PubMed數據庫中參考文獻題名引用和著錄存在問題及分析

齊 燁，鄭雨田，李 娜，蘆 洋

(天津市第三中心醫(yī)院生物醫(yī)學工程與臨床編輯部 天津300170)

參考文獻是一篇完整的科技論文不可缺少的組成部分，是作者在學術研究中，對某一著作或論文整體的參考或借鑒，是對前人學術研究尊重的表現(xiàn)，同時也可為讀者提供進一步查詢資料或信息的線索。PubMed 數據庫是目前國際公認的檢索生物醫(yī)學和生命科學領域文獻的權威性數據庫，旨在提供科研領域信息[1]。為確保編校質量，在編輯工作中，應十分關注稿件中參考文獻的把關與核查。因此，利用PubMed 數據庫中信息查對稿件參考文獻，是編輯工作的一項重要內容。但筆者在編輯工作中發(fā)現(xiàn)，PubMed 數據庫在收錄文獻基本信息時，部分存在著錄的文章題名與實際內容不一致的情況，原因可能是對一些特定詞語使用替代性處理[2]，這需要編輯查對原始文獻并予以修改?，F(xiàn)針對筆者利用PubMed 數據庫查對參考文獻時，在題名方面容易出現(xiàn)的不一致問題及其表現(xiàn)進行介紹和歸納，有助于減少錯誤著錄的發(fā)生。

1 正斜體的核定

科技期刊中外文字母的應用較普遍，一些名詞術語、符號的正、斜體常具有特定意義，這使得規(guī)范書寫顯得十分重要。然而PubMed 數據庫中的文獻題名多采用正體，導致參考文獻存在著錄不一致情況。編輯在查對時應特別留意，有針對性地查詢原始文獻并予以修改。

1.1 拉丁文名

一些拉丁詞如 via(通過)、vs(相對)、in vitro/ ex vivo(體外)、in vivo(在體)、in situ(原處)，以及衍生詞 In silico(于電腦中)需要用斜體表示。例如，某投稿文章引用一篇涉及羥基磷灰石生物活性體外評價的參考文獻，該文獻標題中的 in vitro 在作者原稿和PubMed 數據庫[3]中均采用正體表達，而發(fā)表在Biomaterials 雜志中的原始文獻[4]則以規(guī)范的斜體形式呈現(xiàn)。

1.2 生物物種的學名

目前，生物學名通常采用“雙命名法”規(guī)則，其主要結構為：屬名+種名+命名人。其中，屬名應斜體書寫，且首字母大寫；種名采用斜體書寫，全部為小寫；命名人姓名需正體書寫[5]。

在細胞分化和器官發(fā)育的研究中，題名常出現(xiàn)動植物學名。例如，一篇關于秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditis elegans)轉化的RNAi 載體構建方法的參考文獻，該文獻標題中的Caenorhabditis elegans在作者原稿和 PubMed 數據庫[6]中均采用正體表達，而發(fā)表在 Nature 雜志中的原始文獻[7]則以規(guī)范的斜體形式呈現(xiàn)。在免疫學文獻題名中，經常出現(xiàn)微生物的學名。例如，一篇關于耐藥金黃色葡萄球菌(Enterococcus faecium)感染的參考文獻，該文獻標題中的Enterococcus faecium 在作者原稿和PubMed 數據庫 [8] 中均采用正體表達，而發(fā)表在Pharmacotherapy 雜志中的原始文獻[9]則以規(guī)范的斜體形式呈現(xiàn)。

1.3 限制性內切酶

基于內切酶來源的微生物學名命名規(guī)則，內切酶前3 個字母采用斜體(第1 個為內切酶來源的微生物屬名首字母需大寫，其后 2 個為微生物種名需小寫)，后面的字母(通常為該變種或品系名稱)和編碼(同一種微生物多種內切酶時便于分離)正體平排，如：BamHⅠ、HindⅢ、Sau3AⅠ等[10]。

1.4 基因和蛋白質

根據遺傳學趨勢(trends in genetics，TIC)遺傳命名指南規(guī)定[11]，不同物種有不同的命名規(guī)則，但一般來說，基因名稱應寫成斜體，蛋白質名稱與對應的基因/等位基因的名稱相同，則采用正體。大小寫常用于區(qū)分不同物種：一般地，對于小鼠、大鼠，基因名稱首字大寫，其余小寫；對于人類、非人類靈長類動物/家畜，基因名稱均使用大寫字母；對于細菌、斑馬魚基因符號用 3 個小寫字母表示；對于果蠅、豌豆，基因符號小寫表示隱性突變基因，首字母大寫表示顯性突變基因。筆者曾編輯一篇關于基因突變的參考文獻，該文獻標題中的人 BTK 基因在作者原稿和 PubMed數據庫[12]中均采用正體表達，而發(fā)表在 Gene 雜志中的原始文獻[13]則以規(guī)范的斜體形式呈現(xiàn)。

1.5 化學符號

化學中表示旋光性、分子構型、取代基位置和異構體等符號應用斜體排版，并在其后加半字線，置于化合物名稱前。例如，物質旋光性采用左旋 l-、右旋d-表示，官能團在有機化合物位置可以通過臨位 o-、對位 p-表示，其他還包括反式 trans-、順式 cis-。另外，在化合物表示中，共聚物連接用-co-來書寫。例如，一篇關于化合物消旋體的參考文獻，該文獻標題中的 poly(D，L-lactic-co-glycolic acid)在作者原稿和PubMed 數據庫[14]中均采用正體表達，而發(fā)表在Tissue Engineering Part A 雜志中的原始文獻[15]則以規(guī)范的斜體形式發(fā)表。

1.6 醫(yī)學統(tǒng)計學符號

統(tǒng)計學符號采用斜體書寫，如t 檢驗、F 檢驗，概率 P，標準差 s 及相關系數 r 等。筆者在編輯加工過程中，曾查對過一篇關于線性回歸模型顯著性檢驗方面的參考文獻，該文獻標題中的F-test 在作者原稿和PubMed 數據庫[16]中均采用正體表達，而發(fā)表在Statistics in Medicine 雜志中的原始文獻[17]則是以正確的斜體形式呈現(xiàn)。

1.7 變量符號

在生物醫(yī)學科技論文題名中，以斜體形式呈現(xiàn)的情況還包括表示物理量的符號、特征數符號(雷諾數Re、傅里葉數 Fo、格拉曉夫數 Gr、普朗特數 Pr)、數學符號表示變量(變量、坐標系符號、視為常數的參數、函數、矢量和矩陣符號等)的書寫[18]，這些雖暫未出現(xiàn)在筆者查對的參考文獻中，但在編校時也應予以注意，以免出現(xiàn)錯誤使用。

2 上下角標的核定

正確使用上下角標符號對讀者快速、準確理解書稿內容起到畫龍點睛的作用。筆者通過分析上下角標的編輯規(guī)范，在期刊中正確標注，對普及國家標準起到推動作用。

2.1 化學式

化和物分子式中表示某種元素原子個數，應標注在相應元素之后并以下角標形式表示，如：乙醇C2H6O。編輯曾收到一篇涉及鎂合金材料的參考文獻，該文獻題名中碳酸鎂(MgCO3)在作者原稿和PubMed 數據庫[19]中均以錯誤形式 MgCO3 出現(xiàn)，而發(fā)表在Journal of Biomedical Materials Rresearch 雜志中的原始文獻[20]原子個數則以正確的下角標形式呈現(xiàn)。

2.2 化合物名稱

在一些化合物中會使用不同阿拉伯數字區(qū)分同一家族間不同成員，例如維生素 B 族有 12 種以上，主要有維生素(vitamin)B1、維生素 B2、維生素 B6等。該化合物中數字的表示應標注在字母之后并以下角標形式出現(xiàn)。

2.3 物質陰陽性

在一些名詞術語中，加號(+)代表是該細胞含有某種物質分子表達，是陽性；減號(-)就是沒有檢測到某種物質，是陰性。無論該物質為陽性還是陰性，加號、減號均位于該物質后，且以右上角標形式呈現(xiàn)，例如干細胞Lgr5+ve。某作者文章引用一篇涉及表面陽性表達 CD4，CD25 T 細胞的參考文獻，該文獻標題中的 CD4+CD25+FOXP3+Treg 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫 [21] 中均以錯誤形式CD4+CD25+FOXP3+Treg 出現(xiàn)，而發(fā)表在 Cellular Physiologu and Biochemistry 雜志中的原始文獻[22]陽性加號則以規(guī)范的上角標形式呈現(xiàn)。

2.4 離子符號

在元素符號右上角表示出離子所帶正、負電荷數的符號。其中正電荷為+號，負電荷用-號表示。原子量用阿拉伯數字表示，以右下角標形式呈現(xiàn)，放在該元素符號后，如：SO42-，NH4+。例如，某作者文章引用一篇涉及鋁離子對大鼠骨形態(tài)影響的參考文獻，該文獻標題中的 Al3+在作者文章原稿中和 PubMed 數據庫[23]中均以錯誤形式 Al3+出現(xiàn)，而發(fā)表在 ASAIO Transactions 雜志中的原始文獻[24]離子所帶正電荷符號則以規(guī)范的上角標形式呈現(xiàn)。

2.5 同位素符號

原子量用阿拉伯數字表示放在該元素前，以上角標形式呈現(xiàn)，在核素中最常見，如碘的一種放射性同位素131I，放射性核素18F。還有一種形式多為存在于同位素標記的化合物，如氫質子波譜1H-MRS。某作者文章引用一篇涉及不穩(wěn)定同位素锝(99mTc)在異位甲狀旁腺腫瘤定位診斷的參考文獻，該文獻標題中的99mTc 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[25]中均以錯誤形式出現(xiàn)，而刊載在European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging 原始文獻[26]上則以規(guī)范的上角標形式呈現(xiàn)。

2.6 受體亞型

一種受體應該根據其內源性激動劑來命名，可以用該受體激動劑的縮寫，如果有確鑿證據可以把一些受體進一步分類時，可以用數字、字母下標的形式表示受體的不同亞型。某作者文章引用一篇涉及血管加壓素受體拮抗劑的參考文獻，該文獻標題中的V1a/V2在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[27]中均以錯誤形式V1a/V2 出現(xiàn)，而刊載在 Neurocritical Care原始文獻[28]上則以規(guī)范的下角標形式呈現(xiàn)。

2.7 影像技術

在醫(yī)學影像稿件中，經常遇到名詞術語使用不規(guī)范情況，特別是MRI 掃描序列的表示，阿拉伯數字應以下角標形式書寫，如：T1WI。筆者曾編輯一篇涉及MRI 技術評價心肌功能的參考文獻，該文獻標題中的T1-mapping 在作者文章原稿和PubMed 數據庫[29]中均以錯誤形式 T1-mapping 出現(xiàn)，而刊載在 Eur Heart Journal Cardiovascular Imaging 原始文獻[30]上則以規(guī)范的下角標形式呈現(xiàn)。

3 特殊符號的核定

3.1 字母的混用

生物醫(yī)學工程稿件中細胞因子、基因名稱等常出現(xiàn)希臘字母，根據其生物學性質不同，腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor，TNF)包括 TNF-α、TNF-β，干擾素(interferon，IFN)可分為 IFN-α、IFN-β 及 IFN-γ，淋巴毒素(lymphotoxin，LT)可分為 LT-α、LT-β。例如，某作者文章引用一篇涉及Toller 樣受體介導信號傳導通路的參考文獻，在該表題中的希臘字母κ 在作者文章原稿和 PubMed 數據庫[31]中均以錯誤形式NF-kappaB 出現(xiàn)，而發(fā)表在 Nature Immunology 原始文獻[32]上則以正確形式 NF-κB 呈現(xiàn)。

3.2 符號的遺漏

國外產品在中國國內正式注冊后，會用?表示已經注冊過商標的意思。R 是英文 register(注冊)的第一個字母。生物工程類稿件中，偶爾會遇到注冊商標丟失的情況。例如，一篇關于引用使用肝素涂層透析濾器的參考文獻，該文獻標題中的肝素涂層濾器Genius 在作者原稿和 PubMed 數據庫[33]中均未標明注冊符號，而發(fā)表在Nephrol Dial Transplant 雜志中的原始文獻[34]則以規(guī)范的產品名稱+注冊符號的上角標形式呈現(xiàn)。

4 結 語

PubMed 數據庫是生物醫(yī)學科技工作者獲取科研信息的重要途徑，為相關研究工作的開展提供特定的文獻資料。由于數據庫應用系統(tǒng)設計存在弊端，其在收錄、加工處理信息時對一些特定詞語會給予與原文獻有別的處理，通常表現(xiàn)在文章題名上，會出現(xiàn)錯誤的著錄形式。這些問題常常被文獻引用的作者忽視，而導致引用錯誤。編輯在編校工作中應給予足夠的重視，持有嚴謹的科學態(tài)度，利用互聯(lián)網和數據庫等平臺仔細查詢源文獻，及時核定和更正，避免留下編校差錯，以提高論文水平和期刊質量。