王泓午,趙紫薇,曹 姍,周 萱,徐 芳,于春泉
中國(guó)脂質(zhì)組學(xué)研究現(xiàn)狀的文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)分析*
王泓午,趙紫薇,曹姍,周萱,徐芳,于春泉
(天津中醫(yī)藥大學(xué),天津300193)
[目的]了解國(guó)內(nèi)脂質(zhì)組學(xué)研究現(xiàn)狀。[方法]收集中國(guó)2003年至今的脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn),并運(yùn)用NoteExpress3.0、Bicomb2.0和SPSS19.0軟件進(jìn)行文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)分析。[結(jié)果]共檢出有效文獻(xiàn)74篇。脂質(zhì)組學(xué)研究的年發(fā)文量呈上升趨勢(shì),基本形成核心作者群體,天津大學(xué),中國(guó)科學(xué)院,北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院分別為發(fā)文量前三位的研究機(jī)構(gòu),通過對(duì)18個(gè)高頻關(guān)鍵詞的分析,得到5個(gè)熱點(diǎn)主題方向。[結(jié)論]國(guó)內(nèi)脂質(zhì)組學(xué)研究尚處于初始階段,炎癥相關(guān)的脂質(zhì)組學(xué)研究有待進(jìn)一步深入。
脂質(zhì)組學(xué);文獻(xiàn)計(jì)量學(xué);研究現(xiàn)狀
脂質(zhì)是指一大類不溶于水而易溶于非極性有機(jī)溶劑且化學(xué)成分與結(jié)構(gòu)非均一的有機(jī)化合物,參與生命活動(dòng),為生物提供能量,是生物膜的骨架成分[1]。2003年由美國(guó)圣路易斯華盛頓大學(xué)Han等[2]正式提出脂質(zhì)組學(xué)這一概念,其屬于代謝組學(xué)的重要分支,即對(duì)生物體內(nèi)的脂類物質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)的分析,研究其相互作用以及與其他生物分子的作用。脂質(zhì)組學(xué)的提出興起了對(duì)脂代謝調(diào)控在各種生物現(xiàn)象中作用機(jī)制研究的熱點(diǎn)[3-5],廣泛應(yīng)用于生命、醫(yī)藥等學(xué)科領(lǐng)域之中?,F(xiàn)將2003年至今的國(guó)內(nèi)有關(guān)脂質(zhì)組學(xué)研究的文獻(xiàn)進(jìn)行收集整理,運(yùn)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法分析其研究現(xiàn)狀,望為今后中醫(yī)藥脂質(zhì)組學(xué)研究提供參考。
1.1數(shù)據(jù)庫來源以中國(guó)知網(wǎng)、維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫、萬方數(shù)據(jù)庫為檢索來源。
1.2檢索策略選擇主題檢索,檢索自由詞“脂質(zhì)組學(xué)”,檢索時(shí)間限定為2003年1月—2014年10月。
1.3納入與排除標(biāo)準(zhǔn)同時(shí)符合如下條件:1)納入以脂質(zhì)組學(xué)為主題的文獻(xiàn),排除非該主題文獻(xiàn)。2)納入文獻(xiàn)的類型為會(huì)議論文,期刊文章、學(xué)位論文,排除新聞、會(huì)議通知、文摘、書籍等類型文獻(xiàn)。3)納入的文獻(xiàn)需有足夠信息摘要且可獲得全文,排除資料缺失、不能獲取全文的文獻(xiàn)。4)排除重復(fù)文獻(xiàn)。
1.4研究方法將檢出文獻(xiàn)的題錄導(dǎo)入Note Express3.0軟件,根據(jù)“年度”“題目”字段進(jìn)行查重,保留資料最完整的文獻(xiàn),并通過人工查閱全文的方式篩選符合納入標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)。運(yùn)用NoteExpress3.0、Bicomb2.0和SPSS19.0軟件,對(duì)文獻(xiàn)的年度分布、研究單位、核心作者群、關(guān)鍵詞的共詞聚類以及研究熱點(diǎn)進(jìn)行計(jì)量學(xué)分析,以了解脂質(zhì)組學(xué)研究現(xiàn)狀。
圖1 脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)年度分布Fig.1 The distribution of publication yearsof literatureon lipidom ics
檢出文獻(xiàn)數(shù)量分別為中國(guó)知網(wǎng)68篇,維普中文科技期刊數(shù)據(jù)庫19篇,萬方數(shù)據(jù)庫110篇。對(duì)檢出文獻(xiàn)進(jìn)行清洗后,共納入有效文獻(xiàn)74篇,其中學(xué)位論文25篇,會(huì)議論文8篇,期刊文章41篇。
2.1文獻(xiàn)年度分析文獻(xiàn)的年度分布情況,可以從一定程度上反映該領(lǐng)域的發(fā)展情況,分析文獻(xiàn)量與時(shí)間變化的關(guān)系,可以大體揭示該學(xué)科的發(fā)展階段與規(guī)律[6]。脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)最早的3篇文獻(xiàn)發(fā)表于2004年,2004年至2008年平均年發(fā)文量不足5篇,2009年起年發(fā)文量逐年上升,2013年達(dá)到頂峰14篇,增長(zhǎng)趨勢(shì)見圖1(注:2014年只收錄了1月到10月間發(fā)表的文獻(xiàn)),表明脂質(zhì)組學(xué)這一新興學(xué)科正逐漸被研究者們所關(guān)注。
2.2研究機(jī)構(gòu)分布共有49個(gè)研究機(jī)構(gòu)發(fā)表脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn),其中大學(xué)院校參與發(fā)表44篇,醫(yī)院發(fā)表23篇,研究所發(fā)表20篇。發(fā)文量前3名的研究機(jī)構(gòu)分別為天津大學(xué)9篇(12.16%)、中國(guó)科學(xué)院6篇(8.11%)、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院6篇(8.11%)。74篇有效文獻(xiàn)中由研究機(jī)構(gòu)獨(dú)立發(fā)表39篇(52.70%),多機(jī)構(gòu)合作發(fā)表35篇(47.30%),發(fā)文量前10位的研究機(jī)構(gòu)如表1所示。
表1 脂質(zhì)組學(xué)研究機(jī)構(gòu)分布情況Tab.1 The distribution of institutionson lipidom ics research
2.3高頻關(guān)鍵詞分析關(guān)鍵詞的共詞聚類分析可以反映某一學(xué)科的研究熱點(diǎn)[7],其主要原理是對(duì)一組詞兩兩統(tǒng)計(jì)它們?cè)谕黄墨I(xiàn)中出現(xiàn)的次數(shù),以此為基礎(chǔ)對(duì)這些詞進(jìn)行聚類分析,從而反映出這些詞之間的親疏關(guān)系,進(jìn)而分析這些詞所代表的學(xué)科或主題的結(jié)構(gòu)與變化[8]。運(yùn)用Bicomb2.0軟件提取全部文獻(xiàn)的關(guān)鍵詞,對(duì)相同意義詞語(如“非酒精性脂肪性肝病”同“NAFLD”、“超高效液相色譜/四級(jí)桿飛行時(shí)間質(zhì)譜儀同“UPLC-Q/TOFMS”)進(jìn)行清洗后獲得關(guān)鍵詞380個(gè),截取頻次3次及以上為高頻關(guān)鍵詞(見表2),生成共詞矩陣,應(yīng)用SPSS19.0對(duì)其進(jìn)行聚類分析,得到共詞聚類樹狀圖。見圖2。
2.4核心作者分析共有225位作者參與發(fā)表脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)的發(fā)表。其中發(fā)表文獻(xiàn)3篇的1人,2篇23人。根據(jù)普萊斯定律[9],核心作者所發(fā)表的文獻(xiàn)應(yīng)占文獻(xiàn)總量的50%,核心作者最低文獻(xiàn)量(m)為:,其中n指文獻(xiàn)量最多的作者的文獻(xiàn)數(shù)[10]。在本文中nmax=3,根據(jù)公式得m=1.30,需取整數(shù)為2篇,發(fā)文量為2篇及2篇以上的作者共24人(詳見表3),占全部作者的10.67%,這些作者共發(fā)表文獻(xiàn)49篇,占文獻(xiàn)總量的66.22%,符合普萊斯定律的要求,即脂質(zhì)組學(xué)研究已基本形成核心作者群。
表2 脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)高頻關(guān)鍵詞頻率分布表Tab.2 Thehigh frequency keyword of literatureon lipidom ics
圖2 脂質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)共詞聚類樹狀圖Fig.2 The clustering treegraph ofhigh frequency key word of lipidom ics
3.1磷脂的色譜分析及質(zhì)譜檢測(cè)方法(基于關(guān)鍵字段1、2、4、17、7、5、11)陸姝歡[11]建立了以液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(HPLC/ESI/MSn)為基礎(chǔ)的高通量、高靈敏度及高分辨率的研究方法,為紅豆杉細(xì)胞包含的6類84種磷脂分子建立了磷脂圖庫。王友誼[12]基于鳥槍法的脂質(zhì)組學(xué)研究策略,分別建立了直接進(jìn)樣電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜法分析磷脂和流動(dòng)注射電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜法分析膽固醇酯的方法,并應(yīng)用這兩種方法分析了生物樣本中磷脂和膽固醇酯的分子種和含量。劉瑩[13]采用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)釀酒酵母細(xì)胞磷脂和固醇進(jìn)行定性定量研究,從脂質(zhì)組學(xué)角度系統(tǒng)分析釀酒酵母細(xì)胞在在不同乙醇濃度下二倍體和單倍體發(fā)酵體系的脂代謝的變化規(guī)律和脂生物標(biāo)志物,從脂組學(xué)角度揭示細(xì)胞應(yīng)對(duì)不同濃度乙醇刺激的響應(yīng)應(yīng)答機(jī)制。
表3 脂質(zhì)組學(xué)核心作者發(fā)文量Tab.3 The distribution of literaturequantity from coreauthor
3.2高脂血癥在動(dòng)脈粥樣硬化與冠心病中的作用機(jī)制(關(guān)鍵字段8、18、10、6、12、15) 汪俊軍等[14]通過對(duì)血液樣本的檢測(cè)得出高脂血癥人群血清氧化型低密度脂蛋白水平升高,與低密度脂蛋白中甘油三酯/膽固醇比值高度呈正相關(guān)。高脂血癥人群膽固醇酯轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白水平升高,促進(jìn)了脂蛋白間脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),使高密度脂蛋白和低密度脂蛋白脂質(zhì)組成發(fā)生變化,促進(jìn)了動(dòng)脈粥樣硬化的發(fā)生和發(fā)展。
3.3Ⅱ型糖尿病的脂質(zhì)組學(xué)分析(關(guān)鍵字段9、16、3、13)陶旭光等[5]采集Ⅱ型糖尿病大鼠血清,運(yùn)用高效液相色譜串聯(lián)四極桿飛行時(shí)間質(zhì)譜法(HPLCQ/TOF-MC)進(jìn)行脂質(zhì)學(xué)分析,結(jié)果表明,相對(duì)于正常大鼠,甘油脂類、鞘脂類、磷酯酰絲氨酸、孕烯醇酮脂水平明顯升高,糖脂水平顯著下調(diào),存在多途徑的脂代謝紊亂,并且結(jié)果顯示復(fù)方中藥人參白虎湯及六味地黃丸較單一化合物的西藥二甲雙胍具有更好調(diào)節(jié)脂質(zhì)紊亂的作用。
3.4炎癥的脂質(zhì)組學(xué)研究(關(guān)鍵字段14)趙麗麗[15]運(yùn)用超高效液相色譜/四級(jí)桿飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(UPLC-Q/TOFMS)分析RAW 264.7細(xì)胞中的甘油磷脂類代謝物鑒別了RAW264.7細(xì)胞中的78個(gè)甘油磷脂類成分,有22個(gè)磷脂酰乙醇胺、49個(gè)磷脂酰膽堿、4個(gè)磷脂酰甘油、1個(gè)磷脂酰肌醇和2個(gè)未知的甘油磷脂類成分,并發(fā)現(xiàn)磷脂酰膽堿PC(16∶0/18∶1)和磷脂酰乙醇胺PE(18∶0/18∶1)的代謝調(diào)節(jié)貫穿于炎癥的發(fā)生和消退過程,可能是炎癥發(fā)生、消退過程中的重要的脂質(zhì)標(biāo)記物。
3.5其他目前脂質(zhì)組學(xué)在脂質(zhì)代謝疾病的預(yù)防、控制及診斷、脂質(zhì)生物標(biāo)志物、藥物靶點(diǎn)的鑒定以及藥物的研發(fā)等方面取得了重要進(jìn)展[16-18]。殷婷婷等[19]采用超高效液相色譜飛行時(shí)間質(zhì)譜連用技術(shù),探討風(fēng)濕性疾病濕熱證的脂質(zhì)組學(xué)特征,通過強(qiáng)直性脊柱炎濕熱證組與非濕熱證組血清脂質(zhì)指紋圖譜的比較顯示,部分甘油磷脂酰膽堿類和甘油三酯類為強(qiáng)直性脊柱炎濕熱證脂質(zhì)代謝的特異性本質(zhì);通過強(qiáng)直性脊柱炎、同性性關(guān)節(jié)炎濕熱證組與健康人對(duì)照組的比較,提示溶血甘油磷脂酰膽堿類Lyso-GPC(16∶0)Lyso-GPC(18∶2)與Lyso-GPC(18∶1)可能是風(fēng)濕性疾病濕熱證脂質(zhì)代謝的共性實(shí)質(zhì)。趙鐵等[20]認(rèn)為柴黃益腎顆粒干預(yù)可以延緩糖尿病腎病大鼠的病程進(jìn)展,其機(jī)制可能與該顆粒對(duì)脂質(zhì)特別是鞘脂類代謝異常的調(diào)節(jié)功能有關(guān)。研究方法是運(yùn)用超高壓液相-四級(jí)桿飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù),比較脂質(zhì)代謝物在干預(yù)前后的變化,結(jié)果顯示4種鞘磷脂酰膽堿SM(C33∶1)、SM(d18∶1/16∶1)、SM(C42∶3)、SM(C42∶2)與2種甘油磷脂酰膽堿PC(42∶10)、PC(36∶4)改善明顯,相對(duì)變化倍數(shù)分別為1.50、1.38、1.23、1.29、1.15與1.30。
綜上所述,本文通過搜集脂質(zhì)組學(xué)研究文獻(xiàn),運(yùn)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)的方法分析其研究現(xiàn)狀。脂質(zhì)組學(xué)作為一門新型學(xué)科,國(guó)內(nèi)研究尚屬初級(jí)階段。從近5年研究熱度來看,炎癥方向的脂質(zhì)組學(xué)研究文獻(xiàn)相對(duì)較少,提示此方向可能成為日后研究的新熱點(diǎn),為臨床醫(yī)生以及研究人員對(duì)脂質(zhì)組學(xué)進(jìn)一步的深入研究提供參考。
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(本文編輯:李琳,高杉)
The bibliometricmanalysisof lipidom ics research in China
WANGHong-wu,ZHAOZi-wei,CAOShan,ZHOUXuan,XU Fang,YUChun-quan
(Tianjin University of Traditional Chinese Medicine,Tianjin 300193,China)
[Objective]Literature domestic lipidomicswere analyzed tounderstand the status of research lipidomics.[Methods]We collected since 2003 lipidomics literature,and used NoteExpress3.0,Bicomb2.0 and SPSS19.0 software for bibliometric analysis.[Results]A total of 74 valid documentswere screened out.The amountof literature published were on the rise.The top three institutionswere Tianjin University,Chinese Academy of Sciencesand Chinese Academy ofMedical Sciences Beijing Union Medical College.Through the analysisof18 high-frequency keywordswegot5 hottopics.[Conclusion]Domestic lipidomics research isstill in its initialstage.Inflammation lipidomics researchneeds tobe further deepened.
lipidomics;bibliometric;currentresearch situation
R589.2
A
1672-1519(2015)02-0076-04
10.11656/j.issn.1672-1519.2015.02.04
國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)資助項(xiàng)目(2014CB542902)。
王泓午(1966-),男,醫(yī)學(xué)博士,教授,博士生導(dǎo)師,主要從事中醫(yī)證候?qū)W研究。
于春泉,E-mail:ycq-4@163.com。
(2014-11-03)