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      葉點霉屬真菌寄主(宿主)和地理分布的多樣性

      2015-04-11 08:38:48吳石平劉作易
      貴州農(nóng)業(yè)科學 2015年6期
      關(guān)鍵詞:支系宿主真菌

      吳石平,陳 文,劉作易

      (1.貴州大學 農(nóng)學院,貴州 貴陽550025;2.貴州省植物保護研究所,貴州 貴陽550006;

      3.貴州省農(nóng)業(yè)科學院,貴州 貴陽550006)

      葉點霉屬(Phyllosticta)是葡萄座腔菌目中最重要的幾個屬之一,廣泛分布于世界各地,常寄生或腐生于多種植物或有機基質(zhì)上,是農(nóng)作物、林木、經(jīng)濟作物和觀賞植物上的重要病原菌[1-4]。有的葉點霉屬存在于植物體內(nèi),為植物的重要內(nèi)生真菌,對植物的生長和抗病起著重要的作用,有的還可分泌一些有生物活性的化合物[5-7]。多樣性研究對新種的發(fā)現(xiàn)、物種的認識、完善生物演化理論、利用有益物種和控制有害物種有著重要意義[8]。由于葉點霉屬真菌的分類爭議較多及系統(tǒng)學資料缺乏,其多樣性研究未見報道。因此,筆者以近年已準確分類且有明確寄主、采集國家及序列數(shù)據(jù)的菌株為研究對象,進行寄主的多樣性及地理分布研究,以期為今后新種的發(fā)掘和鑒定、有益內(nèi)生真菌的利用及其與寄主(宿主)植物的協(xié)同進化研究提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 菌株

      從近年發(fā)表的葉點霉屬真菌分類及鑒定文章[9-30]中篩選分類信息準確的菌株共67種203株(表1),其中,53株為模式(type)或外模(epi-type)菌株,提取這些菌株的基因序列獲取號,從Gene-Bank下載ITS、ACT、TEF-1 和GPDH 基因序列,同時提取這些菌株的寄主信息及地點(國家)。

      1.2 系統(tǒng)學分析

      采用 在線比對軟件MAFFT(http://www.ebi.a(chǎn)c.uk/Tools/msa/mafft)對篩選的基因序列進行比對;在BioEdit(1.7.3.0)中打開已完成比對的序列進行手工校正,并將序列兩端剪切整齊,將4個基因的序列進行連接;用Gblocks對保守區(qū)序列進行選擇,用PAUP(v4.0)軟件進行最大簡約法(MP)重建系統(tǒng)樹,并進行自展檢驗,將自展檢驗值標記在系統(tǒng)樹的分枝上。

      1.3 多樣性分析

      采用Shannon指數(shù)(H)和Simpson指數(shù)(D)[31]分析內(nèi)生真菌的群落生物多樣性。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 系統(tǒng)發(fā)育

      6 7種的ITS、ACT、EF和GAPDH 基因聯(lián)合

      表1 67種203株葉點霉屬真菌菌株Table 1 203 Phyllostictafungus strains of 67species

      后,序列總的位點數(shù)為1 751個,其中,保守位點為912個,無簡約信息位點238個,最大簡約信息位點數(shù)601個(占總位點數(shù)的34.8%),采用最大簡約法分析得到48棵系統(tǒng)樹,經(jīng)Kishino-Hasegawa檢驗,各個系統(tǒng)樹之間無顯著差異。系統(tǒng)發(fā)育樹的樹長為3 245,一致性指數(shù)(CI)為0.418,同型指數(shù)(HI)為0.582,保留指數(shù)(RI)為0.643,重標定指數(shù)(RC)為0.268。根據(jù)自展支持率、支系拓撲結(jié)構(gòu)、支系包含的物種數(shù)量等信息將系統(tǒng)樹分為9個支系(圖示)。

      圖示 葉點霉屬真菌的系統(tǒng)樹及寄主多樣性Fig. Phylogenetic tree and host diversity of Phyllostictafungus

      2.2 寄主(宿主)的多樣性

      經(jīng)?;苑治觯ū?),葉點霉屬寄主范圍較廣,在蕨類植物、裸子植物和被子植物上均有分布。67種菌株的寄主分屬32目45科;在蕓香目、百合目、杜鵑花目、囊荷目、無患子目、微子目和鼠李目等7個目中分離到的菌株較多,共140個,占69.0%。7個目中,百合目上真菌的多樣性較多,其上分離的葉點霉屬真菌分屬于5 個支系,Shannon 指數(shù)為1.357,Simpson指數(shù)為0.732;其余各目中葉點霉屬真菌多樣性較小,其中,鼠李目(葡萄科)、荷囊目(芭蕉科)和無患子目的漆樹科上均只分離到1個支系的葉點霉真菌。不同種的寄主多樣性不相同(表3),其中,中央葉點霉(P.capitalensis)的寄主范圍最廣,54 個菌株來源于24 科的植物;芒果球座菌(G.mangiferae)的寄主也較廣,3個菌株分別來源于3科的植物;大多數(shù)種的寄主范圍較窄,均來源于一個科,甚至一個屬,如P.citricarpa 的16個菌株均分離于蕓香科的柑桔屬,P.vaccinii的16個菌株均分離于葡萄科。部分親緣關(guān)系較近的種只寄生于一個科或一個目的幾個科,如P.citriasiana、P.citriasiana和P.citriasiana 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系較近,均屬蕓香科;有的葉點霉在系統(tǒng)發(fā)育上屬于較高支持率的同一支系,卻分離于親緣關(guān)系較遠的植物,如P.fallopiae和P.a(chǎn)lliacea 分別分離于雙子葉植物的蓼科和單子葉植物的百合科,從葉點霉屬真菌和宿主植物來看,其系統(tǒng)發(fā)育無明顯相關(guān)性(圖示)。

      表2 不同寄主(宿主)植物上葉點霉的多樣性Table 2 Diversity of Phyllostictaon different hosts

      表3 葉點霉屬真菌葉點霉屬真菌的寄主(宿主)數(shù)量Table 3 Host number of Phyllostictafungi

      表4 不同國家葉點霉屬真菌的多樣性Table 4 Diversity of Phyllostictafungi of different countries

      2.3 地理分布的多樣性

      從表4看出,67種(203個菌株)葉點霉屬真菌來源于23個國家或地區(qū)。其中,來源于泰國、美國、中國、日本、巴西、澳大利亞和南非等7個國家和地區(qū)的菌株較多,共159個菌株,占78.3%;各個支系在地理分布上無明顯的偏好性。分離到菌株較多的7個國家中,美國的多樣性最高,34個菌株分屬于7個支系,shannon 指數(shù)和Simpson 指數(shù)分別為1.418和0.722;其次為中國和日本;泰國多樣性最低,38個菌株分屬于2個支系,且C1支系占了92.1%;shannon指數(shù)和Simpson 指數(shù)分別為0.642和0.542。

      3 結(jié)論與討論

      葡萄座腔菌科真菌由于孢子較小,可用于分類特征較少,所以寄生的部位和寄主常作為分類的輔助依據(jù),如從銀杏葉部分離到的葡萄座腔菌就為銀杏葉點霉,胡桃科植物葉片上分離到的葡萄座腔菌就為胡桃葉點霉[32-33]。因此,葡萄座腔菌科內(nèi)屬間分類長期以來較為混亂[34],在葉點霉屬的屬內(nèi)種間分類也存在較多的爭議。筆者從系統(tǒng)學的角度分析了葉點霉屬的寄主多樣性,證實了大多數(shù)葉點霉屬真菌在種內(nèi)存在寄主的特異性,部分親緣關(guān)系較近的種也存在寄主的特異性,僅寄生于一個科或一個目的幾個科,但整個葉點霉屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系與寄主的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系并無明顯相關(guān)性;一個科的寄主植物上常寄生(內(nèi)生)多種葉點霉屬真菌,因此,以寄主植物來作為分類的輔助依據(jù),有一定的弊端。

      共選擇67 種,203個菌株進行研究,這些種在地域分布上無明顯的偏好性,但有的國家分離到的葉點霉種類較多,菌種多樣性較高,有的國家分離到的種類較少,多樣性較低,這有可能與葉點霉屬真菌在與寄主(宿主)協(xié)同進化過程中的寄主植物廣泛分布有關(guān)。具體原因有待于聯(lián)合種內(nèi)和種間的數(shù)據(jù)進一步的試驗和分析。

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