胡祎民 金露 李一帆 陳獨群 蘇鄭明 劉家駒 楊尚琪 桂耀庭 毛向明 來永慶
微小 RNA(microRNA,miRNA)是非編碼RNA的一種,長度在20~25個核苷酸左右[1]。因有研究發(fā)現(xiàn)miRNA能夠通過抑制mRNA翻譯或使mRNA降解調(diào)節(jié)基因表達,因此,miRNA近年來成為研究熱點[2]。miRNA在多種重要的細胞生物進程中均發(fā)揮著重要作用,如細胞增殖、細胞遷移、細胞凋亡等[3]。在包括腎癌在內(nèi)的多種腫瘤組織中均檢測到miRNA的異常表達,基因芯片篩選出了在腎癌組織中表達異常的miRNA[4]。但是,和已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的在乳腺癌[5]、喉癌[6]及肝癌[7]等腫瘤組織中的高表達不同,miR-10b在腎癌組織中表達下調(diào),因此我們選用miR-10b作為研究對象,驗證其在腎癌組織中的表達水平,探究其在腎癌發(fā)生、發(fā)展中所發(fā)揮的作用。
腎細胞癌(renal cell cancer,RCC),簡稱腎癌,起源于近端腎小管,是腎臟腫瘤中最常見的類型[4]。腎癌最常見的組織類型為透明細胞癌,約占腎細胞癌的75%~80%[3]。約30%的患者診斷時已經(jīng)存在遠處轉(zhuǎn)移,由于對放療、化療不敏感,目前腎癌的主要治療方法只有通過外科手術(shù)切除[8]。美國2013年統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明新發(fā)腎癌病例有65 150例,其中有8 780例因腎癌死亡[9]。腎癌發(fā)病早期無典型癥狀,預(yù)后不佳,因此尋找可用于腎癌早期診斷、靶向治療及預(yù)后判斷的生物標志物就尤為重要。
本研究通過實時熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測配對組織、腎癌細胞系中miR-10b的相對表達量,分析其表達水平與患者臨床病理特征的相關(guān)性,探究miR-10b與腎癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系。
收集35例腎癌及相應(yīng)的癌旁組織,所取標本均經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準,患者均已簽署知情同意書。標本均由手術(shù)切除,且切除后置于RNA保護液中,24h后轉(zhuǎn)移至-80℃液氮中保存。每對標本包括腎癌組織(顯微鏡檢證實癌細胞80%以上)1例、癌旁組織(手術(shù)切除距腎癌病灶5cm以上,顯微鏡檢提示正常細胞90%以上)1例。所有病例均有完整的臨床資料(見表1),組織分型參考 WHO分類標準,臨床分期參考2009年美國癌癥聯(lián)合會的標準進行。
人RCC細胞系:786-O、ACHN細胞(美國細胞培養(yǎng)收藏中心,美國)。人胚腎細胞系:HEK-293T(中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院培養(yǎng)物收藏中心,中國)。細胞接種于含1%谷氨酰胺、1%抗生素及10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液,放置在37℃,5%CO2溫箱中培養(yǎng)。
在液氮下碾磨標本組織、培養(yǎng)細胞,使用Trizol試劑(Invitrogen,USA)分別提取總 RNA,使用NanoDrop 2000/2000c測定RNA濃度。按照反轉(zhuǎn)錄試劑 miScript RT Kit(Qiagen,Germany)說明書所述,取1μg總RNA加入反應(yīng)體系進行逆轉(zhuǎn)錄,反應(yīng)在普通RT-PCR 儀(BIO-RAD,USA)上進行。反應(yīng)程序:37℃60min,95℃5min。
根據(jù)miRNA 熒光試劑 miScript SYBR Green PCR Kit(Qiagen,Germany)說明書所述,進行qRTPCR反應(yīng),反應(yīng)在LC 480熒光定量PCR儀(Applied Biosystems,USA)上進行。miR-10b正向引物由Qiagen公司合成:5′-UACCCUGUAGAACCGAAUUUGUG-3′,反向引物為Qiagen公司試劑盒中提供的通用引物;以U6snRNA作為內(nèi)參照進行標準化處理,U6正向引物:5′-CTCGCTTCGGCAGCACA-3′,下游引物為5′-ACGCTTCACGA-ATTTGCGT-3′。反應(yīng)條件:95℃15min,94℃15s,55℃30s,70℃30s,共計完成40個循環(huán)。
按 照 公 式 2-ΔCT(ΔCT = CTmiR-196a-CTU6,ΔΔCT=ΔCTRCC-ΔCTNormal)計算 miR-10b的相對表達量[10],2-ΔΔCT即 miR-10b在腎癌及正常組織中表達量比值。采用配對t檢驗分析配對組織間、各細胞系之間miR-10b表達水平差異。將病例資料按年齡、性別、組織類型、臨床分期分組(年齡以中位數(shù)51歲分界),按腎癌組織miR-10b相對表達量平均數(shù)分為高表達組、低表達組,列出四格表,行χ2檢驗探究miR-10b表達水平與患者臨床特征之間的關(guān)系。P<0.05表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
采用qRT-PCR檢測組織及細胞系中miR-10b的表達水平,結(jié)果顯示786-O、ACHN腎癌細胞中miR-10b表達水平均低于 HEK-293T(P<0.05),結(jié)果如圖1所示。在35例腎癌標本中,26例(74.29%)腎癌組織miR-10b表達水平下降,腎癌組織中miR-10b表達水平明顯低于正常組織(P<0.05),結(jié)果如圖2A所示。通過2-ΔCT計算miR-10b在組織中相對表達量,在腎癌中其均數(shù)±標準誤為0.273 84±0.054 63,結(jié)果如圖2B所示。
通過χ2檢驗探究miR-10b表達水平與患者臨床特征之間的關(guān)系,結(jié)果如表1所示,未發(fā)現(xiàn)miR-10b表達水平與病例相關(guān)臨床特征之間有相關(guān)性。
圖1 miR-10b在細胞系中的相對表達量
圖2 miR-10b在正常組織及腎癌組織中的表達
表1 miR-10b表達水平與患者臨床病理特征之間的關(guān)系
miRNA是一類內(nèi)源性具有調(diào)控功能的非編碼RNA,其在多種細胞生物進程中都扮演著重要的角色[11]。超過半數(shù)的miRNA位于染色體的脆性位點及與腫瘤發(fā)生相關(guān)的基因區(qū)域[12],這也表明了miRNA在腫瘤發(fā)生中所扮演角色的重要性及復(fù)雜性。miRNA通過和mRNA的3′端不完全性結(jié)合,抑制信使RNA翻譯或使其降解發(fā)揮基因調(diào)節(jié)作用[13]。據(jù)推算,超過60%的編碼基因均受到miRNA的調(diào)控[14]。有研究證實,miRNA和肺癌、頭頸部腫瘤等的預(yù)后相關(guān),miRNA也有作為腫瘤標志物應(yīng)用于臨床的可能[15]。
miR-10b位于人類2號染色體[4],有關(guān)研究發(fā)現(xiàn)在多種腫瘤中均有miR-10b的表達升高,且和腫瘤的發(fā)生機制相關(guān),但尚無miR-10b在腎癌中的功能研究。在乳腺癌中miR-10b的表達是上調(diào)的,且通過抑制miR-10b的表達可以對抗轉(zhuǎn)化生長因子(transforming growth factor-beta1,TGF-β1)引 起的細胞侵襲、細胞增殖及上皮細胞-間充質(zhì)細胞轉(zhuǎn)換,從而可以抑制乳腺癌組織的生長及轉(zhuǎn)移,因此在乳腺癌中 miR-10b是基因治療的可能靶點[5]。miR-10b在鼻咽癌中表達上調(diào),Allaya等[13]的研究發(fā)現(xiàn)miR-10b通過作用于LMP1及Twist1通路發(fā)揮其作用,且miR-10b的表達水平和鼻咽癌的臨床分級及診斷時年齡相關(guān),提示其作為生物標志物應(yīng)用于鼻咽癌診斷的可能。Sun等[16]的研究發(fā)現(xiàn)miR-10b可以上調(diào)基質(zhì)金屬蛋白酶9(matrix metal-loprotein9,MMP-9)的表達水平,抑制miR-10b的表達則可以明顯下調(diào)鈣黏蛋白(epithelia cadherin,E-cadherin)的表達水平,從而在鼻咽癌細胞的遷移及侵襲中發(fā)揮重要作用。在肝細胞癌中同樣檢測到miR-10b的高表達,且miR-10b可以通過HOXD10/RhoC/uPAR/MMPs通路調(diào)節(jié)肝癌細胞的遷移和侵襲,因此miR-10b是肝細胞癌靶向治療的靶點選擇之一[7]。在許多腫瘤組織中miR-10b的表達均升高,而在腎癌中檢測到miR-10b的表達下調(diào),提示miR-10b在腎癌中的作用機制與在其他腫瘤組織中不同,對miR-10b進行研究可能會對腎癌的發(fā)生及發(fā)展機制有所了解,也為腎癌的基因靶向治療提供一個新的選擇。
本研究在腎癌組織及腎癌細胞中驗證了miR-10b的表達水平,結(jié)果證實miR-10b在腎癌組織中表達水平相對配對癌旁正常組織明顯下降,且在腎癌細胞系(786-O、ACHN)中表達水平明顯低于HEK-293T。未發(fā)現(xiàn)miR-10b的異常表達和患者年齡、性別、腎癌組織類型及分期相關(guān),但這不能排除因樣本數(shù)過少產(chǎn)生的偏倚,需要擴大樣本量進一步驗證。
目前關(guān)于miRNA功能研究的方法已較成熟。下一步的實驗將收集更多組織標本驗證其表達水平及miR-10b和患者臨床病理特征之間的關(guān)系,進而將miR-10b功能類似物及抑制物分別轉(zhuǎn)染到細胞中,通過觀察細胞增殖、遷移、凋亡等一系列生物進程探究miR-10b對腎癌細胞的功能調(diào)節(jié),最后通過熒光素酶、蛋白質(zhì)印跡等實驗尋找miR-10b在腎癌細胞中的靶基因。
總之,腎癌組織及細胞中miR-10b的表達水平下調(diào),提示其對于腎癌的發(fā)生及發(fā)展機制研究有一定意義,為腎癌靶向治療提供了一個新的選擇。但目前尚無miR-10b在腎癌中的功能研究報道,本研究為后續(xù)miR-10b的功能及作用機制研究奠定了基礎(chǔ)。
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