醫(yī)學(xué)領(lǐng)域國(guó)際學(xué)術(shù)期刊數(shù)據(jù)出版政策分析

■劉 穎 王 旋

1)北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館，北京市海淀區(qū)學(xué)院路38號(hào) 1001912)中國(guó)石油勘探開(kāi)發(fā)研究院圖書館，北京市海淀區(qū)學(xué)院路20號(hào) 100083

科研數(shù)據(jù)是科研成果的重要支撐材料，也是科研活動(dòng)的重要產(chǎn)出。但在以往的很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)，科研數(shù)據(jù)只是保存在科研工作者個(gè)人手中或?qū)嶒?yàn)室里，隨著科研過(guò)程的結(jié)束而逐漸被擱置，甚至丟失。伴隨著數(shù)據(jù)密集型科研活動(dòng)的蓬勃發(fā)展，科研成果的再現(xiàn)以及相關(guān)假設(shè)的進(jìn)一步探索都需要獲取這些原始數(shù)據(jù)，科研數(shù)據(jù)的開(kāi)放獲取受到科研過(guò)程中利益相關(guān)者(政府監(jiān)管部門、資助機(jī)構(gòu)、期刊編輯、研究人員)的關(guān)注，越來(lái)越多的資助機(jī)構(gòu)以及國(guó)際學(xué)術(shù)組織提出開(kāi)放數(shù)據(jù)政策，要求科研數(shù)據(jù)能夠公開(kāi)可獲取，以幫助驗(yàn)證、推進(jìn)科學(xué)研究。

數(shù)據(jù)出版(Data Publishing/Data Publication)是近幾年出版界和數(shù)據(jù)共享界共同提出和積極探索的新概念，是數(shù)據(jù)共享的新機(jī)制。Pene等[1]認(rèn)為數(shù)字時(shí)代的數(shù)據(jù)出版是指在互聯(lián)網(wǎng)上公開(kāi)數(shù)據(jù)，并支持除數(shù)據(jù)提供者之外的研究人員或者組織機(jī)構(gòu)下載、分析、再利用以及引用數(shù)據(jù)；從廣義上講，任何將數(shù)據(jù)上傳到互聯(lián)網(wǎng)或者數(shù)據(jù)庫(kù)并支持開(kāi)放獲取的行為都可以稱之為數(shù)據(jù)出版。吳立宗等[2]認(rèn)為科學(xué)數(shù)據(jù)出版是指將數(shù)據(jù)作為一種重要的科學(xué)成果，從科學(xué)研究的角度對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行同行審議和公開(kāi)公布，并創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)和永久的數(shù)據(jù)引用信息，供其他研究性文章引證。國(guó)內(nèi)外數(shù)據(jù)出版定義的表述略有差別，國(guó)外的定義側(cè)重共享，國(guó)內(nèi)更接近于傳統(tǒng)論文出版，有完整的流程和控制標(biāo)準(zhǔn)。

近年來(lái)，越來(lái)越多的學(xué)術(shù)期刊發(fā)布了數(shù)據(jù)出版政策，研究人員對(duì)這些政策開(kāi)展了調(diào)研分析。如陳秀娟等[3]以美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)期刊為例剖析化學(xué)學(xué)科的學(xué)術(shù)期刊數(shù)據(jù)出版政策；雷秋雨等[4]分析了《期刊引用報(bào)告》(JCR)中進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域期刊的數(shù)據(jù)出版政策。本文以醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的核心期刊為例，系統(tǒng)地研究醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)W術(shù)期刊的數(shù)據(jù)出版政策。之所以選擇醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，主要是因?yàn)樵擃I(lǐng)域在數(shù)據(jù)共享政策規(guī)定方面的發(fā)展較為成熟，能為國(guó)內(nèi)同類期刊、期刊編輯制定和完善數(shù)據(jù)出版政策提供參考，也能幫助醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的科研人員了解相關(guān)數(shù)據(jù)出版政策和要求，便于他們投稿和共享科研數(shù)據(jù)。

1 研究對(duì)象和內(nèi)容

選取中科院科學(xué)引文索引(SCI)期刊分區(qū)表中醫(yī)學(xué)大類1區(qū)里影響因子排名在前50的期刊為樣本進(jìn)行研究，這些期刊是中科院依據(jù)美國(guó)科學(xué)信息研究所(ISI)的JCR列出的醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中影響力最大的期刊，在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的期刊中極具代表性和權(quán)威性[5]。截至2017年2月20日，中科院SCI期刊分區(qū)表中1區(qū)醫(yī)學(xué)大類里影響因子排在前50的期刊見(jiàn)表1，按照影響因子從大到小的順序編號(hào)，下文如再次出現(xiàn)，將以編號(hào)代替。

表1 中科院SCI期刊分區(qū)表1區(qū)醫(yī)學(xué)大類影響因子排名前50的期刊列表

筆者調(diào)研了這些期刊的網(wǎng)站，并對(duì)每種期刊的“Author Instructions”部分進(jìn)行了詳細(xì)調(diào)查，調(diào)研的內(nèi)容均為2017年2月的最新版本。對(duì)期刊是否要求作者提交支撐性數(shù)據(jù)或補(bǔ)充數(shù)據(jù)材料進(jìn)行出版的論述進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，將這些期刊的數(shù)據(jù)出版政策按照強(qiáng)弱等級(jí)細(xì)分為4個(gè)等級(jí)；依據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果，進(jìn)一步調(diào)查各個(gè)期刊對(duì)于數(shù)據(jù)發(fā)表和數(shù)據(jù)共享的要求和表述，如要求作者提交何種數(shù)據(jù)、如何提交、提交于何處，以及數(shù)據(jù)的開(kāi)放性規(guī)定，并進(jìn)行歸納總結(jié)；選取具有代表性的學(xué)術(shù)期刊，詳細(xì)介紹其政策規(guī)定。

2 概況

對(duì)表1中50種學(xué)術(shù)期刊的數(shù)據(jù)出版政策進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)有3種期刊沒(méi)有數(shù)據(jù)存繳要求，其余47種期刊均要求作者將相關(guān)數(shù)據(jù)或補(bǔ)充材料作為支撐信息(Supporting Information，SI)隨論文一起提交。SI是指能夠直接支持論文的主要結(jié)論，但對(duì)主要結(jié)論而言是額外的或次要的，或因?yàn)榭臻g或者格式限制等原因不能被列入論文主體中的數(shù)據(jù)或其他材料[6]。在期刊允許的情況下，同行評(píng)審過(guò)程中評(píng)審專家可以將SI作為評(píng)審參考；在論文發(fā)表以后，SI也會(huì)隨論文電子版以期刊規(guī)定的相應(yīng)形式發(fā)表，感興趣的科研人員可以獲取所需數(shù)據(jù)并再現(xiàn)作者的研究成果。

對(duì)有數(shù)據(jù)存繳和出版政策的47種期刊進(jìn)行調(diào)研發(fā)現(xiàn)，出版社對(duì)SI的提交要求通?？煞譃橐韵?種：1)作者及時(shí)提交SI并愿意出版是論文出版的條件之一，不提供SI的論文可能會(huì)被期刊編輯拒絕發(fā)表；2)建議或鼓勵(lì)作者將相關(guān)數(shù)據(jù)作為SI同論文一起在線出版，但提交SI不作為論文是否出版的考量，由作者自己決定；3)作者可以提交相關(guān)數(shù)據(jù)作為SI，但SI是否在線出版由期刊編輯決定。按政策強(qiáng)弱細(xì)分標(biāo)準(zhǔn)，將每種期刊的“Author Instructions”論述中出現(xiàn) “作為論文出版條件”“作者必須提交”“必須愿意出版”等字眼，定義為強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策；論述中出現(xiàn)“鼓勵(lì)提交”“建議提交”“應(yīng)該提交”“可以提交”這些字眼，同時(shí)出現(xiàn)“只要作者愿意就提供在線出版”定義為次強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策；論述中出現(xiàn)“應(yīng)該提交”“可以提交”，同時(shí)出現(xiàn)“由期刊編輯決定是否出版”定義為弱數(shù)據(jù)出版政策。

比照上述標(biāo)準(zhǔn)總結(jié)出表2，在50種期刊中，3種期刊沒(méi)有數(shù)據(jù)出版政策，占6.0%；10種期刊具有強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策，占20.0%；22種期刊具有次強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策，占44.0%；15種期刊具有弱數(shù)據(jù)出版政策，占30.0%。由此可見(jiàn)，只有少部分期刊具有強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策，數(shù)據(jù)出版政策的強(qiáng)制性力度并不大。有數(shù)據(jù)出版政策的47種期刊中，只有少數(shù)需要由編輯來(lái)決定提交的數(shù)據(jù)是否能夠作為SI在線出版，大部分期刊只要作者愿意，就能夠提供在線出版，可見(jiàn)SI的出版條件比較寬松和簡(jiǎn)單。

表2 中科院JCR列表1區(qū)醫(yī)學(xué)大類影響因子排名前50的期刊數(shù)據(jù)出版政策類型分布

3 期刊數(shù)據(jù)出版政策分析

3.1 數(shù)據(jù)類型

有數(shù)據(jù)出版政策的47種期刊依據(jù)該期刊自身特點(diǎn)，對(duì)以SI形式提交的數(shù)據(jù)類型有不同程度的要求(表3)。屬于同一出版集團(tuán)的期刊通常具有相同的數(shù)據(jù)出版政策，以SI形式提交的數(shù)據(jù)類型相同，比如Nature出版集團(tuán)系列期刊、Lancet系列期刊和Annual Review系列期刊。所有期刊都說(shuō)明了SI中可以包含圖、表、數(shù)據(jù)集、音頻、視頻等通用數(shù)據(jù)類型，有一些期刊還說(shuō)明SI中可以包含蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)、DNA和RNA序列數(shù)據(jù)、大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)、微陣列數(shù)據(jù)、計(jì)算機(jī)代碼和臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)等特定數(shù)據(jù)類型。不同期刊對(duì)SI數(shù)據(jù)的格式有不同的要求，某些特定數(shù)據(jù)類型被要求先存儲(chǔ)到推薦的相應(yīng)第三方倉(cāng)儲(chǔ)中，而其他的數(shù)據(jù)類型則可以根據(jù)期刊要求以pdf、doc、excel、mov、mp3或zip等文件形式直接上傳。

表3 中科院JCR列表1區(qū)醫(yī)學(xué)大類影響因子排名前50期刊SI內(nèi)容

3.2 數(shù)據(jù)存儲(chǔ)位置

數(shù)據(jù)存儲(chǔ)位置是期刊數(shù)據(jù)出版政策的重要組成部分。總體上說(shuō)，大部分期刊都允許將通用數(shù)據(jù)直接提交到期刊平臺(tái)上，特定數(shù)據(jù)類型則需要提交到適當(dāng)?shù)墓矀}(cāng)儲(chǔ)中，形式不一而足，具體來(lái)說(shuō)，目前主要有以下幾種數(shù)據(jù)存儲(chǔ)方式。

(1) 直接提交到期刊平臺(tái)上，由期刊進(jìn)行存儲(chǔ)管理

有數(shù)據(jù)出版政策的47種期刊都支持通用數(shù)據(jù)以該方式存儲(chǔ)，但有些對(duì)文件的數(shù)量和大小有限制。如Lancet系列期刊要求音頻、視頻材料的容量小于50 MB；EuropeanHeartJournal要求補(bǔ)充材料不超過(guò)10個(gè)文件，每個(gè)文件不超過(guò)1.5 MB[7]。

(2) 提交到適當(dāng)?shù)墓矓?shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)中

公共數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)是分享科研數(shù)據(jù)的較優(yōu)方式。與期刊平臺(tái)的存儲(chǔ)相比，公共數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)使數(shù)據(jù)更容易被發(fā)現(xiàn)和獲取，并提供數(shù)據(jù)的格式化存儲(chǔ)，支持特殊領(lǐng)域的數(shù)據(jù)報(bào)道標(biāo)準(zhǔn)，特別適合對(duì)特定數(shù)據(jù)類型的存儲(chǔ)。有數(shù)據(jù)出版政策的47種期刊中，明確規(guī)定和要求將特定數(shù)據(jù)類型存儲(chǔ)到推薦的公共數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)的期刊有28種，其中，Nature系列期刊、Lancet系列期刊、Elsevier Cell系列期刊甚至為每種數(shù)據(jù)類型推薦了相應(yīng)的數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)清單(表4)。

表4 特定數(shù)據(jù)類型推薦的第三方倉(cāng)儲(chǔ)

如果某些特殊數(shù)據(jù)類型找不到合適的存儲(chǔ)位置，可選擇通用倉(cāng)儲(chǔ)進(jìn)行存儲(chǔ)，如Figshare 、 Dryad。更多的數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)還可以參照期刊認(rèn)可的推薦列表，如ScientificData[8]、Biosharing[9]整理的倉(cāng)儲(chǔ)信息。

(3) 作為數(shù)據(jù)論文出版

數(shù)據(jù)論文是近年來(lái)興起的數(shù)據(jù)出版形式。與學(xué)術(shù)論文不同，數(shù)據(jù)論文的主要內(nèi)容是數(shù)據(jù)收集、獲取和處理等過(guò)程和方法的描述，不涉及數(shù)據(jù)和研究結(jié)果的分析、推論、假設(shè)和驗(yàn)證。通過(guò)這種出版形式，數(shù)據(jù)可以像學(xué)術(shù)論文一樣納入到學(xué)術(shù)評(píng)價(jià)體系，促進(jìn)數(shù)據(jù)分享、獲取和重用。Nature集團(tuán)從2014年開(kāi)始出版的數(shù)據(jù)期刊ScientificData，它的主要文章類型是Data Descriptor，它主要提供對(duì)數(shù)據(jù)細(xì)節(jié)的描述,闡述數(shù)據(jù)如何被產(chǎn)出、被誰(shuí)產(chǎn)出以及如何能夠被其他研究者再利用。出版的Data Descriptor將與相關(guān)的期刊論文和存儲(chǔ)在數(shù)據(jù)倉(cāng)儲(chǔ)中的數(shù)據(jù)文檔鏈接。調(diào)研中涉及到的11種Nature集團(tuán)的期刊都支持作者將補(bǔ)充資料以數(shù)據(jù)論文形式出版。

(4) 存儲(chǔ)到作者所在機(jī)構(gòu)的網(wǎng)站或機(jī)構(gòu)庫(kù)中

PhysiologicalReviews允許研究人員將補(bǔ)充材料存儲(chǔ)在作者所在機(jī)構(gòu)的網(wǎng)站中，并在論文中按照規(guī)定格式提供鏈接到數(shù)據(jù)集的統(tǒng)一資源定位符(URL)[10]。

(5) 作者自行保存一定時(shí)間

EuropeanUrology不保存論文的補(bǔ)充數(shù)據(jù)，而是建議作者在論文出版之時(shí)起將數(shù)據(jù)集凍結(jié)5年。如果同行評(píng)議需要驗(yàn)證方法和數(shù)據(jù)的有效性，作者需要提供匿名的數(shù)據(jù)集；當(dāng)其他研究人員提出合理的數(shù)據(jù)利用需求時(shí)，EuropeanUrology鼓勵(lì)作者提供，但認(rèn)可不同國(guó)家對(duì)作者義務(wù)的不同規(guī)定[11]。

3.3 數(shù)據(jù)可用性聲明

所有47種有數(shù)據(jù)出版政策的期刊都明確說(shuō)明SI數(shù)據(jù)不會(huì)放在印刷本期刊中，而是以電子方式出版。大多數(shù)期刊會(huì)在印刷稿中聲明補(bǔ)充材料SI可在出版期刊電子版的網(wǎng)站中獲取。在線出版時(shí)，不同期刊對(duì)SI數(shù)據(jù)獲取方式的聲明和提示目前還沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)，但大多數(shù)遵循以下幾種方式：(1)在期刊網(wǎng)站稿件內(nèi)容發(fā)表頁(yè)面或旁邊提示如Supplemental Materials字樣的鏈接，可通過(guò)鏈接獲取數(shù)據(jù)；(2)在稿件的方法部分聲明SI文件獲取事項(xiàng)，如沒(méi)有方法部分，在參考文獻(xiàn)或致謝部分之前聲明；(3)在文中與數(shù)據(jù)相關(guān)的內(nèi)容部分引用，通過(guò)超鏈接獲取文件，普通數(shù)據(jù)通常要求單獨(dú)編號(hào)(如Supplementary Figure S1)，特定數(shù)據(jù)類型在論文中標(biāo)識(shí)數(shù)據(jù)集的訪問(wèn)控制號(hào)、鏈接或DOI號(hào)；(4)向作者申請(qǐng)獲取。

4 結(jié)論

從調(diào)研結(jié)果可以看出，國(guó)際頂尖的醫(yī)學(xué)期刊已經(jīng)積極地介入科研數(shù)據(jù)的管理過(guò)程，紛紛發(fā)表數(shù)據(jù)出版政策。了解期刊的數(shù)據(jù)出版政策，期刊出版社可以緊跟國(guó)際期刊的政策形勢(shì)；投稿的科研人員可以準(zhǔn)確把握期刊要求，提高投稿效率；而需要復(fù)用數(shù)據(jù)的科研人員可以方便獲取所需的科研數(shù)據(jù)。目前，期刊數(shù)據(jù)出版政策已經(jīng)較完善，涉及很多方面，如數(shù)據(jù)存繳的時(shí)間、數(shù)據(jù)格式、隱私信息的處理。但筆者認(rèn)為還有許多問(wèn)題值得進(jìn)一步改進(jìn)和探討。(1)數(shù)據(jù)出版政策的強(qiáng)制力度不夠,有數(shù)據(jù)出版政策的47種期刊中，只有10種有強(qiáng)數(shù)據(jù)出版政策，其余37種期刊都只是建議或者鼓勵(lì)提交數(shù)據(jù)進(jìn)行出版，主要取決于作者本人的意愿，并未形成一種客觀上的要求，在數(shù)據(jù)共享方面沒(méi)有形成強(qiáng)有力的支持。(2)沒(méi)有良好的數(shù)據(jù)質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)，絕大部分有數(shù)據(jù)出版政策的學(xué)術(shù)期刊都說(shuō)明由作者自行對(duì)數(shù)據(jù)的質(zhì)量、真實(shí)性等情況進(jìn)行負(fù)責(zé)，沒(méi)有設(shè)定專門的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)審核專家對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行評(píng)審，無(wú)法保證數(shù)據(jù)的規(guī)范性和質(zhì)量，并不利于數(shù)據(jù)的有效復(fù)用。(3)數(shù)據(jù)描述和可使用性不足，大部分期刊提供直接將數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在期刊平臺(tái)上，并且只是在期刊原文的電子版中提供訪問(wèn)鏈接，有一些期刊甚至要求除了音頻、視頻文件和大數(shù)據(jù)集的其他數(shù)據(jù)都放在一個(gè)PDF文件中，并沒(méi)有對(duì)數(shù)據(jù)內(nèi)容的單獨(dú)描述以及結(jié)構(gòu)化存儲(chǔ)，不便于對(duì)數(shù)據(jù)的檢索、查看和重復(fù)利用。(4)期刊平臺(tái)與第三方倉(cāng)儲(chǔ)整合不足，在上述調(diào)研中，只有ScienceDirect平臺(tái)出版的期刊提到在第三方倉(cāng)儲(chǔ)有相關(guān)數(shù)據(jù)時(shí)，會(huì)出現(xiàn)倉(cāng)儲(chǔ)標(biāo)識(shí)，其他要求將特定數(shù)據(jù)類型數(shù)據(jù)存儲(chǔ)到第三方倉(cāng)儲(chǔ)中的期刊，只要求提供在第三方倉(cāng)儲(chǔ)中的獲取鏈接或獲取編號(hào)。

[1] Penev L,Mietchen D,Chavan V,etal.Pensoft data publishing policies and guidelines for biodiversity data[EB/OL].(2011-05-26)[2017-03-06].http://pensoft.net/J_FILES/Pensoft_Data_Publishing_Policies_and_Guidelines.pdf.

[2] 吳立宗，王亮緒，南卓銅，等.科學(xué)數(shù)據(jù)出版現(xiàn)狀及其體系框架[J].遙感技術(shù)與應(yīng)用,2013,28(3):383-390.

[3] 陳秀娟，吳鳴.學(xué)科領(lǐng)域期刊科研數(shù)據(jù)發(fā)表政策剖析——以美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)期刊為例[J].中國(guó)科技期刊研究,2015,26(8):800-807.

[4] 雷秋雨，馬建玲.學(xué)術(shù)期刊數(shù)據(jù)出版政策研究綜述——以JCR中進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域期刊為例[J].圖書館理論與實(shí)踐,2016(1):30-34.

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[11]EuropeanUrology.Submission guidelines[EB/OL].[2017-03-06].http://www.europeanurology.com/content/resources-for-authors#7000.