陸亞冬,劉賢俠,陳創(chuàng)夫
(石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,新疆石河子 832003)
【研究意義】牛冠狀病毒(Bovine Coronavirus,BCV)系冠狀病毒科冠狀病毒屬成員,其感染對(duì)象是脊椎動(dòng)物,常常是引起10日齡以下初生犢牛腹瀉,由牛冠狀病毒引起的牛冠狀病毒病,是一種以胃腸炎為主要癥狀的,高度接觸性傳染病,經(jīng)口感染為主,其傳染源主要是腹瀉犢牛的糞便被健康犢牛舔食,引起初生犢牛腹瀉,治愈率低,目前尚無(wú)有效的治療藥物和疫苗,對(duì)小腸絨毛上皮的損害十分嚴(yán)重[1],抗原性方面牛冠狀病毒和其他冠狀病毒之間具有部分交叉性。冠狀病毒很容易產(chǎn)生變異,自身不穩(wěn)定,診斷和預(yù)防該病很困難?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】目前尚無(wú)有效的治療藥物和疫苗,牛冠狀病毒對(duì)小腸絨毛上皮的損害十分嚴(yán)重[1],抗原性方面牛冠狀病毒和其他冠狀病毒之間具有部分交叉性。冠狀病毒很容易產(chǎn)生變異,自身不穩(wěn)定,診斷和預(yù)防該病很困難。目前常規(guī)檢測(cè)方法不適合臨床的大規(guī)模應(yīng)用,費(fèi)用高?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】應(yīng)用PCR和ELISA方法對(duì)新疆部分地區(qū)規(guī)模化牛場(chǎng)進(jìn)行致?tīng)倥8篂a冠狀病毒病的初步調(diào)查,應(yīng)用原核表達(dá)蛋白純化技術(shù)對(duì)牛冠狀病毒核衣殼蛋白進(jìn)行初步研究,核衣殼蛋白是牛冠狀病毒主要結(jié)構(gòu)蛋白,常作為檢測(cè)抗原,在病毒侵染宿主方面起著扮演著重要的角色,可作為診斷牛冠狀病毒病的候選蛋白?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】牛冠狀病毒N 基因表達(dá)的N蛋白比較保守,既可以作為冠狀病毒病的診斷方面用的抗原,又具有很強(qiáng)的免疫原性[2]。研究建立一種快速診斷的試劑盒或試紙條奠定一定理論基礎(chǔ)。
1.1材料
E.coliDH 5α菌株、BL21(DE3)菌株和原核表達(dá)載體PET-28a、PET-32a菌株均由石河子大學(xué)動(dòng)物疾病防控兵團(tuán)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存;PMD19-T載體購(gòu)自寶生物(大連)公司。
牛冠狀狀病毒陽(yáng)性病料采自新疆部分規(guī)?;?chǎng);IPTG購(gòu)自MerK公司;限制性?xún)?nèi)切酶(EcoRI/HindIII)、T4連接酶、DNA Marker購(gòu)自大連寶生物工程有限公司;質(zhì)粒小提取試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒、HRP標(biāo)記的山羊抗牛IgG、廣譜彩虹預(yù)染Marker,His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(包涵體蛋白),His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(包涵體蛋白)購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限責(zé)任公司;牛冠狀病毒標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清購(gòu)自青島瑞爾公司;牛冠狀病毒陽(yáng)性血清采集自新疆北疆地區(qū)部分發(fā)病犢牛規(guī)模化場(chǎng),經(jīng)牛冠狀病毒抗原檢測(cè)ELISA試劑盒鑒定。
1.2 方 法
1.2.1 引物設(shè)計(jì)及合成
采集石河子周邊、沙灣、奎屯等部分地區(qū)規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品141份,健康犢牛糞便若干份。所采集的腹瀉犢牛病程大多在10日齡以?xún)?nèi)。根據(jù)GenBanK中(登錄號(hào):318090.1)Mebus株N基因保守序列設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物,擴(kuò)增牛冠狀病毒部分基因的引物,同時(shí)設(shè)計(jì)引物進(jìn)行原核表達(dá),上游引物含有EcoRΙ位點(diǎn),下游引物含有HindⅢ位點(diǎn),引物由上海生物工程股份有限公司合成。表1,表2
表1 牛冠狀病毒部分基因引物信息
Table 1 Partial gene primer information of bovine coronavirus
名稱(chēng)Name引物序列(5’-3’)Primer sequence (5 '-3')擴(kuò)增大小Amplification size (bp)退火溫度TmBCV-N-F1CGGGATCCATGTCTTTTACTCCTGGTBCV-N-F2CCGCTCGAGTTATATTTCTGAGGTGT1 34758℃BCV FATACCCCGGCTGACATTCTCGBCV RCTCTTCTGGCGGGGCTTATTCA 35555℃
表2 PCR引物序列
Table 2 Nucleotide sequences of PCR primers
引物名稱(chēng)Primer name序列(5’-3’)Sequence (5 '-3')擴(kuò)增長(zhǎng)度Amplification length (bp)退火溫度TmBCV -N-FCGAATTCATGTCTTTTACTCCTGGTAAGCABCV -N-RCCAAGCTTTTATATTTCTGAGGTATCTTCAGTAAAGG1 40058℃
1.2.2 牛冠狀病毒抗原ELISA檢測(cè)
(1)試劑準(zhǔn)備:按照說(shuō)明書(shū)操作,使用前所有試劑恢復(fù)至室溫。
(2)操作步驟:按照牛冠狀病毒抗原ELISA說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,試劑盒原理是雙抗體夾心法,將處理好的樣品上清液吸取200 μL加入已經(jīng)預(yù)先包被牛冠狀病毒捕獲抗體的微孔中,同時(shí)設(shè)置陰陽(yáng)性對(duì)照孔和空白孔,除空白孔外,樣品孔中加入辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的檢測(cè)抗體100 μL,微量震蕩儀器上進(jìn)行震蕩混勻,用封板膜封好后置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中作用1 h,取出棄掉微孔中的液體,每孔用洗滌液洗板5次,每次2 min,加入底物后避光孵育15 min,用終止液進(jìn)行終止,在450 nm的酶標(biāo)儀上進(jìn)行讀數(shù)。
1.2.3 牛冠狀病毒 N基因的擴(kuò)增、克隆、測(cè)序及鑒定
用Trizol法提取牛冠狀病毒病料的RNA,以此為模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。采用25 μL反應(yīng)體系:ddH2O 9.7 μL、上下游引物各0.4 μL、模板2.0、2×EsTaqMasterMiX 12.5 μL空白對(duì)照:模板改為水。反應(yīng)條件:預(yù)變性95℃ 5 min,變性94℃ 40 s,退火64℃ 30 s,延伸72℃ 2 min,重復(fù)30個(gè)循環(huán),再延伸 72℃ 10 min,4℃保存。擴(kuò)增后用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),切膠回收。將N基因PCR產(chǎn)物與pMD19-T載體相連,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞。篩選陽(yáng)性克隆,小提質(zhì)粒并進(jìn)行EcoRΙ/HindⅢ雙酶切,獲得目的基因片段,切割膠回收N DNA片段和PET-28a和PET-32a酶切產(chǎn)物。將回收的N基因片段與表達(dá)載體PET-28a和PET-32a于16℃連接過(guò)夜。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂于培養(yǎng)基板上,37℃過(guò)夜培養(yǎng)16~18 h,選取生長(zhǎng)良好的轉(zhuǎn)化菌落,進(jìn)行篩選后提取PET -28a-N質(zhì)粒和PET-32a-N質(zhì)粒,并將篩選后經(jīng)雙酶切鑒定目的條帶正確的質(zhì)粒送上海生物工程股份有限公司進(jìn)行測(cè)序,并將測(cè)序結(jié)果用DNAMAN軟件進(jìn)行在線(xiàn)比對(duì),并將其轉(zhuǎn)化入BL(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,涂于含有卡那霉素(PET-28a-N)的培養(yǎng)基板上和氨芐霉素(PET-32a-N)的培養(yǎng)板上。37℃過(guò)夜培養(yǎng)16~18 h,選取生長(zhǎng)良好的轉(zhuǎn)化菌落,進(jìn)行篩選。經(jīng)酶切鑒定后重組表達(dá)載體命名為PET-28a-N和PET-32a-N。
1.2.4 牛冠狀病毒 N基因在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達(dá)
將陽(yáng)性克隆菌接種到含有抗性(100 mg/L)LB液體培養(yǎng)基中,37℃ 220 r/min搖菌過(guò)夜。吸取200 μL菌液接種到20 mL含有抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、200 r/min培養(yǎng)至菌液旺盛期,加入終濃度為1.0 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)表達(dá),分別于2、4、6、8 h取樣。同時(shí)設(shè)空載體和未加IPTG誘導(dǎo)的重組菌作為對(duì)照。
1.2.5 重組蛋白BCV-28a-N-DE3和BCV-32a-N-DE3的上清/包涵體鑒定及純化
經(jīng)SDS-PAGE鑒定條帶正確的重組蛋白BCV-28a-N-DE3和BCV-32a-N-DE3,分別用2 L的三角瓶進(jìn)行批量誘導(dǎo)后進(jìn)行收菌,加入適量的裂解液進(jìn)行過(guò)夜裂解,裂解菌體之后,取1 mL菌液分裝到1.5 mL離心管中, 8 000 r/m離心30 min,分別取上清和沉淀,進(jìn)行15%SDS-PAGE進(jìn)行電泳,鑒定上清和沉淀。重組蛋白的純化采用His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(包涵體蛋白)、His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(可溶性蛋白)主要操作步驟:
緩沖液的準(zhǔn)備
包涵體蛋白純化緩沖液配方。表3
表3 包涵體蛋白純化緩沖液配方
Table 3 Formulation of inclusion body protein purification buffer
組分ComponentTris-HCl(pH7.9)ImidazoleNaClUreaBinding Buffer20 mM5 mM0.5M8MElution Buffer20 mM500 mM0.5M8M
組裝層析柱,將Ni-Agarose Resin填料混勻后加入層析柱,室溫靜置10 min,待凝膠與溶液分層后,把底部的出液口打開(kāi),讓乙醇通過(guò)重力作用緩慢流出.向裝填好的柱中加入5倍柱體積的去離子水將乙醇沖洗干凈后,再用8倍柱體積的 Binding Buffer平衡柱子,平衡結(jié)束后即可上樣。包涵體蛋白的純化,收集菌體后,每100 mg菌體(濕重)加入2 mL 8 M尿素進(jìn)行變性,過(guò)夜裂解,超聲裂解菌體。10 000×g,4℃離心15 min,分離上清和沉淀,并收集沉淀,將沉淀重懸于Binding Buffer中,盡量混勻使包涵體充分溶解。10 000×g離心20 min,收集上清。將離心后的上清以孔徑為0.45 μm的濾膜過(guò)濾。將上清負(fù)載上柱,流速為10倍柱體積/h,收集流穿液。使用15倍柱體積的Binding Buffer沖洗柱子,洗去雜蛋白。使用適量Elution Buffer洗脫,收集洗脫峰。洗脫后,依次使用5倍柱體積的Binding Buffer,5倍柱體積的去離子水洗滌柱子,再用3倍柱體積的20%乙醇平衡(乙醇要將填料浸沒(méi)),封柱后2~8℃保存。
包涵體形式得到的蛋白需要進(jìn)行復(fù)性即在8M尿素變性后得到的變性條件下目的蛋白需要復(fù)性,將目的蛋白放到透析帶中,進(jìn)行梯度透析分別是6M尿素透析、4M尿素透析、2M尿素透析、1M尿素透析和去離子水透析,時(shí)間分別是6~8 h,最后用蔗糖吸干,分裝保存。
His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(可溶性蛋白)主要操作步驟。表4
表4 可溶性蛋白純化緩沖液配方
Table 4 Formula for soluble protein purification buffer
組分ComponentTris-HCl(pH7.9)ImidazoleNaClBinding Buffer20 mM10 mM0.5MElution Buffer20 mM500 mM0.5M
組裝層析柱:將Ni-Agarose Resin填料混勻后加入層析柱,室溫靜置10 min,待凝膠與溶液分層后,把底部的出液口打開(kāi),讓乙醇通過(guò)重力作用緩慢流出。填料的上層是乙醇保護(hù)層,將填料和乙醇一起混勻,以1 mL填料純化20~30 mg His標(biāo)簽蛋白計(jì)算,取需要的填料與乙醇的混合液加入層析柱。如果乙醇不流出,可以給柱子一個(gè)外力,用大拇指對(duì)柱口輕輕按壓一下,迫使乙醇流出。向裝填好的柱中加入5倍柱體積的去離子水將乙醇沖洗干凈后,再用10倍柱體積的Binding Buffer平衡柱子,平衡結(jié)束后即可上樣??扇苄缘鞍椎募兓?,收集菌體后,每100 mg菌體濕重加入1~5 mL細(xì)菌裂解液,每1 mL細(xì)菌抽提試劑中已加入10 μL蛋白酶抑制劑混合物,超聲裂解菌體。超聲過(guò)程中保持菌液處于冰浴中,超聲條件依賴(lài)于所使用的超聲儀功率,探頭種類(lèi),容器的大小形狀,需實(shí)驗(yàn)中自己摸索,應(yīng)避免連續(xù)超聲導(dǎo)致的大量產(chǎn)熱,可分成短時(shí)間,多次超聲,通過(guò)一定的間隔時(shí)間避免溶液過(guò)熱。最終菌液變清即可,10 000 r/m,4℃離心3 min,收集上清中的可溶性蛋白。用Binding Buffer將菌體裂解液等倍稀釋后負(fù)載上柱,流速為10倍柱體積/h,收集流穿液。使用15倍柱體積的Soluble Binding Buffer沖洗柱子,洗去雜蛋白。使用適量Soluble Elution Buffer洗脫,收集洗脫峰。洗脫后,依次使用10倍柱體積的去離子水洗滌柱子,再用3倍柱體積的20%乙醇平衡乙醇要將填料浸沒(méi),封柱后2~8℃保存。
可溶性蛋白和包涵體蛋白純化方式主要是確定Bingding Buffer(組分Tris-HCl、immdazol、NaCl)和Elution Buffer(組分Tris-HCl、immdazol、NaCl)的中的咪唑的濃度,使用梯度咪唑濃度洗脫蛋白,通過(guò)SDS-PAGE和Western Blot檢測(cè)目的蛋白的純度和活性。
1.2.6 重組蛋白BCV-28a-N-DE3和BCV-32a-N-DE3的Western blot分析
將收集的菌液,10 000 r/min離心1 min 后棄去上清,加入20 μL 5×上樣緩沖液和80 μL去離子水懸浮菌體煮沸10 min,進(jìn)行SDS- PAGE電泳。用考馬斯亮藍(lán)染色鑒定牛冠狀病毒N蛋白的表達(dá)。使用半干式轉(zhuǎn)膜儀,將SDS-PAGE凝膠上的蛋白樣品轉(zhuǎn)印到0.45 μm NC 膜上(300 mA,50 min),用Western blot膜封閉液封閉1 h,TBST洗滌3次,每次5 min,加入稀釋的牛冠狀病毒陽(yáng)性血清,37℃孵育2 h,TBST 洗滌3~5次,每次5~10 min,加入1∶4 900稀釋的辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的山羊抗牛IgG,孵育2 h,TBST洗滌3~5次,每次5~10 min ,加入DAB顯色液進(jìn)行顯色反應(yīng),于顯色完成后用水終止。
2.1 PCR檢測(cè)牛冠狀病毒
應(yīng)用PCR方法對(duì)新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品141份,陽(yáng)性份數(shù)87份,總陽(yáng)性率:61.7%,擴(kuò)增出預(yù)期的目的片段大小,進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果顯示N基因的序列與標(biāo)準(zhǔn)序列同源性達(dá)到98.22%,同源性較高,說(shuō)明檢測(cè)的犢牛樣品中含有冠狀病毒。
牛冠狀病毒主要的結(jié)構(gòu)蛋白基因是N基因,N基因高度保守,可作為診斷BCV的候選基因。PCR檢測(cè)結(jié)果表明新疆部分地區(qū)腹瀉犢牛遭受冠狀病毒感染。圖1,圖2,表5
表5 新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品RT-PCR陽(yáng)性檢測(cè)結(jié)果
Table 5 The main part of Xinjiang area scale test results positive fecal samples of RT-PCR cattle calf diarrhea
主要規(guī)?;?chǎng)Major scale cattle farm樣品總數(shù)Number of samples陽(yáng)性份數(shù)Positive number陽(yáng)性率Positive rate (%)石河子某A規(guī)?;?chǎng)12650.00沙灣縣某A規(guī)?;膛?chǎng)111090.90沙灣某B規(guī)?;?chǎng)16743.75沙灣某C規(guī)模化牛場(chǎng)10550.00奎屯某A規(guī)?;?chǎng)232295.65奎屯某B規(guī)模化牛場(chǎng)8675.00奎屯某C規(guī)?;?chǎng)8450.00奎屯某D規(guī)?;?chǎng)9888.88奎屯某E規(guī)?;?chǎng)11545.45奎屯某F規(guī)?;?chǎng)1218.30奎屯某G規(guī)模化牛場(chǎng)11763.63沙灣某B規(guī)?;?chǎng)10660.00總計(jì)1418761.70
注:*上述健康犢牛血清采集石河子某試驗(yàn)站
Note:
注:M:Maker;12:陰性對(duì)照;1~4、8未擴(kuò)增出牛冠狀病毒基因;5~7、9~11:牛冠狀病毒N基因克隆產(chǎn)物
Note: M:Maker; 12: negative control; 1-4 and 8 did not amplify the coronavirus gene; 5-7, 9-11: Bovine coronavirus N gene clone product
圖1 某A規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便冠狀病毒基因擴(kuò)增
Fig.1 A scale cattle feces of calves diarrhea coronavirus gene amplification detection results
注:M:Maker;19:陰性對(duì)照;1~18、20~24:均擴(kuò)增出牛冠狀病毒N基因部分基因355 bp
Note: M:Maker; 19: Negative control; 1-18, 20-24: All the N genes of bovine coronavirus were amplified by partial 355 bp gene
圖2 某B規(guī)模化牛場(chǎng)牛場(chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品冠狀病毒基因擴(kuò)增
Fig.2 B large-scale dairy cattle calves fecal samples of diarrhea coronavirus gene amplification detection results
2.2 ELISA檢測(cè)
(1)檢測(cè)新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛樣品 141份,陽(yáng)性數(shù)99份,陽(yáng)性率70.21%。表6
2.3 牛冠狀病毒N基因的擴(kuò)增
用BCV- N-F/BCV- N-R引物擴(kuò)增N基因,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)到約1 400 bp條帶,與預(yù)期結(jié)果相符。圖3
表6 新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品雙抗體夾心法ELISA陽(yáng)性檢測(cè)
Table 6 The main part of the Xinjiang scale of dairy calves diarrhea stool samples of double antibody sandwich ELISA positive test results
主要規(guī)?;?chǎng)Major scale cattle farm樣品數(shù)Number of samples陽(yáng)性數(shù)Positive number陽(yáng)性率Positive rate (%)石河子某A規(guī)?;?chǎng)121083.33沙灣縣某A規(guī)?;膛?chǎng)11981.81沙灣某B規(guī)?;?chǎng)161487.50沙灣某C規(guī)模化牛場(chǎng)10880.00奎屯某A規(guī)?;?chǎng)232191.30奎屯某B規(guī)?;?chǎng)8225.00奎屯某C規(guī)模化牛場(chǎng)8562.50奎屯某D規(guī)?;?chǎng)9444.00奎屯某E規(guī)?;?chǎng)111090.90奎屯某F規(guī)模化牛場(chǎng)12216.66奎屯某G規(guī)?;?chǎng)11981.00沙灣某B規(guī)模化牛場(chǎng)10550.00總計(jì)1419970.21
注:健康犢牛血清采集自石河子某實(shí)驗(yàn)站
注:M:DNA 標(biāo)準(zhǔn)MarKer 5 000;1、3:N基因產(chǎn)物;2:陰性對(duì)照
Note: M:DNA standard MarKer 5,000; 1, 3:N gene products; 2: Negative control
圖3 N基因的擴(kuò)增結(jié)果
Fig.3 The amplification result of N gene
2.4 鑒定重組克隆載體PMD 19-T-N
分別采用雙酶切法鑒定重組質(zhì)粒PMD19-T-N,用EcoRΙ/HindⅢ酶切片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)到約1 400 bp片段和約4 000 bp處可見(jiàn)清晰條帶,與預(yù)期結(jié)果一致。圖4
2.5重組原核表達(dá)載體PMD19-T-28a-N和PMD19-T-32a-N的雙酶切及測(cè)序結(jié)果鑒定
將PMD19-T-28a-N 用EcoRΙ/HindⅢ雙酶切鑒定,以2.0%瓊脂糖凝膠電泳分析,結(jié)果分別在1 400 bp和5 369 bp出可見(jiàn)清晰條帶(圖5)和(圖6),同時(shí)將保守序列測(cè)序結(jié)果與牛冠狀病毒N基因標(biāo)準(zhǔn)毒株Mebus株基因序列應(yīng)用DNAMAN軟件進(jìn)行在線(xiàn)比對(duì)同源性達(dá)到98.22%(部分測(cè)序結(jié)果圖7)。圖5~7
注:M:DNA 標(biāo)準(zhǔn)MarKer 5 000 bp.1、2、3、4、5雙酶切后的目的條帶;6:未進(jìn)行雙酶切的PMD19-T-N質(zhì)粒
Note: M:DNA MarKer 5,000 bp.1, 2, 3, 4, 5 after double digestion to strip; 6: NO PMD19-T-N plasmid double digestion
圖4 PMD19-T-N 酶切鑒定結(jié)果
Fig.4 Enzyme digestion of PMD19-T -N
2.6 目的蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE檢測(cè)
重組菌經(jīng)IPTG誘導(dǎo),SDS-PAGE經(jīng)分析表明,目的蛋白成功表達(dá),重組蛋白相對(duì)分子質(zhì)量約為54KD,與理論分析值相符。圖8
2.6.1 重組BCV-N-28a-DE3蛋白上清或包涵體的鑒定(圖9)
注:M:5 000 bp Maker.1、2、3:雙酶切后的目的條帶;4:未進(jìn)行雙酶切的陰性對(duì)照
Note: M:5,000 bp Maker.1, 2, 3: Target bands after double enzyme digestion; 4: Negative control without double enzyme digestion
圖5 PMD19-T-28a-N 酶切鑒定
Fig.5 Enzyme digestion of PMD19-T-28a-N
注:M:5 000 bp Maker.1、2:雙酶切后的目的條帶;3:未進(jìn)行雙酶切的陰性對(duì)照
Note: M:5,000 bp Maker.1, 2: Target bands after double enzyme digestion; 3: Negative control without double enzyme digestion
圖6 PMD19-T-32a-N 酶切鑒定
Fig.6 Enzyme digestion of PMD19-T-32a-N
圖7 牛冠狀病毒N基因保守序列測(cè)序結(jié)果部分
Fig.7 Sequence map of N gene of bovine coronavirus
注:M:蛋白分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。1、2、3、4加IPTG誘導(dǎo)的重組菌;5:PMD19-T-28a-N未誘導(dǎo)對(duì)照
Note: The molecular weight standard of M: protein. 1, 2, 3, 4 and IPTG induced recombinant bacteria; 5:PMD19-T-28a-N was not induced
圖8 重組蛋白 PMD19-T-28a-DE3-N SDS-PAGE分析
Fig.8 SDS-PAGE analysis of recombinant protein of PMD19-T-28a-DE3-NSDS-PAGE
注:2~6為蛋白表達(dá)在上清,1、7~9為蛋白表達(dá)在包涵體
Note: Description: 2-6 protein was expressed in supernatant, 1 and 7-9 were expressed in inclusion bodies
圖9重組BCV-N-28a-DE3蛋白上清或包涵體的鑒定
Fig.9 Identification of recombinantBCV-N-28a-DE3proteinsupernatantorinclusionbody
2.6.2 BCV-N-32a-DE3蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE鑒定
對(duì)加入誘導(dǎo)劑的菌進(jìn)行不同時(shí)間段收菌,同時(shí)設(shè)置未加誘導(dǎo)劑的作為對(duì)照,經(jīng)SDS-PAGE進(jìn)行蛋白表達(dá)及表達(dá)量的鑒定。圖10
注:M:蛋白分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn);1~4:32a-N誘導(dǎo)2、4、6、8 h; 5:32a-N未誘導(dǎo);6~7:32a-DE3未誘導(dǎo)
Note: M: Protein molecular quality standard; 1-4:32a-N induced 2, 4, 6, and 8h.5:32a-N did not induce; 6-7:32a-DE3 was not induced
圖10 BCV-N-32a-DE3蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及SDS-PAGE鑒定
Fig.10InducibleexpressionofBCV-N-32a-DE3proteinandidentificationofSDS-PAGE
2.6.3 BCV-N-32a-DE3蛋白表達(dá)的上清或包涵體鑒定(圖11)
注:M:廣譜彩虹預(yù)染Maker; 說(shuō)明:1~7為包涵體表達(dá),9~11為上清表達(dá)
Note: M: Broad-spectrum rainbow pre staining Maker; Description: 1-7 For inclusion body expression, 9-11 For supernatant expression
圖11 BCV-N-32a-DE3蛋白表達(dá)的上清或包涵體鑒定
Fig.11 Identification of the supernatant or inclusion body of the expressionofBCV-N-32a-DE3protein
2.6.4 BCV-N-28a-DE3表達(dá)的蛋白純化結(jié)果
目的蛋白純化后目的蛋白的大小與理論值相符約54 KD。圖12
注:M:廣譜彩虹預(yù)染Maker;1:對(duì)照;2~4為500 mmoL咪唑洗脫下蛋白純化的結(jié)果
Note: M: Broad-spectrum rainbow pretreated Maker; 1: Contrast; 2-4 purified by 500mmol imidazole eluted protein
圖12重組表達(dá)蛋白BCV-N-28a-DE3表達(dá)的蛋白純化
Fig.12 Protein purification of recombinantexpressionproteinBCV-N-28a-DE3
2.6.5 BCV-N-32a-DE3表達(dá)的蛋白純化結(jié)果
全菌采用50 mM Tris-HCL(pH=7.9),300 mM NaCl,50 mM Imidazole含1%的TritonX-100,1 mM DTT,1 mMPMSF超聲裂解,同時(shí)以50 mM Tris-HCL(pH=7.9),300 mM NaCl,50 mM Imidazole平衡Ni柱之后用250 mmol、500 mmol咪唑的平衡緩沖液洗脫目的蛋白,并收集每個(gè)洗脫組分,整個(gè)過(guò)程在低溫下操作,進(jìn)行SDS-PAGE分析檢測(cè)。圖13,圖14
注:M:廣譜彩虹預(yù)染Marker,2~6為250 mmoL咪唑洗脫下目的蛋白純化的結(jié)果
Note: M: Broad spectrum rainbow pre dye Marker, 2-6 Purified result of 250mmol imidazole eluted target protein
圖13重組表達(dá)蛋白BCV-N-32a-DE3表達(dá)的蛋白純化
Fig.13 Protein purification of recombinantexpressionproteinBCV-N-32a-DE3
注:M:廣譜彩虹預(yù)染Marker,1~4、5~12、17~21為500 mmoL咪唑洗脫下目的蛋白純化的結(jié)果
Note: M: Broad-spectrum rainbow pre dye Marker, 1-4, 5-12, 17-21 for 500mmol imidazole eluted target protein purification results
圖14重組表達(dá)蛋白BCV-N-32a-DE3表達(dá)的蛋白純化
Fig.14 Protein purification of recombinantexpressionproteinBCV-N-32a-DE3
2.7牛冠狀病毒重組表達(dá)BCV-N-28a-DE3和BCV-N-32a-DE3的Western blot鑒定
重組菌表達(dá)產(chǎn)物通過(guò)Western blot進(jìn)行分析。其結(jié)果顯示,在54 KD處有明顯條帶,與預(yù)期值相符,在70 KD處有明顯條帶,同樣與預(yù)期值相符Western blot分析結(jié)果表明,表達(dá)的重組N蛋白可以與牛冠狀病毒陽(yáng)性血清發(fā)生特異性免疫學(xué)反應(yīng),證實(shí)表達(dá)的重組N蛋白具有良好的反應(yīng)原性。圖15,圖16
2.7.1 重組表達(dá) BCV-N-28a-DE3蛋白的Western blot的鑒定
注:M:蛋白質(zhì)分子標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量 Marker;1、2純化后的PMD19-T-28a-DE3-N 融合蛋白
Note: M: Protein molecular standard mass Marker; 1 and 2 purified PMD19-T-28a-DE3-N fusion protein
圖15 融合蛋白的Western blot分析
Fig.15 Western blot analysis of fusion protein
注:M:蛋白質(zhì)分子標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量 Marker;1~4:純化的重組蛋白N與牛冠狀病毒陽(yáng)性血清發(fā)生反應(yīng)(陽(yáng)性血清濃度:分別是1~2,1:100;3~4,1:50)。5~6:純化的重組蛋白N與牛陰性血清不發(fā)生反應(yīng)
Note: M: Protein quality standard Marker; 1-4: Recombinant protein N and Bovine coronavirus positive serum purified reaction (positive serum concentration were 1-2, 1:100; 3-4,1:50). 5-6: Purified recombinant protein N did not react with bovine negative serum
圖16 重組表達(dá)純化的蛋白BCV-N-28a-DE3Western blot分析
Fig.16 Recombinant expression and purificationofproteinBCV-N-28a-DE3Westernblotanalysis
注:M:蛋白質(zhì)分子標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量;1:純化的重組蛋白N與牛冠狀病毒標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清發(fā)生反應(yīng)
Note: M: Protein molecular standard quality; 1: Purified recombinant protein N reacted with bovine coronavirus standard positive sera; Analysis of recombinant expression and purification protein BCV-N-28a-DE3 Western blot
圖17 重組表達(dá)純化的蛋白BCV-N-28a-DE3Western blot分析
Fig.17 Recombinant expression andpurificationofproteinBCV-N-28a-DE3Westernblotanalysis
2.7.2 重組表達(dá) BCV-N-32a-DE3蛋白的Western blot的鑒定
注:M:蛋白質(zhì)分子標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量;1~5:重組蛋白N與牛冠狀病毒陽(yáng)性血清發(fā)生反應(yīng)
Note: M: Protein molecular standard quality; 1-5: Recombinant protein N reacts with bovine coronavirus positive serum
圖18重組表達(dá)BCV-N-32a-DE3蛋白的Western blot的鑒定
Fig.18 Identification of recombinant WesternblotexpressingBCV-N-32a-DE3protein
注:M:蛋白質(zhì)分子標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)量 Marker;1~4:重組蛋白與牛冠狀病毒標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性血清發(fā)生反應(yīng)
Note: M: Protein molecular standard mass Marker; 1-4: Recombinant protein and Bovine coronavirus standard positive serum reaction
圖19重組表達(dá)BCV-N-32a-DE3蛋白的Western blot的鑒定
Fig.19 Identification of recombinant WesternblotexpressingBCV-N-32a-DE3protein
研究從新疆部分地區(qū)采集規(guī)?;?chǎng)中采集腹瀉犢牛的糞便,對(duì)采集的糞便進(jìn)行恰當(dāng)?shù)奶幚?,?yīng)用牛冠狀病毒抗原檢測(cè)試劑盒檢測(cè)新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛樣品 141份,陽(yáng)性數(shù)99份,陽(yáng)性率70.21%。應(yīng)用PCR方法對(duì)新疆部分地區(qū)主要規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便樣品141份,陽(yáng)性份數(shù)87份,總陽(yáng)性率為61.7%,綜合PCR方法和ELISA方法的檢出結(jié)果感染牛冠狀病毒腹瀉犢牛糞便陽(yáng)性率在61.7%~70.21%,這與張坤等[8]運(yùn)用PCR和ELISA方法對(duì)新疆北疆部分地區(qū)規(guī)模化牛場(chǎng)冠狀病毒感染率略高,研究對(duì)新疆部分地區(qū)規(guī)?;?chǎng)腹瀉犢牛糞便中病原的調(diào)查具有一定的參考意義。
BCV是20世紀(jì)70年代初期發(fā)現(xiàn)的導(dǎo)致?tīng)倥8篂a病毒的主要病原之一,是引起新生犢牛出血性腹瀉,表現(xiàn)為急性大規(guī)模的爆發(fā)與流行,劇烈腹瀉,持續(xù)時(shí)間長(zhǎng)、犢牛急劇消瘦、排噴射狀的糞便導(dǎo)致脫水嚴(yán)重、排黑色糞便中帶血,另有研究表明,犢牛腸道感染和呼吸道感染可能由同一型BCV引起的感染[3、4]。犢牛腹瀉病原有細(xì)菌、病毒、寄生蟲(chóng)等均可導(dǎo)致?tīng)倥8篂a,給畜牧業(yè)造成了極大的損失。1972年Mebus等[5]在成年牛和犢牛的腹瀉物中通過(guò)電鏡法檢出BCV,1985年宋廣林等[6]、1990年姚火春等[7]對(duì)于冠狀病毒在我國(guó)的存在和流行進(jìn)行了研究。張坤等[8]進(jìn)行了牛冠狀病毒的分子流行病學(xué)調(diào)查,并繪制了系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),對(duì)核苷酸同源性的問(wèn)題作了介紹。
冠狀病毒是目前已知RNA病毒中最大的病毒,使得人和多種動(dòng)物易于感染,冠狀病毒基因組極易發(fā)生重組,在基因組的結(jié)構(gòu)特征方面牛冠狀病毒呈現(xiàn)遺傳的多樣性。N蛋白構(gòu)成牛冠狀病毒的核衣殼,是病毒的主要結(jié)構(gòu)蛋白,與病毒的致病性方面有關(guān)。喬軍等[9]研究表明N蛋白其結(jié)構(gòu)蛋白中保守性很高的蛋白,發(fā)現(xiàn)其N(xiāo)蛋白具有高度螺旋結(jié)構(gòu),與Motokawa等[10]的研究一致。為了證明N蛋白在復(fù)制、翻譯、致病性等方面起作用,基于體外的復(fù)制實(shí)驗(yàn),從RNA復(fù)制、加工中發(fā)現(xiàn)牛傳染性胃腸炎結(jié)構(gòu)蛋白N蛋白所制備的抗血清,在體外復(fù)制實(shí)驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)能抑制90%的基因的合成。說(shuō)明N蛋白在致病性、復(fù)制及翻譯過(guò)程中起作用。N蛋白發(fā)現(xiàn)牛在感染該病毒早期,體內(nèi)就能產(chǎn)生抗蛋白的高水平抗體,N蛋白是病毒的主要免疫原蛋白之一,可誘發(fā)機(jī)體產(chǎn)生有效的免疫應(yīng)答。在糖基化修飾,蛋白折疊的影響方面,冠狀病毒N蛋白的主要抗原表位,不受糖基化的修飾,蛋白折疊的影響,可應(yīng)用常規(guī)的原核表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行表達(dá),而且表達(dá)量很高,Seo和Seah等[11-12]、Peng 等[13]等分別對(duì)在研究雞傳染性支氣管炎病毒、嵌合小鼠肝炎病毒、豬傳染性胃腸炎病毒N蛋白時(shí)發(fā)現(xiàn):N蛋白與CTL表位和B細(xì)胞表位,病毒的組織嗜性有關(guān)的區(qū)域及抗原位點(diǎn)有關(guān)。冠狀病毒的N蛋白是高度保守、抗原性和免疫原性比較強(qiáng)、N蛋白在BCV不同毒株間變異小并且在病毒RNA的包裝和復(fù)制中起重要作用的核衣殼蛋白,在病毒感染中可大量表達(dá),核衣殼蛋白可作為病毒感染的靶抗原,具有重要的意義。由于冠狀病毒核衣殼蛋白N基因序列高度保守,可用于基因分型的鑒定。這與張婉琪等[14]利用同源性分析的研究發(fā)現(xiàn)N蛋白高度保守,而在不同屬冠狀病毒之間保守性很低且不完全一致。
4.1 應(yīng)用PCR和ELISA方法對(duì)新疆北疆部分地區(qū)規(guī)模化牛場(chǎng)中致?tīng)倥8篂a主要病原冠狀病毒進(jìn)行了調(diào)查,發(fā)現(xiàn)有較高的感染率,對(duì)規(guī)?;?chǎng)采取積極的防控提供依據(jù)。所采集141份腹瀉犢牛糞便中,用ELISA檢測(cè)陽(yáng)性率70.21%;再用PCR檢測(cè)出陽(yáng)性率為61.7%。犢牛冠狀病毒是導(dǎo)致石河子、沙灣、奎屯等10個(gè)規(guī)?;膛?chǎng)和部分肉牛場(chǎng)犢牛腹瀉的主要病原;ELISA方法和PCR方法結(jié)合應(yīng)用檢測(cè)犢牛冠狀病毒效果具有參考意義。
4.2 在PET-28a和PET-32a原核表達(dá)系統(tǒng)中高效表達(dá)了BCV N蛋白,并進(jìn)行了免疫印跡實(shí)驗(yàn),N蛋白具有很強(qiáng)的免疫反應(yīng)性。