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      測基因,知壽命

      2018-05-25 04:53:40
      看世界 2018年10期
      關(guān)鍵詞:索菲亞基因組測序

      “我們正在著手編寫生命之書中最激動(dòng)人心的一個(gè)章節(jié),”惠康基金會(huì)桑格研究所所長艾倫·布拉德利博士說道,他對于人類基因組計(jì)劃的成功感到十分高興。10多年前,完成一套人類基因組測序的花費(fèi)是300億美元(約合人民幣1900億元),耗時(shí)長達(dá)13年?,F(xiàn)在,只需不到500美元就可進(jìn)行基因組測序。

      英國牛津納米孔公司開發(fā)了一種手持基因測序儀,可在幾分鐘內(nèi)完成簡單的基因測序工作。該公司首席執(zhí)行官戈登·桑格拉談到了公司的遠(yuǎn)大愿景:“如果擁有實(shí)時(shí)DNA信息,那么就可以實(shí)現(xiàn)生物聯(lián)網(wǎng),這與我們公司的遠(yuǎn)大愿景非常吻合:讓任何人在任何地方都可以獲取DNA信息?!倍麄冮_發(fā)的便攜測序儀MinION就可以完成這個(gè)工作。

      戈登·桑格拉認(rèn)為這項(xiàng)技術(shù)不僅可以應(yīng)用于醫(yī)療保健行業(yè),也可用于檢測餐廳、食品加工廠中食物或供水系統(tǒng)是否存在有害微生物,還可以用于犯罪現(xiàn)場的DNA分析。“基因組測序就像是最后一道條形碼?!备甑恰ど8窭f道。

      一條單鏈DNA的大小大約是一根頭發(fā)的萬分之一,MinION的工作原理就是將DNA的一條鏈通過納米級的小孔,與此同時(shí),納米孔上會(huì)通過離子電流,DNA或RNA的序列由核酸鏈依次通過小孔過程中電流的變化決定。只需十分鐘,就能夠快速、經(jīng)濟(jì)地生產(chǎn)出長達(dá)上萬個(gè)堿基的讀長。

      迄今為止,牛津納米孔公司已籌集到超過4.5億英鎊(約合人民幣39億元)的投資,桑格拉也堅(jiān)信這樣的便攜測序儀最終會(huì)被用于家庭中常見感染病的自我診斷,從而減少醫(yī)生不必要的出診時(shí)間和解決醫(yī)院醫(yī)生濫開抗生素的問題。

      “在未來10年內(nèi),對嬰兒進(jìn)行基因測序?qū)⒊蔀榭赡??!鄙8窭f道,“并且我們可以對DNA分子信息做檢測,分析它所含有的各種基因情況,使人們能夠了解自己的基因信息,預(yù)知身體患疾病的風(fēng)險(xiǎn),從而避免或延緩疾病的發(fā)生?!?/p>

      另一方面,隨著基因組測序成本的降低,每天都會(huì)有海量的DNA序列產(chǎn)生,使得生物數(shù)據(jù)量呈指數(shù)規(guī)模增長。據(jù)DNA測序公司Illumina(該公司總市值達(dá)350億美元)估計(jì),目前全球已有超過50萬個(gè)人類基因組完成測序。

      但要如何將這些數(shù)據(jù)與其他數(shù)據(jù)相結(jié)合并進(jìn)行分析呢?成立于2007年的英國生物銀行目前已經(jīng)登記了50萬名志愿者的匿名醫(yī)療數(shù)據(jù),他們希望通過建立這樣一個(gè)豐富的研究數(shù)據(jù)庫,從而改善居民健康狀況。

      美國馬薩諸塞州波士頓布萊根婦女醫(yī)院的調(diào)查人員利用英國生物銀行的數(shù)據(jù),更好地了解輪班工作,尤其是頻繁的夜班工作如何導(dǎo)致2型糖尿病的發(fā)生。研究小組發(fā)現(xiàn),與日間工人相比,所有輪班工人都更容易患2型糖尿病,長期夜班工人除外。在考慮到其他已確定的危險(xiǎn)因素后,那些不定時(shí)輪班和通常夜班工作的人患2型糖尿病的可能性高出44%。

      現(xiàn)在,基因數(shù)據(jù)還會(huì)與其他數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)。今年4月份,英國生物樣本庫宣布了一項(xiàng)重大舉措,將對5萬名志愿參與者的全基因組進(jìn)行測序。全基因組測序?qū)⒂?018年和2019年在英國劍橋的惠康桑格研究所開展,由英國醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)(MRC)提供3000萬英鎊(約合人民幣2.6億元)的資助。

      更加便攜的基因測序儀,可在幾分鐘內(nèi)完成簡單的基因測序工作

      生物制藥公司再生元制藥與其他七家公司組成的聯(lián)盟目前正在資助另外45萬名參與者的外顯子組測序——外顯子組由活躍的基因組成,大約占人類基因組的2%。聯(lián)盟每位成員分別提供了1000萬美元(約合人民幣6332萬元)的資助。

      同時(shí),利用人工智能對這些基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,有望精確預(yù)測每個(gè)腫瘤的復(fù)雜性,從而開發(fā)出適合臨床環(huán)境的個(gè)性化癌癥治療手段。來自瑞士的索菲亞遺傳公司已經(jīng)創(chuàng)造了數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)醫(yī)療的集體人工智能,名為“索菲亞”?!八鞣苼啞笨梢宰x取并合計(jì)DNA的遺傳密碼,甚至能預(yù)測和診斷基因疾病,該公司表示,“索菲亞”平臺目前正在被55個(gè)國家的400多家醫(yī)院使用,已經(jīng)分析了20多萬名患者的基因組圖譜。

      “自從成立以來,我們的愿景是為集體人工智能鋪路,以平等地幫助患者,為他們提供個(gè)性化治療方案,無論他們住在哪里?!惫綜EO兼聯(lián)合創(chuàng)始人喬奇·康布隆說道。

      僅需幾分鐘,“索菲亞”就能處理完數(shù)十億的數(shù)據(jù)點(diǎn),再由醫(yī)生專家對數(shù)據(jù)結(jié)果進(jìn)行判斷、分類,并加以完善,而“索菲亞”也會(huì)進(jìn)行機(jī)器學(xué)習(xí),不斷改善診斷速度和精確性。以往需要幾個(gè)月,現(xiàn)在只需要幾小時(shí)就能完成檢測。

      更多地應(yīng)用于商業(yè)用途

      “我們正在進(jìn)入一個(gè)新時(shí)代,可以通過分析收集到的癌癥病例數(shù)據(jù),來判斷某一個(gè)疑似癌癥患者到底得了哪種癌癥,從而幫助醫(yī)生制定個(gè)性化治療方案?!笨挡悸≌f道。“我們的人工智能引擎最近開始可以從醫(yī)療影像(比如腫瘤圖像)中提取有用信息,如果醫(yī)生能夠得知腫瘤在未來的一段時(shí)間內(nèi)的生長情況,就可以決定是否要立刻實(shí)施手術(shù)。”

      “我們正身處醫(yī)療改革的開端,”阿斯利康制藥有限公司副總裁魯思·馬馳說道,“隨著人們越來越了解導(dǎo)致患病的基因遺傳突變情況,主治醫(yī)師也能為患者制定最佳的藥物治療方案。”

      也有公司認(rèn)為,將基因組數(shù)據(jù)與其他健康數(shù)據(jù)相結(jié)合,可以幫助人類了解自身健康情況,從而過上更長壽、更健康的生活。比如由人類基因組研究領(lǐng)域的領(lǐng)軍人物克雷格·文特爾博士創(chuàng)立的人類長壽公司(HLI)致力于以個(gè)人基因組大數(shù)據(jù)為基石,破解人類基因密碼,最終延長人類壽命。

      “從前我們只能等人生病了,才去進(jìn)行治療。而現(xiàn)在,我們想要改變這種醫(yī)學(xué)現(xiàn)狀?!蔽奶貭栒f道。HLI與人體成分分析方面的領(lǐng)頭公司Amra合作,準(zhǔn)備將基因組分析與代謝輪廓分析相結(jié)合,目標(biāo)是只需經(jīng)過6分鐘掃描就可讓患者詳細(xì)了解自身的肌肉和脂肪情況。

      在人類成功繪制出基因組序列圖之際,人們對未來的醫(yī)學(xué)充滿了各種期待,但想取得戲劇性的醫(yī)學(xué)突破卻很難。“人類基因組計(jì)劃的完成為更好地了解和治療疾病提供了巨大的希望,但人們往往很容易就忽略了基因與疾病和人體健康之間的復(fù)雜關(guān)系?!盜BMWatson基因組學(xué)科研團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人拉克希米·帕里達(dá)說道。

      當(dāng)然,這一切還只是開始,在基因組時(shí)代,醫(yī)療保健領(lǐng)域正在發(fā)生不可逆轉(zhuǎn)的變化。

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