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      基于CHD基因和EE0.6基因遺傳多態(tài)鑒定白枕鶴、丹頂鶴性別研究報(bào)告

      2018-03-17 06:47:44孫志明徐琪徐祿倪谷音王金美
      野生動(dòng)物學(xué)報(bào) 2018年1期
      關(guān)鍵詞:丹頂鶴染色體引物

      孫志明徐 琪徐 祿倪谷音王金美

      (1.無錫市動(dòng)物園管理處,無錫,214151;2.揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,揚(yáng)州,225009)

      白枕鶴(Grusvipio)是國家Ⅱ級(jí)保護(hù)動(dòng)物,IUCN將其列為易危(VU),丹頂鶴(Grusjaponensis)是國家Ⅰ級(jí)保護(hù)動(dòng)物,IUCN將其列為瀕危(EN),受到動(dòng)物飼養(yǎng)、保護(hù)機(jī)構(gòu)的高度重視和保護(hù)。這2種鶴均為單態(tài)性鳥,兩性形體相似,它們的性別無論是幼鳥還是成鳥都很難從外觀或行為上進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定,在人工養(yǎng)殖時(shí),給配對(duì)造成很大困難。目前這2種鶴無論是野外數(shù)量還是圈養(yǎng)數(shù)量都沒有明顯上升,圈養(yǎng)條件下成功地鑒定性別可人為提高鶴類配對(duì)指數(shù)和繁殖率。

      目前在鶴類上常見性別鑒定方法主要有利用繁殖季行為特征觀察、泄殖腔翻檢、糞便中雌激素與睪酮比例的測(cè)定、染色體分析、內(nèi)窺鏡探測(cè)等,但是這些方法準(zhǔn)確度都不高,且有的傷害性大、有的費(fèi)時(shí)費(fèi)力。隨著鳥類基因組研究發(fā)展,多個(gè)基因在非平胸鳥類W、Z染色體上均存在差異,如染色體螺旋蛋白基因(Chromo-helicase-DNA-Binding gene,CHD)。該基因在非平胸鳥類上有2個(gè)同源拷貝CHD-W和CHD-Z,而兩者的外顯子序列和大小相似,但內(nèi)含子大小卻有很大差別。又如EE0.6序列在W、Z染色體上有一段同源序列,但它們?cè)诖蟛糠中蛄猩蠀s存在差異。因此可根據(jù)W、Z染色體上基因序列差異來鑒別鳥類的性別[1-2]。與傳統(tǒng)方法相比,這種方法準(zhǔn)確、快速、方便,對(duì)動(dòng)物傷害小,在鑒定鳥類性別上起重要作用。

      基于此,本研究以無錫市動(dòng)物園飼養(yǎng)的白枕鶴和丹頂鶴為研究對(duì)象,分別運(yùn)用CHD基因鑒定法和EE0.6序列鑒定法,并根據(jù)這一結(jié)果對(duì)白枕鶴、丹頂鶴進(jìn)行配對(duì),孵化,驗(yàn)證這2種方法在鶴類性別鑒定中的可行性。

      1 材料與方法

      1.1 主要材料

      樣本來自于無錫動(dòng)物園圈養(yǎng)條件下的白枕鶴(5只,編號(hào)B1-B5)、丹頂鶴(3只,編號(hào)D1-D3)。利用乙二胺四乙酸(EDTA)或肝素鈉方法收集全血樣本。

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 基因組DNA的提取

      按照禽血DNA抽提試劑盒(北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司)說明書提取基因組DNA,利用蛋白質(zhì)核酸分析儀檢測(cè)基因組DNA的含量和純度,保存于4℃?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2 引物設(shè)計(jì)

      利用CHD基因內(nèi)含子兩側(cè)保守序列,以及EE0.6序列W、Z染色體上的特異性片斷設(shè)計(jì)特異性引物,引物信息見表1。

      1.2.3 PCR擴(kuò)增與瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)檢測(cè)

      PCR擴(kuò)增的反應(yīng)體系為20 μL,含10×Buffer(含Mg)2 μL、dNTPs(2.5 mM)2 μL、上下游引物(10 pmol/μL)各1μL、Taq酶(5U/μL)0.2 μL、模板DNA(100~200 ng/μL)1 μL、滅菌蒸餾水12.8 μL。反應(yīng)條件為94℃ 5 min;94℃50 s,57℃ 50 s,72℃ 50 s,30個(gè)循環(huán);72℃ 10 min。取5 μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),用Gene Genius凝膠成像儀分析檢測(cè)擴(kuò)增結(jié)果。

      表1 CHD 和EE0.6引物信息

      Tab.1 CHD and EE0.6 primer information

      1.2.4 白枕鶴、丹頂鶴配對(duì)與孵化記錄

      根據(jù)PCR鑒定結(jié)果,對(duì)白枕鶴、丹頂鶴配對(duì),并記錄受精蛋和孵化率。

      2 結(jié)果

      2.1 白枕鶴、丹頂鶴性別鑒定結(jié)果

      利用引物2550F/2718R對(duì)白枕鶴、丹頂鶴性染色體連鎖基因—CHD基因在W、Z兩個(gè)染色體上的同源部分進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果見圖1。從圖1可以看出,B1、B2、B3、B4、D1、D2個(gè)體僅能擴(kuò)增出1條帶,即為雄性,而B5、D3個(gè)體可擴(kuò)增出2條帶,即為雌性。利用引物組合BW/FZ、CW/FZ、CW/DZ對(duì)白枕鶴、丹頂鶴EE0.6序列W、Z兩個(gè)染色體上的同源部分進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果見圖2。從圖2可以看出,3對(duì)引物擴(kuò)增結(jié)果一致,B1、B2、B3、B4、D1、D2個(gè)體僅能擴(kuò)增出1條帶,即為雄性,而B5、D3個(gè)體可擴(kuò)增出2條帶,即為雌性。從上可以看出,2種PCR鑒定方法結(jié)果一致。

      圖1 CHD基因引物2550F/2718R擴(kuò)增結(jié)果電泳圖Fig.1 Electrophoresis diagram of amplification result of CHD gene primer 2550F/2718R 注:B1、B2、B3、B4、B5為白枕鶴;D1、D2、D3為丹頂鶴;M:1 000 bp DNA Ladder Marker Note:B1、B2、B3、B4、B5 are white-naped crane;D1、D2、D3 are red-crowned crane;M:1 000 bp DNA Ladder Marker

      圖2 EE0.6序列不同引物組合BW/FZ、CW/FZ、CW/DZ部分?jǐn)U增結(jié)果電泳圖Fig.2 Electrophoresis diagram of partial amplification of BW/FZ,CW/FZ and CW/DZ in different combinations of EE0.6 sequences 注:B1、B2、B3、B4、B5為白枕鶴;D1、D2、D3為丹頂鶴;M:500 bp DNA Ladder Marker Note:B1、B2、B3、B4、B5 are white-naped crane;D1、D2、D3 are red-crowned crane;M:500 bp DNA Ladder Marker

      2.2 白枕鶴、丹頂鶴配對(duì)與孵化結(jié)果

      根據(jù)PCR鑒定結(jié)果,對(duì)白枕鶴、丹頂鶴配對(duì),并記錄產(chǎn)蛋數(shù),受精率和受精蛋孵化率(表2)。

      表2 白枕鶴、丹頂鶴配對(duì)與孵化結(jié)果

      Tab.2 Pairing and hatching results of white-naped cranes and red crowned cranes

      3 討論

      本研究分別利用CHD基因鑒定法和EE0.6序列鑒定法,對(duì)無錫動(dòng)物園5只白枕鶴和3只丹頂鶴進(jìn)行性別鑒定。2種鑒定方法的結(jié)果一致,B1、B2、B3、B4、D1、D2個(gè)體為雄性,B5、D3個(gè)體為雌性。CHD基因鑒定法和EE0.6序列鑒定法已先后在丹頂鶴、蓑羽鶴(Anthropoidesvirgo)、灰鶴(Grusgrus)、白鶴(Grusleucogeranus)、東方白鸛(Ciconiaboyciana)、黑冠鶴(Balearicapavonina)等珍稀鶴類擴(kuò)增出不同的片段[3-5],劉鑫等[6]曾嘗試?yán)肊E0.6序列對(duì)白枕鶴的性別進(jìn)行鑒定,張紅霞[7]也曾利用CHD基因引物2550F/2718R和EE0.6序列鑒別了白枕鶴、蓑羽鶴、黑冠鶴、丹頂鶴和灰鶴性別,盡管這些方法能對(duì)性別作出判斷,有利于珍稀鶴類的繁殖,但是真正在生產(chǎn)中應(yīng)用案例還很少見。本研究為了驗(yàn)證該方法的實(shí)際可操作性,根據(jù)PCR鑒定結(jié)果對(duì)白枕鶴、丹頂鶴進(jìn)行配對(duì),結(jié)果均成功孵化出后代,表明該P(yáng)CR鑒定結(jié)果可靠。與傳統(tǒng)鑒定性別相比,該方法采樣量小,取樣容易,對(duì)鶴類應(yīng)激反應(yīng)也不大,相對(duì)安全;利用穩(wěn)定遺傳的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增應(yīng)用來鑒定性別,結(jié)果更可靠;鑒定不受年齡的限制,從剛出生到成年個(gè)體均可通過PCR鑒定性別;操作簡便、周期短,也易推廣。研究結(jié)果可為進(jìn)入繁殖期鶴類進(jìn)行配對(duì)提供了依據(jù),避免了同性配對(duì),從而提高繁殖效率,有效地保護(hù)物種。

      [1] 陳武,謝淑敏,謝高基,等.PCR技術(shù)在鳥類性別鑒定上的應(yīng)用[J].中國獸醫(yī)科學(xué),2006,36(6):485-488.

      [2] 包文斌,胡飛,徐琪,等.鳥類性別鑒定的分子生物學(xué)方法[J].中國畜牧獸醫(yī),2007,34(10):33-36.

      [3] 田秀華,劉鑄,何相寶,等.7種鶴形目鳥類性別的分子鑒定[J].動(dòng)物學(xué)雜志,2006,41(5):62-67.

      [4] 劉鑄,田秀華,白素英.一種準(zhǔn)確簡便的東方白鶴性別分子鑒定方法[J].野生動(dòng)物,2006,27(3):50-53.

      [5] Itoh Y,Suzuki M,Ogawa A,et al.Identification of the sex of a wide range of Carinatae birds by PCR using primer sets selected from chicken EE0.6 and its related sequences[J].Journal of Heredity,2001,92(4):315-321.

      [6] 劉鑫,張紅霞,包文斌,等.白枕鶴性別的分子鑒定方法[J].揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào):農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版,2009,30(1):42-44.

      [7] 張紅霞.鶴性別鑒定及線粒體遺傳多樣性與鶴系統(tǒng)發(fā)育分析[D].揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2008.

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