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    PCR實(shí)驗(yàn)室的污染及控制措施

    2016-03-09 18:25:18郭利華
    關(guān)鍵詞:控制措施產(chǎn)物標(biāo)本

    郭利華

    (成都艾迪康醫(yī)學(xué)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室有限公司 610037)

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    PCR實(shí)驗(yàn)室的污染及控制措施

    郭利華

    (成都艾迪康醫(yī)學(xué)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室有限公司610037)

    目的分析PCR實(shí)驗(yàn)室污染途徑。方法針對(duì)PCR實(shí)驗(yàn)室不同的污染途徑采取不同的控制措施。結(jié)果通過一系列控制措施,達(dá)到了有效預(yù)防和控制污染的發(fā)生。結(jié)論P(yáng)CR實(shí)驗(yàn)由于具有高靈敏度,容易產(chǎn)生污染,必須針對(duì)不同污染途徑采取不同控制措施,以避免污染產(chǎn)生的風(fēng)險(xiǎn)。

    聚合酶鏈反應(yīng);實(shí)驗(yàn)室污染;控制措施

    聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)是20世紀(jì)80年代慢慢發(fā)展起來的一種體外基因擴(kuò)增技術(shù)。該項(xiàng)技術(shù)在人體外可在很短的一定時(shí)間內(nèi)將極微量的靶核酸擴(kuò)增上百萬倍,得到大量特定目的基因片段。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,PCR技術(shù)具有特異、快速、敏感、產(chǎn)率高、易自動(dòng)化、高通量、簡(jiǎn)便等突出優(yōu)點(diǎn),已成為臨床實(shí)驗(yàn)室常用的操作技術(shù)之一[1-2]。PCR技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域重點(diǎn)應(yīng)用于臨床醫(yī)學(xué)和預(yù)防醫(yī)學(xué)中[3],大多數(shù)病原體都可通過PCR檢測(cè)為人類疾病的防治提供新的檢測(cè)手段,但在實(shí)際PCR實(shí)驗(yàn)過程中極易發(fā)生污染,引起結(jié)果的假陽性。為保證結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性,結(jié)合有關(guān)資料和工作經(jīng)驗(yàn)分析PCR實(shí)驗(yàn)室污染產(chǎn)生的途徑及控制措施。

    1 PCR實(shí)驗(yàn)室常見污染途徑

    由于PCR技術(shù)敏感性特高,所以要求更高,影響因素也非常多,從樣品開始采集到結(jié)果報(bào)告發(fā)出,任何一處細(xì)小的失誤都會(huì)造成檢測(cè)結(jié)果的偏差,極其微量的污染都容易導(dǎo)致樣品出現(xiàn)假陽性結(jié)果。產(chǎn)生污染的主要途徑包括4個(gè)方面:(1)是PCR試劑污染。主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣器、容器、水及其他溶液被PCR核酸模板污染。(2)是標(biāo)本間交叉污染。①收集標(biāo)本的容器被污染。②標(biāo)本放置時(shí),由于密封不嚴(yán)溢于容器外。③容器外黏有標(biāo)本造成相互間交叉污染。④標(biāo)本核酸模板在提取過程中,由于吸樣器污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染。⑤有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠而擴(kuò)散導(dǎo)致污染。(3)是PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染。這是PCR中最常見的污染問題,因?yàn)镻CR產(chǎn)物拷貝量大,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測(cè)數(shù)個(gè)拷貝的極限,所以極微量的PCR產(chǎn)物污染就可形成假陽性。(4)是實(shí)驗(yàn)室中克隆質(zhì)粒的污染。在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室及某些用克隆質(zhì)粒做陽性對(duì)照的實(shí)驗(yàn)室,這個(gè)問題也比較常見。克隆質(zhì)粒在單位容積內(nèi)濃度高,另外在純化過程中需要較多的用具及試劑,而且在活細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒,由于活細(xì)胞的生長(zhǎng)繁殖的簡(jiǎn)便性及其具有很強(qiáng)的生命力,其污染可能性也很大[4]。由于一旦發(fā)生基因?qū)嶒?yàn)室污染,該實(shí)驗(yàn)就必須要停止,花費(fèi)大量物力、人力直到尋找污染源為止,而且實(shí)驗(yàn)報(bào)告結(jié)果必須作廢,需重新操作實(shí)驗(yàn),結(jié)果才可靠。

    2 PCR污染的控制措施

    2.1工作區(qū)域的嚴(yán)格劃分

    2.1.1各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域設(shè)置合理,根據(jù)《CNAS-CL36醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力認(rèn)可準(zhǔn)則在分子診斷領(lǐng)域的應(yīng)用說明》要求,合理分隔實(shí)驗(yàn)室。將樣品的處理、配制PCR反應(yīng)液、PCR循環(huán)擴(kuò)增及PCR產(chǎn)物的鑒定等步驟分區(qū)或分室進(jìn)行,特別注意標(biāo)本處理及PCR產(chǎn)物的鑒定應(yīng)與其他步驟嚴(yán)格分開。最好能劃分:標(biāo)本處理區(qū),PCR反應(yīng)液制備區(qū),PCR循環(huán)擴(kuò)增區(qū),PCR產(chǎn)物鑒定區(qū)。其實(shí)驗(yàn)用品及吸樣槍應(yīng)專用。實(shí)驗(yàn)前應(yīng)將實(shí)驗(yàn)室用紫外線消毒以破壞殘留的DNA或RNA[5]。

    2.1.2各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域要對(duì)不同設(shè)備、物品顏色有明顯的標(biāo)記,如各區(qū)域使用專門的工作服、工作鞋、垃圾桶、拖把、抹布、筆等,避免不同工作區(qū)域內(nèi)的設(shè)備、物品混用。

    2.2使用一次性用具吸頭、離心管、無粉塵手套、口罩等均為一次性使用。

    2.3規(guī)范的系統(tǒng)設(shè)置設(shè)置規(guī)范的空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng),盡可能采用全送全排空調(diào)系統(tǒng)。在進(jìn)入各個(gè)操作區(qū)域需要嚴(yán)格單一流向進(jìn)行,即試劑準(zhǔn)備和貯存區(qū)→樣品制備區(qū)→PCR擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū),不得逆行。

    2.4污染監(jiān)測(cè)需要設(shè)立陽性對(duì)照、陰性對(duì)照,進(jìn)行重復(fù)試驗(yàn),選擇不相同區(qū)域的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增等,做好污染監(jiān)測(cè),以便采取措施防止和消除污染。

    2.5規(guī)范操作

    2.5.1PCR實(shí)驗(yàn)室人員必須進(jìn)行上崗培訓(xùn),取得外部和內(nèi)部上崗證后,方可從事基因擴(kuò)增檢驗(yàn)工作。

    2.5.2在操作中勤換手套,且不能與管蓋內(nèi)面接觸。吸頭、離心管裝上濾嘴才能用。

    2.5.3要正確操作相關(guān)儀器設(shè)備,認(rèn)真按照制訂的合理、科學(xué)的操作規(guī)程操作相關(guān)儀器設(shè)備,避免產(chǎn)生氣溶膠污染。

    2.5.4取樣、加液(標(biāo)本、反應(yīng)液等)時(shí)應(yīng)先高速離心將管蓋上液體沉于管底,動(dòng)作輕快、以避免飛濺和產(chǎn)生氣溶膠污染環(huán)境。取樣應(yīng)就近操作,避免較遠(yuǎn)距離移樣。

    2.5.5若在各區(qū)域操作發(fā)生試劑、樣品的外濺,此時(shí)工作人員先隔離其他未被污染的相關(guān)物品,戴上手套和生物防護(hù)裝置,用吸水紙吸干液體,對(duì)污染處用2 000 mg/L的次氯酸鈉消毒液覆蓋30 min,再用75%乙醇擦拭2遍,等試驗(yàn)結(jié)束后用紫外線照射39 min[6]。

    2.5.6若發(fā)生實(shí)驗(yàn)室工作人員工作服、鞋、帽被污染時(shí),必須立即脫掉并包裹好進(jìn)行消毒處理,換上另外消毒好的工作服、鞋、帽等后方可繼續(xù)工作。如果污染重則停止當(dāng)天的下一步工作或另換其他具有資質(zhì)的人員進(jìn)行工作。

    2.5.7清潔工作及時(shí)、準(zhǔn)確,每次實(shí)驗(yàn)前后用500 mg/L的含氯消毒液擦拭地面及工作臺(tái)面,75%乙醇擦拭儀器設(shè)備,再用紫外線照射整個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域及設(shè)備,時(shí)間不低于30 min。實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的樣品溶液和擴(kuò)增產(chǎn)物產(chǎn)生的氣溶膠是重要的污染源,故PCR實(shí)驗(yàn)室要經(jīng)常通風(fēng)換氣和消毒。當(dāng)試驗(yàn)結(jié)束后產(chǎn)生的廢棄反應(yīng)管、槍頭等廢棄物應(yīng)置于2 000 mg/L的含氯消毒液中浸泡12 h以上。廢棄物需要經(jīng)高壓滅菌后按醫(yī)療廢物進(jìn)行消毒處理,避免污染實(shí)驗(yàn)環(huán)境。

    2.6科學(xué)合理的管理根據(jù)實(shí)際情況,制訂科學(xué)、合理的關(guān)于PCR相關(guān)制度文件、程序文件、標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程及記錄表格等文件,文件相關(guān)內(nèi)容一定要有科學(xué)性、前瞻性、、嚴(yán)謹(jǐn)性,并且操作性強(qiáng),以便工作人員現(xiàn)場(chǎng)查閱和培訓(xùn)學(xué)習(xí)。

    目前PCR技術(shù)廣泛應(yīng)用,已經(jīng)得到長(zhǎng)足發(fā)展,成為臨床一些疾病診斷和預(yù)防控制領(lǐng)域的有力工具。為避免在PCR實(shí)驗(yàn)室內(nèi)出現(xiàn)污染、假陰性及假陽性結(jié)果等現(xiàn)象,確保檢驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性,實(shí)驗(yàn)人員應(yīng)該不斷提升檢測(cè)能力,具備應(yīng)對(duì)污染的能力,控制污染蔓延,將損失降到最小。

    [1]Pfaffl MW.A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR[J].Nueleic Acids Res,1994,29(9):51-52.

    [2]朱永芳.實(shí)時(shí)熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測(cè)技術(shù)[M].北京:中國(guó)計(jì)量出版社,2013.

    [3]林萬明.PCR技術(shù)操作和應(yīng)用[M].北京:人民軍醫(yī)出版社,2012.

    [4]Munoz N,Bosh FX,de Sanjose S,et al.Epidemiogic classification of human papillomavirus types associated with cervical Cacer[J].N Engl J Med,2003,348(6):518-527.

    [5]黃雅,馮玉昆.HPV亞型檢測(cè)與宮頸癌篩查[J].醫(yī)學(xué)綜述,2007,13(19):1453-1454.

    [6]Herrero R,Castellsague X,Pawlta M,et al.Human papillomaviruses and oral caner:the international agency for research on cacer multcenter sdudy[J].J NATL Cancer Int,2003,95(1):1772-1783.

    10.3969/j.issn.1673-4130.2016.16.067

    B

    1673-4130(2016)16-2354-02

    2016-02-14

    2016-06-03)

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