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      基于CNKI數(shù)據(jù)庫(kù)的國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)分析

      2018-05-24 04:16:56邱志凌胡元會(huì)褚瑜光石晶晶薄榮強(qiáng)
      關(guān)鍵詞:帕金森病線粒體資助

      邱志凌,胡元會(huì),褚瑜光,石晶晶,薄榮強(qiáng)

      線粒體不僅是提供能量、調(diào)節(jié)信號(hào)的重要細(xì)胞器,也是活性氧(ROS)的主要來(lái)源。損傷的線粒體產(chǎn)生過(guò)多的ROS,損傷DNA和蛋白結(jié)構(gòu),進(jìn)一步引起線粒體功能失調(diào)[1]。因此,及時(shí)地清除損傷線粒體,對(duì)細(xì)胞的正常生長(zhǎng)至關(guān)重要。2004年Kissova等[2]在對(duì)酵母的研究中首次發(fā)現(xiàn)選擇性降解線粒體的現(xiàn)象,2005年Lemasters 等[3]正式提出“線粒體自噬”這一術(shù)語(yǔ)。線粒體自噬由于選擇性地降解受損線粒體,對(duì)維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)有重要作用,且作為一個(gè)新興的研究方向。本文采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法,對(duì)國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行檢索分析,探索國(guó)內(nèi)線粒體自噬的研究熱點(diǎn)和研究方向。

      1 材料與方法

      以中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)(CNKI)為資料來(lái)源,以“線粒體自噬”為主題詞,檢索時(shí)限為2004-01-01至2017-09-01發(fā)表的文獻(xiàn),共獲文獻(xiàn)383篇,對(duì)全部文獻(xiàn)進(jìn)行計(jì)量學(xué)分析,以文獻(xiàn)發(fā)表年度、學(xué)科領(lǐng)域、基金資助、研究人員機(jī)構(gòu)分布、被引頻次及高頻關(guān)鍵詞為對(duì)象進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,研究線粒體自噬的相關(guān)文獻(xiàn)的研究特點(diǎn)及發(fā)展規(guī)律。

      2 結(jié)果

      2.1 文獻(xiàn)發(fā)表年度趨勢(shì)分析 自2004-01-01至2017-09-01共檢索相關(guān)文獻(xiàn)383篇,檢索得到最早的文獻(xiàn)發(fā)表于2006年,發(fā)文數(shù)量2010~2013年增長(zhǎng)緩慢,2013年后增長(zhǎng)速度明顯加快,2014~2017年,共有315篇,約占文獻(xiàn)總數(shù)的82%。其中,2016年發(fā)表文獻(xiàn)最多,共有110篇。2017年截至目前(09-01),共發(fā)表50篇,依據(jù)之前的發(fā)展趨勢(shì),CNKI分析系統(tǒng)預(yù)測(cè)2017年全年可發(fā)表文獻(xiàn)132篇(圖1,表1)。

      2.2 研究機(jī)構(gòu)分布分析 經(jīng)分析統(tǒng)計(jì),發(fā)表文獻(xiàn)8篇以上的研究機(jī)構(gòu)共有9所,分別是華東師范大學(xué)、浙江大學(xué)、河北醫(yī)科大學(xué)、天津體育學(xué)院、第三軍醫(yī)大學(xué)、南方醫(yī)科大學(xué)、第四軍醫(yī)大學(xué)、山東大學(xué),武警后勤學(xué)院。其中華東師范大學(xué)發(fā)表文獻(xiàn)數(shù)量最多,為18篇。

      圖1 各年度發(fā)表線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)

      表1 各年度國(guó)內(nèi)發(fā)表線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)

      表2 國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)資助分布

      2.3 基金資助分布分析 通過(guò)對(duì)納入文獻(xiàn)基金分布情況分析,獲得基金資助的文獻(xiàn)有195篇,資助3篇(含)以上的基金共有8個(gè),其中獲國(guó)家自然科學(xué)基金資助的論文篇數(shù)最多,共計(jì)121篇,約占比例31.68%。未有明確基金資助的文獻(xiàn)有187篇,約占總文獻(xiàn)數(shù)量的48.95%(表2)。

      2.4 學(xué)科類型分布情況分析 對(duì)納入文獻(xiàn)進(jìn)行學(xué)科類型分析,可大致分為33個(gè)類型(有的文獻(xiàn)涉及交叉學(xué)科)。文獻(xiàn)數(shù)量在10篇以上的有10種,依次是基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)(61篇)、神經(jīng)病學(xué)(55篇)、生物學(xué)(49篇)、腫瘤學(xué)(30篇)、體育(28篇)、內(nèi)分泌學(xué)及全身性疾病(24篇)、心血管系統(tǒng)疾病(22篇)、中藥學(xué)(17篇)、藥學(xué)(14篇)、特種醫(yī)學(xué)(11篇),見(jiàn)圖2。

      2.5 被引頻次分析 對(duì)納入文獻(xiàn)進(jìn)行被引頻次分析,未被引用的文獻(xiàn)數(shù)量為263篇,占文獻(xiàn)總量的68.67%。被引頻次在1~5次之間的文獻(xiàn)居多。被引次數(shù)最高為29次,是何云凌等發(fā)表在《生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展》的“線粒體自噬在低氧適應(yīng)中的作用”一文(表3)。

      2.6 關(guān)鍵詞及共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析 對(duì)納入文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,出現(xiàn)頻次≥6的關(guān)鍵詞共有35個(gè),部分關(guān)鍵詞及出現(xiàn)頻次如下圖所示(圖3)。其中,除線粒體自噬本身含義的關(guān)鍵詞外,出現(xiàn)頻率較高的關(guān)鍵詞還有“Parkin”、“凋亡”、“氧化應(yīng)激”、“pink1”、“帕金森病”、“運(yùn)動(dòng)”、“NIX”、“LC3”等。設(shè)節(jié)點(diǎn)出現(xiàn)頻次≥6,對(duì)高頻關(guān)鍵詞進(jìn)行共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)分析及聚類分析,結(jié)果見(jiàn)圖4。

      圖2 國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)學(xué)科類型分布

      3 討論

      本研究基于CNKI數(shù)據(jù)庫(kù),借助CNKI計(jì)量可視化分析系統(tǒng),對(duì)國(guó)內(nèi)線粒體自噬領(lǐng)域進(jìn)行了文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)分析,為研究人員開(kāi)展線粒體自噬研究提供一定參考。從國(guó)內(nèi)線粒體自噬文獻(xiàn)年度發(fā)文量來(lái)看,從2011年,國(guó)內(nèi)學(xué)者對(duì)線粒體自噬的研究興趣逐漸增強(qiáng),特別是2013~2017年,發(fā)文量增長(zhǎng)迅速。說(shuō)明線粒體自噬作為一個(gè)新興的研究熱點(diǎn),近幾年得到國(guó)內(nèi)學(xué)者的廣泛關(guān)注。從研究機(jī)構(gòu)來(lái)看,國(guó)內(nèi)有關(guān)線粒體自噬的研究主要集中在高等院校,地理位置遍布華北、華東、華南,以江浙地區(qū)較為突出,除綜合性大學(xué)外,醫(yī)學(xué)院校及體育院校占一定比例,研究者可予以關(guān)注。從基金資助的情況來(lái)看,國(guó)家自然科學(xué)基金資助的研究最多,但仍有近50%的文獻(xiàn)未有明確基金資助??梢?jiàn),國(guó)家比較重視該領(lǐng)域的研究,但資助力度和覆蓋面有待提升。

      表3 國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)被引頻次

      圖3 國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)高頻關(guān)鍵詞(30個(gè))

      圖4 國(guó)內(nèi)線粒體自噬相關(guān)文獻(xiàn)關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)關(guān)系

      從納入文獻(xiàn)涉及的學(xué)科來(lái)看,國(guó)內(nèi)線粒體自噬的研究涉及內(nèi)容廣泛,共有33個(gè)學(xué)科,涉及學(xué)科交叉。大部分為醫(yī)學(xué)類學(xué)科,其中,神經(jīng)病學(xué)、腫瘤學(xué)、內(nèi)分泌學(xué)及全身性疾病、心血管系統(tǒng)疾病的研究較多。從納入文獻(xiàn)的被引頻次來(lái)看,大部分文獻(xiàn)為零引用,占文獻(xiàn)總數(shù)的68.67%,高影響力的文獻(xiàn)較少,這說(shuō)明文獻(xiàn)質(zhì)量尚待提高。

      從納入文獻(xiàn)的高頻關(guān)鍵詞來(lái)看,除線粒體自噬本身含義外,“Parkin”、“凋亡”、“氧化應(yīng)激”、“pink1”、“帕金森病”、“運(yùn)動(dòng)”、“NIX”、“LC3”等出現(xiàn)頻次較高。體內(nèi)出現(xiàn)氧化應(yīng)激時(shí),產(chǎn)生大量ROS損傷線粒體結(jié)構(gòu)和功能,引發(fā)細(xì)胞凋亡,線粒體自噬是有效的清除損傷線粒體的方式[4]。目前研究發(fā)現(xiàn)線粒體自噬機(jī)制有幾種類型[1],其中,Pink1-Parkin通路介導(dǎo)的線粒體自噬是目前國(guó)內(nèi)研究最多的途徑。有關(guān)文獻(xiàn)顯示[5],帕金森病的主要機(jī)制是Pink1-Parkin途徑中Pink1、Parkin基因突變,使線粒體自噬障礙,導(dǎo)致神經(jīng)元ROS大量堆積及凋亡系統(tǒng)誘發(fā),對(duì)神經(jīng)元造成不可逆的損傷。NIX介導(dǎo)的線粒體自噬屬于線粒體外膜受體介導(dǎo)機(jī)制,在缺氧的情況下,NIX(BNIP3L)表達(dá)增加,誘導(dǎo)自噬去除受損或泄露線粒體,減少ROS及促凋亡因子的產(chǎn)生和釋放[6]。無(wú)論何種途徑,最終均需通過(guò)與LC3-Ⅱ結(jié)合,形成自噬體。

      從納入文獻(xiàn)關(guān)鍵詞的共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖來(lái)看,也證實(shí)線粒體自噬與“Parkin”、“凋亡”、“氧化應(yīng)激”、“pink1”、“帕金森病”、“BINP3”、“LC3”聯(lián)系緊密。從聚類的結(jié)果來(lái)看,在有關(guān)線粒體自噬的研究中,NLRP3炎性體是一類較為特殊的研究。NLRP3炎性體是目前研究最多的炎性體,它的激活多與ROS有關(guān)[7,8],且與線粒體自噬關(guān)系密切。曾俊莉等[9]在“線粒體相關(guān)的NLRP3炎性體激活”一文中,論述了線粒體自噬與NLRP3炎性體關(guān)系。

      綜上所述,近幾年線粒體自噬在國(guó)內(nèi)得到越來(lái)越多學(xué)者的關(guān)注,研究迅速發(fā)展,涉及學(xué)科廣泛。從現(xiàn)有文獻(xiàn)分析預(yù)測(cè),線粒體自噬與氧化應(yīng)激及相關(guān)反應(yīng)的關(guān)系、Pink1-Parkin途徑、線粒體自噬與凋亡的誘發(fā)和交互作用可能成為線粒體自噬的研究熱點(diǎn)和發(fā)展趨勢(shì)。神經(jīng)病學(xué)、腫瘤學(xué)、內(nèi)分泌學(xué)及全身性疾病、心血管系統(tǒng)疾病領(lǐng)域的研究人員應(yīng)給予關(guān)注。此外,應(yīng)加強(qiáng)研究機(jī)構(gòu)間的交流與合作,積極申請(qǐng)基金資助,滿足所需科技支持,提高論文影響力。

      參 考 文 獻(xiàn)

      [1]Ploumi C,Daskalaki I,Tavernarakis N. Mitochondrial biogenesis and clearance: a balancing act[J]. Febs Journal,2017,284(2):183-95.

      [2]Kissová I,Deffieu M,Manon S,et al. Uth1p is involved in the autophagic degradation of mitochondria[J]. Journal of Biological Chemistry,2004,279(37):39068-74.

      [3]Lemasters J J. Selective mitochondrial autophagy, or mitophagy, as a targeted defense against oxidative stress, mitochondrial dysfunction,and aging[J]. Rejuvenation Research,2005,8(1):3-5.

      [4]Scherz-Shouval R,Elazar Z. Regulation of autophagy by ROSPhysiology and pathology[J]. Trends BiochemSci,2011,36(1):30-8.

      [5]吳優(yōu),盧中秋,姚詠明. 線粒體自噬中pink1-parkin途徑調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 醫(yī)學(xué)研究雜志,2017,46 (03):186-188+130.

      [6]Hanna RA,Quinsay MN,Orogo AM,et al. Microtubule-associated protein1 light chain 3 (LC3) interacts with Bnip3 protein to selectively remove endoplasmic reticulum and mitochondria via autophagy[J]. J Biol Chem,2012,287(23):19094-104.

      [7]Heid ME,Keyel PA,Kamga C,et al. Mitochondrial reactive oxygen species induces NLRP3-dependent lysosomal damage and inflammasome activation[J]. Journal of Immunology,2013,191(10):5230-8.

      [8]Wu J,Yan Z,Schwartz DE,et al. Activation of NLRP3 inflammasome in alveolar macrophages contributes to mechanical stretchinduced lung inflammationand injury[J]. Journal of Immunology,2013,190(7):3590-3599.

      [9]曾俊莉,吳冠楠,宋勇. 線粒體相關(guān)的NLRP3炎性體激活[J]. 中華肺部疾病雜志:電子版, 2015,8(3):82-4.

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