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      新疆特高發(fā)腫瘤資源庫管理系統(tǒng)的開發(fā)與應(yīng)用

      2015-12-25 03:27:58郭文佳,朱琳,舒曉敏
      關(guān)鍵詞:管理系統(tǒng)信息

      通信作者:王喜艷,男,主任醫(yī)師,博士生導(dǎo)師,研究方向:胰腺腫瘤的基礎(chǔ)和臨床,E-mail: wangxiyan2415@163.com。

      新疆特高發(fā)腫瘤資源庫管理系統(tǒng)的開發(fā)與應(yīng)用

      郭文佳, 朱琳, 舒曉敏, 張園, 董翔, 王喜艷

      (新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院新疆腫瘤防治研究所, 烏魯木齊830011)

      摘要:目的建立新疆特高發(fā)腫瘤資源庫信息管理系統(tǒng)。方法開發(fā)“腫瘤資源庫管理系統(tǒng)”軟件,以醫(yī)院內(nèi)網(wǎng)為操作平臺,對庫存的標(biāo)本進行信息管理。 結(jié)果該系統(tǒng)具有信息錄入、儲存、瀏覽、檢索及數(shù)據(jù)維護、導(dǎo)出、保密等功能。可以提供標(biāo)本信息的查詢,還可通過醫(yī)院信息系統(tǒng)獲得電子病歷、病理結(jié)果、病案和隨訪等信息。結(jié)論該系統(tǒng)具有高效、安全、操作方便等優(yōu)點,可以為科學(xué)研究提供高水平的信息研究平臺。

      關(guān)鍵詞:腫瘤資源庫; 信息; 管理系統(tǒng)

      基金項目:國家自然科學(xué)基金(81460361); 新疆科技基礎(chǔ)條件平臺建設(shè)項目(PT1107)

      作者簡介:郭文佳(1984-),女,碩士,助理研究員,研究方向:哈薩克族食管癌發(fā)病機理。

      中圖分類號:R197.324

      doi:10.3969/j.issn.1009-5551.2015.03.004

      [收稿日期:2014-11-19]

      Development and application of Xinjiang tumor resource bank management system

      GUO Wenjia, ZHU Lin, SHU Xaomin, ZHANG Yuan, DONG Xiang, WANG Xiyan

      (TumorResearchInstitute,TumorAffiliatedHospitalofXinjiangMedicalUniversity,

      Urumqi830011,China)

      Abstract:ObjectiveTo establish Xinjiang tumor resource bank management system for better managing tumor specimens and scientific research. MethodsWe developed the tumor resource bank management system with local area network of hospital as the operating platform. ResultsThe management system has the functions of recording, bowing, storing, searching of information and maintenance, administration of data, the advantages of efficient, safe and easy to be used, as well as directly getting diagnosis and treatment information of the patient from Hospital Information System. ConclusionWith the functions of reflecting the sample information accurately and dynamically, the system would provide a good platform for scientific research.

      Key words: tumor resource bank; information; management system

      目前在世界范圍內(nèi)開始進行腫瘤分子分型和個體化診治的研究,這項研究能否獲得實質(zhì)性進展取決于一個最基本的問題,即研究用生物樣本的質(zhì)量和數(shù)量,包括符合臨床診治規(guī)范的臨床研究隊列,高質(zhì)量、嚴(yán)格按照標(biāo)準(zhǔn)操作程序收集組織樣本和詳細(xì)的臨床、病理、治療和隨訪等資料。從這個意義上講現(xiàn)代腫瘤研究是以獲得高質(zhì)量腫瘤樣本和系統(tǒng)的信息資料為核心[1]。

      新疆特高發(fā)腫瘤資源庫日常工作可歸納為2個重點環(huán)節(jié):一是腫瘤標(biāo)本的收集、處理、保存和使用;二是腫瘤標(biāo)本相關(guān)信息的儲存、管理、統(tǒng)計和檢索[2]。為了使腫瘤資源庫各項工作能夠取得實質(zhì)性進展和持續(xù)發(fā)展,有必要在一開始的基礎(chǔ)性工作中突出課題研究所用腫瘤標(biāo)本的規(guī)范化信息管理。由于標(biāo)本信息量大,而且處于動態(tài)變化之中,利用計算機技術(shù)處理資料和管理腫瘤資源庫標(biāo)本是方便、高效的方法[3]。因此,本研究結(jié)合新疆特高發(fā)腫瘤資源庫現(xiàn)狀,設(shè)計一套功能完善、安全可靠、使用高效的腫瘤資源庫信息管理系統(tǒng),對腫瘤資源庫標(biāo)本的所有信息進行信息化管理,旨在建立新疆特高發(fā)腫瘤資源庫的信息管理系統(tǒng)。

      1材料與方法

      1.1材料新疆醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院使用醫(yī)院信息系統(tǒng)(hospital information Ssystem,HIS),包括實驗室信息系統(tǒng)(laboratory information system, LIS)、醫(yī)生工作站、門診管理系統(tǒng)、手術(shù)管理系統(tǒng)、隨訪管理系統(tǒng)、病案管理系統(tǒng)等和患者的臨床資料。

      1.2方法以HIS為載體,將腫瘤資源庫管理系統(tǒng)納入其中,成為HIS子系統(tǒng),將腫瘤資源庫的標(biāo)本作為醫(yī)院資料的一部分加以保存,實現(xiàn)標(biāo)本資料高效管理,方便工作人員對腫瘤資源庫庫存標(biāo)本進行查詢。

      新疆特高發(fā)腫瘤資源庫收集的標(biāo)本來源于入院的不同患者或者患者不同病程階段的血液、手術(shù)切取的組織;病種包括食管癌、肺癌、宮頸癌、卵巢癌、肝癌、胰腺癌、腎癌、前列腺癌、腦腫瘤、骨腫瘤等,數(shù)量可達數(shù)萬份;血液和組織標(biāo)本儲存于多臺-80℃冰箱。要求腫瘤資源管理系統(tǒng)兼具信息錄入、儲存、瀏覽、檢索、導(dǎo)出、數(shù)據(jù)維護、管理等功能,并具有操作安全、方便等特點。同時,腫瘤標(biāo)本管理系統(tǒng)能夠與醫(yī)院HIS有機結(jié)合在一起,HIS為腫瘤資源庫管理系統(tǒng)提供患者一般資料、歷次住院情況、手術(shù)安排情況、隨訪資料,根據(jù)患者一般資料、診斷等條件,查詢和篩選目標(biāo)腫瘤標(biāo)本。

      2結(jié)果

      2.1新疆特高發(fā)腫瘤資源庫使用和構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(1)患者資料庫,包括患者的診治時間、病理資料、預(yù)后資料;(2)標(biāo)本使用資料庫,包括標(biāo)本的使用數(shù)量、標(biāo)本質(zhì)量、研究者使用情況;(3)研究資料庫,包括研究結(jié)果等。

      2.2腫瘤資源庫管理系統(tǒng)的功能(1)錄入功能:錄入患者住院號,腫瘤資源庫管理系統(tǒng)給出標(biāo)本唯一標(biāo)本編號,并且自動從HIS調(diào)出患者基本信息(患者姓名、民族、年齡、性別、籍貫、就診日期、臨床診斷、通訊方式、臨床信息、治療摘要、手術(shù)信息等)。腫瘤資源庫管理系統(tǒng)提供標(biāo)本信息(標(biāo)本編號、入庫編號、入庫時間、標(biāo)本類別、標(biāo)本詳細(xì)描述等);患者病理信息(腫瘤的體積、組織類型、分級、浸潤深度、切緣情況、免疫表型等);標(biāo)本存放信息(存放的位置、存放標(biāo)本的數(shù)量等);標(biāo)本的使用情況(出庫編號、出庫時間、申請人、申請單位、相關(guān)項目、審批人、操作者等);標(biāo)本的質(zhì)控信息(實驗內(nèi)容、實驗結(jié)果、實驗人、實驗日期等);標(biāo)本廢除信息(廢除編號、入庫編號、標(biāo)本原始位置、廢除日期、廢除原因、經(jīng)手人等)。工作人員可以根據(jù)患者的一般資料、診斷和隨訪資料等條件,查詢標(biāo)本庫存和使用情況。(2)標(biāo)本儲存功能:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)能夠儲存工作人員每日收集的組織、血液標(biāo)本信息,并且自動提取HIS中的病歷信息,儲存到資源庫管理系統(tǒng)中。(3)標(biāo)本和患者信息瀏覽功能:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)中,工作人員能夠根據(jù)自行設(shè)定的多種條件查看腫瘤資源庫中所有標(biāo)本的各種詳細(xì)信息以及患者的信息。(4)標(biāo)本的檢索功能:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)可按照工作人員需求設(shè)定查找范圍,如入庫時間、標(biāo)本類別、標(biāo)本來源、姓名、性別、住院號以及備注等條件進行查找,并可以將查詢的結(jié)果導(dǎo)出至Excel文件。(5)數(shù)據(jù)維護功能:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)中,工作人員可以通過獲得的權(quán)限,將已錄入的各項數(shù)據(jù),如“標(biāo)本編碼”、“標(biāo)本類別”等進行修改。(6)標(biāo)本的導(dǎo)出功能:腫瘤資源庫標(biāo)本管理系統(tǒng)可以通過條件查找功能導(dǎo)出所需要的標(biāo)本信息,以Excel文件形式保存,方便使用者統(tǒng)計、總結(jié)。(7)標(biāo)本的保密功能:為了對病人資料進行保密,必須確保數(shù)據(jù)的安全性。軟件開發(fā)時對登陸本系統(tǒng)的工作人員設(shè)置了多級管理權(quán)限,即獲取權(quán)限的工作人員才能對數(shù)據(jù)進行修改,而不知道密碼或者非操作人員無權(quán)進入系統(tǒng)。

      2.3腫瘤資源庫管理系統(tǒng)的特點(1)專業(yè)性強:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)作為專業(yè)的定制標(biāo)本管理系統(tǒng),所有標(biāo)本資源的存儲都是根據(jù)專業(yè)的需求來收集,在此基礎(chǔ)上系統(tǒng)保存和收集的信息專業(yè)程度更高,針對性更強。(2)準(zhǔn)確性高:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)作為專業(yè)的信息系統(tǒng),對所收集的各種組織和血液標(biāo)本的信息做到準(zhǔn)確及時地儲存、整理和分析。(3)實用性廣:腫瘤資源庫管理系統(tǒng)能根據(jù)研究工作的需求,利用計算機所建立數(shù)據(jù)庫及時更新信息,及時地為醫(yī)藥科學(xué)研究提供多種必需的信息服務(wù)。(4)便捷的服務(wù):能夠幫助腫瘤資源庫管理者從復(fù)雜繁瑣又無序的狀態(tài)下解放出來,以實驗室綜合信息管理的核心部分,滿足各大實驗機構(gòu)在信息管理上的迫切需求。實現(xiàn)對各類型庫存資源的有效管理,為工作人員和研究人員服務(wù)。

      3討論

      設(shè)計一套計算機管理軟件對腫瘤資源庫庫存標(biāo)本進行信息化管理,腫瘤資源庫管理系統(tǒng)在工作中發(fā)揮了極大的優(yōu)勢,有利于全面了解庫存標(biāo)本的情況,更加簡明、全面和準(zhǔn)確地反映庫存標(biāo)本數(shù)量、質(zhì)量和使用情況。進一步完善腫瘤資源庫的管理系統(tǒng),利用計算機更加準(zhǔn)確地核算采集、存儲標(biāo)本的成本,更加具體化地評價庫存標(biāo)本的質(zhì)量,腫瘤資源庫成本控制更有效[4]。通過腫瘤資源庫管理系統(tǒng)界面直接得知醫(yī)院每天手術(shù)的安排情況,腫瘤資源庫取材人員能夠靈活安排采集手術(shù)標(biāo)本的時間,保證取材不遺漏。腫瘤資源庫管理人員可以通過授權(quán)直接獲得患者的歷次住院和門診臨床所有診治情況及隨訪資料[5]。

      今后新疆特高發(fā)腫瘤資源庫的工作重點是采集標(biāo)本,除手術(shù)冰凍標(biāo)本、血液標(biāo)本外,還將包括石蠟標(biāo)本,以及對入組的臨床樣本和數(shù)據(jù)進行科學(xué)實驗鑒定和系統(tǒng)分析。在此基礎(chǔ)上建立并完善腫瘤分子標(biāo)志譜臨床研究專用的樣本采集和應(yīng)用體系,包括技術(shù)規(guī)范、資源庫和實驗分析數(shù)據(jù)庫,這些都必須以腫瘤資源庫的信息化管理作為基礎(chǔ),建立高質(zhì)量的腫瘤標(biāo)本和系統(tǒng)臨床隨訪資料庫,建立規(guī)范化診治的多中心臨床隊列。我們應(yīng)從面臨的實際問題出發(fā),對腫瘤資源庫庫存標(biāo)本的管理在實際工作中逐步加以完善,形成良好的運行和使用機制??茖W(xué)研究與腫瘤資源庫的發(fā)展離不開多方合作[6]。有了現(xiàn)在規(guī)范的技術(shù)平臺,腫瘤資源庫預(yù)計今后在各地州下設(shè)腫瘤衛(wèi)星組織庫,推廣建庫的經(jīng)驗和標(biāo)準(zhǔn)化操作流程,加強區(qū)域共享資源,構(gòu)建良好的科技合作機制,形成完備的生物信息網(wǎng)絡(luò),以利于全區(qū)醫(yī)療衛(wèi)生從業(yè)人員共享資源,協(xié)作進行腫瘤科研工作。

      參考文獻:

      [1]Cahane M, van Baare J. European association of tissue banks [J]. Dev Ophthalmol, 2009, 43:1-31.

      [2]葉鐵真,鄭錦濤,張曉紅.兒童腫瘤標(biāo)本庫標(biāo)本信息管理系統(tǒng)的建立和應(yīng)用[J].中國醫(yī)院管理,2003,11(23):33-35.

      [3]Mager SR, Oomen MH, Morente MM, et al. Standard operating procedure for the collect ion of fresh frozen tissue samples[J]. Eur J Cancer, 2007, 43(5):828.

      [4]Mishra A, Pandey A, Shaw R. Initiating tumor banking for translational research:MD Anderson and Liverpool experience[J]. Indian J Cancer, 2007, 44(1):17.

      [5]Hwang RF, Wang H, Lara A, et al. Development of an integrated bio-specimen bank and multidisciplinary clinical database for pancreatic cancer[J] . Ann Surg Oncol, 2008, 15(5):1356.

      [6]鄧軍衛(wèi),施小六,許毅,等.綜合醫(yī)院組織細(xì)胞庫信息系統(tǒng)的建立及意義[J].中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志,2010,11(20):3512-3515.

      (本文編輯周芳)

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