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    1株高效菲降解不動(dòng)桿菌的篩選、鑒定及性能研究

    2018-02-26 08:00:40王永剛陳吉祥孫尚琛李文新
    微生物學(xué)雜志 2018年6期
    關(guān)鍵詞:加氧酶鄰苯二酚芳烴

    馬 丹,王永剛,2*,陳吉祥,楊 智,孫尚琛,,李文新

    (1.蘭州理工大學(xué) 石油化工學(xué)院,甘肅 蘭州 730050;2.蘭州理工大學(xué) 生命科學(xué)與工程學(xué)院,甘肅 蘭州 730050;3.蘭州石化能源裝備工程研究院有限公司,甘肅 蘭州 730000)

    多環(huán)芳烴是一類廣泛分布并穩(wěn)定存在于自然環(huán)境中的含2個(gè)或2個(gè)以上苯環(huán)的有毒有機(jī)污染物。菲為一種三環(huán)芳烴,是石油和煤炭加工工業(yè)的副產(chǎn)品,也是土壤沉積物中最常見(jiàn)的一類多環(huán)芳烴污染物[1]。菲具有致癌性、致畸性、致突變性、生物累積性以及內(nèi)分泌擾亂等特性,對(duì)人體健康和自然環(huán)境有極大危害。微生物可以通過(guò)自身的代謝將多環(huán)芳烴進(jìn)行分解轉(zhuǎn)化,從而降低多環(huán)芳烴對(duì)生態(tài)環(huán)境的污染。目前采用微生物去除多環(huán)芳烴的方法是最常見(jiàn)的途徑之一[2-4]。研究較為廣泛的可降解菲的菌屬主要有芽胞桿菌屬(Bacillus)[5-6]、氣單胞菌屬(Aeromonas)[7]、假單胞菌屬(Pseudomonas)[8]、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)[9-10]和根瘤菌[11]等。而約翰遜不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌的研究主要集中在對(duì)處理污水和污物中的氮磷化合物,對(duì)外界不利條件的抵抗能力以及耐藥性和耐藥機(jī)制等方面。其中研究最深入的是其聚磷與解磷特性及其機(jī)制[12-13]。Li等[4]在低溫中篩選出1株可以以檸檬酸鈉和乙酸鈉等為唯一碳源的約翰遜不動(dòng)桿菌,該菌株呈現(xiàn)出較高的亞硝酸鹽積累效率和較低的硝酸鹽移除效率。約翰遜不動(dòng)桿菌還具有較普遍的耐藥性[15]。Wang等[16]從土壤中篩選出1株能產(chǎn)脂肪酶的約翰遜不動(dòng)桿菌。蘇丹等[17]以約翰遜不動(dòng)桿菌DBP-3菌株為研究對(duì)象,對(duì)其冷休克蛋白基因進(jìn)行了克隆及表達(dá)。在環(huán)境領(lǐng)域內(nèi)關(guān)于約翰遜不動(dòng)桿菌對(duì)多環(huán)芳烴菲降解機(jī)制和應(yīng)用鮮有報(bào)道。有部分報(bào)道主要是不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌對(duì)其他烴類化合物的降解。劉玉華等[18]概述了不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌對(duì)烷烴、芳香烴等石油組分的降解。周婷等[19]篩選出2株不動(dòng)桿菌,并對(duì)菌株的石油降解功能進(jìn)行研究,而該菌株能夠利用一定濃度的烷烴以及多環(huán)芳烴進(jìn)行生長(zhǎng)。本研究從蘭州某化工廠石油廢水中分離篩選出1株不動(dòng)桿菌屬的高效菲降解菌,并對(duì)該菌株的生長(zhǎng)特性、降解特性、降解動(dòng)力學(xué)、菲的相關(guān)降解基因及參與菲代謝關(guān)鍵酶酶活進(jìn)行了研究,以期為菲及其他多環(huán)芳烴的生物處理提供參考。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌株來(lái)源 菌株F-1分離自蘭州某化工廠含油廢水的污染水樣。

    1.1.2 培養(yǎng)基 ①LB固體培養(yǎng)基:酵母粉 2.5 g,蛋白胨 5 g,NaCl 5 g,瓊脂 10 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,1×105Pa滅菌20 min。②液體培養(yǎng)基:酵母粉 2.5 g,蛋白胨 5 g,NaCl 5 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,121 ℃滅菌20 min。③基礎(chǔ)培養(yǎng)基:NH4NO33 g,K2HPO41.5 g,KH2PO41.5 g,F(xiàn)eCl20.01 g,無(wú)水CaCl20.01 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,NaCl 0.5 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,1×105Pa滅菌20 min。④篩選培養(yǎng)基:不同濃度菲為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基。

    1.1.3 試劑和儀器 菲(純度≥97%,天津希恩思),環(huán)己烷、正己烷(色譜純,天津市彪仕奇),其他試劑均為分析純。無(wú)菌操作臺(tái)(SW-CJ-2FD,蘇州安泰),全自動(dòng)高壓滅菌鍋 (280SA,致微儀器),恒溫振蕩器(IS-RDV1,美國(guó)精騏),紫外分光光度計(jì)(UV-2102PC,尤尼柯上海儀器),PCR擴(kuò)增儀(TC-96/G/H,杭州博日)。

    1.2 方法

    1.2.1 菲降解菌的篩選 吸取1 mL水樣于100 mL篩選培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)3 d后,從培養(yǎng)液中吸取1 mL置于新的篩選培養(yǎng)基中,重復(fù)3次。將最后一次的培養(yǎng)液涂布于固體篩選基礎(chǔ)培養(yǎng)基上,30 ℃恒溫過(guò)夜暗室培養(yǎng)后,采用劃線分離法進(jìn)行分離與純化,-70 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.2.2 降解菌株的鑒定 采用細(xì)菌DNA抽提試劑盒提取菌株基因組DNA,采用16S rDNA通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)與1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGCTT-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增條件:94 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min,58 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,循環(huán)30次;72 ℃ 10 min。擴(kuò)增結(jié)束后,產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,將檢測(cè)大小正確的PCR產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果提交NCBI/BLAST數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)分析,選取一致性在98%以上的近緣性物種,用MEGA 6.06軟件按照鄰接法(Neighbor-Joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),自展值為1 000。

    1.2.3 菲降解菌生長(zhǎng)特性 按2%接種量將菌株F-1接種于以菲(100 mg/L)為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,采用濁度法分別考察菌株F-1在不同溫度(4、10、20、25、30、40和50 ℃)、不同pH值(2、3、4、5、6、7、8、9和10)、不同鹽度(0%、0.3%、0.5%、1%、2%、3%、4%、5%、6%和7%)條件下的生長(zhǎng)狀況,震蕩培養(yǎng)24 h后測(cè)定OD600值,確定菌株F-1的最適生長(zhǎng)溫度、pH和鹽度。

    1.2.4 菲降解菌降解特性 取F-1菌液轉(zhuǎn)接到以菲(100 mg/L)為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng),在4、8、12、24、28、32、36、48、52、56 h對(duì)其進(jìn)行取樣涂平板計(jì)數(shù),計(jì)算菌株在該培養(yǎng)基中生長(zhǎng)數(shù)量。將菌株F-1分別接種于含有不同質(zhì)量濃度菲(50、100、150、200、250、400、600、800 mg/L)為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min震蕩培養(yǎng)24 h后測(cè)定OD600值,確定其菲的耐受范圍,并采用平板涂布法進(jìn)行菌落計(jì)數(shù)。同時(shí)考察菌株F-1在以聯(lián)苯、萘、蒽、菲、芘、直鏈烴(正癸烷、十二烷、十四烷、十六烷、十八烷、二十二烷、二十四烷和二十八烷)為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中的降解特性。

    1.2.5 菲的測(cè)定 以環(huán)己烷作溶劑,精確配置 0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0 mg/L菲的標(biāo)準(zhǔn)溶液,在波長(zhǎng)為251 nm處用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行菲濃度的測(cè)定,繪制菲的標(biāo)準(zhǔn)曲線。同樣采用環(huán)己烷萃取實(shí)驗(yàn)樣品,多次萃取,合并萃取液,經(jīng)無(wú)水硫酸鈉脫水后,定容至50 mL,作為待測(cè)樣品。并于251 nm波長(zhǎng)處測(cè)定吸光度,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算培養(yǎng)基中殘留菲的濃度,從而計(jì)算降解率。

    1.2.6 降解動(dòng)力學(xué)研究 將多環(huán)芳烴菲的濃度隨時(shí)間變化的趨勢(shì)與零級(jí)、一級(jí)、二級(jí)動(dòng)力學(xué)方程進(jìn)行擬合,取相關(guān)系數(shù)高者為相應(yīng)的反應(yīng)級(jí)數(shù)。

    零級(jí)降解動(dòng)力學(xué)方程:c=-κt+c0(1)

    t1/2=c0/(2κ) (2)

    一級(jí)降解動(dòng)力學(xué)方程:lnc=-κ1t+c0(3)

    t1/2=ln2/κ1(4)

    二級(jí)降解動(dòng)力學(xué)方程: 1/c=κ2t+1/c0(5)

    t1/2=1/(κ2·c0) (6)

    式中:c為菲質(zhì)量濃度(mg/L);t為降解時(shí)間(h);t1/2為降解半衰期(h);κ為零級(jí)降解速率常數(shù);κ1為一級(jí)降解速率常數(shù);κ2為二級(jí)降解速率常數(shù)。

    1.2.7 菌株F-1對(duì)直鏈烷烴的GC-MS分析 分別稱取正癸烷、十二烷、十四烷、十六烷、十八烷各3.75 g,二十二烷、二十四烷及二十八烷各1.25 g,用正己烷定容至25 mL,配制成正癸烷、十二烷、十四烷、十六烷、十八烷的終質(zhì)量濃度為750 mg/L,二十二烷、二十四烷及二十八烷的終質(zhì)量濃度為25 mg/L的混合液,每100 mL基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入2 mL混合液,并接入2%的F-1菌液,30 ℃、180 r/min搖床培養(yǎng)3 d。采用正己烷萃取實(shí)驗(yàn)樣品,多次萃取,合并萃取液,經(jīng)無(wú)水硫酸鈉脫水后,定容至50 mL。用GC-MS測(cè)定其降解率[20],十五烷作內(nèi)標(biāo),在中國(guó)科學(xué)院蘭州化學(xué)物理研究所完成。

    1.2.8 芳烴降解基因的PCR檢測(cè) 參考菌株AcinetobacterjohnsoniiXBB1基因序列(登錄號(hào)為CP010350),選擇與芳烴降解相關(guān)的鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶、苯甲酸鹽雙加氧酶、鐵氧化還原蛋白還原酶、乙醇脫氫酶、二羥酸脫水酶、醛縮酶和氧化還原蛋白基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增。設(shè)計(jì)特異性引物見(jiàn)表1,反應(yīng)條件同1.2.2。

    1.2.9 鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶活力的測(cè)定 將菌株F-1接種到液體LB培養(yǎng)基及菲質(zhì)量濃度分別為50、100、150 mg/L的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,過(guò)夜培養(yǎng)16 h,離心收集菌體,用磷酸緩沖液重懸。采用超聲破碎儀在冰浴中進(jìn)行破碎,8 500 r/min、4 ℃下離心30 min后取上清液(粗酶液)。石英比色皿中分別加入粗酶液(0.2 mL)、磷酸緩沖液(2.4 mL)和20 μmol/L鄰苯二酚溶液(0.4 mL),37 ℃恒溫水浴鍋中反應(yīng)30 min。在253 nm處測(cè)定光吸度值,計(jì)算光吸度增加值。酶活力單位(U)定義:37 ℃反應(yīng)30 min條件下,每分鐘內(nèi)OD值變化0.001為1個(gè)酶活力單位(U)。

    表1 菌株F-1降解基因檢測(cè)引物Table 1 Primers for PCR detection of phenanthrene-degrading related genes

    2 結(jié)果與分析

    2.1 高效降解菲菌株篩選結(jié)果

    采用篩選培養(yǎng)基從石油廢水中共分離獲得6株可以利用菲的菌株,分別編號(hào)為S-1、S-2、F-1、F-2、F-3、F-4。分別以2%的接種量接種到以菲(100 mg/L)為唯一碳源的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)5 d后,菲的降解率如圖1。其中菌株F-1降解菲的能力最強(qiáng),降解率為43.57%。因此,將菌株F-1作為后續(xù)研究的主要對(duì)象。

    圖1 不同菌株對(duì)菲的降解率Fig.1 Phenanthrene degradation rate of the different strains

    2.2 菌株F-1的鑒定結(jié)果

    菌株F-1在LB固體培養(yǎng)基上30 ℃過(guò)夜培養(yǎng)后,菌落呈乳白色,表面光滑,革蘭染色結(jié)果顯示為陰性細(xì)菌。菌株F-1部分生理生化特性結(jié)果見(jiàn)表2,該菌株除精氨酸、鳥(niǎo)氨酸、賴氨酸及尿素是陽(yáng)性反應(yīng)外,其余均為陰性反應(yīng)?;?6S rDNA序列分析比對(duì)結(jié)果,采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),如圖2。從圖2中可以看出,菌株F-1與約翰遜不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌聚為一類,親緣關(guān)系最近,與AcinetobacterjohnsoniiATCC 17909 16S rDNA序列一致性為100%。因此,結(jié)合菌落形態(tài)和生理生化實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步說(shuō)明菌株F-1為約翰遜不動(dòng)桿菌屬。提交GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),登錄號(hào)為MF447530。

    表2 菌株F-1部分生理生化特性Table 2 Biochemical tests performed on the strain F-1

    注:“+”表示陽(yáng)性反應(yīng);“-”表示陰性反應(yīng)

    圖2 菌株F-1系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Phylogenetic tree of the bacteria F-1 based on the 16S rDNA sequences

    2.3 菲降解菌F-1的生長(zhǎng)特性

    菌株F-1在不同pH、溫度、初始濃度、鹽度及時(shí)間的生長(zhǎng)情況見(jiàn)圖3。由圖3A可知,菌株F-1在4~50 ℃范圍內(nèi)能正常生長(zhǎng)。最適生長(zhǎng)溫度為30 ℃,生長(zhǎng)速度最快;在低溫(4~20 ℃)和高溫(>50 ℃)條件下生長(zhǎng)較為緩慢。圖3B顯示菌株 F-1在pH為5~9能夠正常生長(zhǎng)。最適pH為7,偏酸性;而在pH為2和10時(shí)幾乎不能生長(zhǎng)。圖3C顯示其最適鹽度為0.3%,隨著鹽度升高,菌株生長(zhǎng)情況逐漸降低,最大耐受鹽濃度可達(dá)7%。圖3D說(shuō)明菌株F-1在菲初始質(zhì)量濃度為250 mg/L時(shí)生長(zhǎng)最好,在800 mg/L的質(zhì)量濃度下依然可以生長(zhǎng),但生長(zhǎng)微弱??梢?jiàn),該菌株具有較好的環(huán)境適應(yīng)性和較高菲濃度耐受性。

    圖3 菲降解菌生長(zhǎng)特性Fig.3 Growth characteristics of the phenanthrene-degrading bacteria

    2.4 降解動(dòng)力學(xué)

    分別將降解率與時(shí)間關(guān)系用零級(jí)、一級(jí)、二級(jí)動(dòng)力學(xué)方程擬合[21-22],得到降解動(dòng)力學(xué)擬合方程,結(jié)果如圖4。降解半衰期分別為136.24、143.21和153.89 h。從圖4中可以看出,二級(jí)方程擬合系數(shù)為0.986 75,線性相關(guān)性良好。在120 h內(nèi)將菲的含量從100 mg/L降解到56.43 mg/L,降解率為43.57%。

    2.5 菌株F-1對(duì)直鏈烷烴的GC-MS分析

    菌株F-1在以菲(100 mg/L)為唯一碳源的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)情況見(jiàn)圖5A,可見(jiàn)在12~24 h菌株生長(zhǎng)情況最好,24 h后呈下降趨勢(shì)。菌株F-1在不同芳烴中的生長(zhǎng)情況見(jiàn)圖5B,菌株F-1分別在聯(lián)苯、萘、蒽、菲和芘(各終濃度均為100 mg/L)的基礎(chǔ)培養(yǎng)基中生長(zhǎng)24 h后,測(cè)得其在聯(lián)苯以及菲中生長(zhǎng)旺盛,但在萘、蒽和芘中的生長(zhǎng)情況較差。采用GC-MS分析菌株F-1對(duì)直鏈烷烴正癸烷、十二烷、十四烷、十六烷、十八烷、二十二烷、二十四烷、二十八烷的降解效果,GC-MS檢測(cè)如圖5C、D,培養(yǎng)3 d后,正癸烷的降解率為25.3%,十二烷為10.2%,十四烷為11.6%,十六烷為15.6%,十八烷為27.4%,二十二烷為16%,二十四烷12%,二十八烷11%。由此可知,菌株F-1不僅可以高效的降解多環(huán)芳烴菲,對(duì)直鏈烷烴也有較好的降解效果。

    圖4 菌株F-1對(duì)菲的降解動(dòng)力學(xué)曲線Fig.4 Dynamics curve of the degradation of phenanthrene of strain F-1

    圖5 降解特性及菌株F-1降解直鏈烷烴的GC-MS分析Fig.5 GC-MS analysis of the straight-chain alkane by the Strain F-1

    2.6 菲降解相關(guān)基因檢測(cè)

    微生物降解與代謝烴類化合物主要依賴于基因組多種功能性基因協(xié)作調(diào)控完成的。采用PCR特異性擴(kuò)增從菌株F-1全基因組中檢測(cè)到鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶、苯甲酸鹽雙加氧酶、鐵氧化還原蛋白還原酶、乙醇脫氫酶、二羥酸脫水酶、醛縮酶、氧化還原蛋白7種基因存在,電泳結(jié)果見(jiàn)圖6。這些基因的存在進(jìn)一步證明了菌株F-1具有降解菲以及其他烴類化合物的能力,具體基因之間如何協(xié)作調(diào)控還有待進(jìn)一步研究。

    圖6 菌株F-1降解基因PCR檢測(cè)電泳圖Fig.6 Electrophoresis of the phenanthrene-degrading genes of the strains F-1M: DNA Maker; 1、4: 二羥酸脫水酶DAD和DAD2; 2: 醛縮酶A; 3:鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶C12D; 5: 氧化還原蛋白; 6: 乙醇脫氫酶AD; 7: 鐵氧化還原蛋白還原酶FR; 8: 苯甲酸鹽雙加氧酶 B12DM: DNA Marker; 1,4: dihydroxy-acid dehydratase DAD&DAD2; 2: aldolase A; 3: catechol-1,2-dioxygenase C12D; 5: ferredoxin; 6: alcohol dehydrogenase AD; 7: ferredoxin reductase FR; 8: benzoate-1,2-dioxygenase B12D

    2.7 鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶活力

    鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶是參與多環(huán)芳烴降解的關(guān)鍵性酶[23]。分別將F1接種在含不同濃度菲為唯一碳源的培養(yǎng)基和LB培養(yǎng)基中,30 ℃、180 r/min培養(yǎng)16 h后,測(cè)定鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶活力,結(jié)果見(jiàn)圖7。由圖7可知,隨著培養(yǎng)基中菲濃度的升高,鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶活力呈極顯著性增加(P<0.01),而在LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)菌株的酶活力僅為1.3 U。這可能是因?yàn)槿鄙倭朔谱鳛榈孜锏恼T導(dǎo),使得鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶在菌體中的組成型表達(dá)量減少,由此說(shuō)明鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶是環(huán)境誘導(dǎo)性酶,而且有研究表明,菲濃度與酶活力之間存在正相關(guān)關(guān)系[24-25],與本文研究結(jié)果一致。

    圖7 不同碳源和菲濃度中的酶活力Fig.7 Activity of catechol-1,2-dioxygenase under different phenanthrene concentrations and different source of carbon

    3 討 論

    石油及化學(xué)加工業(yè)的快速發(fā)展,導(dǎo)致多環(huán)芳烴被帶入環(huán)境,大面積的土壤及水源受到了威脅。由于多環(huán)芳烴在環(huán)境中的難降解性、致癌性、致畸性及致突變性,使其成為污染生態(tài)學(xué)研究的重點(diǎn)污染物。菲一直是科研人員在多環(huán)芳烴研究中的代表性污染物。因此,篩選出能有效降解菲的菌株更具應(yīng)用價(jià)值。Janikowski等[26]實(shí)驗(yàn)表明鞘氨醇單胞菌屬對(duì)菲的降解率在75 h達(dá)98 mg/(L·h) 。鄧軍等[27]從受多環(huán)芳烴污染的土壤中篩選出1株氧化節(jié)桿菲降解菌,在含菲的基礎(chǔ)培養(yǎng)基(初始質(zhì)量濃度為50 mg/L)5 d降解率可達(dá)60%。徐成斌等[28]從活性污泥中篩選出耳炎假單胞菌,培養(yǎng)96 h后降解率為65.8%。

    大量研究表明,微生物對(duì)多環(huán)芳烴代謝主要通過(guò)各種芳烴加氧酶去除芳香環(huán)取代基和引入羥基,使芳香環(huán)打開(kāi)后進(jìn)一步降解。馬迎飛等[29]從活性污泥中篩選出假單胞菌屬,經(jīng)PCR擴(kuò)增和體外克隆獲得雙加氧酶基因。Meyer等[30]從廢水以及土壤中分離出紅球菌屬和假單胞菌屬兩種菲降解菌,利用PCR技術(shù)檢測(cè)出鄰苯二酚雙加氧酶。Chang-Hyun Chang等[31]從土壤中篩選出3株菲降解菌,通過(guò)PCR擴(kuò)增檢測(cè)出鄰苯二酚2,3-雙加氧酶。Taylo等[32]、Seo等[33]相繼對(duì)PAHs降解菌的相關(guān)基因做了研究。而細(xì)菌對(duì)菲的降解主要有兩個(gè)途徑即水楊酸途徑和鄰苯二甲酸途徑[34]。Robin等[35]篩選出1株分枝桿菌,能夠降解多環(huán)芳烴(PAHs),驗(yàn)證該菌是通過(guò)鄰苯二甲酸途徑降解菲。何麗娟等[36]從石油污染土壤中分離到1株鞘氨醇桿菌屬,對(duì)降解途徑的初步研究顯示,該菌株通過(guò)水楊酸途徑降解菲。曹軍偉等[37]從深海環(huán)境篩選出1株CeleribacterindicusP73,通過(guò)GC-MS聯(lián)用技術(shù)鑒定出該菌降解菲的兩個(gè)重要代謝產(chǎn)物為1-羥基-2-萘甲酸和1-萘酚。

    多環(huán)芳烴由于自身穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu)以及較差的水溶性,使得其難以被微生物利用。多環(huán)芳烴污染的土壤中含有較高濃度的鹽類物質(zhì),而鹽濃度過(guò)高會(huì)抑制微生物的生長(zhǎng),從而影響微生物對(duì)多環(huán)芳烴的降解效率。微生物的生理活動(dòng)也受環(huán)境pH值變化的影響,過(guò)高或過(guò)低的pH值都會(huì)影響微生物的生長(zhǎng)及降解酶的活性,進(jìn)而降低對(duì)多環(huán)芳烴的降解速率[38]。被多環(huán)芳烴嚴(yán)重污染的地區(qū),因污染物濃度過(guò)高,微生物無(wú)法生存,導(dǎo)致污染物無(wú)法被有效降解。因此,進(jìn)一步豐富多環(huán)芳烴降解微生物菌種庫(kù),闡明多環(huán)芳烴的降解機(jī)制是至關(guān)重要的。

    本研究從石油廢水中分離到1株以菲為唯一碳源生長(zhǎng)的約翰遜不動(dòng)桿菌屬細(xì)菌F-1,該菌株有較強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)能力,在25~40 ℃、pH值5.0~9.0、鹽度0%~2.0%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))范圍內(nèi)良好生長(zhǎng)。在30 ℃、pH 7.0、鹽度0.3%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))、轉(zhuǎn)速180 r/min條件下,培養(yǎng)5 d對(duì)菲(終質(zhì)量濃度為100 mg/L)降解率為43.57%,降解過(guò)程符合一級(jí)動(dòng)力學(xué)特征。同時(shí)能以聯(lián)苯、萘、蒽、芘為唯一碳源良好生長(zhǎng)。對(duì)直鏈烷烴正癸烷的降解率為25.3%,十二烷為10.2%,十四烷為11.6%,十六烷為15.6%,十八烷為27.4%,二十二烷為16%,二十四烷12%,二十八烷11%。菌株F-1基因組中存在大量與烴類化合物代謝相關(guān)的基因,進(jìn)一步研究對(duì)含菲廢水及多環(huán)芳烴污染的處理和深度修復(fù)有著潛在的應(yīng)用前景。

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