NDIKUBWIMANA Jean de Dieu,邵侃凱,高曉冬,中西秀樹(shù)
(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無(wú)錫 214122)
基因組測(cè)序表明,在真核生物中,囊泡融合機(jī)制是高度保守的,SNARE蛋白是膜融合蛋白中的重要成員。SNARE蛋白是保守性很強(qiáng)的蛋白家族,經(jīng)常被分為 Q-SNARE蛋白和 R-SNARE蛋白[1]。SNARE蛋白位于特定的膜上,只有當(dāng)Q-SNARE蛋白 R-SNARE蛋白結(jié)合時(shí),泡膜才能融合[1-2]。SNARE蛋白最初是從神經(jīng)元細(xì)胞中分離得到,在突觸囊泡融合中,syntaxin-1和 SNAP-25扮演 QSNARE角色,synaptobrevin則扮演著R-SNARE角色[1-2]。當(dāng)囊泡膜上的synaptobrevin與syntaxin-1和SNAP-25結(jié)合在一起時(shí),突觸囊泡中的神經(jīng)遞質(zhì)就會(huì)釋放出來(lái),傳遞給突觸末段。和突觸囊泡融合SNARE蛋白同源物類(lèi)似,在釀酒酵母細(xì)胞中,QSNARE蛋白Sso1/2和Sec9與R-SNARE蛋白Snc1/2結(jié)合在一起,形成一個(gè)平行的四螺旋復(fù)合體從而導(dǎo)致酵母細(xì)胞膜融合的進(jìn)行[2-3]。
肉毒神經(jīng)毒素(BotuIinum Neurotoxin,BoNT)是由厭氧梭狀肉毒芽胞桿菌屬生長(zhǎng)過(guò)程中分泌的多分子復(fù)合物外毒素[4],肉毒神經(jīng)毒素根據(jù)α-血清中和能力分為A-G7種亞型[5],絕大部分脊椎動(dòng)物只要攝入微量即可引起肉毒中毒[6]。肉毒神經(jīng)毒素是目前已知毒性最強(qiáng)的神經(jīng)毒素,被美國(guó)疾病控制預(yù)防中心(CDC)列為A級(jí)生物恐怖劑[7]。肉毒神經(jīng)毒素是AB結(jié)構(gòu)的神經(jīng)毒素,由輕鏈(LC,~50 kDa)和重鏈(HC,~100 kDa)通過(guò)二硫鍵結(jié)合在一起組成[8]。輕鏈由一個(gè)鋅離子依賴的金屬蛋白酶區(qū)域組成,它可以降解 SNARE蛋白;肉毒神經(jīng)毒素類(lèi)型A,C,E可以降解 SNAP25,類(lèi)型 B,D,F(xiàn),G 降解 VAMP-2,另外類(lèi)型C還可以降解Syntaxin 1a[9-13]。重鏈由兩個(gè)區(qū)域組成:一個(gè) N 端轉(zhuǎn)運(yùn)結(jié)構(gòu)域(HCT,~50 kDa)和一個(gè) C 端受體結(jié)合區(qū)域(HCR,~50 kDa)[14]。 HCR 進(jìn)一步分為HCRN和HCRC兩個(gè)更小的區(qū)域。HCRN沒(méi)有功能活性,但可能參與調(diào)整HCT最優(yōu)的幫助輕鏈進(jìn)入宿主細(xì)胞,而HCRC介導(dǎo)肉毒神經(jīng)毒素結(jié)合到宿主受體[15-16]。Lacy和Stevens解決了肉毒神經(jīng)毒素A的晶體結(jié)構(gòu)[17]。
BoNT不僅僅是一種神經(jīng)毒素,它還可以作為一種治療藥物。早在1954年,Brooks發(fā)現(xiàn)在極度活躍的肌肉注射少量的BoNT/A會(huì)破壞運(yùn)動(dòng)神經(jīng)末梢乙酰膽堿的釋放,從而引起短暫的肌肉松弛[18]。這一發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致了第1次使用BoNT/A作為治療藥物替代傳統(tǒng)手術(shù)治療人類(lèi)斜視[19]。這些開(kāi)創(chuàng)性的研究后,治療用BoNT/A擴(kuò)展到各種各樣由于功能失調(diào)的膽堿能終端引起的神經(jīng)障礙,例如痙攣性斜頸、眼瞼痙攣、面部癱瘓、肌張力障礙和痙攣狀態(tài)[20-21]。BoNT/A還用于美容治療和頭痛治療[22]。
雖然目前有不少關(guān)于BoNT/A的研究,但關(guān)于BoNT/A抗性藥物及其作為藥物用于醫(yī)用治療并不是十分成熟,而且沒(méi)有關(guān)于酵母肉毒中毒的研究。本研究在釀酒酵母細(xì)胞中表達(dá)了BoNT/A輕鏈,在釀酒酵母中來(lái)研究BoNT/A輕鏈的功能及其能否降解Sec9蛋白。
釀酒酵母出發(fā)菌株Saccharomyces cerevisiaeYPH499,BoNT/A 表達(dá)用質(zhì)粒 pRS426-GAL1pr,SEC9表達(dá)用質(zhì)粒pRS414-TEFpr及引物相關(guān)信息見(jiàn)表1。SEC9基因由HXS 33和HXS 34引物PCR獲得,△Nsec9基因由HXO 573和HXS 34引物PCR獲得,BoNT/A基因由HXO 72和HXO 73引物PCR獲得,BoNT/AE224Q由 HXS 76和 HXS 77引物PCR獲得。
限制性內(nèi)切酶、DNA T4連接酶及Ligation Mix連接酶購(gòu)于 TaKaRa公司 (大連);KOD-Plus Neo DNA聚合酶購(gòu)于東洋紡公司(上海);PCR產(chǎn)物純化試劑盒、質(zhì)粒小量抽提試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒及脫脂奶粉購(gòu)于上海生工;ClarityTM Western ECL Substrate顯色劑、SDS-PAGE凝膠配制試劑盒購(gòu)于碧云天生物技術(shù)研究所;Mouse anti-HA一抗、Goat anti-mouse IGg-HRP二抗購(gòu)于北京全式金生物技術(shù)有限公司,v5抗體購(gòu)于近岸蛋白質(zhì)科技有限公司 (上海),PVDF膜購(gòu)于美國(guó)伯樂(lè)公司。無(wú)水甲醇、無(wú)水乙醇及異丙醇等其他試劑均為進(jìn)口分裝或國(guó)產(chǎn)分析純。
壓力蒸汽滅菌器(立式)購(gòu)于上海申安器械廠;電泳儀購(gòu)于北京六一儀器廠;pH計(jì)、電子天平購(gòu)于梅特勒-托利多儀器公司(上海);無(wú)菌操作臺(tái)、恒溫培養(yǎng)箱購(gòu)于上海三發(fā)科學(xué)儀器公司;恒溫?fù)u瓶柜購(gòu)于江蘇太倉(cāng)強(qiáng)樂(lè)設(shè)備廠;PCR儀、移液槍購(gòu)于德國(guó)Eppendorf公司;凝膠成像系統(tǒng)購(gòu)于美國(guó) Bio-Rad公司;半干電轉(zhuǎn)儀、SDS-PAGE凝膠電泳儀購(gòu)于美國(guó)伯樂(lè)公司;紫外分光光度計(jì)、ImageQuantTMLAS 400 mini購(gòu)置于美國(guó)GE公司;熒光倒置顯微鏡購(gòu)自日本尼康公司。
表1 本研究所用的菌株、質(zhì)粒和引物Table 1 Lists of strains,plasmids and primers used in this study
1)YPAD 培養(yǎng)基:酵母抽提物(Yeast Extract)20 g/L,蛋白胨(Peptone)10 g/L,腺嘌呤(Adeline)30 mg/L,瓊脂粉(Agar)20 g/L(固體培養(yǎng)基),葡萄糖20 g/L。 2)LB 培養(yǎng)基:胰蛋白胨(Tryptone)10 g/L,酵母抽提物 5 g/L,氯化鈉(NaCl)10 g/L,瓊脂粉(Agar)20 g/L (固體培養(yǎng)基);3)YNB 選擇培養(yǎng)基:YNB(Yeast Nitrogen Base without Amino Acids)6.7 g/L,缺陷型粉末2 g/L,葡萄糖20 g/L,瓊脂粉20 g/L(固體培養(yǎng)基)。SG培養(yǎng)基是用半乳糖代替葡萄糖。4)8 mol/L 尿素:480.48 g 尿素,8.766 g NaCl,25 mmol/L(pH 8.0),加去離子水定容至 1 L。 5)TBST溶液:5 mol/L NaCl 30 ml,1 mol/L Tris·HCl(pH 8.0)10 mL,Tween20 500 uL,加去離子水定容至 1 L。6)5%脫脂牛奶:稱取5g脫脂奶粉,用TBST定容至100mL。7)轉(zhuǎn)膜緩沖溶液:稱取甘氨酸 14.4 g,Tris·HCl 3.03g,量取無(wú)水甲醇200 mL,加去離子水定容至1 L。
1.5.1 細(xì)胞生長(zhǎng)分析將質(zhì)粒pRS426-GALpr,pRS426-GALpr-BoNT/A轉(zhuǎn)化至YPH499細(xì)胞中,在SD尿嘧啶缺陷平板上篩選陽(yáng)性克隆。將陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子在以葡萄糖為碳源的尿嘧啶缺陷培養(yǎng)平板劃線培養(yǎng)48 h,分別用牙簽挑取不同的轉(zhuǎn)化子在以葡萄糖和半乳糖為碳源的尿嘧啶缺陷平板上劃線,在30℃培養(yǎng)3 d,觀察細(xì)胞的生長(zhǎng)情況。
1.5.2 蛋白質(zhì)提取將不同細(xì)胞接種在5 mL以葡萄糖為碳源的SD尿嘧啶培養(yǎng)基中于 30℃培養(yǎng)至OD660=1.0,收集細(xì)胞轉(zhuǎn)移至25 mL以葡萄糖為碳源的SD尿嘧啶培養(yǎng)基上于30℃培養(yǎng)至OD660=1.0,收集細(xì)胞轉(zhuǎn)移至30 mL以半乳糖為碳源的SD尿嘧啶培養(yǎng)基中,起始OD660=0.2,30℃培養(yǎng)至OD660=0.8~1.0。不同轉(zhuǎn)化子收集相同數(shù)量的細(xì)胞,用去離子水洗細(xì)胞1次,加8 mol/L尿素緩沖溶液和蛋白酶抑制劑PMSF,加玻璃珠震蕩破碎細(xì)胞,15 000 g,離心10 min取上清即為所提取蛋白。用BCA試劑盒測(cè)定蛋白質(zhì)濃度。
1.5.3 蛋白質(zhì)免疫印跡
1)電泳:取100 μg蛋白樣品上樣跑電泳,濃縮膠電壓 80 V,30 min,分離膠電壓 120 V,60 min。 2)轉(zhuǎn)膜:采用半干式轉(zhuǎn)膜方式,電壓25 V,電流1.0 A,時(shí)間30 min。3)封閉:5% 的脫脂奶粉封閉 1 h。4)孵育抗體:一抗 1∶5 000,室溫 1 h;二抗 1∶5 000 室溫 1 h。5)顯色:ECL顯色液A和B混勻,涂于膜上,用ImageQuant LAS4000mini顯色。
在人體內(nèi),BoNT/A作用于神經(jīng)元細(xì)胞內(nèi)腔,特異性降解突觸體相關(guān)蛋白SNAP25抑制神經(jīng)遞質(zhì)釋放從而導(dǎo)致相關(guān)疾病,而酵母細(xì)胞中存在SNAP25的同源蛋白Sec9。盡管酵母是真核生物,是研究真核生物的模式生物,但是酵母細(xì)胞和哺乳動(dòng)物細(xì)胞存在很大的差異,不知能否在酵母中檢測(cè)到BoNT/A的表達(dá)?在釀酒酵母YPH499細(xì)胞中表達(dá)BoNT/A是否會(huì)抑制酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)?如圖1所示,在釀酒酵母YPH499細(xì)胞中半乳糖誘導(dǎo)培養(yǎng)8 h之后可以檢測(cè)到表達(dá)的BoNT/A,表達(dá)BoNT/A會(huì)抑制酵母細(xì)胞的生長(zhǎng),這種抑制作用可能是因?yàn)锽oNT/A過(guò)表達(dá)在酵母細(xì)胞中累積對(duì)細(xì)胞有毒害作用;也可能是因?yàn)檫^(guò)表達(dá)BoNT/A降解酵母細(xì)胞中膜融合所需要的SNARE蛋白或其他生長(zhǎng)必需蛋白。
圖1 BoNT/A抑制釀酒酵母YPH499生長(zhǎng)Fig.1 BoNT/A inhibits the growth of yeast
為了研究在酵母細(xì)胞中BoNT/A的活性位點(diǎn)Glu224突變?yōu)镚ln后,突變的BoNT/A表達(dá)水平穩(wěn)定性有無(wú)影響,對(duì)酵母的生長(zhǎng)有無(wú)影響。如圖2所示,當(dāng)活性位點(diǎn)突變后,突變體BoNT/A表達(dá)水平穩(wěn)定性幾乎沒(méi)有變化,并且不抑制釀酒酵母的生長(zhǎng)。與本研究結(jié)果類(lèi)似,Kukreja等研究發(fā)現(xiàn),BoNT/A的催化活性區(qū)域HEXXH的Glu224突變成Gln后,BoNT/A的催化活性完全失去[23],這都說(shuō)明BoNT/A對(duì)釀酒酵母的生長(zhǎng)抑制作用是通過(guò)其水解酶催化活性來(lái)實(shí)現(xiàn)的。
圖2 BoNT/A活性突變體不抑制釀酒酵母YPH499生長(zhǎng)Fig.2 BoNT/A mutant does not inhibit the growth of yeast
圖3 在sec9△中過(guò)表達(dá)Sec9可以回補(bǔ)酵母的生長(zhǎng)Fig.3 Overexpression of Sec9 in sec9△could rescue the yeast growth
由于SEC9是酵母生長(zhǎng)必須基因,在YPH499中敲除SEC9基因的酵母不能生長(zhǎng),因此我們?cè)诮湍钢邢葘?dǎo)入一個(gè)pRS316-SEC9質(zhì)粒在敲除SEC9基因。如圖 3所示,sec9△(pRS316-SEC9)中導(dǎo)入pRS414TEF-SEC9質(zhì)粒,5-FOA移除pRS316-SEC9質(zhì)粒后 sec9△(pRS414TEF-SEC9)仍可以生長(zhǎng),這說(shuō)明pRS414TEF-SEC9質(zhì)??梢栽诮湍钢斜磉_(dá)并能回補(bǔ)sec9△菌株的生長(zhǎng)。
從圖2可知,BoNT/A對(duì)酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)抑制作用是基于其水解酶蛋白活性。在動(dòng)物細(xì)胞中SNAP25是BoNT/A的降解底物,而在酵母中只有SNAP25的同源基因SEC9,因此,為了探究Sec9蛋白是否會(huì)被BoNT/A降解,本文在酵母中過(guò)表達(dá)Sec9蛋白,觀察是否能回補(bǔ)被BoNT/A抑制的酵母的生長(zhǎng)。如圖4所示,過(guò)表達(dá)Sec9可以回補(bǔ)被BoNT/A抑制的酵母的生長(zhǎng)。
圖4 過(guò)表達(dá)Sec9可以回補(bǔ)BoNT/A對(duì)釀酒酵母YPH499的抑制Fig.4 Overexpression of Sec9 could rescue the inhibition of BoNT/A to YPH499
本研究在釀酒酵母細(xì)胞中表達(dá)了BoNT/A,研究發(fā)現(xiàn),在釀酒酵母細(xì)胞中BoNT/A通過(guò)其水解酶活性抑制酵母細(xì)胞的生長(zhǎng),當(dāng)活性位點(diǎn)被突變,失去水解酶活性的BoNT/A不會(huì)抑制酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)??梢岳媒湍讣?xì)胞研究BoNT/A的功能,同時(shí)還可以在酵母細(xì)胞中進(jìn)行BoNT/A抗性藥物的篩選。同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn),在表達(dá)BoNT/A的釀酒酵母細(xì)胞中過(guò)表達(dá)Sec9蛋白可以解除BoNT/A對(duì)酵母細(xì)胞的生長(zhǎng)抑制作用??梢酝茰y(cè)Sec蛋白可能是BoNT/A在酵母細(xì)胞中的識(shí)別底物,BoNT/A是通過(guò)降解Sec9蛋白從而抑制酵母的生長(zhǎng)。本研究為酵母中肉毒神經(jīng)毒素的研究提供了一定的理論依據(jù),可以通過(guò)在酵母中表達(dá)肉毒神經(jīng)毒素,可以對(duì)其功能進(jìn)行進(jìn)一步研究,可以在酵母中建立肉毒神經(jīng)毒素篩選系統(tǒng),還可以探索在酵母中是否存在肉毒神經(jīng)毒素新的降解底物。