朱艷,暢志堅(jiān),張曉軍,李欣,詹海仙,郭慧娟,喬麟軼
(1.山西大學(xué)生物工程學(xué)院,山西太原030006;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西太原030031)
偃麥草屬分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)研究進(jìn)展
朱艷1,暢志堅(jiān)2,張曉軍2,李欣2,詹海仙2,郭慧娟2,喬麟軼2
(1.山西大學(xué)生物工程學(xué)院,山西太原030006;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西太原030031)
偃麥草具有小麥育種中需要的優(yōu)質(zhì)、抗病、耐鹽堿等諸多優(yōu)良性狀,為充分發(fā)掘偃麥草在提高小麥品質(zhì)和抗性方面的應(yīng)用潛力,列舉了3種偃麥草特異分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)情況,闡述了其在小麥育種中的應(yīng)用現(xiàn)狀,分析了開(kāi)發(fā)偃麥草分子標(biāo)記技術(shù)存在的問(wèn)題,以期促進(jìn)偃麥草分子標(biāo)記更好地應(yīng)用于小麥遺傳育種。
偃麥草;育種應(yīng)用;標(biāo)記開(kāi)發(fā)
偃麥草屬(Thinopyrum)植物是禾本科小麥族(Triticeae)多年生草本植物,世界范圍內(nèi)約有50種偃麥草屬植物,我國(guó)現(xiàn)有長(zhǎng)穗偃麥草(Th.elongatatum)、中間偃麥草(Th.intermedia)、茸毛偃麥草(Th. trichophora)、硬葉偃麥草(Th.smithii)等[1]。偃麥草屬植物因具有抗寒、抗旱、耐鹽堿、品質(zhì)優(yōu)良等性狀而多被用來(lái)作飼草,也是防風(fēng)固沙、水土保持的理想植物[2-3]。該屬植物是小麥的三級(jí)基因庫(kù),具有小麥缺乏的優(yōu)良基因及性狀,同時(shí)它與小麥的染色體組相近,且易于小麥雜交,因而,被廣泛應(yīng)用于小麥抗病育種[4]。偃麥草中的E基因組是小麥族中很重要的一個(gè)基本基因組,該基因組包含Ee和Eb2個(gè)亞基因組。依據(jù)系統(tǒng)分類學(xué)研究,推斷Ee和Eb基因組的真正供體分別是Th.elongatum(2n=2X=14,EeEe)[5]和Th.bessarabicum(2n=2X=14,EbEb)[6]。目前應(yīng)用最多的是長(zhǎng)穗偃麥草、百薩偃麥草、中間偃麥草,在小麥的抗病和品質(zhì)改良上充分體現(xiàn)了其價(jià)值。
分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展使得在分子水平上檢測(cè)外源遺傳物質(zhì)成為可能。其中,分子標(biāo)記技術(shù)被廣泛用于小麥異源種質(zhì)的鑒定、小麥異染色體系尤其是小片段易位系的選擇[7]以及分子標(biāo)記輔助選擇育種[8]。偃麥草染色體包含大量的抗性和品質(zhì)相關(guān)基因,基于基因組開(kāi)發(fā)特異分子標(biāo)記,將極大促進(jìn)偃麥草優(yōu)異性狀的發(fā)掘、鑒定與利用,加快小麥抗性育種進(jìn)程。
1.1 長(zhǎng)穗偃麥草標(biāo)記
長(zhǎng)穗偃麥草(Th.elongatum(Host)D.R Dewey)與小麥親緣關(guān)系較近,E基因組與小麥A,B,D基因組的遺傳分化程度較小。長(zhǎng)穗偃麥草通常有二倍體、四倍體、十倍體3種類型,二倍體長(zhǎng)穗偃麥草的Ee基因組是該物種的基本基因組,也有人認(rèn)為存在六倍體長(zhǎng)穗偃麥草[9]。長(zhǎng)穗偃麥草基因組中蘊(yùn)含著豐富的抗病、抗寒、抗旱、耐鹽堿等優(yōu)良基因,其染色體7EL或7ES上[10]、1E[11]染色體臂上發(fā)現(xiàn)了抗赤霉病基因,它是提高小麥生物和非生物脅迫耐受性的一個(gè)重要的潛在基因供體?;谄渲T多優(yōu)良性狀,因此,較早地育成了一套完整的小麥-長(zhǎng)穗偃麥草二體附加系和代換系。
早在1998年,劉樹(shù)兵等[9]已經(jīng)通過(guò)長(zhǎng)穗偃麥草與普通小麥間的多態(tài)性及E組染色體的特異RAPD標(biāo)記研究中,以中國(guó)春、長(zhǎng)穗偃麥草及其7個(gè)二體附加系為材料,獲得了3個(gè)長(zhǎng)穗偃麥草染色體特異RAPD標(biāo)記OPE-051300,OPF-03700和OPF-15400,分別位于1E和3E染色體上。尤明山等[5]用40對(duì)小麥SSR引物對(duì)17份偃麥草、2份小麥材料PCR擴(kuò)增分析后,篩選到Xgwm325-100 bp是Ee染色體組的特異SSR標(biāo)記。陳國(guó)躍等[12]首次獲得了一套完整的分子標(biāo)記。張超[13]利用11條引物,共獲得除2E外分布于其余6條長(zhǎng)穗偃麥草染色體特異片段74條,其中,1E,3E,4E,5E,6E,7E分別為7,7,15,19,9,17條。3類引物組合為ISSR,IRAP和REMAP等3種類型,并將位于5E以及7E染色體上的共3個(gè)E染色體特異片段轉(zhuǎn)換為特異PCR標(biāo)記。朱雪[14]用11條引物,共獲得45條特異片段,分布于長(zhǎng)穗偃麥草6條染色體(除2E)上,其中,1E,3E,4E,5E,6E,7E分別有6,3,8,11,8,9條,這些條帶屬于ISSR,IRAP和REMAP等3種類型。并將位于1E(Z34-IE200),4E(Z8-4E374),6E(Z17-6E199)以及7E(Z31-7E215)染色體上的4個(gè)特異片段轉(zhuǎn)換為SCAR標(biāo)記。葛江燕等[15]基于抑制消減雜交(SSH)篩選出36個(gè)長(zhǎng)穗偃麥草特異分子標(biāo)記。陳士強(qiáng)等[16]基于SLAF-seq技術(shù),共開(kāi)發(fā)了48個(gè)長(zhǎng)穗偃麥草特異分子標(biāo)記,基因組特異分子標(biāo)記2個(gè),1E染色體特異分子標(biāo)記20個(gè),其他染色體的特異標(biāo)記26個(gè),包括17個(gè)僅出現(xiàn)在1E和5E染色體上。秦樹(shù)文等[17]依據(jù)TRAP技術(shù),獲得30個(gè)長(zhǎng)穗偃麥草特異SCAR標(biāo)記,其中具有單條、2條和全基因組染色體特異SCAR標(biāo)記個(gè)數(shù)分別為18,9,3個(gè)。CHEN等[18]根據(jù)逆轉(zhuǎn)錄酶以及大麥BARE-1和水稻RIRE-1中的長(zhǎng)末端重復(fù)序列保守區(qū)域設(shè)計(jì)的11個(gè)引物組合,得到145個(gè)分布在長(zhǎng)穗偃麥草的全部7條E染色體上的ISSR,IRAP,REMAP等3種類型的特異性片段。經(jīng)與小麥序列同源性比對(duì)后,將其中13個(gè)長(zhǎng)穗偃麥草特異染色體標(biāo)記然后轉(zhuǎn)換成SCAR標(biāo)記。
1.2 百薩偃麥草標(biāo)記
百薩偃麥草(Th.bessarabicum L?ve,2n=2X=14)為海岸禾草,多生長(zhǎng)于歐洲波羅的海和地中海沿岸。百薩偃麥草除抗小麥梭條花葉病、赤霉病、線蟲等,還具有耐鹽、耐銅、耐鋁、耐重金屬等優(yōu)良性狀[19]。目前,研究最多的是它的耐鹽性。人們首先合成了普通小麥中國(guó)春-百薩偃麥草雙二倍體(2n=8X=56),簡(jiǎn)稱為Tritipyrum,以期轉(zhuǎn)移和利用其耐鹽基因,又相繼獲得異附加系、異代換系、易位系等小麥親緣物種的異染色體系[20]。
KING等[21]獲得了5J染色體上10個(gè)特異RAPD標(biāo)記,利用基因組原位雜交法,將其中6個(gè)定位在短臂上,4個(gè)定位在長(zhǎng)臂上。ZHANG等[6]篩選出一套中國(guó)春-百薩偃麥草二體附加系的AFLP和RAPD標(biāo)記,并利用GISH技術(shù)證實(shí),其中48,67,39,59,54個(gè)AFLP標(biāo)記分別可以追蹤1J,2J,4J,5J和7J染色體。陳華鋒等[20]篩選出30個(gè)特異分子標(biāo)記可追蹤百薩偃麥草染色質(zhì),其中可以特異追蹤C(jī)H05,CH09和CH03等二體附加系中的百薩偃麥草染色體的特異分子標(biāo)記5,4,2個(gè),同時(shí)篩選出3個(gè)標(biāo)記可以特異追蹤C(jī)H12和CH11中的易位染色體,還篩選出5個(gè)STS,3個(gè)RFLP探針和5個(gè)SSR共13個(gè)標(biāo)記,并推斷可以特異追蹤4J,5J染色體。達(dá)瓦頓珠[22]利用一套中國(guó)春-百薩偃麥草附加系,篩選出2個(gè)4J染色體特異標(biāo)記,XZ564和Xwmc233,且將其初步定位在4JS;篩選出8個(gè)5J染色體特異標(biāo)記,根據(jù)8個(gè)標(biāo)記在單體附加系MA5J自交后代的擴(kuò)增結(jié)果分析,推斷其中的一個(gè)標(biāo)記Xedm46位于5JL,其他7個(gè)標(biāo)記位于5JS。同時(shí)還篩選4個(gè)特異標(biāo)記能追蹤百薩偃麥草其他染色體,能特異追蹤1J的標(biāo)記為XZ507,XZ505,XZ476,能特異追蹤7J的標(biāo)記為Xedm144。李晨旭等[23]結(jié)合RNA-seq技術(shù),通過(guò)其EST-PCR產(chǎn)物在普通小麥中國(guó)春、百薩偃麥草和中國(guó)春-百薩偃麥草雙二倍體中的擴(kuò)增分析,共定位了198個(gè)百薩偃麥草特異標(biāo)記,分別位于染色體1J(31),2JS(15),2JL(26),3JS(20),4JS(12),4JL(12),5J(27),6JS(13),6JL(22)和7JS(20)上。
1.3 中間偃麥草標(biāo)記
中間偃麥草(Th.intermedium,2n=6X=42)是個(gè)部分同源-異源六倍體物種,其中,2個(gè)染色體組可能源于二倍體百薩偃麥草(Th.bessarabicum,2n=2X=14,EbEb)和二倍體長(zhǎng)穗偃麥草(Th.elongatum,2n=2X=14,EeEe);另外一個(gè)染色體組原始供體可能為擬鵝觀草(Pseudoroegneiria strigosa,2n=4X=28,StStStSt),與小麥親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。一般將中間偃麥草染色體組構(gòu)成表示為EeEeEbEbStSt或者JJJSJSStSt[24]。中間偃麥草對(duì)小麥白粉病、銹病、黑穗病、根腐病、黃矮、葉枯病、條紋花葉病和赤霉病等多種病害免疫或高抗,因其生命力強(qiáng),適應(yīng)性廣,分布于世界上諸多國(guó)家,是偃麥草屬中最早與小麥雜交成功的近緣物種[25]。迄今,已經(jīng)選育出多個(gè)小麥-中間偃麥草異附加系、異代換系和易位系[4,26]。
尤明山等[27]篩選到一個(gè)中間偃麥草染色體組特異標(biāo)記,并將該標(biāo)記進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為偃麥草染色體SCAR標(biāo)記。張?jiān)銎G等[28]獲得了中間偃麥草St染色體組特異RAPD和SCAR標(biāo)記。崔志富等[7]在中間偃麥草2Ai-2染色體的短臂上定位到抗黃矮病基因,將3個(gè)RFLP探針序列轉(zhuǎn)化為STS126,STS131和STS112標(biāo)記可用于追蹤2Ai-2染色體。崔雨等[29]利用RNA-seq技術(shù)設(shè)計(jì)EST-SSR引物,對(duì)普通小麥、中間偃麥草及其基因組供體二倍體長(zhǎng)穗偃麥草、百薩偃麥草、假鵝觀草進(jìn)行擴(kuò)增分析,從而篩選鑒定出中間偃麥草基因組特異標(biāo)記。
迄今為轉(zhuǎn)移普通小麥野生近緣種屬的優(yōu)良基因,通過(guò)遠(yuǎn)緣雜交及染色體工程技術(shù),已完成了普通小麥與10多個(gè)近緣屬、80多個(gè)種的遠(yuǎn)緣雜交[19]。偃麥草作為其中一個(gè)重要野生近緣種,從中發(fā)掘、轉(zhuǎn)移和利用諸多優(yōu)良基因,從而改良小麥品種,拓寬小麥遺傳基礎(chǔ)[4,26]。常規(guī)上通過(guò)對(duì)遠(yuǎn)緣雜交后代進(jìn)行選擇,獲得具有目標(biāo)性狀的小麥單株,該方法難度大、周期長(zhǎng)。而憑借DNA分子標(biāo)記不但可以檢測(cè)外源遺傳物質(zhì)的存在與否以及外源種質(zhì)資源的多樣性,而且利用遺傳群體還能明確分子標(biāo)記與外源基因的連鎖關(guān)系,大大提高了選擇準(zhǔn)確度和育種效率[30]。KING等[21]結(jié)合GISH技術(shù),利用RAPD鑒定出5JL和5JS端體附加系、5AS·5JL易位系等。王瑞晶等[31]依據(jù)偃麥草EST序列中SSR的總體特征,獲得了64個(gè)具有多態(tài)性的偃麥草EST-SSR標(biāo)記,其結(jié)果可應(yīng)用于偃麥草重要性狀關(guān)聯(lián)分析、遺傳多樣性研究分析。閆紅飛等[32]對(duì)來(lái)源于長(zhǎng)穗偃麥草的小麥抗葉銹基因Lr19開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記,建立了與Lr19共分離的穩(wěn)定的SCAR標(biāo)記Y19SCAR982,對(duì)120個(gè)小麥品種檢測(cè)的結(jié)果表明,該標(biāo)記可有效應(yīng)用于小麥抗葉銹分子輔助選擇育種。
目前,國(guó)內(nèi)外開(kāi)展了大量小麥與近緣種屬的遠(yuǎn)緣雜交工作,獲得了許多異源附加系、代換系和易位系,由于當(dāng)前基因組原位雜交(GISH)等細(xì)胞學(xué)技術(shù)在跟蹤檢測(cè)外源遺傳物質(zhì)方面存在一定的局限性,限制了上述材料的深度利用。因此,發(fā)展快速、有效的檢測(cè)技術(shù),有助于推動(dòng)遠(yuǎn)緣雜交、染色體工程育種的發(fā)展,同時(shí)在小麥種質(zhì)資源的創(chuàng)制與鑒定上意義深遠(yuǎn)。當(dāng)前小麥和偃麥草基因組的全序列結(jié)果未公開(kāi),加之小麥和偃麥草的基因組序列的同源性較高,利用AFLP,RFLP,RGAP,SSR和RAPD標(biāo)記技術(shù)開(kāi)發(fā)的一些偃麥草特異分子標(biāo)記普遍存在成本高、周期長(zhǎng)、效率低、穩(wěn)定性低、重復(fù)性和特異性不強(qiáng)等缺點(diǎn)[33]。同樣是二倍體長(zhǎng)穗偃麥草染色體1E-7E特異標(biāo)記,用42個(gè)RGAP引物組合擴(kuò)增共獲得特異RGAP標(biāo)記30個(gè)[12],用5對(duì)AFLP引物組合擴(kuò)增共獲得AFLP標(biāo)記28個(gè)[34],在效率上有所提高,但是轉(zhuǎn)化成STS標(biāo)記的只有4個(gè)[15]。因此,高效利用偃麥草優(yōu)良性狀的關(guān)鍵是開(kāi)發(fā)新的操作簡(jiǎn)單、快速、經(jīng)濟(jì)和有效的分子標(biāo)記。
TRAP技術(shù)[17]與RAPD,SSH,AFLP,SLAF-seq比較,其優(yōu)勢(shì)在于設(shè)計(jì)引物不是隨機(jī)的,是依據(jù)已有EST序列利用引物設(shè)計(jì)軟件所得,同時(shí)最終的多態(tài)性標(biāo)記與表現(xiàn)型的相關(guān)性相對(duì)較高。同時(shí)利用TRAP技術(shù)開(kāi)發(fā)的長(zhǎng)穗偃麥草特異SCAR標(biāo)記,具有特異性強(qiáng)、穩(wěn)定性好、擴(kuò)增結(jié)果簡(jiǎn)明易讀的特點(diǎn),可用于小麥背景中不同材料和不同世代中長(zhǎng)穗偃麥草染色體的跟蹤和鑒定[17]。RNA-seq技術(shù)是以數(shù)字化信號(hào)檢測(cè)物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng),同時(shí)還具有成本低、周期短、高通量等優(yōu)勢(shì),為快速開(kāi)發(fā)親緣物種特異分子標(biāo)記提供了豐富的序列信息,是目前開(kāi)發(fā)大量特異分子標(biāo)記的有效工具,這一技術(shù)在分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)和分子機(jī)理研究方面應(yīng)用越來(lái)越廣泛。目前一項(xiàng)利用RNA-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)的百薩偃麥草特異標(biāo)記的研究中,得到的標(biāo)記在鑒定小麥-百薩偃麥草小片段易位系或漸滲系、染色體物理作圖中具有很大的應(yīng)用潛力[23]。
[1]李雪蓮.偃麥草和中間偃麥草抗旱鑒定及其分子標(biāo)記輔助篩選[D].烏魯木齊:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué),2005.
[2]COLMER T D,F(xiàn)LOWERS T J,MUNNS R.Use of wild relatives to improve salt tolerancein wheat[J].Journal of Experimental Botany,2006,57(5):1059-1078.
[3]吳珊.長(zhǎng)穗偃麥草醇溶蛋白的遺傳多樣性分析[J].河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2016,45(3):34-38.
[4]張榮琦,陳春環(huán),趙曉農(nóng),等.八倍體小偃麥與普通小麥雜交選育優(yōu)質(zhì)小麥新品種的研究[J].西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào),2004,32(3):26-32.
[5]尤明山,李保云,田志會(huì).等.利用小麥微衛(wèi)星引物建立偃麥草Ee染色體組特異SSR標(biāo)記[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2003,11(6),577-581.
[6]ZHANG J Y,LI X M,RICHARD R C,et al.Molecular cytogenetic characterizationofEbgenomechromosomesinThinopyrum bessarabicum disomic addition lines of bread wheat[J].Plant Sci,2002,163(1):167-174.
[7]胡靜,李欣,閻曉濤,等.一個(gè)新的小麥-中間偃麥草異代換系的分子細(xì)胞學(xué)鑒定[J].山西農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,42(5):425-427.
[8]崔志富,林志珊,辛志勇,等.應(yīng)用GISH和STS標(biāo)記鑒定小麥-中間偃麥草抗黃矮病端體系[J].作物學(xué)報(bào),2006,32(12):1855-1859.
[9]劉樹(shù)兵,賈繼增,王洪剛,等.長(zhǎng)穗偃麥草(Agropyron elongatum,2n=14)與普通小麥間的多態(tài)性及E組染色體的特異RAPD標(biāo)記[J].作物學(xué)報(bào),1998,24(6),688-690.
[10]FUS,LVZ,BAOQ,et al.Molecular cytogenetic characterization of wheat-Thinopyrum elongatum,addition,substitution and translocation lines with a novel source ofresistance towheat fusariumhead blight[J].Journal ofGenetics&Genomics,2012,39(2):103-104.
[11]CHEN S Q,HUANG Z F,ZHANG Y,et al.Chromosomal location of the genes associated with FHB resistance of Lophopyrmn elongatum in Chinese Spring background[J].Journal of Triticeae Crops,2012,32:839-845.
[12]陳國(guó)躍,董攀,魏育明,等.普通小麥背景中長(zhǎng)穗偃麥草[Lophopyrum elongatum(Host)A.L?ve]E染色體組的RGAP特異標(biāo)記[J].作物學(xué)報(bào),2007,33(11):1782-1787.
[13]張超.長(zhǎng)穗偃麥草E組染色體特異PCR標(biāo)記開(kāi)發(fā)[D].揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2009.
[14]朱雪.小麥中國(guó)春背景中長(zhǎng)穗偃麥草E染色體組SCAR標(biāo)記發(fā)展[D].揚(yáng)州:揚(yáng)州大學(xué),2011.
[15]葛江燕,陳士強(qiáng),高營(yíng)營(yíng),等.基于抑制消減雜交開(kāi)發(fā)長(zhǎng)穗偃麥草(Lophopyrum elongatum)特異分子標(biāo)記[J].作物學(xué)報(bào),2012,38(10):1818-1826.
[16]陳士強(qiáng),秦樹(shù)文,黃澤峰.基于SLAF-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)長(zhǎng)穗偃麥草染色體特異分子標(biāo)記[J].作物學(xué)報(bào),2013,39(4):727-734.
[17]秦樹(shù)文,戴毅,陳士強(qiáng),等.基于TRAP的長(zhǎng)穗偃麥草SCAR標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用[J].麥類作物學(xué)報(bào),2014,34(12):1595-1602.
[18]CHEN S Q,GAO Y,ZHU X,et al.Development of E-chromosome specific molecular markers for Thinopyrum elongatum in a wheat background[J].Crop Science,2015,55(6):2777-2785.
[19]裴自友,溫輝芹,陳華鋒,等.百薩偃麥草在小麥遺傳改良中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J].陜西農(nóng)業(yè)科學(xué),2008(1):70-72.
[20]陳華鋒,錢保俐,莊麗芳,等.普通小麥中國(guó)春-百薩偃麥草異染色體系的分子標(biāo)記分析[J].作物學(xué)報(bào),2007,33(8):1232-1239.
[21]KING I P,PURDIE K A,REZANOOR H N,et al.Characterization of Thinopyrum bessarabicum chromosome segments in wheat using randomamplified polymorphic DNAs(RAPDs)and genomic in situ hybridization[J].Theoretical&Applied Genetics,1993,86(8):895-900.
[22]達(dá)瓦頓珠.普通小麥-百薩偃麥草4J、5J異染色體系的選育與分子標(biāo)記分析[D].南京:南京農(nóng)業(yè)大學(xué),2011.
[23]李晨旭,劉志濤,莊麗芳,等.基于RNA-seq的百薩偃麥草染色體特異分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)與應(yīng)用[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,48(6):1052-1062.
[24]吉萬(wàn)全,薛秀莊,王長(zhǎng)有.中間偃麥草的GISH分析[J].西北植物學(xué)報(bào),2001,21(3):401-405.
[25]劉紫垠,王長(zhǎng)有,陳春環(huán),等.小麥-中間偃麥草衍生后代的細(xì)胞學(xué)和SSR標(biāo)記鑒定[J].麥類作物學(xué)報(bào),2013,33(3):435-439.
[26]LAKIN P J,BANKS P M,LAGUDAH E S,et al.Disomic Thinopyrum intermedium addition lines in wheat with barley yellow dwarf virus resistance and with rust resistance[J].Genome,1995,38:385-394.
[27]尤明山,李保云,唐朝暉,等.偃麥草E染色體組特異RAPD和SCAR標(biāo)記的建立[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2002,7(5):1-6.
[28]張?jiān)銎G,王麗麗,辛志勇,等.中間偃麥草染色體2Ai-2特異PCR新標(biāo)記的建立和St基因組特異序列的克隆[J].遺傳學(xué)報(bào),2002,29(7):627-633.
[29]崔雨,鮑印廣,王洪剛,等.基于RNA-seq技術(shù)開(kāi)發(fā)中間偃麥草基因組特異分子標(biāo)記[J].麥類作物學(xué)報(bào),2016,36(6):699-707.
[30]徐林濤.小麥-中間偃麥草種質(zhì)系的鑒定[D].泰安:山東農(nóng)業(yè)大學(xué),2015.
[31]王瑞晶,李培英,張延輝.偃麥草EST-SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及應(yīng)用[J].草業(yè)科學(xué),2016,33(8):1526-1535.
[32]閆紅飛,楊文香,陳云芳,等.偃麥草屬E染色體組特異SCAR標(biāo)記對(duì)Lr19的特異性和穩(wěn)定性研究[J].植物病理學(xué)報(bào),2009,39(1):78-81.
[33]CHEN S Q,HUANG Z F,DAI Y,et al.The development of 7E chromosome-specific molecular markers for Thinopyrum elongatum based on SLAF-seq technology[J].PLoS One,2013,8(6):e65122-e65122.
[34]張麗,顏澤洪,鄭有良,等.小麥中國(guó)春背景下長(zhǎng)穗偃麥草Ee染色體組特異AFLP及STS標(biāo)記的建立[J].農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào),2008,16(1):465-473.
Research Progress of Molecular Markers Development inThinopyrum
ZHUYan1,CHANGZhijian2,ZHANGXiaojun2,LI Xin2,ZHANHaixian2,GUOHuijuan2,QIAOLinyi2
(1.College ofBiological Engineering,Shanxi University,Taiyuan 030006,China;2.Institute ofCrop Sciences,Shanxi AcademyofAgricultural Sciences,KeyLaboratoryofCrop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau,MinistryofAgriculture,Taiyuan 030031,China)
Thinopyrum has manyexcellent traits,such as high quality,disease resistance and salinity,which are urgentlyneeded in wheat breeding.To fully exploit the potential of Thinopyrum in improving the quality and resistance of wheat,the paper enumerates the development of specific molecular markers for three kinds of Thinopyrum,the paper expounds its application in wheat breeding,and analyzes the existingproblems about the development technologyfor Thinopyrum,soas topromote the Thinopyrum molecular markers for be better applyingin the genetic breedingofwheat.
Thinopyrum;breedingapplication;marker development
Q943.2
A
1002-2481(2017)04-0659-04
10.3969/j.issn.1002-2481.2017.04.41
2016-12-01
國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0102004-07);山西省青年基金項(xiàng)目(2015021145);山西省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20150311001-1);山西省國(guó)際合作項(xiàng)目(201603D421003);山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院攻關(guān)項(xiàng)目(15YGG01,YGG1602)
朱艷(1992-),女,山西朔州人,在讀碩士,研究方向:種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用。喬麟軼為通信作者。