• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看 ?

      亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物對(duì)人與昆蟲(chóng)GABA受體的選擇性研究

      2019-02-20 08:52:22陳佳麗王秀美田亞鋒鄭小嬌劉根炎
      關(guān)鍵詞:家蠅斜紋飛虱

      陳佳麗 ,翟 納 ,陳 達(dá) ,王秀美 ,田亞鋒 ,鄭小嬌 ,劉根炎*

      1.武漢工程大學(xué)化工與制藥學(xué)院,湖北 武漢 430205;

      2.綠色化工過(guò)程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(武漢工程大學(xué)),湖北 武漢 430205

      γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)是生物體神經(jīng)系統(tǒng)中重要的抑制性傳導(dǎo)遞質(zhì),通過(guò)與兩類(lèi)GABA受體(離子型和代謝型)結(jié)合而發(fā)揮生理作用。GABA受體是一種多功能的藥物作用靶標(biāo),與諸多神經(jīng)性疾病密切相關(guān)[1-2]。離子型GA?BA受體屬于配體門(mén)控氯離子通道,是重要的殺蟲(chóng)劑作用靶標(biāo)之一,如氟蟲(chóng)腈和林丹等均是作用于該受體的商品化農(nóng)用殺蟲(chóng)劑[3-4]。因此,離子型GABA受體一直是相關(guān)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。

      離子型GABA受體屬于Cys-loop超家族的一員,一般由5個(gè)同源或異源的亞基構(gòu)成。每個(gè)亞基含有1個(gè)較長(zhǎng)的N-端胞外區(qū)、4個(gè)疏水的跨膜區(qū)(TM1-TM4)和1個(gè)胞內(nèi)區(qū)[5]。GABA的結(jié)合位點(diǎn)位于親水的胞外區(qū),第二跨膜區(qū)(TM2)的大多數(shù)氨基酸殘基參與形成了離子通道。GABA與受體結(jié)合后,離子通道打開(kāi),氯離子流入細(xì)胞內(nèi)部,使細(xì)胞膜超極化,從而對(duì)生物體的神經(jīng)傳導(dǎo)產(chǎn)生抑制作用。2014年,Miller等[6]成功解析了人類(lèi) GABA受體一個(gè)亞型(β3同源五聚體)的三維結(jié)構(gòu),這一發(fā)現(xiàn)為GABA受體的研究提供了重要的科學(xué)依據(jù)。目前,19個(gè)哺乳動(dòng)物GABA受體的亞基已被鑒定[1]。對(duì)昆蟲(chóng)而言,至今只發(fā)現(xiàn)了3種亞基:RDL(resistance to dieldrin,RDL 亞基),GRD(gly?cine-like receptor,過(guò) 氨 酸 受 體 )和 LCCH3(li?gand-gated chloride channel homologue 3,配體門(mén)控氯離子通道同系物3)[7-8]。研究表明,這三種亞基中只有RDL可以形成功能性的GABA門(mén)控氯離子通道[9],因此昆蟲(chóng)GABA受體也被稱為RDL受體。

      傳統(tǒng)作用于GABA受體的殺蟲(chóng)劑,均屬于該受體的非競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑[3],能直接作用于離子孔道,阻滯氯離子內(nèi)流,最終導(dǎo)致昆蟲(chóng)神經(jīng)興奮無(wú)法抑制而死亡。其中典型的芳基吡唑類(lèi)殺蟲(chóng)劑氟蟲(chóng)腈自20世紀(jì)90年代成功上市后,得到了廣泛應(yīng)用,也引起了研究人員的廣泛關(guān)注。但由于長(zhǎng)期使用,多種害蟲(chóng)已對(duì)該類(lèi)殺蟲(chóng)劑產(chǎn)生不同程度的抗藥性[3-4,10]。研究表明靶標(biāo)GABA受體發(fā)生抗性突變是害蟲(chóng)產(chǎn)生抗性的主要機(jī)制之一,褐飛虱和小菜蛾等害蟲(chóng)GABA受體第二跨膜區(qū)的關(guān)鍵氨基酸會(huì)產(chǎn)生A’2S和A’2N等突變,從而使這些害蟲(chóng)對(duì)氟蟲(chóng)腈類(lèi)殺蟲(chóng)劑產(chǎn)生數(shù)百倍的抗藥性[4,10]。GA?BA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑與非競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑具有相似的功能,均可使氯離子通道呈關(guān)閉狀態(tài),從而產(chǎn)生殺蟲(chóng)活性,但二者的結(jié)合位點(diǎn)和作用機(jī)制不同[11]。傳統(tǒng)的非競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑直接作用于跨膜區(qū)從而阻滯氯離子通道,而競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑作用于胞外區(qū),與GABA競(jìng)爭(zhēng)同一結(jié)合位點(diǎn),使GABA無(wú)法達(dá)到作用位點(diǎn)而導(dǎo)致氯離子通道無(wú)法開(kāi)啟。因此,GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑不會(huì)受現(xiàn)有抗藥性機(jī)制的干擾,是研發(fā)高效新型殺蟲(chóng)劑的潛在對(duì)象。

      目前關(guān)于昆蟲(chóng)GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑的報(bào)道較少。Gabazine是大鼠GABAA受體一個(gè)典型競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑[12],有報(bào)道證明Gabazine對(duì)昆蟲(chóng)GABA受體也具有一定的拮抗效應(yīng)[13-15]。Ozoe課題組發(fā)現(xiàn)在Gabazine噠嗪環(huán)的3位引入芳香基團(tuán)會(huì)使其對(duì)昆蟲(chóng)GABA受體的競(jìng)爭(zhēng)性拮抗活性明顯增加[16-17](圖1),但未見(jiàn)文獻(xiàn)報(bào)道該類(lèi)化合物的殺蟲(chóng)活性。Fr?lund課題組設(shè)計(jì)并合成了多個(gè)系列的五元雜環(huán)類(lèi)化合物,包括異噁唑類(lèi)、異噻唑類(lèi)和吡唑類(lèi)等,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明這些化合物均是哺乳動(dòng)物GABAA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑[18-20]。除此之外,Rahman等[17]研究發(fā)現(xiàn)氰基可能為噠嗪環(huán)1位羧酸的生物電子等排體。因此經(jīng)過(guò)結(jié)構(gòu)修飾的亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物有潛力開(kāi)發(fā)為昆蟲(chóng)GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑的先導(dǎo)化合物。

      圖1 Gabazine及其衍生物化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.1 Chemical structures of gabazine and its derivatives

      昆蟲(chóng)GABA受體的三維晶體結(jié)構(gòu)還未見(jiàn)報(bào)道。本研究采用同源模建的方法,以人GABAAβ3受體的晶體結(jié)構(gòu)為模板,分別構(gòu)建家蠅(Musca domestica)、褐飛虱(Laodelphax striatellus)和斜紋夜蛾(Spodoptera litura)的RDL GABA受體以及人(Homo sapiens)的α1β2γ2 GABA受體模型,然后將昆蟲(chóng)GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與所建模型進(jìn)行對(duì)接,研究亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與兩種農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)、一種衛(wèi)生害蟲(chóng)和一種哺乳動(dòng)物GABA受體的結(jié)合模式和作用機(jī)理。我們期望從分子水平預(yù)測(cè)和闡釋亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物在昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物的GABA受體中選擇性機(jī)理,為研發(fā)高效、低毒的作用于GABA受體的新型殺蟲(chóng)劑提供理論指導(dǎo)。

      1 實(shí)驗(yàn)部分

      本研究所涉及的分子模擬實(shí)驗(yàn)均使用Win?dows版 SYBYL-X 2.1軟件(Tripos Inc.,St.Louis,MO,USA)完成。如未做特殊說(shuō)明,所用參數(shù)均采用默認(rèn)值。

      1.1 目標(biāo)序列和模板選擇

      為構(gòu)建目標(biāo)蛋白的三維模型,通過(guò)對(duì)Uni?ProtKB數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,尋找到3種目標(biāo)昆蟲(chóng)(家蠅、褐飛虱和斜紋夜蛾)和1種哺乳動(dòng)物(人)的GABA受體的亞基序列,編號(hào)分別如下:1)家蠅RDL亞基序列編號(hào)Q75NA5;2)褐飛虱RDL亞基序列編號(hào)Q0ECT5;3)斜紋夜蛾RDL亞基序列編號(hào)G8IIS8;4)人GABA受體α1亞基序列編號(hào)P14867,β2亞基序列編號(hào) P47870,γ2亞基序列編號(hào)P18507。

      對(duì)RCSB Protein Data Bank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜尋,未發(fā)現(xiàn)已經(jīng)解析的家蠅等昆蟲(chóng)的GABA受體三維結(jié)構(gòu)。因此本研究選用人GABAAβ3受體的晶體結(jié)構(gòu)(PDB ID:4COF)為模板,采用同源模建的方法分別構(gòu)建家蠅、褐飛虱和斜紋夜蛾的RDL GA?BA受體及人α1β2γ2 GABA受體的三維模型。

      1.2 構(gòu)建亞基

      利用SYBYL-X 2.1軟件Biopolymer模塊中的Compare Sequence功能,采用Needleman&Wunsch方法將6個(gè)目標(biāo)亞基序列分別與人GABAAβ3模板序列進(jìn)行比對(duì),得到序列比對(duì)的6個(gè)MSF文件。在ORCHESTRAR模塊中導(dǎo)入MSF文件,通過(guò)構(gòu)建和分析保守區(qū)、搜索并添加疏水環(huán)區(qū)、添加側(cè)鏈、氫鍵優(yōu)化等步驟分別完成每個(gè)目標(biāo)亞基的構(gòu)建。

      1.3 組合模型

      通過(guò)分析模板受體人GABAAβ3受體的晶體結(jié)構(gòu)可知,該蛋白是同源五聚的氯離子通道,在構(gòu)建完成所需的目標(biāo)亞基后,需通過(guò)SYBYL-X 2.1軟件Edit/Merge模塊將3種昆蟲(chóng)的5個(gè)亞基和模板受體4COF疊合后依次組成五聚的氯離子通道。由于人α1β2γ2 GABA受體并不是同源寡聚體,所以將人α1β2γ2 GABA受體與模板4COF進(jìn)行比對(duì),需要將前者的α1、β2和γ2亞基分別疊合到4COF為模板的各個(gè)亞基上,以順時(shí)針?lè)较颍é?)(γ2)(α1)(β2)(γ2)組合構(gòu)建人α1β2γ2 GABA受體(見(jiàn)圖2)。

      1.4 模型優(yōu)化

      圖2 人α1β2γ2 GABA受體亞基排列的示意圖Fig.2 Schematic diagram of arrangement of human α1β2γ2 GABA receptor subunits

      針對(duì)所構(gòu)建的模型,采用能量?jī)?yōu)化與分子動(dòng)力學(xué)兩種方法對(duì)模型結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,以使各模型獲得能量較穩(wěn)定的構(gòu)象。首先在AMBER7 FF99力場(chǎng)下,采用共軛梯度法對(duì)每個(gè)模型進(jìn)行能量?jī)?yōu)化至連續(xù)兩次能量梯度差小于0.005 kcal/(mol·nm)。在此基礎(chǔ)上,使用SYBYL-X 2.1軟件中內(nèi)置的分子動(dòng)力學(xué)模塊Dynamics執(zhí)行動(dòng)力學(xué)模擬,具體參數(shù)為:NPT模式,溫度 300 K,壓力101 325 Pa,步長(zhǎng)1 fs,每2.5 ps取樣一次,總時(shí)長(zhǎng)為500 ps。

      1.5 分子對(duì)接

      運(yùn)用SYBYL-X 2.1軟件中的Surflex-Docking模塊,自定義氨基酸殘基模式確定受體結(jié)合口袋,其中原型分子(protomol)為結(jié)合口袋,參數(shù)Bloat值和Threshold值確定結(jié)合口袋的形狀及大小。將5個(gè)亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物(見(jiàn)圖1)分別與模建得到的家蠅、褐飛虱和斜紋夜蛾的RDL GABA受體及人的α1β2γ2 GABA受體的三維模型進(jìn)行分子對(duì)接,分析昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物GABA受體正構(gòu)位點(diǎn)與其競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物的結(jié)合模式。

      2 結(jié)果與討論

      2.1 同源模建

      通過(guò)序列同源性比對(duì),我們可以發(fā)現(xiàn)目標(biāo)蛋白的各亞基序列與模板蛋白β3序列亞基同源性較高,模板4COF每條鏈與3種昆蟲(chóng)的RDL亞基和人GABA受體的α1、β2、γ2亞基序列一致性均大于40%。通常來(lái)說(shuō),模建蛋白序列與構(gòu)建的目標(biāo)蛋白序列一致性大于30%時(shí),通過(guò)同源模建方法就可以獲得較為可靠的目標(biāo)蛋白三維結(jié)構(gòu)模型。因此,在本研究中,針對(duì)同源模建家蠅、褐飛虱、斜紋夜蛾的RDL GABA受體和人的α1β2γ2 GABA受體所選取的人GABAAβ3受體作為模板是合理的。

      模板蛋白人GABAAβ3受體為5個(gè)同源亞基構(gòu)成的氯離子通道,因而以其為模板構(gòu)建3種昆蟲(chóng)GABA受體結(jié)構(gòu)模型時(shí)需要對(duì)模板蛋白進(jìn)行拆分,取得每一條模板受體亞基。再分別與3種昆蟲(chóng)RDL GABA受體亞基序列進(jìn)行1次序列比對(duì),模建得到每條亞基,然后將模建得到的亞基分別與模板蛋白的亞基進(jìn)行疊合,組合成最終的蛋白模型,如圖3所示。人α1β2γ2 GABA受體則需要分別對(duì)α1、β2和γ2亞基進(jìn)行序列比對(duì),再將模建所得的各亞基按順時(shí)針?lè)较颍▓D2)分別疊合到模板蛋白的亞基上,組合成為人α1β2γ2 GABA受體結(jié)構(gòu)模型,見(jiàn)圖 3(d)。

      圖3 模建的GABA受體三維模型:(a)家蠅,(b)褐飛虱,(c)斜紋夜蛾,(d)人α1β2γ2Fig.3 Three-dimensional models of constructed GABA receptors:(a)housefly,(b)small brown planthopper,(c)common cutworm,(d)human α1β2γ2)

      在能量?jī)?yōu)化方面,利用SYBYL-X 2.1軟件中內(nèi)置的分子動(dòng)力學(xué)模塊Dynamics對(duì)所構(gòu)建的4個(gè)受體模型分別進(jìn)行了500 ps的分子動(dòng)力學(xué)模擬。所構(gòu)建的家蠅和褐飛虱GABA受體模型在開(kāi)始的80 ps內(nèi)能量變化較大,在隨后的420 ps能量趨于穩(wěn)定化,波幅較穩(wěn)定,基本穩(wěn)定于1 700 kcal/mol和1 900 kcal/mol左右[圖4(a),4(b)];所構(gòu)建的斜紋夜蛾GABA受體模型在開(kāi)始的60 ps內(nèi)能量快速下降,在接下來(lái)的450 ps能量波幅趨于穩(wěn)定,最后能量基本穩(wěn)定在1 800 kcal/mol左右[圖4(c)];所構(gòu)建的人α1β2γ2 GABA受體模型能量在開(kāi)始的100 ps內(nèi)下降非常迅速,在隨后的200 ps緩慢下降,在350ps后趨于平穩(wěn)狀態(tài),基本能量穩(wěn)定在1500kcal/mol[圖4(d)]。這表明,所構(gòu)建的4個(gè)受體模型能量上合理且均較穩(wěn)定。

      圖4 GABA受體模型分子動(dòng)力學(xué)能量-時(shí)間圖:(a)家蠅,(b)褐飛虱,(c)斜紋夜蛾,(d)人α1β2γ2Fig.4 Plot of potential energies of GABA receptor models versus simulation time for 500 ps molecular dynamics:(a)housefly,(b)small brown planthopper,(c)common cutworm,(d)human α1β2γ2

      在構(gòu)象變化方面,在動(dòng)力學(xué)模擬的最初階段,家蠅、褐飛虱、斜紋夜蛾和人GABA受體的三維結(jié)構(gòu)骨架原子的位置相對(duì)于模型最初構(gòu)象的均方根差值逐漸上升,約350 ps之后,RMSD(Root-Mean-Square Deviation)值分別穩(wěn)定在0.41、0.75、0.44 nm和0.55 nm左右(圖5),表明體系已趨于穩(wěn)定,這進(jìn)一步說(shuō)明了該模型在結(jié)構(gòu)上的合理性。

      圖5 GABA受體模型500 ps分子動(dòng)力學(xué)RMSD-時(shí)間圖:(a)家蠅,(b)褐飛虱,(c)斜紋夜蛾,(d)人α1β2γ2Fig.5 Plot of RMSDs of GABA receptor models versus the simulation time for 500 ps molecular dynamics:(a)housefly,(b)small brown planthopper,(c)common cutworm,(d)human α1β2γ2

      運(yùn)用SYBYL/ProTable模塊內(nèi)拉氏圖對(duì)所得到模型的構(gòu)象進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證(圖6)。家蠅、褐飛虱、斜紋夜蛾和人受體結(jié)構(gòu)模型的拉氏圖分別如圖 6(a),6(b),6(c)和 6(d)所示。由圖 6 可知,在模建的4種GABA受體結(jié)構(gòu)模型中,超過(guò)99%的氨基酸殘基均處于允許區(qū)域內(nèi),這驗(yàn)證了4個(gè)受體模型的可靠性。

      圖6 GABA受體模型氨基酸Ramachandran圖:(a),家蠅,(b)褐飛虱,(c)斜紋夜蛾,(d)人α1β2γ2Fig.6 Ramachandran graph of GABA receptor models:(a)housefly,(b)small brown planthoppe,(c)common cutworm,(d)human α1β2γ2

      2.2 分子對(duì)接

      根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑的結(jié)合區(qū)域位于膜外區(qū)的正構(gòu)位點(diǎn),一般由6個(gè)loop區(qū)(A-F)的氨基酸殘基構(gòu)成。由于本研究中所構(gòu)建目標(biāo)蛋白的序列不同,結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸殘基也存在一定的差異。對(duì)各個(gè)受體序列和模型進(jìn)行分析,對(duì)接位點(diǎn)的關(guān)鍵氨基酸總結(jié)如下。

      1)家蠅和褐飛虱:Phe90(loop A)、Glu148(loop B)、Phe150(loop B)、Ser149(loop B)、Tyr198(loop C)、Tyr53(loop D)、Arg55(loop D)。

      2)斜紋夜蛾:Phe88(loop A)、Glu146(loop B)、Ser14(loop B)、Phe148(loop B)、Tyr196(loop C)、Arg198(loop C)、Tyr51(loop D)、Arg53(loop D)。

      3)人:Phe89(loop A)、Glu146(loop B)、Ser147(loop B)、Tyr196(loop C)、Arg198(loop C)、Tyr53(loop D)。

      本研究采用SYBYL-X 2.1軟件C_score模塊對(duì)亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與所模建的4個(gè)GABA受體對(duì)接結(jié)果分別進(jìn)行評(píng)價(jià)打分。如表1所示,在家蠅和褐飛虱GABA受體中,相對(duì)Gabazine而言,化合物1-4的對(duì)接打分均有所提高,這表明在Gabazine噠嗪環(huán)的3位引入芳香基團(tuán)有助于提高該類(lèi)化合物對(duì)昆蟲(chóng)受體的拮抗活性。其中,化合物3(4-[3-(2-萘基)-1,6-二氫-6-亞氨基噠嗪基]丁酸氫溴酸鹽)在三種昆蟲(chóng)受體中的打分均最高,這一結(jié)果與Rahman等[16-17]的活性測(cè)試結(jié)果基本一致。此外,所有亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物(1-4)與三種昆蟲(chóng)GABA受體的對(duì)接打分均高于與人α1β2γ2 GABA受體的對(duì)接打分,這表明亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物在哺乳動(dòng)物和昆蟲(chóng)GABA受體之間作用具有差異性,對(duì)昆蟲(chóng)選擇性更好?;衔?與對(duì)人α1β2γ2 GABA受體的對(duì)接得分最低為3.49,這表明化合物3與人α 1β2γ2 GABA受體的結(jié)合不夠穩(wěn)定。

      表1 亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與四種GABA受體模型的對(duì)接打分Tab.1 Docking scores of the iminopyridazines in four GABA receptor models

      以亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物具有最高對(duì)接分?jǐn)?shù)的化合物3為例,分析其與三種昆蟲(chóng)RDL GABA受體及人α1β2γ2 GABA受體模型正構(gòu)位點(diǎn)的結(jié)合模式,具體結(jié)果如圖7所示。從對(duì)接模式來(lái)看,化合物3都是垂直插入三種昆蟲(chóng)GABA受體的正構(gòu)位點(diǎn),這與文獻(xiàn)中所報(bào)道的GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑結(jié)合模式基本符合[14-17]?;衔?與三種昆蟲(chóng)GABA受體對(duì)接構(gòu)象差別較小,具有較相似的結(jié)合模式。以家蠅GABA受體與化合物3相互作用的結(jié)合模式為例,如圖7(a)所示,化合物3的噠嗪環(huán)1位取代的丁酸羰基O原子可以和loop C中Thr194側(cè)鏈上的羥基H原子形成較穩(wěn)定的氫鍵;loop B中的Phe150的骨架羰基O原子作為氫鍵受體,與化合物3中6位取代的亞氨基H形成氫鍵,氫鍵距離為0.178 nm,作用較強(qiáng)?;衔?在斜紋夜蛾和褐飛虱GABA受體的作用位點(diǎn)也可形成相似的氫鍵作用[圖7(b)和7(c)]。除了氫鍵作用外,化合物3中噠嗪環(huán)3位(R2)取代的2-萘基與loop D中的Tyr53中的苯環(huán)產(chǎn)生較強(qiáng)的π-π堆積作用,這也與Rahman等[16]報(bào)道的結(jié)論相吻合。Rahman等[16-17]的研究表明在噠嗪環(huán)的3位引入2-萘基時(shí),所得衍生物在100 μmol/L時(shí),對(duì)褐飛虱、斜紋夜蛾和家蠅的GABA受體均表現(xiàn)出較好的拮抗活性。綜上,本研究中所發(fā)現(xiàn)的π-π堆積作用可能是化合物3對(duì)昆蟲(chóng)GABA受體產(chǎn)生競(jìng)爭(zhēng)性拮抗作用的的關(guān)鍵之一。此外,loop D中的Arg55側(cè)鏈帶一定的正電性,化合物3中1位取代的羧基帶有負(fù)電,二者之間可以產(chǎn)生靜電作用,loop A中的Phe90和loop C中的Tyr198可與化合物3產(chǎn)生較強(qiáng)的疏水作用,這與LIU等[14-15]文獻(xiàn)中報(bào)道的一致。

      在與人的GABA受體模型對(duì)接中,筆者發(fā)現(xiàn)特征氨基酸殘基Arg55、Tyr148、Tyr196和Ser192和化合物3的距離較遠(yuǎn),未形成氫鍵作用,也未發(fā)現(xiàn)特征的π-π堆積作用(圖7d)。此外,化合物3與昆蟲(chóng)GABA受體的對(duì)接打分是與人GABA受體對(duì)接打分的2倍及以上(表1),說(shuō)明其與昆蟲(chóng)GABA受體結(jié)合更穩(wěn)定。化合物3與家蠅、褐飛虱和斜紋夜蛾GABA受體較穩(wěn)定的結(jié)合模式,可以從一定程度上解釋其與昆蟲(chóng)GABA受體的結(jié)合具有靶標(biāo)專一性,表明該類(lèi)對(duì)昆蟲(chóng)與哺乳動(dòng)物GABA受體具有一定的選擇性。

      圖7 化合物3與所構(gòu)建GABA受體模型的分子對(duì)接:(a)家蠅,(b)褐飛虱,(c)斜紋夜蛾,(d)人α1β2γ2Fig.7 Docking results of compound 3 into the constructed GABA receptor models:(a)housefly,(b)small brown planthopper,(c)common cutworm,(d)human α1β2γ2

      3 結(jié) 語(yǔ)

      本論文以人GABAAβ3受體的晶體結(jié)構(gòu)為模板,通過(guò)同源模建的方法,分別構(gòu)建了2種農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)(褐飛虱和斜紋夜蛾)、1種衛(wèi)生害蟲(chóng)(家蠅)和1種哺乳動(dòng)物(人)的離子型GABA受體的三維結(jié)構(gòu)模型,且經(jīng)能量?jī)?yōu)化、分子動(dòng)力學(xué)、拉氏圖驗(yàn)證了所有模型的穩(wěn)定性和合理性。利用分子對(duì)接方法,研究了GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與所構(gòu)建模型的結(jié)合模式和作用機(jī)理。結(jié)果表明亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物與3種昆蟲(chóng)GABA受體對(duì)接打分趨勢(shì)基本一致,均高于其與人GABA受體的對(duì)接打分。亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物的芳香基團(tuán)可能和昆蟲(chóng)GABA受體中結(jié)合位點(diǎn)loop D區(qū)域的Tyr形成π-π堆積作用,從而增強(qiáng)其結(jié)合能力,這有可能是亞氨基噠嗪類(lèi)衍生物對(duì)昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物具有選擇性的關(guān)鍵因素之一。本研究從分子水平上預(yù)測(cè)和闡釋了昆蟲(chóng)GABA受體競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑對(duì)昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物具有選擇性的原因,可以為設(shè)計(jì)新型競(jìng)爭(zhēng)性拮抗劑苗頭化合物提供新思路,為研發(fā)安全、高效的新型農(nóng)藥研發(fā)提供理論指導(dǎo)。

      猜你喜歡
      家蠅斜紋飛虱
      元江燈下飛虱種群調(diào)查
      直接多重TaqMan qPCR方法快速鑒定褐飛虱屬3種飛虱
      斜紋軟呢新姿
      斜紋軟呢再續(xù)睛采
      褐飛虱體內(nèi)共生菌多樣性研究進(jìn)展
      三種稻田常見(jiàn)螯蜂對(duì)半翅目害蟲(chóng)的寄主偏好性及控害作用
      無(wú)數(shù)家蠅入侵俄羅斯小鎮(zhèn)居民無(wú)法外出苦不堪言
      奇聞怪事(2020年7期)2020-09-10 01:41:40
      芹菜籽對(duì)家蠅產(chǎn)卵忌避作用研究
      EcR-RNAi和印楝素處理斜紋夜蛾幼蟲(chóng)誘導(dǎo)腹足發(fā)育受阻表型
      結(jié)構(gòu)用單板層積材的斜紋承壓力學(xué)性能
      嘉鱼县| 镇安县| 沙河市| 独山县| 沈丘县| 合川市| 甘洛县| 谷城县| 虎林市| 密山市| 滁州市| 南岸区| 临泉县| 富锦市| 沧州市| 吉安市| 信宜市| 镇原县| 景洪市| 宜丰县| 资溪县| 驻马店市| 耿马| 南丰县| 新建县| 赤水市| 西贡区| 永安市| 珠海市| 赤峰市| 八宿县| 沁水县| 常德市| 庄浪县| 抚宁县| 梁山县| 黎川县| 涿州市| 金山区| 金秀| 惠来县|