)行了分析,為兔場防治及合理治療提供依據(jù)。
從山東某規(guī)模化兔場出現(xiàn)鼻炎癥狀兔中隨機(jī)采集鼻腔棉拭子25份,12 h內(nèi)進(jìn)行細(xì)菌分離培養(yǎng)。
pMD-18T克隆載體購自TAKARA公司;PCR擴(kuò)增試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒均購自Axygen公司,酵母粉、胰蛋白胨、瓊脂粉等細(xì)菌培養(yǎng)基及其他試劑均購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
將樣品在SC肉湯(亞硒酸鹽-半胱氨酸肉湯)中,37℃、18~24 h預(yù)增菌進(jìn)行選擇性培養(yǎng)后,用接種環(huán)以劃線形式接種到5%胎牛血清培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)過夜。在培養(yǎng)基上分別挑取典型或可疑菌落,革蘭氏染色鏡檢。
取單個細(xì)菌菌落懸浮于50 μL生理鹽水作為模板,使用16S通用引物27F(AGAGTTTGATCCTGGCTCAG)和 1492R(TACGGYTACCTTGTTACGACTT)進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。反應(yīng)體系:模板 1μL,上下游引物(20 pmol/μL)各0.5 μL,2×Taq PCR Mix 12.5 μL,補(bǔ)充去離子水至 25 μL。PCR 反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性 5 min,94℃變性 40 s、53℃復(fù)性 40 s、72℃延伸 1 min,35個循環(huán),最后 72℃預(yù)變性10 min。將PCR產(chǎn)物克隆到pMD-18T載體上,送北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司測序分析。
無菌條件下將純培養(yǎng)的細(xì)菌按照WHO推薦的瓊脂紙片擴(kuò)散法(K-B)[5],分別挑取分離的純培養(yǎng)菌的單菌落用無菌生理鹽水稀釋,吸取200 μL菌液均勻涂布于普通瓊脂平板,用無菌小鑷子夾取各類藥敏片,平貼于平板表面,37℃培養(yǎng)24 h,測定抑菌圈大小,藥敏結(jié)果按NCCLS標(biāo)準(zhǔn)作出判定。
各分離菌株經(jīng)常規(guī)培養(yǎng)、顯微鏡觀察后初步分離出151個菌株,分別編號為A1、A2…A151,部分菌落形態(tài)及細(xì)菌形態(tài)如圖1所示。
圖1部分檢出菌鏡檢圖
對所有分離菌進(jìn)行16S PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%凝膠瓊脂電泳驗(yàn)證,均成功擴(kuò)增。將測序結(jié)果輸入GenBank進(jìn)行同源性檢索,所有分離株與對應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)菌株的同源性均在94%~100%之間?;驕y序結(jié)果顯示,大部分菌株為大腸桿菌、金黃色葡萄球菌和奇異變形桿菌,此外還檢測出鮑曼不動桿菌、波氏桿菌、枯草芽孢桿菌、多殺性巴氏桿菌以及綠膿桿菌等,各類菌數(shù)量及所占百分比如表1。
對8種鑒定菌進(jìn)行藥敏試驗(yàn),結(jié)果如表2所示。所有檢出菌對紅霉素、磺胺異噁唑的耐藥率最高,其次為阿奇霉素和慶大霉素。所有分離菌均對阿米卡星不耐藥。枯草芽孢桿菌對15種抗生素敏感性均較高。
表1各分離菌數(shù)量及百分比
表2鑒定菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果
近年來,隨著兔規(guī)?;B(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,兔鼻炎的發(fā)病率呈上升趨勢,直接影響兔群的出欄率,且病因極為復(fù)雜[6]。本試驗(yàn)從山東省某兔場25只鼻炎癥狀兔的鼻腔棉拭子中分離得到了151株細(xì)菌,經(jīng)16S rRNA基因測序及序列比對,發(fā)現(xiàn)大腸桿菌、多殺性巴氏桿菌、金黃色葡萄球菌、奇異變形桿菌等8種細(xì)菌為主要菌群。根據(jù)臨床癥狀、各分離菌的種類及所占比例,該場鼻炎兔的病原菌疑為多殺性巴氏桿菌、波氏桿菌及金黃色葡萄球菌混合感染。
本研究的藥敏試驗(yàn)結(jié)果表明,所有檢出菌對紅霉素、磺胺異噁唑的耐藥率最高,所有分離菌均對阿米卡星不耐藥,可對該場及該地區(qū)鼻炎兔的用藥治療提供參考及指導(dǎo)作用。本研究與朱芝秀等[7]、曾彥欽等[8]報道中的同類細(xì)菌的藥敏結(jié)果存在較大差異,這是由于臨床用藥的差異,以及各養(yǎng)殖場、各地區(qū)對細(xì)菌的種類和耐藥譜差異很大。因此,建議規(guī)范管理兔場及合理使用抗生素,定期對分離菌株進(jìn)行抗生素敏感性檢測,對有效防止兔場疾病發(fā)生有重要意義。