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      基因異常對(duì)胰腺癌預(yù)后影響的研究進(jìn)展

      2019-02-12 14:22:18荊薇楊向紅
      實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志 2019年5期
      關(guān)鍵詞:失活外顯子基因突變

      荊薇 楊向紅

      1中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院第一腫瘤科(沈陽110022);2中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院病理科(沈陽110004)

      胰腺癌是預(yù)后極差的消化系統(tǒng)惡性腫瘤,據(jù)統(tǒng)計(jì)2015年在中國(guó)共有超過79 400 例患者被確診為胰腺癌[1]。僅有15%~20%的患者于早期確診,近80%的患者因局部進(jìn)展或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移不能接受手術(shù)治療,晚期患者中位生存期僅為6~9 個(gè)月[2]。近30年治療技術(shù)的發(fā)展使胰腺癌的綜合治療有了更多的選擇,然而胰腺癌患者總體5年的生存率仍僅有5%[3]。因此,尋找影響胰腺癌預(yù)后的因素是目前的研究熱點(diǎn)。

      既往研究提出的包括高齡、吸煙、糖尿病、慢性胰腺炎、KPS 評(píng)分、TNM 分期及血清CA199 水平等[4?7]臨床相關(guān)因素只能提示患者的預(yù)后趨勢(shì)及發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),但對(duì)個(gè)體化預(yù)后預(yù)測(cè)及治療靶點(diǎn)缺乏指向性。

      基因檢測(cè)研究技術(shù)的發(fā)展為我們深入認(rèn)識(shí)胰腺癌提供了幫助,在胰腺癌發(fā)生、發(fā)展的過程中,往往伴隨著多種基因的改變[8]。JUHASZ 等[9]發(fā)現(xiàn)胰腺癌中包含鼠類肉瘤病毒癌基因(kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)基因在內(nèi)的多種基因改變。BIANKIN 等[10]發(fā)現(xiàn)基因改變多發(fā)生于如G1/S 檢查點(diǎn)、凋亡、血管新生調(diào)節(jié)等重要的通路。YACHIDA 等[11]發(fā)現(xiàn)在胰腺癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移過程中腫瘤進(jìn)展的各個(gè)時(shí)期突變的基因亦各不相同。BREITKREUTZ 等[12]指出具有復(fù)雜信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的胰腺癌患者與具有單一信號(hào)的惡性腫瘤患者相比,往往具有更差的生存。以上研究結(jié)果提示我們,單個(gè)或是一組相關(guān)基因的改變可能影響胰腺癌患者的預(yù)后。目前研究多集中于孤立基因改變對(duì)胰腺癌預(yù)后的影響,少有綜合性分析及匯總報(bào)道。因此,我們有必要對(duì)胰腺癌相關(guān)基因改變進(jìn)行分析歸納,以便對(duì)不同的胰腺癌患者進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)分類,提示預(yù)后并指導(dǎo)個(gè)體靶向治療。

      1 經(jīng)典的基因變化

      1.1 KRAS 基因 癌基因KRAS 位于第12 號(hào)染色體,編碼RAS 同源體,屬于細(xì)胞質(zhì)GTPase 家族,通過活化MAPK 和(或)PI3K 通路促進(jìn)細(xì)胞增殖。有研究表明90%以上的胰腺癌患者存在KRAS 突變,突變常位于第12 外顯子,第13、61 外顯子突變也有報(bào)道[13]。目前認(rèn)為KRAS 基因突變是胰腺癌的早期事件。因而檢測(cè)KRAS 基因突變狀態(tài)可以用來區(qū)分胰腺病變的進(jìn)展程度[8]。

      BLACKFORD 等[14]對(duì)89 例病理診斷胰腺癌的標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)發(fā)現(xiàn),98.5%的患者存在KRAS 突變,但突變與患者預(yù)后不相關(guān),KRAS 突變可以作為胰腺癌的診斷指標(biāo)。WINDON 等[15]指出90%的胰腺癌患者存在KRAS 突變,與KRAS 野生型患者相比,KAS 突變患者具有更差的生存。KRAS 基因檢測(cè)可以在血漿及胰液等臨床標(biāo)本中進(jìn)行。CHEN 等[16]對(duì)91 例不能接受手術(shù)切除的晚期胰腺癌患者進(jìn)行外周血DNA 中KRAS 基因突變狀態(tài)檢測(cè),33%的患者具有KRAS 第12 外顯子突變。KRAS 突變與TNM 分期及肝轉(zhuǎn)移相關(guān)。KRAS 第12 外顯子突變患者的生存短于野生型患者。外周血DNA KRAS 基因第12 外顯子突變是影響胰腺癌患者生存的因素。GOLAN 等[17]發(fā)現(xiàn)KRAS 基因突變狀態(tài)與胰腺癌信號(hào)通路差異相關(guān)。KRAS 野生型表達(dá)Smad 4、Muc6、VEGFR?2 和VEGFB 蛋白,野生型患者可能從血管生成抑制劑治療中獲益。而KRAS 突變型則表達(dá)SHH、IHH 蛋白,突變型患者可能從Hedgehog 抑制劑治療中取得獲益。KRAS 基因突變狀態(tài)可以影響胰腺癌患者的治療決策,進(jìn)而影響患者治療的有效性。然而KRAS 基因突變與胰腺癌預(yù)后的關(guān)系尚無定論。

      1.2 SMAD4/DPC4 基因 抑癌基因SMAD4/DPC4 基因位于第18 號(hào)染色體,其缺失及突變?cè)谝认侔┲械陌l(fā)生率為55%,為晚期事件[8]。轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子?β(transforming growth factor?β,TGF?β)與胞外受體結(jié)合通過級(jí)聯(lián)反應(yīng),使smad4進(jìn)入細(xì)胞核,調(diào)節(jié)特定基因的表達(dá)控制細(xì)胞生長(zhǎng)。該基因缺失或突變后,p21 因子不能被激活,腫瘤細(xì)胞無控制的增殖生長(zhǎng)。SMAD4/DPC4 基因具有以下二個(gè)特點(diǎn),在胰腺癌中突變率明顯高于其他腫瘤;組織中smad4 蛋白可以用來代替表示SMAD4 基因狀態(tài)。因此,采用免疫組化方法檢測(cè)smad4 蛋白可以反映SMAD4/DPC4 基因的情況[18?19]。

      MASETTI 等[19]研究發(fā)現(xiàn)胰腺癌組織中SMAD4/DPC4基因的突變或缺失導(dǎo)致其表達(dá)失調(diào),進(jìn)而導(dǎo)致遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致更差的預(yù)后。研究發(fā)現(xiàn)胰腺癌組織中該基因缺失的患者遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移率明顯增高[20]。在89 例可手術(shù)切除的胰腺癌患者中檢測(cè)SMAD4、TP53、CDKN2A 基因及TGF?β信號(hào)通路相關(guān)基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SMAD4 基因失活的胰腺癌患者中位生存期為11.5 個(gè)月,而野生型患者中位生存期為14.2 個(gè)月。SMAD4 野生型的患者生存明顯好于SMAD4 失活(突變或者純合子缺失)的患者。存在SMAD4 失活的患者多出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,因而具有較差的預(yù)后。推測(cè)具有爭(zhēng)議的手術(shù)時(shí),具有SMAD4 失活的患者可能具有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn),SMAD4 高表達(dá)的患者遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)更低,需要更加積極地進(jìn)行新輔助化療及手術(shù)切除[14]。

      1.3 CDKN2A/P16INK4a 基因 抑癌基因CDKN2A 基因位于第9 號(hào)染色體,編碼p16 蛋白,通過p16/Rb 控制細(xì)胞周期,抑制cdk4/6 介導(dǎo)的Rb 磷酸化,抑制G1/S 期的轉(zhuǎn)變。p16 失活可導(dǎo)致細(xì)胞周期失控最終導(dǎo)致過度增殖。家族性多發(fā)黑痣患者多伴有CDKN2A 基因的突變,易發(fā)生黑色素瘤及胰腺癌[21?22]。95%的胰腺癌患者具有p16 蛋白的失活,但是DKN2A 基因的各種改變對(duì)p16 蛋白的失活起的作用各不相同。純合子缺失、突變及啟動(dòng)子甲基化發(fā)生率在胰腺癌中的發(fā)病率分別為40%、40% 及15%。其中突變及啟動(dòng)子甲基化都可以導(dǎo)致p16 蛋白的失活[8]。

      LUO 等[23]對(duì)既往32 例胰腺癌患者組織標(biāo)本中p16 缺失進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果提示P16 失活為50%。在存活短的患者中發(fā)現(xiàn)p16INK4a 失活較高,因而判定p16INK4a 可能為導(dǎo)致患者預(yù)后差的因素。在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,具有P16INK4a基因失活的小鼠在同時(shí)轉(zhuǎn)錄入P16INK4a 及P53 基因后,生存明顯好于分別單獨(dú)轉(zhuǎn)入P16INK4a 或P53 基因的小鼠。推測(cè)在P16INK4a 基因突變的患者中同時(shí)針對(duì)P16INK4a 及P53 的靶點(diǎn)治療才有效[24]。OSHIMA 等[25]對(duì)可切除的106 例胰腺癌患者病理組織進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),P16基因缺失發(fā)生率為67.0%,與淋巴結(jié)的侵襲及術(shù)后腫瘤遠(yuǎn)處播散轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。具有P16 基因缺失的胰腺癌患者具有較差的術(shù)后生存期。

      1.4 TP53 基因 抑癌基因TP53 編碼p53 蛋白,位于17 號(hào)染色體短臂。p53 蛋白對(duì)G1/S 期、G2/M 期阻滯及細(xì)胞凋亡起重要作用。55%~75%的胰腺癌患者存在TP53 基因突變,通常為雜合子突變。TP53 基因突變導(dǎo)致p53 蛋白的缺失意味著胰腺癌中調(diào)節(jié)細(xì)胞死亡及分化的兩條重要途徑出現(xiàn)異常[26]。TP53 基因共有3 個(gè)點(diǎn)突變位點(diǎn),其中2 個(gè)位點(diǎn)位于編碼區(qū),而另一個(gè)位點(diǎn)位于非編碼區(qū)的位點(diǎn)突變目前功能不詳[27]。

      KIM 等[28]對(duì)397 例胰腺癌患者術(shù)后標(biāo)本進(jìn)行TP53、TAM 表達(dá)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)TAM 缺失伴TP53 表達(dá)的患者具有更差的生存。JEONG 等[29]對(duì)44 例胰腺癌患者標(biāo)本進(jìn)行p53蛋白檢測(cè)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),異常的p53 蛋白表達(dá)率31.8%,異常的p53 蛋白表達(dá)與病理組織分級(jí)相關(guān),陽性表達(dá)異常p53蛋白的患者無病生存率低于陰性表達(dá)的患者。一項(xiàng)對(duì)可行手術(shù)切除的89 例胰腺癌患者研究中發(fā)現(xiàn),即使對(duì)淋巴結(jié)狀態(tài)、腫瘤分級(jí)、手術(shù)切緣、年齡及腫瘤大小進(jìn)行標(biāo)化后,TP53 基因的突變狀態(tài)與患者的生存不相關(guān)[14]。另一項(xiàng)納入62 例患者的研究中提出長(zhǎng)期生存及短期生存的兩組患者TP53 基因突變率分別為55%、70%,但未達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(校正后P=0.686)。認(rèn)為TP53基因的突變狀態(tài)與生存不相關(guān),TP53 基因的突變不能作為預(yù)后因子[23]。PETERSEN 等[30]的研究也指出,無論是單變量還是多變量分析后,TP53 突變的狀態(tài)與胰腺癌生存都不相關(guān)。

      2 非經(jīng)典的基因變化

      2.1 BRAF 基因 BRAF 基因位于第7 號(hào)染色體,在66%的惡性腫瘤中存在錯(cuò)義突變,但在每種惡性腫瘤中的突變率都比較低。其中80%的BRAF 基因突變發(fā)生于第15 外顯子V600E。突變所產(chǎn)生的RAF 蛋白可以不受RAS 蛋白的調(diào)控持續(xù)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖。

      與以往在肺癌及結(jié)腸癌報(bào)道的BRAF 基因突變與KRAS 基因突變不同時(shí)存在不同。近1/3 攜帶野生型KRAS基因的胰腺癌患者同時(shí)攜帶BRAF 基因突變。ZHOU 等[31]在126 例胰腺癌術(shù)后標(biāo)本中未檢測(cè)出BRAF 基因的突變,推測(cè)較低的BRAF 突變?cè)谝认侔┑陌l(fā)展及預(yù)后中作用有限。SCHULTZ 等[32]對(duì)170 例胰腺導(dǎo)管腺癌患者進(jìn)行KRAS及BRAF 基因突變檢測(cè)發(fā)現(xiàn),BRAF 基因突變率為16%,14%的胰腺癌患者同時(shí)具有KRAS 及BRAF 基因的突變。但是BRAF 基因突變與胰腺癌患者的總生存不相關(guān)。

      2.2 表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor recep?tor,EGFR)基因 EGFR 位于KRAS 的上游,可與其配體EGF 結(jié)合,通過RAS/RAF?MET?ERK 通路調(diào)控細(xì)胞的增殖。GUO 等[33]對(duì)357 例胰腺癌患者進(jìn)行EGFR 表達(dá)狀態(tài)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)陰性及陽性的EGFR 表達(dá)患者對(duì)輔助治療及放療具有不同的反應(yīng)性,但EGFR 表達(dá)狀態(tài)不影響胰腺癌患者術(shù)后的生存。目前文獻(xiàn)報(bào)道在胰腺癌中EGFR 基因突變率<3%。OLIVEIRA CUNHA 等[34]對(duì)88 例胰腺癌及壺腹周圍癌病例檢測(cè),只有2 例患者存在EGFR 基因突變,且突變的位置位于第18?21 外顯子上。由于EGFR 基因突變率過低,目前認(rèn)為其對(duì)胰腺癌的預(yù)后不具有預(yù)測(cè)意義。

      2.3 PIK3CA 基因 WEISS 等[35]在30 例胰腺癌患者的組織標(biāo)本中進(jìn)行磷脂酰肌醇?3?激酶(phosphatidylino?sitol 3?kinases,PI3Ks)的p110 亞單位PIK3CA(9?20)基因突變的檢測(cè),但是未發(fā)現(xiàn)具有突變。在PIK3CA 8 號(hào)內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)一個(gè)此前沒有數(shù)據(jù)報(bào)道的SNP,但此患者的臨床數(shù)據(jù)無特殊差別??偨Y(jié)目前文獻(xiàn)報(bào)道PI3KCA 基因的突變率小于5%,認(rèn)為不具有預(yù)測(cè)預(yù)后的作用。

      2.4 RUNX3 基因 RUNX3 基因位于第1 號(hào)染色體,基因編碼的產(chǎn)物是TGF?β 信號(hào)通路的重要組成部分。在胰腺癌中,RUNX3 基因不表達(dá)或低表達(dá),超甲基化及雜合子缺失為不表達(dá)的主要原因。SMAD2、SMAD3 與RUNX3 基因產(chǎn)物結(jié)合后進(jìn)入細(xì)胞核促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。在32 例胰腺癌患者組織中檢測(cè)發(fā)現(xiàn)33.4%的患者存在RUNX3 基因雜合子缺失,62.5%存在RUNX3 基因的啟動(dòng)子高甲基化。32 例標(biāo)本中未發(fā)現(xiàn)基因突變及SNP。而RUNX3 基因啟動(dòng)子高甲基化預(yù)示患者具有較差的生存[36]。

      2.5 MDM2 基因 MDM2 在腫瘤中過表達(dá),是E3 的泛素連接酶,抑制P53 的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)腫瘤的生長(zhǎng)。而MDM2 啟動(dòng)子存在309 位核苷酸T→G 的轉(zhuǎn)變,該位點(diǎn)純合子G 可以使SP1 親和性增加,進(jìn)而促進(jìn)MDM2 的mRNA 及蛋白的表達(dá),從而抑制p53 的活性,導(dǎo)致較差的預(yù)后。具有309G純和狀態(tài)的胰腺癌患者發(fā)病率是其他人的2 倍,生存率降低是其他患者的2~3 倍。MDM2?309 位點(diǎn)的雜合子T/G以及純合子G/G 狀態(tài)降低胰腺癌患者的無進(jìn)展生存及總生存[37]。

      2.6 DNA 修復(fù)相關(guān)基因突變 DNA 錯(cuò)配修復(fù)基因MLH1和MSH2 是典型的胰腺癌DNA 修復(fù)基因。二者產(chǎn)物蛋白協(xié)同起作用,修復(fù)新復(fù)制生成DNA 的錯(cuò)誤小插入、缺失及片段錯(cuò)配。其中一個(gè)出現(xiàn)失活后(突變或啟動(dòng)子甲基化)可以出現(xiàn)DNA 的異常,稱為微衛(wèi)星不穩(wěn)定。胰腺癌出現(xiàn)微衛(wèi)星不穩(wěn)定性為4%,有學(xué)者推測(cè)具有微衛(wèi)星不穩(wěn)定的胰腺癌患者具有較好的預(yù)后,但是卻具有伴隨非胰腺癌的其他腫瘤風(fēng)險(xiǎn),其基因改變對(duì)胰腺癌預(yù)后的影響目前尚無研究報(bào)道[38?39]。

      3 聯(lián)合多個(gè)基因改變

      基因改變存在于胰腺癌的發(fā)生、發(fā)展、增殖、侵襲及轉(zhuǎn)移等各個(gè)過程[40]。有研究根據(jù)基因改變的分布將胰腺癌分為4 個(gè)亞型[41]。穩(wěn)定亞型約占20%,該亞型腫瘤基因組包括<50 個(gè)結(jié)構(gòu)變異事件,通常表現(xiàn)出廣泛的非整倍體細(xì)胞周期/有絲分裂的缺陷。KRAS 的點(diǎn)突變率及SMAD4 改變與其余亞型相似,TP53 突變的發(fā)生率為61%。局部重排亞型約占30%,其亞組中包括KRAS、SOX9 和GATA6 基因的局部擴(kuò)增,以及常用于臨床治療靶點(diǎn)的ERBB2、MET、CDK6、PIK3CA 以及PIK3R3 的小突變。約36%為散發(fā)亞型,這類腫瘤表現(xiàn)出中等范圍的非隨機(jī)染色體損傷和<200 的結(jié)構(gòu)變異。不穩(wěn)定亞型約占14%,腫瘤表現(xiàn)出大量的基因結(jié)構(gòu)變化。這種基因組不穩(wěn)定性暗示DNA 修復(fù)缺陷,并提示了腫瘤對(duì)DNA 損傷藥物的敏感性。以上4 種亞型的具有潛在的臨床治療相關(guān)性,可能提示胰腺癌患者的預(yù)后生存。

      近年來,采用全基因組和深度外顯子測(cè)序方法對(duì)456例胰腺癌組織基因變化進(jìn)行檢測(cè)。發(fā)現(xiàn)胰腺癌相關(guān)的基因突變多集中于DNA 損傷修復(fù)、細(xì)胞周期調(diào)控、TGF?β 信號(hào)通路、染色質(zhì)調(diào)節(jié)、軸突導(dǎo)向通路[42]。而通過表達(dá)譜分析進(jìn)一步將病理因素預(yù)后不同的胰腺癌分為4 個(gè)亞型,分別為鱗狀細(xì)胞、胰腺祖細(xì)胞、免疫原性、異常分化的內(nèi)分泌外分泌型(ADEX)。胰腺癌的這些不同亞型具有不同的分子進(jìn)化、識(shí)別以及治療預(yù)后。鱗狀細(xì)胞型具有較差的預(yù)后,其富含TP53 和KDM6A 突變以及胰腺內(nèi)胚層細(xì)胞命運(yùn)決定基因的高甲基化;胰腺祖細(xì)胞型優(yōu)先表達(dá)與胰腺早期發(fā)育相關(guān)的基因FXA2/3、PDX1 和MNX1;ADEX 型顯示上調(diào)調(diào)控KRAS 激活的網(wǎng)絡(luò)相關(guān)基因;免疫原性型上調(diào)免疫網(wǎng)絡(luò),包括參與獲得性免疫抑制的途徑。

      4 展望

      由于多數(shù)胰腺癌患者在確診時(shí)已經(jīng)喪失手術(shù)機(jī)會(huì),更好地了解胰腺癌的病理、分子等特點(diǎn)有益于早期診斷,判斷預(yù)后,使更多的患者得到接受根治手術(shù)的機(jī)會(huì),針對(duì)靶點(diǎn)接受治療,從而延長(zhǎng)患者的生存時(shí)間,提高生存質(zhì)量。借助于基因分析的技術(shù),構(gòu)建于基因分子改變特征之上,有助于我們?cè)谂R床中發(fā)現(xiàn)高風(fēng)險(xiǎn)人群,為胰腺癌的個(gè)體化治療、靶向治療提供新的依據(jù)。

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