張國斌
(沈陽市疾病預防控制中心,遼寧 沈陽 110031)
瘧疾的實時熒光PCR快速檢測方法探討
張國斌
(沈陽市疾病預防控制中心,遼寧 沈陽 110031)
目的 探討瘧疾的實時熒光PCR快速檢測方法。方法 選擇本市國際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測血樣。本研究設計了瘧疾病原體實時熒光PCR快速檢測的引物和探針,總結了快速檢測方法,瘧疾鏡檢陽性/陰性血樣均各分為4次檢測完畢,統(tǒng)計各份血樣檢測結果和每次檢測時間,計算平均用時和瘧疾鏡檢與實時熒光PCR檢測符合率。結果 瘧疾鏡檢陽性血樣20份,檢測4次,平均用時(19.15±1.34)min,瘧疾鏡檢陰性血樣平均用時為(19.52±1.49)min,40份血樣熒光PCR檢測平均用時(19.34±1.65)min。在熒光PCR檢測與瘧疾鏡檢符合率方面,陽性血樣(100%)和陰性血樣(90.00%)比較,無顯著差異P>0.05,認為無統(tǒng)計學意義。40份待測血樣熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率為95.00%(38/40)。結論 本研究瘧疾病原體實時熒光PCR快速檢測準確性高,陽性檢出高,檢測時間段,用于瘧疾快速檢驗可行性較強,不易發(fā)生漏檢情況。
瘧疾;實時熒光;PCR;快速檢測;巢式PCR
瘧疾是我國流行病防治的重點,檢測診斷多依靠瘧原蟲形態(tài)檢查、抗體血清學檢查以及瘧原蟲體抗原檢測等方法,鏡檢是較為可靠的瘧原蟲檢測方法,但存在各種限制因素,假陰性率較高,較容易出現(xiàn)漏診情況,故需要探索一套更為靈敏、快捷的檢測方法[1]。為此,為此,本研究設計了瘧疾病原體實時熒光 PCR快速檢測的引物和探針,總結了一套快速檢測方法,選擇本市國際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測血樣,統(tǒng)計各份血樣檢測結果,對比分析了瘧疾鏡檢與實時熒光 PCR 檢測符合率,報道如下。
1.1 一般資料:選擇本市國際旅行衛(wèi)生保健中心提供的瘧疾鏡檢陽性血樣20份,另選擇健康者(瘧疾鏡檢陰性)血樣20份作為待測血樣。40份血樣均為靜脈血,采用真空采血管(2%EDTA-Na2抗疑)采血,在本實驗室按要求(20 ℃)保存。
1.2 試劑及DNA提?。罕締挝徊捎肣iagen公司全血DNA提取試劑盒和熒光PCR試劑。按QIAamp DNA Blood Extraction Minikit提取瘧原蟲DNA并低溫保存。
1.3 引物設計合成:惡性瘧、間日瘧、三日瘧和卵形瘧的SSU rRNA基因的引物和探針,由上海生工生物工程公司合成,包括實時熒光PCR檢測的引物、探針。各引物擴增參數(shù)為:Plas-FP 、Plas-RP和Plas-Pro擴增長度73 bp;rPLUout-FP和rPLUout-RP擴增長度1815 bp;rPLUin-FP和rPLUin-RP擴增長度240 bp。使用TaqMan體系配置行熒光PCR檢測,58 ℃收集熒光,擴增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,隨后進行擴增產(chǎn)物電泳分析,凝膠成像系統(tǒng)結果拍照并分析。
1.4 研究方法:瘧疾鏡檢陽性血樣20份,每次檢測5份,共分為4次檢測完畢,統(tǒng)計各份血樣檢測結果和每次檢測時間,計算平均用時。瘧疾鏡檢陰性血樣處理方法同上。統(tǒng)計瘧疾鏡檢與實時熒光PCR檢測符合率。
1.5 統(tǒng)計學方法:采用SPSS20.0統(tǒng)計學軟件分析研究數(shù)據(jù),計量資料采用t檢驗;計數(shù)資料采用χ2檢驗,P<0.05認為差異顯著,有統(tǒng)計學意義。
2.1 瘧疾實時熒光PCR檢測時間:瘧疾鏡檢陽性血樣20份,檢測4次,用時為18~20 min,平均 (19.15±1.34)min。瘧疾鏡檢陰性血樣20份,檢測4次,用時為18~21 min,平均 (19.52±1.49)min。瘧疾鏡檢陰性血樣和瘧疾鏡檢陽性血樣熒光 PCR檢測時間無明顯差異P>0.05,40份血樣熒光PCR檢測平均用時(19.34±1.65)min,約為20 min。
2.2 瘧疾實時熒光PCR檢測結果與鏡檢比較:瘧疾鏡檢陽性血樣20份中,熒光PCR檢測陽性20份,熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率為100%(20/20)。瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,熒光PCR檢測陰性為18份,檢出陽性2份,熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率為90.00%(18/20)。在熒光PCR檢測與瘧疾鏡檢符合率方面,陽性血樣(100%)和陰性血樣(90.00%)比較,無顯著差異P>0.05,認為無統(tǒng)計學意義。40份待測血樣熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率為95.00%(38/40)。
我國并非瘧疾疫區(qū)國家,但是近年來我國勞動力輸出增多,較多瘧疾疫區(qū)生活人員往來于我國境內,因而必須有效控制瘧疾的傳入。國境口岸等單位是負責瘧疾檢測工作的主要部門,需要應對各類瘧疾檢測,但傳統(tǒng)瘧原蟲形態(tài)檢查、抗體血清學檢查以及瘧原蟲體抗原檢測等方法,存在耗時長或一次檢測數(shù)量有限等問題,影響了瘧疾病原體檢測效率。為此,應更為快捷、準確的瘧疾檢測系統(tǒng)[2]。
近年來,基因擴增技術趨于成熟,因而應探索該方法在瘧原蟲基因檢測方面的優(yōu)勢性。為此,本次研究基于各類瘧疾病原體的SSU rRNA基因序列,設計了熒光PCR快速檢測的引物和探針,形成了一套通用型實時熒光PCR快速檢測方法。實時熒光PCR快速檢測時間較短,本次研究40份血樣熒光PCR檢測平均用時(19.34±1.65)min,約為20 min,可知其檢測速度較快,檢測效率明顯提升。當前,國內對實時熒光PCR快速檢測逐漸增多,但是對于快速檢測的準確性仍存在一定的爭議,尚無可靠論據(jù)[3]。本次研究對比分析了瘧疾鏡檢陽性血樣與陰性血樣的熒光PCR快速檢測結果,發(fā)現(xiàn)鏡檢陽性血樣熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率達到了100%(20/20),而瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,熒光PCR檢測陰性為18份,熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率為90.00%,瘧疾鏡檢陽性血樣與陰性血樣的熒光PCR快速檢測結果無顯著差異,40份待測血樣熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率高達95.00%(38/40),可知熒光PCR快速檢測結果較為準確、可靠,提示該快速檢測方法實驗室應用價值較高。但是本次研究在對比陰/陽血樣熒光PCR快速檢測結果中也發(fā)現(xiàn),雖然鏡檢陽性血樣熒光PCR檢測和瘧疾鏡檢符合率較高,但是瘧疾鏡檢陰性血樣20份中,檢出陽性2份,存在一定的假陽性概率,而無假陰性血樣,提示在熒光PCR快速檢測中應對陽性病例,再次實施瘧疾鏡檢,以排除假陽性病例,保證檢測結果準確性。當前,熒光PCR快速檢測技術快速發(fā)展,多數(shù)通用熒光PCR快速檢測設備已經(jīng)可以完成1次90份以上的檢測量,基本可以滿足國境口岸等單位大規(guī)模檢測的需求,對于我國瘧疾防控工作具有重要意義。
綜上所述,本研究瘧疾病原體實時熒光PCR快速檢測準確性高,陽性檢出高,檢測時間段,用于瘧疾快速檢驗可行性較強,不易發(fā)生漏檢情況。
[1] 營雅茹,李衛(wèi)東,張?zhí)?等.快速檢測試劑條、鏡檢和PCR在瘧疾診斷中的應用研究[J].中華疾病控制雜志,2014,10(2):163-165.
[2] 祁軍,于智睿,黃吉城,等.交叉引物等溫擴增技術在惡性瘧疾快速檢測中的應用[J].中國媒介生物學及控制雜志,2013,8(3):204-207.
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R531.3
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1671-8194(2017)07-0017-02