斯汀/編譯
DNA制造的新時代:大規(guī)模生產(chǎn)
斯汀/編譯
DNA工廠:Twist公司的機器在硅板上600納米的孔中制造DNA鏈
●合成生物產(chǎn)業(yè)的新創(chuàng)公司從計算機行業(yè)獲取技術。
生物技術新創(chuàng)公司Twist Bioscience首席執(zhí)行官兼共同創(chuàng)建人艾米麗·勒普洛斯特(Emily Leproust)是納米層面的實業(yè)家。她說:“我提醒公司里的每一個人,我們是一家制造公司。我們制造DNA?!?/p>
Twist是新成立的合成生物學行業(yè)的新興企業(yè),此行業(yè)以生物實驗室為廠房,以生物體為產(chǎn)品??茖W家們制造DNA鏈,作為組裝生命基因密碼的材料,創(chuàng)造前所未有的生物體模樣。這些新的生命形態(tài)肯定能為人所用,有一定的實用價值。例如,生物學家們已經(jīng)制造出能夠分泌藥物的酵母細胞,以及可以用于生產(chǎn)飛機燃料的藻類。
DNA組裝過程具有勞動密集型特點,需要訓練有素的人員投入大量艱辛的工作,此項充滿生機的新興產(chǎn)業(yè)因此受到阻礙。如今,創(chuàng)業(yè)公司彼此競爭,創(chuàng)建時尚、自動化的DNA組裝線,亨利·福特在世也會為此感到驕傲;公司還向制作電腦芯片的工廠學習技術制造DNA。合成革新技術降低了DNA鏈的制造成本,這些企業(yè)正計劃降低價格,他們自己說這將帶來一個繁榮的市場。2016年,Twist Bioscience將在舊金山的總部開始商業(yè)運營,目前他們是這場競爭中的領軍者。
組成基因材料的分子叫做核堿基,DNA中有四種分別以字母A、C、G和T來表示。這些字母的順序代表著構建一個生物體的密碼,根據(jù)這些密碼,生物具備不同的細胞以及功能。對于人類來說,這一密碼約有32億個字母的長度,而用于烘培和啤酒釀造的酵母密碼約有1 200萬個字母。改變字母之間的順序,就改變了生物的系統(tǒng)指令。合成生物學家們已經(jīng)書寫了新的密碼片段,并將它們嵌入酵母菌的DNA中,就能炮制出所需要的微生物。例如魚油補劑中的Omega-3脂肪酸,以及以前只有玫瑰花才能產(chǎn)生的芳香精油。
第一個“合成生物體”的名字叫做Mycoplasma Laboratorium,由一百萬個堿基基因組裝配的細菌。
構建DNA鏈并不復雜,事實上,這是全世界實驗室里常見的技術程序。但實驗室里的程序通常手動操作完成,Twist公司的勒普洛斯特說:“微生物學是體力勞動。找個博士生,整天將液體從一個試管倒入另一個試管?!睘榇怂退暮献髡邆儼l(fā)明了一個機器,可以自動完成整個構建過程。
該機器的核心是一塊表面有著一萬個小孔的硅板,結合電腦芯片制造中非常完善的光刻技術,蝕刻這些小孔,不同的DNA鏈便可以在每一個600納米寬的孔洞里完成構建。這臺機器可以做和一個博士生“完全一樣的化學過程”,勒普洛斯特說,“只是體積上小了100倍?!?/p>
Twist公司并不出售機器,而是銷售制造DNA的服務,主要服務于尋找改良新基因以使研究順利進行的科研人員以及新創(chuàng)公司。2015年,公司開始對所選的客戶提供DNA產(chǎn)品。2016年,Twist準備將服務全面商業(yè)化。DNA生產(chǎn)線以每個核堿基的成本模式定價,勒普洛斯特表示公司每個核堿基10美分的起步價是行業(yè)內最低的。但她的目標是兩美分的價點:“以這個點,研究人員可以進行規(guī)模試驗,不再受到DNA價格成本的限制。”目前,客戶們已經(jīng)定制了300個DNA鏈,1 800個堿基的長度。做個比較,胰島素(INS)的基因長度為1 600堿基;而乳腺癌風險(BRCA1)的基因長度為81 000堿基。
舊金山地區(qū)另一家合成生物新創(chuàng)公司Zymergen則向用戶提供更廣泛的服務。公司不僅低價構建DNA片段,也能將DNA嵌入微生物并監(jiān)測結果。公司首席科學官扎克·賽貝爾(Zach Serber)解釋說,監(jiān)測的結果可用于下一輪DNA的設計,讓用戶快速獲得他們想要的理想生物體。賽貝爾說:“你撒下個大網(wǎng),等你發(fā)現(xiàn)了一個改善微生物表現(xiàn)的變體,你就可以雙倍投入?!?/p>
前述這些事例被打上“生物體工廠”的標簽,引起人們對合成生物學這一產(chǎn)業(yè)的激烈討論。但DNA規(guī)?;a(chǎn)的前景并沒有打動生物科技顧問兼BioEconomy Capital創(chuàng)投基金的執(zhí)行總裁羅布·卡爾森(Rob Carlson)。他表示:我不理解這種商業(yè)模式。
卡爾森對此提出質疑,他認為低價的DNA合成會導致出現(xiàn)大量想從微生物上獲利的新創(chuàng)公司?!斑@樣你就可以制造并測試更多的DNA,但這并不是最難的部分。從簡單的試管到實驗室規(guī)模再到商業(yè)規(guī)模的過程,高達產(chǎn)品成本的90%。”對于一家想要利用酵母菌來研發(fā)藥物的新創(chuàng)公司來說,他需要管理巨大的裝滿微生物的槽罐。而初期DNA生產(chǎn)降低的成本只給公司帶來微薄小利,卡爾森說:“天哪,那點錢他們只能買啤酒,或者周五多買點披薩?!?/p>
[資料來源:IEEE Spectrum][責任編輯:彥隱]