王慧宇,趙龍,范中濤,呂珽
(西昌學(xué)院,四川 西昌 615013)
建昌黑山羊廣泛分布于涼山彝族自治州,該品種山羊耐粗飼、易管理、抗病力強、生產(chǎn)性能較高,在當?shù)氐胤浇?jīng)濟發(fā)展中占有很重要的地位[1]。DNA分子標記是以個體間核苷酸序列變異為基礎(chǔ)的遺傳標記,是DNA水平遺傳變異的直接反映。在分子遺傳標記中,單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)技術(shù)是最常用的方法之一,主要用于檢測堿基突變[2]。類固醇21-羥化酶,是腎上腺類固醇激素合成調(diào)控的關(guān)鍵酶之一,由CYP21基因編碼,包含10個外顯子和9個內(nèi)含子。17-羥孕酮及孕酮在21-羥化酶的作用下,分別轉(zhuǎn)化成脫氧皮質(zhì)醇和脫氧皮質(zhì)酮,最終產(chǎn)物分別是去氧皮質(zhì)醇和去氧皮質(zhì)酮[3]。而17-羥孕酮、孕酮、皮質(zhì)醇等類固醇激素在調(diào)節(jié)動物的繁殖、生長及生命活動中具有重要作用。
1.1 羊群來源及樣本采集 檢測羊群來自四川省會理縣建昌黑山羊種羊場,采集具有不同產(chǎn)羔數(shù)的母羊的血液樣本62份,記錄其生產(chǎn)數(shù)據(jù)。每只羊都從頸部靜脈采血5mL到真空采血管中,于實驗室-20℃冰柜中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2 主要試劑 血液基因DNA提取試劑盒、2×Taq PCR MasterMix(含染料)、Marker D2000、6×DNA Loading Buffer等生物制劑均購買自天根生化科技有限公司,30%Acr-Bis(29∶1)購買自 Biosharp 公司,其余是一些實驗室常規(guī)藥品。
1.3 DNA提取 血液樣品室溫下解凍,使用血液基因DNA提取試劑盒提取DNA。
1.4 引物設(shè)計與PCR擴增 根據(jù)CYP21基因DNA序列(GenBank登錄號:NC_007324),對 CYP21基因第八外顯子設(shè)計1對引物,目的片段大小為184bp,由杰李生物公司負責(zé)合成。
引物 1:CAGATTCAGCGCCGCCTTC;引物 2:ACT GCTAGGCCGCGTGGT。
PCR反應(yīng)體系:DNA模版3.0μL,引物1、引物2(10μM)各 1μL,2×預(yù)混液 13μL,雙蒸水補至 25μL,按照反應(yīng)體系加入反應(yīng)物混勻,按照PCR反應(yīng)循環(huán)進行PCR擴增。
PCR反應(yīng)循環(huán)設(shè)置:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,57℃退火30s,72℃延伸15s,共35個循環(huán);然后72℃延伸7min,4℃保存。
1.5 SSCP分析 取4μL PCR 產(chǎn)物和6μL 6×DNA Loading Buffer試劑混勻,98℃變性10min,然后冰浴5min。變性后的PCR產(chǎn)物在12%非變性聚丙烯酰胺凝膠中常溫電泳12h,電泳結(jié)束后,銀染顯帶,用凝膠成像儀分析。
12%非變性聚丙烯酰胺配方:30%非變性聚丙烯酰胺 12 mL,5×TBE 6 mL,10%過硫酸銨 200 μL,TEMD 15μL,加 ddH2O 12mL。
1.6 多態(tài)性分析 根據(jù)電泳結(jié)果進行基因多態(tài)性分析。
2.1 PCR擴增 使用1%濃度的瓊脂糖凝膠對PCR產(chǎn)物進行電泳,結(jié)果顯示PCR產(chǎn)物特異性好,且符合目的條帶大小(186bp),條帶單一、明亮(見圖 1)。2.2 SSCP分析 對PCR產(chǎn)物進行12%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,所有樣品的電泳圖像均顯示為三根條帶,無變化,不存在多態(tài)性樣本(如圖2所示)。
圖1 PCR擴增產(chǎn)物圖
圖2 PCR產(chǎn)物的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳圖
本次試驗結(jié)果表明,建昌黑山羊CYP21基因的第八外顯子基因序列不存在多態(tài)性,與其產(chǎn)羔數(shù)并無關(guān)聯(lián)。閆艷[4]研究表明:遼寧絨山羊、波爾山羊、內(nèi)蒙古絨山羊、濟寧青山羊、安哥拉山羊5個山羊品種的CYP21基因第八外顯子均沒有多態(tài)性,與本試驗結(jié)果一致,說明這段基因序列在各個山羊品種中的保守性高。楊志敏等[5]的研究結(jié)果表明:小尾寒羊、特克塞爾羊、多賽特羊、湖羊4個綿羊品種的CYP21基因第八外顯子具有多態(tài)性。其原因可能是綿羊與山羊的CYP21基因本身就存在差別,綿羊CYP21基因第八外顯子的保守性低,易突變,而建昌黑山羊的CYP21基因第八外顯子具有高度保守性,出現(xiàn)基因突變的概率比較低所致;還可能是由于本次試驗樣本數(shù)量少,品種單一,未做不同品種間的比較所致。本試驗初步得出建昌黑山羊的CYP21基因第八外顯子不存在多態(tài)性,為以后建昌黑山羊的育種工作提供了借鑒。但建昌黑山羊CYP21基因的其余外顯子是否存在多態(tài)性以及多態(tài)性是否與產(chǎn)羔數(shù)相關(guān),還需進一步研究。