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      SIRT7基因在胃癌中的表達(dá)及意義

      2018-03-15 09:15:50劉衍姣李蘭蘭曹璋
      科技視界 2018年35期
      關(guān)鍵詞:表達(dá)胃癌

      劉衍姣 李蘭蘭 曹璋

      【摘 要】目的:基于大數(shù)據(jù)挖掘分析SIRT7基因在胃癌組織的表達(dá)及其對(duì)胃癌患者預(yù)后的影響。方法:采用Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)分析SIRT7在胃癌組織中的mRNA表達(dá)情況,通過(guò)Kaplan-Meier Plotte數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行胃癌患者總生存期的分析。結(jié)果:在mRNA水平上,與正常胃組織比較,胃癌組織中呈低表達(dá),但是差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;但是生存分析結(jié)果顯示SIRT7 高表達(dá)的胃癌患者預(yù)后較差。結(jié)論:SIRT7表達(dá)在胃癌和正常胃組織中有明顯差異,SIRT7過(guò)表達(dá)的胃癌患者預(yù)后較差。

      【關(guān)鍵詞】胃癌;SIRT7;預(yù)后;表達(dá)

      中圖分類號(hào): R735.2 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A 文章編號(hào): 2095-2457(2018)35-0180-002

      DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2018.35.078

      Expression of SIRT7 in Gastric Cancer and Its Clinical Significance

      LIU Yan-jiao1,2 LI Lan-lan1 CAO Zhang1*

      (1.Department of Pathology, Binzhou Medical Uuniversity, Yantai Shandong 264003, China;

      2.Gao Qing Maternal And Child Health Care Hospital, Zibo Shandong 256300, China)

      【Abstract】Objective: To analyze the expression and prognostic value of SIRT7 gastric cancer based on big data mining. Methods: The mRNA expression levels of SIRT7 in gastric cancer tissues were analyzed via the Oncomine database. Moreover, the Kaplan-Meier database was used to evaluate the effect on overall survival (OS) of patients with gastric cancer. Results: Compared with the normal gastric tissue, SIRT7 expression was lower in gastric cancer tissue Patients with high SIRT7 expression had a shorter overall survival. Conclusion: mRNA expression of SIRT7 in gastric cancer was underexpression. Patients with high SIRT7 expression had a poor prognosis.

      【Key words】Gastric cancer; SIRT7; Prognosis; Expression

      0 前言

      胃癌是起源于胃黏膜上皮的惡性腫瘤,是全球癌癥相關(guān)死亡率的第三大原因,胃癌已經(jīng)是我國(guó)第二大惡性上皮腫瘤,全世界近一半的新發(fā)胃癌患者和死亡病例在中國(guó)。目前,我國(guó)胃癌患者的五年生存率是35.9%,而東亞的日本、韓國(guó)均已達(dá)到60%以上。與之比較,我國(guó)胃癌五年生存率仍處于較低水平[1-3]。胃癌的治療方案主要包括手術(shù)治療和放化療,但是很多胃癌患者在確診時(shí)已經(jīng)進(jìn)展到中晚期,即使進(jìn)行了胃癌根治術(shù),術(shù)后仍有較高的復(fù)發(fā)率,為社會(huì)帶來(lái)了巨大的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。近年,隨著精準(zhǔn)醫(yī)療概念的提出和臨床推廣應(yīng)用,從分子水平研究胃癌的發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后,有利于發(fā)現(xiàn)新的分子靶點(diǎn),提供更精確的胃癌治療方案。SIRT7是一種NAD+依賴性組蛋白去乙?;福谌祟惗喾N癌組織中高表達(dá),與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和病人預(yù)后具有顯著相關(guān)性[4-7]。本研究采用Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)和數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)性分析了SIRT7在胃癌中的表達(dá)和預(yù)后,以期為胃癌患者個(gè)體化的治療方案的選擇提供新的方向。

      1 方法

      1.1 Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)分析SIRT7在胃癌組織中的表達(dá)情況

      Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)癌基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)和整合數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái),在此數(shù)據(jù)庫(kù)中可以根據(jù)自己的需求設(shè)定篩選條件。在此研究中,設(shè)定篩選條件有以下幾個(gè):(1)“Gastric Cancer”;(2)“Gene: sirt7”(3)“Data Type: mRNA”;(4)“Sample Type:Clinical Specimen”;(5)Analysis Type:Cancer vs. Normal Analysis”;(6)值設(shè)定:P value <0.01,fold change>2,gene rank=top 10%?!癈linical Outcome: Survival Status at 5 Years。篩選的結(jié)果中可以根據(jù)需要選擇呈現(xiàn)形式,如箱狀圖或柱狀圖,亦可顯示某基因在正常與癌癥組織之間表達(dá)的倍數(shù)關(guān)系、P值等。

      1.2 采用數(shù)據(jù)庫(kù)在線分析患者預(yù)后的影響

      Kaplan-MeierPlotter 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=service&cancer;=gastric)的胃癌數(shù)據(jù)集進(jìn)行在線生存分析。篩選條件如下:(1)Cancer: Gastric Cancer;(2)Gene: SIRT7;(3)Survival:Over-all Survival(OS);(4)Treatment:surgery alone。P<0.01認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 SIRT7在胃癌組織中的表達(dá)及預(yù)后

      Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)顯示:胃癌與正常組織中SIRT7表達(dá)降低,但是差異無(wú)明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(圖1);SIRT7基因表達(dá)對(duì)胃癌患者預(yù)后的影響分析發(fā)現(xiàn),在胃癌組織中SIRT7的高表達(dá)對(duì)胃癌患者總生存期較短,與既往研究相一致,Affy ID: 218797_s_at SIRT7,Cutoff value used in analysis:584。(圖2)

      3 討論

      SIRT7是位于染色體17 (17q25.3)染色體端粒下區(qū)域的單個(gè)復(fù)制基因,其基因組序列跨越6.2 kb區(qū)域,SIRT7及基因編碼10個(gè)外顯子,外顯子4最短(長(zhǎng)71bp),外顯子7最長(zhǎng)(長(zhǎng)237bp)[8]。人類SIRT7的開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)1203bp,編碼長(zhǎng)400個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),這個(gè)蛋白質(zhì)的分子量大約是44.9KD,等電點(diǎn)9.8。SIRT7與酵母Sir2只有21%的相同,酵母Sir2是去乙?;傅鞍准易宓膭?chuàng)始人(至少在七種哺乳動(dòng)物去乙?;钢校IRT7對(duì)酵母Sir2只有21%的認(rèn)同,酵母Sir2是、乙?;傅鞍准易宓膭?chuàng)始人(至少在七種哺乳動(dòng)物去乙?;钢校?。在七種哺乳動(dòng)物去乙?;钢?,SIRT7與SIRT6蛋白序列的相似性(56%)最接近,與研究最多的人類去乙?;?SIRT1的相似性為39%。在SIRT7序列中,保守的催化域在90-331氨基酸(包括外顯子3-9)之間[9-14]。

      SIRT7 mRNA在小鼠的所有組織中普遍表達(dá),盡管它們的表達(dá)水平不同。SIRT7在肌肉,心臟和腦等非增殖組織中表達(dá)較低,但在肝臟,脾臟和睪丸等代謝活躍組織中表達(dá)較高。老齡化小鼠心臟(23個(gè)月)顯示SIRT7表達(dá)水平降低約40%。經(jīng)歷衰老的原代成纖維細(xì)胞不僅顯示SIRT7轉(zhuǎn)錄水平降低,而且還顯示原代成纖維細(xì)胞中復(fù)制衰老的核仁SIRT7缺失[15]。然而,隨著細(xì)胞轉(zhuǎn)錄水平的升高,人乳腺上皮細(xì)胞中SIRT7的表達(dá)水平增加。毒胡蘿卜內(nèi)酯或衣霉素處理誘導(dǎo)的ER應(yīng)激反應(yīng)期間,還發(fā)現(xiàn)SIRT7的表達(dá)水平增加。發(fā)現(xiàn)SIRT7在甲狀腺,乳腺,膀胱和肝細(xì)胞癌組織中上調(diào)。特異性選擇用于化學(xué)抗性的癌細(xì)胞系MCF-7,Saos-2和A2780顯示與原始非抗性細(xì)胞系相比SIRT7的表達(dá)降低。通常,很難將去乙?;笟w為癌基因或腫瘤抑制因子[16]。SIRT1在癌癥背景下進(jìn)行了最廣泛的研究,其表達(dá)模式在不同的癌癥類型中有所不同。相比之下,已發(fā)現(xiàn)SIRT7在迄今為止所研究的所有癌癥類型中都被上調(diào),例如甲狀腺癌,淋巴結(jié)陽(yáng)性乳腺癌,膀胱癌,肝細(xì)胞癌和結(jié)腸直腸癌,被視為潛在的致癌基因。此外,許多研究報(bào)道,與正常對(duì)應(yīng)物相比,癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平增加,并且這些細(xì)胞系中SIRT7表達(dá)水平的降低了它們的增殖或致癌能力[17-19]。

      本研究首先采用Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)分析SIRT7在胃癌組織中的表達(dá),結(jié)果顯示:胃癌與正常胃組織中和 的 表達(dá)無(wú)明顯差異。 但在zhang等研究發(fā)現(xiàn)人胃癌組織中具有高表達(dá)。在胃癌細(xì)胞中敲低Sirt7能夠抑制細(xì)胞增殖過(guò)程和體外克隆形成,皮下移植瘤實(shí)驗(yàn)同樣證明sirt7表達(dá)降低能夠顯著抑制胃癌細(xì)胞生長(zhǎng)。Sirt7的表達(dá)水平與疾病發(fā)展階段、轉(zhuǎn)移和病人存活具有顯著相關(guān)性。與數(shù)據(jù)庫(kù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果結(jié)果不一致,我們本次數(shù)據(jù)挖掘的mRNA水平的變化,蛋白表達(dá)的結(jié)果有待進(jìn)一步驗(yàn)證。我們進(jìn)一步通過(guò) Kaplan-Meier Plotter 數(shù)據(jù)庫(kù)分析SIRT7 在胃癌患者預(yù)后中的意義,結(jié)果表明SIRT7高表達(dá)的胃癌患者總生存期較短,與Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)果似乎相互沖突。Kim等人報(bào)道了SIRT7在肝細(xì)胞癌中的致癌作用。在大量HCC患者樣品以及幾種肝細(xì)胞癌細(xì)胞系中,SIRT7表達(dá)水平升高。在HCC細(xì)胞系中敲低SIRT7通過(guò)降低p21的表達(dá)水平和增加細(xì)胞周期蛋白D1的水平來(lái)抑制其生長(zhǎng)速率,從而導(dǎo)致G1/S進(jìn)展減少。在HCC患者中SIRT7的表達(dá)增加是由于微小RNA,miR-125a-5p和miR-125b的內(nèi)源性高甲基化所調(diào)控[20]。

      綜上所述,Sirtuin 7作為sirtuin蛋白家族的成員之一,SIRT7的高表達(dá)已在幾種癌癥類型中報(bào)道,并且研究結(jié)果傾向SIRT7是一種候選的癌基因,SIRT7是否也會(huì)在其他致癌基因(如突變體Ras)的背景下促進(jìn)腫瘤發(fā)生的發(fā)展仍有待探索。然而,從現(xiàn)有的報(bào)道來(lái)看,SIRT7在胃癌發(fā)生、發(fā)展中的作用還需進(jìn)一步探討和研究。

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