劉希旻,楊海霞,黃靈曦,李曉雁,權(quán)桂芝,楊紅澎,黃海東,通信作者
一株高效解磷假單胞菌的分離鑒定及解磷特性
劉希旻1,楊海霞1,黃靈曦1,李曉雁2,權(quán)桂芝1,楊紅澎1,黃海東1,通信作者
(1. 天津農(nóng)學(xué)院 農(nóng)學(xué)與資源環(huán)境學(xué)院,天津 300384;2. 天津農(nóng)學(xué)院 食品科學(xué)與生物工程學(xué)院,天津 300384)
磷是植物生長所必需的重要元素之一,土壤中的磷大都以難溶性磷的形式存在,難以被植物吸收利用。為提高鹽堿地中磷的利用率,從天津濱海新區(qū)鹽堿地土壤中篩選解磷細菌,在無機磷固體平板上分離得到一株能產(chǎn)生明顯溶磷圈的菌株LQH-7,其溶磷指數(shù)為2.86,形態(tài)學(xué)、生理生化和基于16S rDNA基因序列的分子鑒定結(jié)果表明,LQH-7為維羅尼假單胞菌,與CIP 104663的同源性為99.65%。在初始pH為8.0,NaCl質(zhì)量分數(shù)為0.5%的無機磷培養(yǎng)基中,30 ℃搖瓶發(fā)酵60 h,菌株LQH-7發(fā)酵液的pH為4.30,解磷量最高可達850.1 mg/L,說明該菌株在鹽堿地土壤生物修復(fù)方面具有潛在的應(yīng)用價值。
解磷菌;維羅尼假單胞菌;菌種鑒定;解磷能力
磷是植物生長不可缺少的元素,參與細胞代謝和能量傳遞,缺磷易造成植物生長緩慢、成熟延遲和產(chǎn)量降低[1]。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中以施用化肥來增加土壤中的有效磷含量,但磷肥在土壤中的利用率很低,大量磷元素會轉(zhuǎn)化為難溶性的磷酸鹽而被土壤固定,造成土壤的潛在磷庫很大,卻仍然表現(xiàn)出“遺傳學(xué)缺磷”[2]。解磷菌能將被土壤固定的難溶性磷轉(zhuǎn)化為植物可利用的有效磷[3-4],在農(nóng)田中施用含有解磷菌的菌肥,在不增加土壤磷庫的情況下,可提供更多的磷元素供作物生長,解磷菌還能在作物根際周圍快速繁殖,抑制其他病原微生物的生長,減輕作物病害[5]。國內(nèi)外研究者對解磷菌進行了大量研究,篩選到的解磷菌包括芽孢桿菌屬()、假單胞菌屬()、腸桿菌屬()、無色桿菌屬()、節(jié)桿菌屬()等的一些菌株[6-9],這些解磷菌大多從普通土壤中篩選得到,對環(huán)境的適應(yīng)范圍有限,將解磷菌開發(fā)為菌肥就需要篩選適應(yīng)不同土壤類型和溫度條件的微生物[10-11]。本研究中將從鹽堿地土壤中分離得到的一株高效解磷菌LQH-7進行分類鑒定,研究其解磷特性,以期為今后制作微生物菌劑提供菌種資源,并為解決鹽堿地土壤固磷強度高的問題以及提高鹽堿地作物產(chǎn)量提供支持。
土樣采自天津市濱海新區(qū)鹽堿地土壤,北緯39°4'57",東經(jīng)117°42'8"。
細菌基因組DNA提取試劑盒、酶、質(zhì)粒提取試劑盒、普通DNA產(chǎn)物純化試劑盒、pGM-T克隆試劑盒均購自北京天根公司,鉬酸銨、丙酮酸鈉、冰乙酸、抗壞血酸均為分析純。
無機磷培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖10,硫酸銨0.5,酵母浸粉0.5,氯化鈉0.3,氯化鉀0.3,硫酸鎂0.3,硫酸亞鐵0.03,硫酸錳0.03,磷酸鈣5,瓊脂15,pH 9.0±0.2。
R2A培養(yǎng)基(g/L):酵母膏0.5,蛋白胨0.5,酸水解酪素0.5,磷酸氫二鉀0.3,葡萄糖0.5,可溶性淀粉0.5,丙酮酸鈉0.3,硫酸鎂0.05,瓊脂15,pH 8.0±0.2。
LB培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 0.5,瓊脂15,pH 7.0~7.5。
1.3.1 解磷菌的篩選
取10 g土樣,加90 mL無菌水渦旋振蕩10 min,靜置5 min后將上層懸液進行倍比稀釋,取100 μL涂布于添加磷酸鈣的無機磷培養(yǎng)基表面,30 ℃培養(yǎng)72 h,觀察解磷圈。溶磷指數(shù)(SPI, soluble phosphorus index)=(菌落直徑+解磷圈直徑)/菌落直徑。篩選SPI大的菌落進行分離純化,并保存于-80 ℃冰箱中。
1.3.2 菌種鑒定
1.3.2.1 菌株的形態(tài)學(xué)及生理生化特征測定
菌株的形態(tài)學(xué)觀察及接觸酶、脲酶、七葉苷水解、熒光色素和甲基紅試驗等生理生化指標的測定參考文獻[12]進行。
1.3.2.2 菌株的16S rDNA基因序列測定及系統(tǒng)進化分析
利用細菌DNA提取試劑盒提取試驗菌株的基因組DNA,采用細菌16S rDNA基因擴增通用引物8F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)進行PCR擴增, 95 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性45 s,60 ℃退火45 s,72 ℃延伸1 min,共30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測后,用DNA產(chǎn)物純化試劑盒純化PCR產(chǎn)物,與pGM-T載體連接后,轉(zhuǎn)化至TOP10感受態(tài)細胞中,在含 IPTG和X-Gal的LB平板上37 ℃過夜培養(yǎng),挑取白色單菌落,驗證并送上海生工進行測序。將得到的16S rDNA序列與GenBank中的核酸數(shù)據(jù)進行BLAST比對,得到與其同源性較高的相關(guān)序列,用軟件ClustalX 1.8對所獲得的核苷酸序列進行分析,得到序列之間的相似值;利用軟件 MEGA 2.0計算出序列的系統(tǒng)進化距離,用鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹[13]。
1.3.3 可溶性磷含量的測定
取1.0 mL發(fā)酵液,于4 ℃,10 000 r/min離心5 min,取上清液稀釋至合適倍數(shù),用鉬藍比色法測定可溶性磷含量[14],計算公式為:=×15.91×。式中為發(fā)酵液中可溶磷含量(mg/L),為稀釋倍數(shù),為660 nm處吸光度值。
1.3.4 菌株LQH-7生長曲線及溶磷能力測定
取活化的菌株LQH-7接種于裝有100 mL無機磷液體培養(yǎng)基的250 mL三角瓶中,置于搖床中30 ℃,150 r/min培養(yǎng)84 h,以不接種的培養(yǎng)基為對照,每隔12 h無菌取樣,測定細胞濃度、pH值和可溶磷含量,每個樣品3個重復(fù)。
1.3.5 菌株LQH-7最適溶磷pH的確定
調(diào)節(jié)無機磷液體培養(yǎng)基的初始pH分別為4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0、11.0,接種菌株LQH-7,30 ℃,150 r/min搖床培養(yǎng)60 h后測定細胞濃度、pH值和可溶磷含量,每個樣品3次重復(fù)。
1.3.6 菌株LQH-7最適溶磷鹽質(zhì)量分數(shù)的確定
將菌株LQH-7分別接種于NaCl質(zhì)量分數(shù)為0、0.5%、1.0%、1.5%、2.0%、2.5%、3.0% pH為8.0的無機磷液體培養(yǎng)基中,30 ℃,150 r/min搖床培養(yǎng)60 h后,測定細胞濃度、pH值和可溶磷含量,每個樣品3次重復(fù)。
取天津市濱海新區(qū)鹽堿地土壤,用無機磷固體培養(yǎng)基平板進行解磷菌的分離篩選,得到1株能產(chǎn)生明顯溶磷圈的細菌,其溶磷指數(shù)(SPI)為2.86(圖1),將該菌株命名為LQH-7,并對其進行分類鑒定和解磷特性研究。
圖1 菌株LQH-7的溶磷圈
2.2.1 菌株LQH-7的形態(tài)特征
在R2A平板培養(yǎng)基上30 ℃培養(yǎng)2 d,菌株LQH-7形成邊緣整齊的白色菌落,表面光滑,凸起,直徑4.5~5.0 mm。菌株LQH-7的細胞大小為(0.6~0.8)μm ×(2.0~3.5)μm,桿狀(圖2)、無芽孢、革蘭氏陰性。
圖2 菌株LQH-7的細胞形態(tài)(×1 000)
2.2.2 菌株LQH-7的16S rDNA序列測定及系統(tǒng)進化分析
擴增得到菌株LQH-7的16S rDNA序列,長度為1 422 bp,在GenBank中的序列登記號為MK734421。將該序列在GenBank數(shù)據(jù)庫中進行BLAST比對,得到與其同源性高的序列信息,進而進行ClustalX1.8比對,并利用軟件MEGA 2.0的鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹(圖3)。結(jié)果表明,菌株LQH-7屬于屬,與劃分在同一個簇內(nèi),同源性最高的為
CIP 104663,達到99.65%,與CCM 2115同源性為99.02%,與ATCC 10844同源性為98.87%,根據(jù)目前的分子分類標準,判斷菌株LQH-7為(維羅尼假單胞菌)。
圖3 菌株LQH-7的16S rDNA序列系統(tǒng)進化樹
2.2.3 菌株LQH-7的生理生化特征
菌株LQH-7的生長溫度范圍為4~39 ℃。由表1可知,該菌株產(chǎn)熒光色素,石蕊牛奶試驗表現(xiàn)為酸凝現(xiàn)象,接觸酶、淀粉酶、脲酶、酪蛋白水解、V-P試驗、檸檬酸利用和吲哚產(chǎn)生為陽性;酯酶、甲基紅試驗、七葉苷水解呈陰性;與模式菌株CIP 104663在酯酶等指標上不同[15]。結(jié)合形態(tài)學(xué)、生理生化和基于16S rDNA的分子分類數(shù)據(jù),確定菌株LQH-7為維羅尼假單胞菌,是與該種模式菌株不同的菌株。
表1 菌株LQH-7的生理生化特征
項目結(jié)果項目結(jié)果 接觸酶+V-P試驗+ 酯酶-淀粉酶+ 檸檬酸鹽利用+吲哚產(chǎn)生+ 甲基紅試驗-七葉苷水解- 酪蛋白水解+石蕊牛奶酸凝 熒光色素+脲酶+
由圖4可知,菌株LQH-7在發(fā)酵培養(yǎng)36 h后達到最高菌量,細胞濃度為4.2×109cfu/mL,隨著培養(yǎng)時間的延長,LQH-7培養(yǎng)液的pH也隨之逐漸降低,培養(yǎng)60 h時,pH為4.67,此時解磷量最高,培養(yǎng)液中的可溶磷含量達到831.4 mg/L。60 h后培養(yǎng)液的pH穩(wěn)定在4.50左右,由于細胞代謝活力的降低,菌株的溶磷量開始下降。
圖4 培養(yǎng)時間對菌株LQH-7解磷量的影響
在初始pH為4.0~11.0的培養(yǎng)基中進行LQH-7的發(fā)酵培養(yǎng),結(jié)果如圖5所示。由圖5可以看出,pH在5.0~8.0 范圍內(nèi),培養(yǎng)60 h后細胞濃度均處在較高水平,在3.6×109cfu/mL以上。但更高的初始pH影響細胞的生長,且發(fā)酵液的最終pH上升,解磷量隨之下降。初始pH為8.0時,解磷量最高,比初始pH 7.0時的解磷量高9.4%,最終發(fā)酵液pH值為4.36。說明篩選得到的解磷菌LQH-7具有一定的耐堿性。
圖5 初始pH對菌株LQH-7解磷量的影響
菌株LQH-7的耐鹽試驗結(jié)果如圖6所示。由圖6可見,LQH-7解磷效果最佳時的NaCl質(zhì)量分數(shù)為0.5%,此條件下的細胞濃度最高,為6.1×109cfu/mL,發(fā)酵液pH為4.30,可溶磷含量也達到最高,為850.1 mg/L。LQH-7細胞生長可以耐受的NaCl質(zhì)量分數(shù)為2.5%,在鹽質(zhì)量分數(shù)為0~2.5%的條件下,LQH-7發(fā)酵液的最終pH均低于5.91,解磷量高于202.1 mg/L。當NaCl質(zhì)量分數(shù)為3.0%時,菌株LQH-7的生長和解磷能力均被抑制,發(fā)酵液最終pH為6.40,細胞濃度和可溶磷含量分別為最高值的7.6%和14.9%。
圖6 NaCl質(zhì)量分數(shù)對菌株LQH-7解磷量的影響
我國鹽堿地總面積達9 913萬hm2,約占全國土地面積的1/10[16]。磷元素利用率低是制約作物生長的主要因素之一。研究表明,解磷菌能夠通過產(chǎn)生有機酸,釋放土壤中固定的磷,為作物生長提供可利用的有效磷,同時降低作物根際的pH,增加作物的耐堿性[17]。假單胞菌是植物根系中較為活躍的一類解磷微生物,用作生物肥料可提高土壤中磷的利用率,增加作物產(chǎn)量。如,,,等對玉米、小麥、黃瓜、番茄都有較好的促生作用[18],而維羅尼假單胞菌的相關(guān)研究尚未見報道。
本研究從天津市濱海新區(qū)鹽堿土壤中篩選到一株高效解磷菌LQH-7,多項分類鑒定結(jié)果表明其為維羅尼假單胞菌(),在初始pH為8.0,NaCl質(zhì)量分數(shù)為0.5%的條件下,解磷量可達850.1 mg/L,與國內(nèi)外報道的一些高效解磷菌株P(guān)S-1[19],P9[20],RAF15[21]相比,LQH-7具有較高的解磷能力,且能適應(yīng)中度鹽漬化的土壤,說明篩選到的菌株在鹽堿地生物修復(fù)中具有很好的應(yīng)用潛力,對菌株LQH-7進行深入研究,可為適用于鹽堿地的微生物肥料研發(fā)提供新的菌種資源。
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Isolation and identification of a high-efficiency phosphate solubilizingand its phosphate solubilizing characteristics
LIU Xi-min1, YANG Hai-xia1, HUANG Ling-xi1, LI Xiao-yan2, QUAN Gui-zhi1,YANG Hong-peng1, HUANG Hai-dong1, Corresponding Author
(1. College of Agronomy and Resources Environmentt, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China; 2.College of Food Science and Bioengineering, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China)
Phosphorus is one of the important elements for plant growth. Plants cannot absorb enough phosphorus when a large amount of phosphorus in the soil exists in the form of insoluble state. To increase the utilization efficiency of phosphorus in saline-alkali, phosphate solubilizing bacteria were isolated from saline-alkali soil in Binhai New Area of Tianjin. Strain LQH-7, producing distinct soluble phosphorus circle with SPI 2.86, was isolated in inorganic phosphorus solid plate. Morphology, physiological-biochemical index and phylogenetic analysis based on 16S rDNA gene sequences showed that strain LQH-7 belonged to, exhibiting the highest sequence similarity withCIP 104663(99.65%). In inorganic phosphorus medium,under the fermentation conditions in which the initial pH was 8.0, NaCl content was 0.5%, temperature was 30 ℃ and fermentation time was 60 h, pH of strain LQH-7 fermentation broth reached 4.30 and the phosphate-solubilizing quantity reached its highest value, 850.1 mg/L, suggesting that LQH-7 is a potent candidate for bioremediation of saline-alkali soil.
phosphate solubilizing bacteria;; identification of bacteria; phosphate solubilizing ability
1008-5394(2019)04-0049-05
10.19640/j.cnki.jtau.2019.04.010
S154.38
A
2019-06-27
國家級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃項目(201910061002)
劉希旻(1998-),男,本科在讀,研究方向:生物技術(shù)。E-mail:XmLiu19980119@163.com。
黃海東(1972-),男,教授,博士,研究方向:資源與應(yīng)用微生物學(xué)。E-mail:hdhuang@tjau.edu.cn。
責(zé)任編輯:宗淑萍