田少華 張樹龍
離子通道病多數(shù)由編碼心臟離子通道的基因異常所引起,如長QT綜合征(LQTS)、 Brugada綜合征(BrS)、兒茶酚胺敏感性室性心動過速( CPVT)、J波綜合征(JWSs)等。離子通道病的基因檢測在診斷、預(yù)防及治療上扮演著重要角色,越來越受到學(xué)者的關(guān)注。隨著新一代測序技術(shù)(NGS)的展開,使得基因檢測變得越來越容易,越來越多的致病基因和變異被篩選出來。離子通道病基因檢測的潘多拉盒子似乎要打開了,但事實真的如此嗎?筆者將對離子通道病基因檢測的最新進(jìn)展和相關(guān)離子通道疾病基因檢測的應(yīng)用評論作一綜述。
近些年,隨著離子通道病共識的推出,離子通道病的基因檢測在診斷、預(yù)防及治療上扮演著重要角色,越來越受到學(xué)者的關(guān)注。近兩年,離子通道病的基因檢測又有了一些新的進(jìn)展。
1.1LQTS的基因檢測 根據(jù)孟德爾遺傳定律,LQTS分為兩種類型:多數(shù)為常染色體顯性遺傳的RW綜合征(Romano-Wardsyndrome syndrome),少數(shù)為常染色隱形遺傳的JLN綜合征(Jervell Lange-Nielsen syndrome )。以往研究認(rèn)為RWS相關(guān)突變基因有13個,但Marsman等[1]通過更先進(jìn)的NGS技術(shù)篩選基因組范圍內(nèi)的罕見致病基因,發(fā)現(xiàn)表達(dá)鈣調(diào)蛋白的CALM1、CALM2基因變異與LQT有關(guān),這一發(fā)現(xiàn)使RWS的候選基因庫增加到15個。但這一發(fā)現(xiàn)未能明確基因表型和臨床表型之間的關(guān)聯(lián),目前還不適于用于臨床基因檢測[2]。但NGS通過對人基因庫篩選發(fā)現(xiàn)致病基因,對推動離子通道病的基因檢測與臨床應(yīng)用有重要意義,會成為一種常規(guī)基因檢測手段。
另外,對LQT2的基因檢測又有新發(fā)現(xiàn),Kondo等[3]對1例LQT2研究發(fā)現(xiàn)了新的HERG突變A78T,同時對該變異進(jìn)行熱休克(heat shock)干預(yù)來檢驗其穩(wěn)定性。結(jié)果表明A78T-HERG蛋白表達(dá)并不穩(wěn)定,而且使快速延遲整流K通道表達(dá)下降。但運用熱休克因子-1(heat shock factor-1,HSF-1)干預(yù)后A78T-HERG的變異得以恢復(fù)。這提示,對A78T-HERG的LQT2病人通過HSF-1靶點干預(yù)將會是新的治療手段。
1.2CPVT的基因檢測 截止目前,CPVT共發(fā)現(xiàn)3種致病基因,1-2型CPVT分別為RYR2、CASQ2,它們引起肌漿網(wǎng)離子通道鈣離子通道蛋白及跨膜蛋白的結(jié)構(gòu)及功能改變[4],CPVT3型基因位于7p22-p14,但犯罪基因至今仍未明確[5]。RYR2、CASQ2分別為常染色體顯性、隱性遺傳,以往對它們的研究發(fā)現(xiàn)較多。通過NGS技術(shù)研究RYR2,發(fā)現(xiàn)了諸多變異。近期,Roston等[6]又通過對一個CPVT合并左室致密化不全(LVNC)的多代遺傳的家系進(jìn)行了研究,通過基因檢測發(fā)現(xiàn)了新的RYR2變異位點(I4855M),該變異在該家系的兩位先證者發(fā)現(xiàn)。I4855M可能干擾了Ca2+釋放,在野生型RYR2中引起負(fù)顯性效應(yīng),最終通過基因結(jié)構(gòu)及功能檢測發(fā)現(xiàn),這一變異為功能缺失變異。他們的研究提示,這一新的RYR2變異可能是CPVT和LVNC的重疊變異。除了以上三種基因變異,Makita等[7]還報道了少見的CPVT致病基因,鈣調(diào)蛋白表達(dá)異常的CALM1、CALM2基因也與CPVT的發(fā)生相關(guān)。這也提示,CPVT和LQTS存在著重疊致病基因。近期,學(xué)者們通過對CALM、TRD進(jìn)行基因檢測發(fā)現(xiàn),它們是CPVT的致病變異,分別為CPVT4、CPVT5[8]。Vega等[9]發(fā)現(xiàn),與LQT7有關(guān)的KCNT2變異及與LQT4有關(guān)的ANK2變異,可能是CPVT的變異基因亞型,這些證據(jù)也表明,CPVT和LQTS存在著很多的基因重疊。
1.3BrS的基因檢測 BrS是沒有器質(zhì)性心臟病的常染色顯性遺傳病。迄今為止,發(fā)現(xiàn)多達(dá)19種致病基因[10],這些基因引起鈉、鉀、鈣通道結(jié)構(gòu)或功能改變。以往研究發(fā)現(xiàn),SCN5A是BrS最常見的致病基因。近幾年研究發(fā)現(xiàn),單一的SCN5A變異會在同一個體或家系出現(xiàn)多種臨床表型,如BrS、LQT3、病竇綜合征(SSS)、心臟傳導(dǎo)障礙(CCD),出現(xiàn)所謂的重疊綜合征[11]。并且,相同基因型的BrS臨床表型可能會出現(xiàn)很大差別,甚至有些患者僅僅通過表現(xiàn)出早復(fù)極綜合征(ERS)而被識別[11]。以上發(fā)現(xiàn),提示BrS更容易表現(xiàn)出重疊綜合征和基因異質(zhì)性,這或許和BrS的致病基因類型較多,和其他離子通道病基因重疊概率大有關(guān)。
1.4JWSs的基因檢測 JWSs包括BrS和ERS。目前,與 BrS相關(guān)的SCN5A基因變異就超過300個,在BrS和ERS中有很多與SCN5A基因變異相關(guān)。SCN5A的功能缺失突變與BrS和ERS都有關(guān)系,也與SSS、CCD、Lenegre病有關(guān)。當(dāng)存在顯著增大的短暫外向鉀電流(Ito)時,功能缺失突變導(dǎo)致INa減低表現(xiàn)為BrS/ERS,否則表現(xiàn)為傳導(dǎo)異常[12]。在BrS先證者中發(fā)現(xiàn),13%病人包括下列基因變異:CACNA1C(Cav1.2)、CACNB2b(Cavβ2b)和CACNA2D1(Cavα2δ)。相對罕見基因突變包括:三磷酸甘油脫氫酶1基因(GPD1L)、SCN1B(鈉通道的β1亞基)、KCNE3(MiRP2)、SCN3B(鈉通道的β3亞 基)、KCNJ8 (Kir6.1)、KCND3(Kv4.3)、RANGRF(MOG1)、SLMAP、ABCC9(SUR2A)、(Navβ2)、PKP2(plakophillin-2)、FGF12(FHAF1)、HEY2和SEMA3A(腦信號蛋白)[13]。最近發(fā)現(xiàn)編碼鈉通道的SCN10A基因突變也可引起B(yǎng)rS。Behr等[14]分析了SCN10A突變及罕見突變的患病率,發(fā)現(xiàn)兩者具有很高的相關(guān)性(5%~16.7%)。這些基因突變引起鈉和鈣通道電流(INa、ICa)的功能缺失,以及Ito和ATP敏感性鉀電流(IK-ATP)的功能獲得[14]。另外,最新報道的易感但仍需驗證的基因有:瞬時受體電位M通道蛋白-4基因(TRPM4)和KCND2基因[15]。
早期復(fù)極樣改變(ERP)的心電圖改變具有明顯家族聚集性。目前已確定的與ERP和ERS都相關(guān)的基因變異有7個。另外,在ERS先證者中也發(fā)現(xiàn)了L型鈣通道(CACNA1C、CACNB2和CACNA2D1)的α1、β2、α2δ亞基,Nav1.5的α1亞基,以及Nav1.8(SCN5A、 SCN10A)的功能缺失突變[13]。
1.5緩慢型心律失常的基因檢測 SCN5A在心房肌表達(dá)豐富,這在以往已經(jīng)明確。Baskar等[16]報道過某一SCN5A變異可引起整個心房傳導(dǎo)阻滯,從而引起心房靜止或SSS,但具體作用機(jī)制不明。Chiang等[17]對緩慢型心律失常患者進(jìn)行回顧性研究發(fā)現(xiàn),功能缺失的SCN5A變異和竇房結(jié)功能不良、心房靜止及起搏奪獲不良相關(guān)。以往也有學(xué)者報道調(diào)控心房鈉尿肽(ANP)表達(dá)的鈉尿肽前體蛋白A(NPPA)基因變異與心房靜止有關(guān),這可能與ANP啟動第二信使環(huán)磷酸鳥苷(cGMP)參與調(diào)控離子通道有關(guān),但NPPA變異引起的心房電生理效應(yīng)仍不清楚[18]。越來越多的證據(jù)顯示,LMNA、SCN1B、SCN10A、GJA5(Cx40)、KCNJ2、TRPM4、KCNK17等基因變異參與了心臟傳導(dǎo)阻滯的發(fā)生[18]。
2.1LQTS基因檢測評價 以往研究發(fā)現(xiàn),在LQTS中KCNQ1基因(LQT1)占30%~35%,KCNH2基因(LQT2)占25%~30%,SCN5A基因(LQT3)占5%~10%,這三種基因占LQTS基因檢測陽性病例的90%。雖然其他類型LQTS相關(guān)基因<5%,但在LQTS基因檢測中仍會遇到假陽性的可能[19]。
另外,在確診的LQTS中,LQT1~3基因表型和臨床表型相關(guān),并且根據(jù)臨床特點(癥狀、家族史、心電圖)可以推斷基因型,這在以往已經(jīng)明確,對這類明確基因表型和臨床表型關(guān)聯(lián)的候選基因進(jìn)行基因檢測更合理[20]。少數(shù)的LQTS,其基因型和臨床特點并無關(guān)聯(lián)。某些表現(xiàn)出明顯臨床特點的LQTS患者,其陽性基因檢出率只有10%[21],這在LQT7和LQT8基因檢測中更常見[22]。因此,對未能明確基因表型和臨床表型有確信關(guān)聯(lián)的致病基因型,并不適合用于臨床基因檢測。由于LQTS相關(guān)基因變異較大,最近有學(xué)者[23]試圖通過全外顯子測序(WES)篩選可疑基因,這或許能揭示LQTS的真實世界數(shù)據(jù),但基因序列的高變異性和相關(guān)基因的低覆蓋率會使這一檢測手段的敏感性降低。
2.2CPVT基因檢測評價 Makita等[7]報道了CALM1、CALM2基因與CPTV的發(fā)生相關(guān)。近期,學(xué)者們通過對CALM、TRD進(jìn)行基因檢測發(fā)現(xiàn),它們是CPVT的致病變異,分別為CPVT4、CPVT5[8]。Vega等[9]發(fā)現(xiàn),與LQT7有關(guān)的KCNT2變異及與LQT4有關(guān)的ANK2變異,可能是CPVT的變異基因亞型,這些證據(jù)表明,CPVT和LQTS存在著很多的基因重疊。NGS的出現(xiàn)解決了基因測序的問題,但通過NGS無法提高重疊綜合征的基因檢測特異度。CPVT的基因檢測,對合理選擇治療策略(藥物、ICD、LCSD、RFCA)有指導(dǎo)意義,但對重疊綜合征相關(guān)基因進(jìn)行檢測,較低的特異度或許會限制基因檢測的臨床應(yīng)用。
2.3BrS基因檢測評價 最近的專家共識認(rèn)為,已在先證者發(fā)現(xiàn)BrS致病基因突變者,推薦其家族成員及相關(guān)親屬進(jìn)行該特定突變的檢測(Ⅰ類推薦)[24]。BrS發(fā)作前心電圖正常,暈厥、室性心動過速或心臟驟停可能是首發(fā)表現(xiàn),具有較高的心源性猝死(SCD)風(fēng)險。有學(xué)者認(rèn)為SCN5A是BrS最常見的致病基因,對此致病進(jìn)行基因檢測,有很強的預(yù)測價值。然而,真實世界似乎并非如此。越來越多的研究發(fā)現(xiàn),SCN5A變異似乎并不是BrS的未來心臟事件(暈厥或SCD)的獨立預(yù)測因子[25]。通過亞組分析發(fā)現(xiàn),和錯義的SCN5A變異相比,引起蛋白表達(dá)截短(中斷或移碼)的SCN5A變異中出現(xiàn)了PR、QRS間期延長。通過對中國臺灣的漢族人群研究發(fā)現(xiàn),SCN5A變異很可能并不是BrS心律失常復(fù)發(fā)的預(yù)測因子,但可能能夠預(yù)測心律失常事件的啟動時間(數(shù)據(jù)尚未發(fā)布)。對BrS進(jìn)行基因檢測前,必須有能夠診斷BrS的臨床證據(jù)(臨床發(fā)作史、家族史、心電圖),而且對臨床確診的BrS,不同于LQTS,無論藥物或ICD,均不依賴于基因檢測指導(dǎo)?;驒z測更多是體現(xiàn)在心臟事件復(fù)發(fā)的預(yù)測價值上。以上研究顯示,BrS相關(guān)基因似乎并非心律失常事件的預(yù)測因子,預(yù)測價值有限。對臨床確診的BrS,進(jìn)行基因檢測或許并不合適,但對家系中的其他成員檢測,對早期發(fā)現(xiàn)可疑基因及豐富變異基因位點有一定意義。
盡管目前專家共識推薦BrS1或復(fù)雜BrS基因檢測有益,但對SCN5A檢測發(fā)現(xiàn),仍有2%~5%的正常人群出現(xiàn)了SCN5A稀有變異,這也提示并非所有已知的SCN5A變異必須進(jìn)行基因檢測[26]。此外,根據(jù)2012年外顯子組排序計劃(ESP)提供的數(shù)據(jù),與BrS相關(guān)的SCN5A變異,在人群中的分布特點仍不清楚。ESP僅僅發(fā)現(xiàn)7%(22/300)的SCN5A變異與BrS相關(guān),原先學(xué)者們認(rèn)為的所謂致病變異,只是基于這一變異在正常人群中沒有出現(xiàn)?,F(xiàn)在來看,這類變異可能本來就罕見或者出現(xiàn)頻率很低,單純歸結(jié)為致病變異而進(jìn)行基因檢測或許并不合適。此外,很多的BrS變異基因呈不顯性表達(dá)或變異表達(dá),對此類變異進(jìn)行合理解釋更難,基因檢測對此類變異幾乎沒有什么幫助[27]。
BrS更容易表現(xiàn)出重疊綜合征和基因異質(zhì)性,單一的SCN5A變異會在同一個體或家系出現(xiàn)多種臨床表型,如BrS、LQT3、SSS、CCD[11]。雖然NGS通過高通量測序使變異基因的檢測更準(zhǔn)確全面,但由于重疊綜合征的存在,對基因檢測的特異度提出了挑戰(zhàn)。
2.4JWSs基因檢測評價 針對BrS和ERS的眾多致病基因,當(dāng)前僅僅對很小一部分變異進(jìn)行了功能表達(dá)研究,確定了這些變異與疾病的因果關(guān)系,闡明了合理的致病機(jī)制。學(xué)者們運用轉(zhuǎn)基因動物模型進(jìn)行研究的基因變異也很少,而對BrS或ERS先證者分離的原代心肌細(xì)胞或誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞衍生的心肌細(xì)胞的研究更少。通過計算模擬技術(shù)有益于預(yù)測突變的功能,但至今仍未進(jìn)行嚴(yán)格測試。Schwartz等[28]強調(diào):缺乏對基因變異的功能學(xué)或生物學(xué)驗證,是基因檢測解讀中最嚴(yán)重的不足所在。
源于NGS方法的應(yīng)用,擴(kuò)大了對一些特異性疾病的認(rèn)識。 如大幾率外顯子排序工程(GO-ESP)和外顯子組聚集研究(ExAC),極大地改變了以往關(guān)于心臟離子通道病易感基因所謂的“正?!钡募膊∝?fù)擔(dān)和背景基因變異認(rèn)知的程度[29]。對BrS患者基因檢測發(fā)現(xiàn),18%~28%的患者可檢測到SCN5A基因變異,而在普通人群中同樣存在3%~5%的“良性” SCN5A基因變異。這表明,對基因檢測結(jié)果的解釋非常復(fù)雜。這提示即使是攜帶最常見致病突變且有典型BrS表型的患者,基因檢測出現(xiàn)“假陽性”的概率仍高達(dá)10%。目前,已經(jīng)確定了20余個JWSs易感基因。 這些基因信息僅增加了檢測結(jié)果解釋中總的 “基因?qū)W噪音”,并未實質(zhì)性地增加基因檢測中發(fā)現(xiàn)真致病突變的機(jī)會[30]。以上這些基因檢測中存在的問題使我們認(rèn)識到,以純粹的概率論來解讀JWSs基因檢測的結(jié)果很有必要,但卻不能據(jù)此得出是否有病或確診疾病的結(jié)論。
近30年,離子通道病的基因檢測取得了輝煌的成就。盡管更加先進(jìn)的DNA測序技術(shù)應(yīng)用于離子通道病的基因檢測中,使基因結(jié)構(gòu)和功能復(fù)雜的離子通道病得以明確,但NGS基因檢測技術(shù)應(yīng)用于臨床實踐仍面臨挑戰(zhàn)。NGS篩選多致病基因的同時,不可避免的納入了有意義的不確定罕見變異(VUS),并增加了后續(xù)基因功能研究的難度。盡管有這些技術(shù)的幫助, 基因檢測中發(fā)現(xiàn)的大量基因變異仍成為我們被迫面對的“基因?qū)W煉獄”,這些變異的數(shù)目也會隨著外顯子或基因?qū)W測序的廣泛應(yīng)用而更趨增多。這就要求建立一個包含有臨床確診和變異分級證據(jù)相關(guān)的基因變異數(shù)據(jù)庫。這樣或許更能推動離子通道病的基因檢測,至少現(xiàn)階段,離子通道病基因檢測的潘多拉盒子仍未打開。
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